Версія даної теми для друку

Натисніть сюди для перегляду даної теми у оригінальному форматі

Розподілені обчислення в Україні _ Медико-біологічні _ Simap

Автор: Waldhausen Mar 3 2006, 17:54

IPB Image

Проект "Simap"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

ТОП-20 участников:
IPB Image
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 08.01.2006 Капитан - http://distributed.org.ua/fenchenko
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите http://boinc.berkeley.edu/download.php (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://boincsimap.org/boincsimap/ -- адрес недавно поменялся!
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее http://boincsimap.org/boincsimap/team_display.php?teamid=212&sort_by=total_credit&offset=0 вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

О проекте:
http://boincsimap.org/boincsimap/project.php
SIMAP - база данных сходств протеинов. Она содержит почти все опубликованные протеиновые последовательности и постоянно обновляется. Протеиновые последовательности вычисляются с использованием алгоритма FASTA, который обеспечивает оптимальные скорость и чувствительность. SIMAP - единственный известный нам проект, совмещающий исчерпывающее покрытие в отношении всех известных протеинов и возможности инкрементального обновления.

Для чего используется SIMAP?
Огромное количество известных протеиновых последовательностей в публичных базах данных не позволит в ближайшем будущем экспериментально описать большинство из них. Тем не менее, протеины, полученные от общего предка, часто имеют те же функции (так называемые ортологи - orthologs). Таким образом оказывается возможным вывести функцию неохаракеризованного протеина из ортолога с известной функцией. Широко известные примеры - исследования генов и протеинов мыши. Их результаты оказались во многих случаях справедливыми и для человеческих генов и протеинов. Сходства протеинов предоставляют информацию о связях между протеинами и необходимы для предсказания ортологов. Существует множество биоинформационных методов, полагающихся на сходства протеинов. Наша база данных сходств протеинов предоставляет предварительно вычисленные данные о сходстве и представляет известное пространство протеинов. Это открывает абсолютно новые перспективы по сравнению с используемыми методами для повторного пересчёта такого рода данных. SIMAP регулярно обновляется. Матрица сходств расширяется по мере появления новых последовательностей. Использование SIMAP полностью бесплатно для образовательных целей и публичных исследований.

Зачем нам нужны распределённые вычисления для SIMAP?
Стоимость вычислений данных о сходствах протеиновых послеовательностей пропорциональна квадрату количества содержащихся последовательностей. Таким образом, вычислительные усилия для поддержания матрицы в актуальном состоянии постоянно растут. Наших внутренних ресурсов, годами выполняющих вычисления для SIMAP, больше не достаточно для отслеживания новых последовательностей. Вот почему мы реализовали SIMAP-клиента для платформы BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), основанного на алгоритме FASTA для обнаружения сходств последовательностей.

Какие организации стоят за SIMAP?
SIMAP - это совместный проект GSF Национального исследовательского центра окружающей среды и здоровья в Нойерберге под Мюнхеном и Научного центра жизни и питания в Вайенстефане (Германия). Контактное лицо - Томас Раттай (Отдел геном-ориентированной биоинформатики, Технический Университет, Мюнхен).

Перевёл Вит Сердаковский
Translation by "witdba" from the Boinc-Simap forum.

График ППД команды за последние 60 дней:
(Show/Hide)

IPB Image


02.02.2009
CODE
Project Rank Team Today Last Update Yesterday 2 Days Ago Average Last 7 days Last 28 Days RAC Total Credit
142 Ukraine 0 0 0 0 0 0 3,385 106 279,603


2.03.2009
CODE
140    Ukraine    0    0    628    0    90    628    7,664    126    287,642


----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:

IPB Image

http://webclu.bio.wzw.tum.de/portal/web/simap/

http://www.boinc-af.org/content/view/111/219/

http://www.dp.by/wiki/Projects/Simapathome

CODE
http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Simap/en


http://www.irelandboinc.com/projects/40-projects/113-simap

http://distributed.ru/wiki/pro:simap

Автор: romko Mar 4 2006, 09:45

Дякую за інформацію. Цікава стаття і цікавий проект smile.gif

Автор: ReMMeR Mar 6 2006, 08:10

(Waldhausen @ Mar 3 2006, 05:54 PM) *

Всем привет. Ниже представлено описание проекта http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/.



Оформляем до уровня статьи - и можно на сайт закинуть
Команда наша там есть как видно smile.gif http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=212

Дополняем статью как подключится, как смотреть статистику, может вопросы какие частые.

Автор: Waldhausen Mar 6 2006, 15:51

(ReMMeR @ Mar 6 2006, 08:10 AM) *

(Waldhausen @ Mar 3 2006, 05:54 PM) *

Всем привет. Ниже представлено описание проекта http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/.


Оформляем до уровня статьи - и можно на сайт закинуть
Команда наша там есть как видно smile.gif http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/team_display.php?teamid=212

Дополняем статью как подключится, как смотреть статистику, может вопросы какие частые.


Упс. Дык, есть же описание. В этом разделе... Общее для BOINC.

Автор: Waldhausen Mar 6 2006, 16:40

Всім привіт. Нижче наведено опис проекта http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/

Про SIMAP

Що таке SIMAP?
SIMAP - база даних подібностей протеїнів. Вона містить майже всі опубликовані протеїнові последовності и постійно оновлєються. Протеїнові послідовності обчислюються з використанням алгоритма FASTA, який забезпечую оптимальні швидкість та чутливість. SIMAP - єдиний відомий нам проект, що поєднує виключне покриття всіх відомих протеїнів та можливості інкрементального оновлення.

Для чого використовується SIMAP?
Величезна кількість відомих протеїнових послідовностей в публічних базах даних не дозволить в найближчому майбутньому експериментально описати більшість з них. Однак, протеїни, отримані від загального предка, часто мають ті ж самі функції (так звані ортологи - orthologs). Таким чином виявляється можливим вивести функцію ще неохаракеризованого протеїна з ортолога з відомою функцією. Широко відомі приклади - дослідження генів та протеїнів миші. Їх результати виявилися в багатьох випадках справедливими і для людських генів та протеїнів. Подібності протеїнів надають інформацїю про зв'язки між протеїнами та є необхідними для передбачення ортологів. Існуєт багато біоинформаційних методів, що спираються на подібності протеїнів. Наша база даних подібностей протеїнів надає заздалегідь обчислені дані про подібність та представляє відомий простір протеїнів. Це відкриавє абсолютно нові перспективи у порівнянні з методами, що використувуються для повторного обчислення даних такого роду. SIMAP регулярно оновлюється. Матриця подібностей розширюється по мері появи нових послідовностей. Використання SIMAP повністю безкоштовне для освтніх цілей та публічних досліджень.

Навіщо нам потрібні розподілені обчислення для SIMAP?
Вартість обчислень даних про подібності є пропорціональною до квадрату числа послідовностей, що в ній містяться. Таким чином, обчислювальні зусилля для підтримання матриці в актуальному стані постійно зростає. Наших внутрішніх ресурсів, які роками виконують обчислення для SIMAP, більше не вистачає для відстеження нових послідовностей. Ось чому ми реалізували SIMAP-кліента для платформи BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), в основі якого полягає алгоритм FASTA для виявлення подібностей послідовностей.

Які організації стоятя за SIMAP?
SIMAP - це спільний проект GSF Національного дослідного центра навколишнього середовища та здоров'я в Нойерберзі під Мюнхеном та Научного центра життя та харчування в Вайенстефані (Німеччина). Контактна особа - Томас Раттай (Відділ геном-орієнтованої біоінформатики, Технічний Університет, Мюнхен).

Автор: ReMMeR Jan 5 2008, 22:18

Задание считается очень быстро - до 10-15 минут.

Задание весит : 1.8 Мб
Результат весит : 0.7 Мб

Это вам не сказки сказывать на 64к smile.gif

Автор: Death Jul 23 2008, 10:29

присоединился и на тебе

Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from july 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around august 1st.


ГОТОВИМСЯ!

если к первому числу все будут готовы - есть шанс нахапать ВУ и войти в сотню )

32 132 Gentoo Linux Users Everywhere 0 0 0 0 0 0 1,716 55 247,682
33 133 Crunchers Inc 0 0 0 0 0 0 0 1 246,515
34 134 Hewlett-Packard 0 0 0 0 0 0 1,326 40 243,762
35 135 Death Metal Rules 0 0 0 0 0 0 0 0 241,005
36 136 Ukraine 0 0 0 0 0 0 49 6 235,617

Автор: Death Dec 4 2008, 23:28

фальстарт!

как показало вскрытие к первому числу релизится пачка заданий - расхватывается за два дня и потом народ две недели сливает результаты. таймаут похоже большой у вушек, так чт она экспайр расчитывать не приходится.
проект реально БОЛЬШОЙ! 27к участнегов.
мы в далёком анусе - 144 место.

November 30, 2008
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 200.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in november, will start in the morning (UTC) of december 1st.

October 28, 2008
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 100.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in october, will start in the evening (UTC) of october 30th.

вот так вот. я полагаю что к первому числу будет возможно пачка побольше - 300к например.
ну вы поняли ))) надо вытаскивать.

судя по корпстинке 100к в наябре щитались дней 10. в этом месяце следовательно будет дней 20 щитаться.



уж простите что отрываю от абц... я честно даже не предлагаю к симапу подрубаться. есть какбэ приоритеты - магнетизм, абц, 3х+1 вот тоже на финише, офтоп - надо ещё пару дней на сегодняшней скорости чтобы получить +3 в 3х )) дальше бесполезно.

так вот, когда закончится абц и ВУ в магнетизме, поставьте симап хотябы с приоритетом 30 ))) команда не в сотне - вас это не угнетает?

Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from december 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around january 1st.

Автор: Algon Dec 5 2008, 00:30

Попробуем (+7).

Автор: Rilian Dec 14 2008, 08:55

The project has currently no work (see below).

The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from december 2008 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around january 1st.

до первого января прогреваем процы!

Автор: Algon Dec 15 2008, 05:18

Мне вчера накидали ~30 заданий на машину и постоянно идут новые по мере отправки результатов. Да и до этого 1-3 задания ежедневно перепадали.
Каждое задание на Core2 3GHz считается около часа, на Athlon 64 X2 6400+ около полутора часов, Celeron-ы вообще похоже застряли надолго (от 2,5 часов/задание).
Deadline заданий: неделя.

Автор: Death Dec 15 2008, 22:30

да, лут повалил.

RESULTS Approximate #
in database 214,870
unsent 8,799

так шо до первого числа можно малёхо подпихнуться.

они решили до 1 числа не ждать ))

December 14, 2008
New Workunits: an additional batch of workunits has been started for the calculation of similarities and features of approx. 1.500.000 new sequences, that were imported from metagenomes.


шо-то очей понты дают. как команді по 20к в сутки сливают???

Opportunities
Rank Team Score Average Daily Gain Days to Overtake
144 Matrix World Search Team 254,026 0 80 44.69
142 NASCAR Fans 260,340 18 62 158.62
138 Aplin Clan 270,363 0 80 248.28
133 Digi International 281,694 0 80 389.49

пилят.

Автор: Algon Dec 16 2008, 05:50

Очков маловато дают, к тому-же примерно 70-80% результатов пока pending. Действительно странно, как при таком раскладе некоторые команды умудряются быстро разогнаться.

Автор: Rilian Dec 16 2008, 06:35

Может они "долго" разгонялись? И на самом деле задания есть независимо от новостей на главной? (Ведь не могут же закончиться протеины в базе)

Автор: Algon Dec 16 2008, 08:09

Rilian
Задания были и раньше, у меня к проекту подключено несколько машин, ловилось в среднем 1-3 задания в день, так что заранее они набрать вряд-ли могли. По поводу протеинов в базе - у них написано, что база обновляется по мере необходимости (видимо по мере поступления новых данных) и их основная задача - поддерживать "актуальность" базы. В общем ладно, в конце концов очки не главное smile.gif

Автор: Death Dec 16 2008, 11:00

Riliane, они обещали к 1 января подкинуть пачку, а подкинули 15 декабря. О чём и была новость у них на сайте.

Данные они действительно выкладывают по мере поступления из лабораторий.

Автор: Death Dec 31 2008, 16:14

понеслась.

Project status
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 400.000 new sequences from public databases imported in december 2008.
After these calculations are finished, next workunits are expected around february 1st.

RESULTS Approximate #
in database 163,969
unsent 6,543
in progress 116,273

Project Rank Team Today Last Update Yesterday 2 Days Ago Average Last 7 days Last 28 Days RAC Total Credit
144 Ukraine 0 0 0 0 200 1,178 17,543 666 265,182

Автор: Death Jan 13 2009, 11:42

Project status
The project has currently no work (see below).
The similarity matrix of the SIMAP project is currently up to date. All workunits from the last calculation period are distributed, thanks to all users for chrunchig them.
The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from January 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around February 1st.

142 Ukraine 83 83 36 32 472 1,486 29,163 773 279,603

+2 места.

До сотни надо будет не хуже чем в АБЦ навалиться )))

Автор: Rilian Jan 17 2009, 17:12

присоединился

пока заданий не пришло

Автор: Rilian Jan 24 2009, 21:04

The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from January 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around February 1st.

Задания будут 1го февраля

Автор: (_KoDAk_) Jan 28 2009, 02:49

http://www.dotsch.de/boinc/SIMAP.html
множество расчетных модулей под различные платформы
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/appdownloads.php

Автор: Death Feb 1 2009, 03:44

January 31, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 300.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in January, will start in the evening (UTC) of February 1st.

Мы на 142-м месте (((

Автор: Rilian Feb 1 2009, 22:42

НАЛЕТАЙ! punk2.gif punk2.gif punk2.gif punk2.gif 1.gif 1.gif 1.gif 1.gif 1.gif

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/server_status.php clap_1.gif

Всего 250000 ВЮ (умножить на кворум 2 шт), каждая считается примерно 30 минут на среднем по мощности компе

Автор: Burzum Feb 1 2009, 23:10

01.02.2009 23:09:33|boincsimap|Message from server: (Project has no jobs available)

Автор: Rilian Feb 1 2009, 23:45

Повысьте приоритет. ВЮ аплоадятся пачками

Автор: Rilian Feb 1 2009, 23:58

Да, 15 тыщ ВЮ расхватали за полчаса

кол-во ВЮ на сайте увеличивается, так что надо просто не отключать клиент

Автор: Rilian Feb 2 2009, 00:22

После 20 минут простоя мой комп отхватил вторую ВЮ. Скоро "рынок" насытится и ВЮ будут разбираться без проблем

Автор: Death Feb 2 2009, 00:34

Project status
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 250.000 new sequences from public databases imported in January 2009.
After these calculations are finished, next workunits are expected around March 1st.

RESULTS Approximate #
in database 22,185
unsent 24
in progress 21,548

Автор: Rilian Feb 2 2009, 00:44

QUOTE(Death @ Feb 2 2009, 00:34) *

RESULTS Approximate #
in database 22,185
unsent 24
in progress 21,548

угу. прикинь какая конкуренция на 24 задания среди активных за последнюю неделю 13,001 компов? smile.gif

пс: тока что удалось получить еще 2 ВЮ (после пары десятков безуспешных запросов)

Автор: Burzum Feb 2 2009, 01:01

Невезучий я... Ніфіга нема для мене... idontno.gif

Автор: Rilian Feb 2 2009, 01:13

А я тока что зохвотил еще 6 ВЮ. Хватит на пол ночи.

Вобщем техника такова:
1) разрешить принимать задания тока СИМАПу
2) выставить кэш на 1 день
3) Раз в минуту нажимать Update в боинке на этом проекте

Автор: Rilian Feb 2 2009, 01:30

Итак, зохвотилось еще 12 ВЮ. То есть кэш на день заполнил

Автор: Rilian Feb 2 2009, 22:25

[quote]Mon Feb 2 22:24:23 2009|boincsimap|Sending scheduler request: Requested by user. Requesting 0 seconds of work, reporting 24 completed tasks
Mon Feb 2 22:24:28 2009|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 0 new tasks

Автор: Death Feb 3 2009, 00:43

а мне 10 свалилось.

как отдать кому-нить?

Автор: Rilian Feb 3 2009, 01:16

там еще 300000 ВЮ на февраль. Лучше досчитай сам smile.gif

Автор: Death Feb 3 2009, 11:00

та так и сделаю )))

RESULTS Approximate #
in database 358,840
unsent 9,577
in progress 172,290

мы на 140-м месте гдето.
так шо каждая ву важна!

судоку кончается, реверси кончается, 3х+1 кончился, огр кончится через 2 недели, праймгрид челенж прошёл, может в марте соберёмся и до сотни попробуем рвануть?

Автор: Rilian Feb 3 2009, 23:14

Ниче-так популярность у проекта. 500 тыщ ВЮ кранчится за день. И потом месяц отдыха

Автор: (_KoDAk_) Feb 28 2009, 02:56

February 27, 2009 New Workunits in the evening (UTC) of February 28th

New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 200.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP in February, will start in the evening (UTC) of February 28th.

Автор: Death Feb 28 2009, 03:24

28.02.2009 3:16:42 boincsimap Message from server: (Project has no jobs available)

пока нету.
блин страшно смотреть как 200000 ву перемалывают за неделю.

зато такие графики прикольные на фришниках.





ах, да.

мы на 140-м. я включился.....

Автор: Rilian Feb 28 2009, 09:57

готовимся к 1 марта! Надо нагребать ВУ побольше

Автор: Rilian Mar 1 2009, 00:41

ПОЯВИЛИСЬ ВЮ! НАЛЕТАЙ!

советую остановить прием ВЮ в других проектах, увеличит кэш на неск дней, дождаться пока вам перепадет много ВЮ (это может занять неск часов так как ВЮ мало а компов много - конкуренция). Потом верните кэш обратно и активируйте другие проекты

Sun Mar 1 00:40:52 2009|boincsimap|Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 1462039 smile.gif seconds of work, reporting 0 completed tasks
Sun Mar 1 00:40:57 2009|boincsimap|Scheduler request succeeded: got 10 new tasks
Sun Mar 1 00:40:59 2009|boincsimap|Started download of 9030101.011171
Sun Mar 1 00:40:59 2009|boincsimap|Started download of 9030101.011172

Автор: Rilian Mar 1 2009, 01:08

В этот раз снова будет 600000 ВЮ и по моим прогнозам они закончатся завтра днем

каждая ВЮ считается по 52 мин на core2duo 2.1GHz

Автор: Death Mar 1 2009, 18:04

было 200к. уже кончились. ((
надеюсь хоть на 10 мест поднимемся...

Автор: Death Mar 1 2009, 18:20

ура! дают вухи.

нагребайте ПОБОЛЬШЕ!! 140-е место это сакс. потом ещё месяц работу ждать....

Автор: ReMMeR Mar 1 2009, 23:37

Хочу Симап ! smile.gif

Тольо такое выставил сразу пошло качать =)


Автор: Rilian Mar 1 2009, 23:58

У меня в кэше 60 штук = 50 часов smile.gif

Эти ВЮ в 2 раза дольше считаются чем прошлые, поэтому по новому прогнозу они закончатся завтра вечером. Следующие будут не раньше апреля

Автор: Rilian Mar 2 2009, 12:33

нагреб в кэш на 5 компах 300 ВЮ smile.gif

это примерно 6000 очков

Автор: Некто Mar 2 2009, 12:47

у мну в кэше 120 заданий

Автор: Rilian Mar 2 2009, 13:19

Мы поднялись аж на 139 место!

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=120

Автор: Rilian Mar 3 2009, 00:56

Осталось 50000 заданий и 100000 ВЮ. По прогнозам их разберут до 12 часов утра smile.gif

Автор: Death Mar 3 2009, 01:06

в кеше 17 штук по полтора часа.

поставил кеш 10 дней - нифига.

03.03.2009 1:03:40 boincsimap Message from server: No work sent
03.03.2009 1:03:40 boincsimap Message from server: (won't finish in time) BOINC runs 88.9% of time, computation enabled 99.9% of that

ХЗ

Некто, за сколько задание кранчится?

Автор: Rilian Mar 3 2009, 01:11

На core2duo 2.1 Ghz кранчится за час +- пара минут

На core2duo 2.66Ghz@2.85Ghz кранчится за 45 минут

ПС: осталось 75000 ВЮ. Думаю до утра разберут ... Слудующая пачка в апреле

Автор: Rilian Mar 3 2009, 13:29

Осталось очень мало ВЮ. Запасайте в кэш!

ПС: команда вышла на 138 место!

Автор: Rilian Mar 3 2009, 21:10

Итак, запущены все блоки ВЮ, что видно на странице batch monitor

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php

каждая ВЮ высылается 2 раза, итого в сумме будет 1030000 ВЮ, в среднем на 55 минут рассчетов. Уже отправлено ( http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/server_status.php ) 630000 ВЮ, осталось 400000 штук. 13000 активных компов посчитают (или скачают) это примерно за 30 часов, то есть до середины 5 марта

smile.gif

Автор: Death Mar 4 2009, 11:25

да, что-то медленно поднимаемся (((

Автор: Rilian Mar 4 2009, 23:12

Тем временем мы вышли на 136 место!

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=120

Автор: Rilian Mar 4 2009, 23:46

ВЮ отбираютс со скоростью 1000 в 20 минут.

Осталось около 190000

Автор: Death Mar 4 2009, 23:58

04.03.2009 23:43:05 boincsimap Requesting new tasks
04.03.2009 23:43:10 boincsimap Scheduler request completed: got 0 new tasks
04.03.2009 23:43:10 boincsimap Message from server: No work sent
04.03.2009 23:43:10 boincsimap Message from server: (reached per-CPU limit of 30 tasks)
04.03.2009 23:43:10 boincsimap Message from server: (Project has no jobs available)

Автор: Rilian Mar 5 2009, 00:00

Да, лимит 30 ВЮ на ядро, а также 200 ВЮ в день на комп

Автор: Rilian Mar 5 2009, 10:15

Осталось 105000 ВЮ (идет 8я тысяча заданий с кворумом 2 http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/batchmonitor.php)

Команда уже на 135 месте!

Автор: Rilian Mar 5 2009, 18:06

Пошла последняя пачка заданий!

Осталось 56000 ВЮ! Запасайте кэши



http://distributed.org.ua/index.php?go=distribredir&url=http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=120&go=distribredir

Автор: Death Mar 5 2009, 22:53

щас раздаются одни ххмеры. на 2 часа с копейками.

Автор: Rilian Mar 5 2009, 23:01

зато за них дают по 29 очков

осталось 22000 ВЮ на сервере

Автор: Rilian Mar 6 2009, 00:23

Осталось 12000 ВЮ. Через 2 часа закончатся

БТВ, мы уже на 132 месте!

Автор: Некто Mar 6 2009, 10:42

(Death @ Mar 5 2009, 22:53) *

щас раздаются одни ххмеры. на 2 часа с копейками.

на 45 минут :-P

Автор: Rilian Mar 6 2009, 12:35

ВЮ закончились, считаем кэши...

Между тем команда поднялась на 129 место! Спасибо Nekto за мегасливы!

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=120

Думаю на кэшах есть шанс вытянуть примерно 126 место!

Автор: Rilian Mar 6 2009, 22:22

Уже 127 место!

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=120

У меня в кэше еще на пару тысяч очков

Автор: Death Mar 7 2009, 17:49

у меня 15 заданий. двое суток. мож ещё что свалится.....

Автор: Rilian Mar 7 2009, 18:24

Ого, у нас уже 123 место!

Автор: Rilian Mar 8 2009, 23:04

Начинают появляться ВЮ которые высылаются заново из-за дедлайна! flowers.png

Автор: Rilian Mar 11 2009, 23:20

122 место!

в апреле надо постараться и зайти в топ-100. Это риальне!

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=120

Автор: Rilian Mar 31 2009, 17:44

налетай, разбирай. ftopku.gif ves001.gif

Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 260.000 new sequences from public databases imported in March 2009.
After these calculations are finished, next workunits are expected around May 1st.


есть 260000 заданий, что составляет 520000 ВЮ HMMER

Автор: Death Mar 31 2009, 19:02

31.03.2009 19:57:18 boincsimap Sending scheduler request: Requested by user.
31.03.2009 19:57:18 boincsimap Requesting new tasks
31.03.2009 19:57:24 boincsimap Scheduler request completed: got 0 new tasks
31.03.2009 19:57:24 boincsimap Message from server: (Project has no jobs available)


Work and Results
WORKUNITS Approximate #
in database 9,831
with canonical result 14
waiting for validation 0
waiting for assimilation 0
waiting for deletion 0
RESULTS Approximate #
in database 19,727
unsent 0
in progress 19,024
waiting for deletion 0
deleted 30
valid 28
Oldest Unsent Result no results left

Автор: Rilian Mar 31 2009, 19:03

я уже 1 посчитал

Автор: (_KoDAk_) Mar 31 2009, 22:58

ну утро покажет

Автор: (_KoDAk_) Apr 1 2009, 01:05

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/workunit.php?wuid=534177
я посчитал за 2,066.06
а claimed credit 15.23
granted credit 18.62
а кто-то за 2,709.48
а claimed credit 12.31
granted credit 18.62
вот .......

Автор: Rilian Apr 1 2009, 01:13

Там в рассчетном ядре скорее всего есть свой маленький бенчмарк, и очки выставляются по нему

Автор: Tamagoch Apr 1 2009, 06:33

понравилось имя процесса на х64:
simap_5.10_windows_x86_64*32
fool.gif

Автор: (_KoDAk_) Apr 1 2009, 13:31

ну толи прогнали и не тем скомпилировали толи решили обмануть боинк менеджер вот и все

Автор: Rilian Apr 1 2009, 13:58

Имя со звездочкой? Такого не бывает

Автор: (_KoDAk_) Apr 1 2009, 14:08

имя как имя, а звездоска дописывается в диппетчере --индицирует в каком режиме работает процесс
т.е. simap_5.10_windows_x86_64 но все равно пашет в 32 бит режиме (

Автор: Rilian Apr 1 2009, 20:52

Чего такая низкая активность? http://stat.polarseti.ru/index.php?t=11&p=42

Автор: Death Apr 1 2009, 21:29

на работе набрал 10 штук в кеш, а дома висит астропульс ещё 90 часов щитать. не хочет у симапа просить ничего, даже на 10 дней.

Автор: Rilian Apr 1 2009, 21:33

а ты суспендь проект и ВЮ и кэш поставь на 9.99 smile.gif

Автор: (_KoDAk_) Apr 1 2009, 22:01

не знаю мне заданий наваливает и наваливает

Автор: Rilian Apr 1 2009, 22:54

На сайте осталось около 210000 заданий, каждое на ~1 час

Автор: Rilian Apr 2 2009, 11:33

Осталось около 30000 ВЮ

Автор: Rilian Apr 30 2009, 08:57

Calculation of SIMAP updates is starting soon.
The calculation of new simap workunits containing new sequences from public databases imported in April 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start in the evening (UTC) of April 30th.

не забудьте подключиться к SIMAP сегодня вечером!

Автор: Death Apr 30 2009, 10:08

пилят. а как жы челенж??????
после чела - обязательно!

Автор: Rilian May 1 2009, 09:11

Project status
Calculation of SIMAP updates is currently running.
The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 200.000 new sequences from public databases imported in April 2009.
After these calculations are finished, next workunits are expected around June 1st.

Автор: Tamagoch May 1 2009, 10:13

вот тут-то тупость боинковского шедулера сработала по уму blink.gif
иначе я бы сейчас пришел домой и вместо челленджа считался бы симап...

надеюсь, успею подцепить задания на нескольких машинках

Автор: Tamagoch May 2 2009, 17:22


а где ж задания? все что ли? sad.gif


Автор: Rilian May 2 2009, 19:44

QUOTE(Tamagoch @ May 2 2009, 18:22) *

а где ж задания? все что ли? sad.gif

200000 заданий обычно разбирается за 1 день. В марте было 500000 заданий - они были разобраны за 3 дня

Автор: Tamagoch May 3 2009, 08:38

показалось странным, что в апреле я успел сделать 1000 очков одной машиной, а в мае только 700 тремя (!)

Автор: Rilian May 3 2009, 09:46

За задания дают столько же очков сколько и всегда. Подожди пока все валидируется.

Автор: Death May 3 2009, 21:06

реально 1 ву успел скачать. прайм чел блин.

Автор: Rilian May 4 2009, 20:09

http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=100

Ukraine 114

Автор: Rilian May 6 2009, 17:57

Досчитал свои кэши

Командные результаты:

http://stat.polarseti.ru/index.php?t=11&p=42

Автор: Death May 26 2009, 15:43

The calculation of new simap workunits containing the novel proteins from May 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start around June 1st. ;-)

надо хоть в сотню войти...

Автор: (_KoDAk_) May 27 2009, 17:25

а для этого нужно +100к (

Автор: Rilian May 27 2009, 17:29

Если хотя бы 5-10 человек будут считать, то 100к можно набрать за пару месяцев без проблем. Посл две раздачи считали вообще единицы из команды

Автор: (_KoDAk_) May 27 2009, 17:43

ну я +10к и тебе +10к как минимум ) а вот остальное ...

Автор: Death May 27 2009, 21:45

шо уже дают????

Автор: (_KoDAk_) May 27 2009, 22:09

ну с первого числа вроде как вот мы обсуждаем кто будет что читать

Автор: Rilian May 27 2009, 22:42

Проводим опрос. Кто честно загрузит по 30 ВЮ на ядро и покранчит?

Автор: Tamagoch May 28 2009, 10:14

Rilian,
как их загрузить по 30?
я в последнюю раздачу пытался, почему-то сервак зажал юниты, вообще как-то вяло выдавал sad.gif
а когда я уехал на день, так вообще проект мимо меня прошел...

Автор: Rilian May 28 2009, 10:20

ставь кэш на 2 дня, и приоритет симапа 1000. Постепенно наберет полный кэш

Автор: Death May 28 2009, 11:48

я буду полюбому.

комп дома сделал, правда 75 градусов сцуко.....

Автор: Rilian May 28 2009, 12:24

уже трое...

Автор: ReMMeR May 28 2009, 12:41

У меня Симап всегда на прием стоит.

Автор: Burzum Jun 1 2009, 19:08

До змагання в праймгріді залишилось ще достатньо часу, можна порахувати сімап. Роздають нову пачку, таримось!

упд. Мені вдалось зловити лише 1 завдання.. (( Хтось зміг більше качнути?

упд2. Нєфть пашла!!

Автор: Tamagoch Jun 1 2009, 20:33

туговато.... никак не могу кэши наполнить, боялся, что снова проспал.... приехал только недавно sad.gif
одна машина через час останется без работы, если ничего не будет

Автор: Tamagoch Jun 3 2009, 08:44

заданий что ли больше, чем обычно... до сих пор кэши заполнены - успеть бы до челленджа в прайме smile.gif

Автор: Death Jun 3 2009, 10:24

до 11 числа успеем.

Автор: Rilian Jun 3 2009, 16:12

Блин, я пока перевел все на IBERCIVIS. Догоню в Июле

Автор: Tamagoch Jun 6 2009, 11:38

все, задания кончились
досчитываем кэши и атакуем следующий проект на очереди

кажется эта пачка заданий была самой большой...

Автор: Death Jun 6 2009, 19:52

Weekly Rank Change : +7
Monthly Rank Change : +7

Opportunities
Rank Team Score Average Daily Gain Days to Overtake
106 Mesa State College 463,007 497 4,275 3.36
104 teamboinc 468,367 0 4,771 4.14
105 SwissTeam.NET 466,542 1,296 3,475 5.15
103 bahndamm.net-simap_club 471,134 562 4,210 5.35
102 Tempus 484,752 45 4,726 7.64
101 FadBeens 493,592 417 4,355 10.32

у меня кеша ещё на два дня. ну может лут ещё какой попадётся..

Автор: re_SET Jun 8 2009, 18:34

Все! У меня кеш на двух машинах полностью досчитался!

Автор: Tamagoch Jul 1 2009, 21:54

не понял... это что, в этом месяце всего 5 тыщ юнитов и уже все расхватали??? sad.gif((

Автор: Death Jul 1 2009, 23:49

RESULTS Approximate #
in database 24,630
unsent 0
in progress 23,665

шото я провтыкал

Автор: (_KoDAk_) Jul 5 2009, 21:33

уже закончились(

Автор: Rilian Jul 29 2009, 10:42

Мы сейчас на 101 месте

прогревайте процессоры и запасайтесь ВЮшками 1-го числа! koc.gif

Автор: Rilian Jul 31 2009, 12:07

Calculation of SIMAP updates is starting soon.
The calculation of new simap workunits containing new sequences from public databases imported in July 2009 (simap app) and their domains (hmmer app) will start in the evening (UTC) of July 31st.

Присоединяйтесь! Давайте наконец выведем команду в первую сотню! koc.gif koc.gif koc.gif worthy.gif

Автор: Tamagoch Jul 31 2009, 18:58

я буду, только эта неопределенность "когда-то вечером" - опять наберу заданий только к утру...

Автор: Death Aug 1 2009, 12:24

загрёб штук 30

Автор: Tamagoch Aug 1 2009, 21:13

по 30 на проц дают, пока хватает

Автор: Rilian Aug 2 2009, 20:57

Мы на 98 месте. Ура!

Автор: Rilian Aug 4 2009, 11:05

Хорошо посчитали в этом месяце!

Вышли на 93 место (и это еще не предел)
http://boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=simap&st=0

По скорости в этом месяце мы на 24 месте!
http://boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=simap&co=&st=0&or=12

koc.gif dk.gif

Автор: Burzum Aug 24 2009, 21:23

Якось ні з того, ні з сього автоматом закачалось кілька завдань. Спробував ще накачати - не вийшло. Зайшов на сайт, а там написано:

New Workunits of a new SIMAP dataset available
August 24, 2009
New Workunits: Approx. 200.000 new workunits are that calculate the similarities of domain superfamilies. This dataset has been prepared in co-operation with the Gene3D team and initiates a novel aspect of SIMAP. If the test using the current approx. 200.000 workunits will be successful, we will maintain this dataset as part of SIMAP. It will be used to construct new versions of the Gene3D database.

Ловіть, може зловите!

Автор: Algon Aug 25 2009, 16:48

У меня 4 машины нормально получили задания, трудятся...

Автор: (_KoDAk_) Aug 28 2009, 18:57

New Workunits by August 28
August 28, 2009
New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 100.000 new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP until the end of July, has been started.


Автор: Burzum Jan 8 2010, 14:43

Нарешті, після довгої перерви з"явились завдання. Налітай!

Автор: Tamagoch Jan 8 2010, 16:03

замало завдань цього місяця, вже усі роздали мабуть...

Автор: mzhelo Jan 31 2010, 10:20

Появились новые задания.
Негайно до праці.

Автор: Burzum Feb 2 2010, 01:40

(mzhelo @ Jan 31 2010, 10:20) *

Появились новые задания.
Негайно до праці.

гоп! ...себто, up

Автор: Tamagoch Feb 3 2010, 09:29

на этот раз заданий много, несколько этапов вычислений - на недельку должно хватить smile.gif

Автор: Tamagoch Feb 7 2010, 09:12

мы уже на 65-м месте! (можно обновить шапку)
обошли каталонцев и DPC, на горизонте Russia Team
однако ВМС США нас скорее всего нагонит, если никто из наших не подключится
почему в этом году так пассивно в команде с симапом? sad.gif

Автор: Tamagoch Feb 10 2010, 09:49

нужна одна-две машины, чтобы не дать http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=60! хелп!

Автор: EKONOMIST Feb 10 2010, 10:33

Могу одну подрубить на недельку или до 10к

Автор: mzhelo Feb 10 2010, 21:31

(Tamagoch @ Feb 10 2010, 09:49) *

нужна одна-две машины, чтобы не дать http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/top_teams.php?sort_by=total_credit&offset=60! хелп!

Это не морпехи, не путайте. US Navy = Военно-морские силы США. Они бы, наверное, обиделись.
А Корпус морской пехоты (US Marines) тем более.

Автор: Tamagoch Feb 11 2010, 14:27

наверное, таки обиделись....
обошли нас sad.gif

Автор: Arbalet Mar 1 2010, 20:39

Новые задания появятся поздно вечером 1 марта

New Workunits: the calculation of similarities and features of new sequences, that were imported from protein databases into SIMAP until the end of February, will start in the evening (UTC) of March 1.

Автор: Death Mar 1 2010, 20:43

чьорт только на энигму нацелился....

Автор: Tamagoch Mar 2 2010, 06:46

всего в этом месяце пять этапов вычислений
первый - довольно маленькая пачка, уже разобрали
остальные, возможно, затянутся на недельку-полторы, как в прошлый раз
считайте с нами!

Автор: mzhelo Mar 31 2010, 23:42

telephone.gif К оружию amo006.gif , появились задания!

Автор: Tamagoch Apr 1 2010, 06:27

по 20 очков за штуку, считается на разогнанном АМД менее получаса

Автор: Rilian Apr 30 2010, 11:46

2010-04-30: New Workunits: the calculation of similarities and features of approx. 250,000 new sequences, that were imported from protein databases and metagenomes into SIMAP until the end of April, will start in the evening (UTC) of April 30.

Новые задания сегодня вечером! Налетай! Пачка заданий ориентировочно на 2 дня или меньше

Автор: Tamagoch Apr 30 2010, 15:23

в последнее время заданий больше
помогите посчитать, чтобы успеть к началу Пентатлона!

Автор: Death Apr 30 2010, 16:24

на работе не могу. админ за траф ругается.
а дома таки да.

Автор: Arbalet Apr 30 2010, 18:14

Завсегда и с удовольствием считаю жирные вюхи simap помогаю наполнять новыми аминокислотными последовательностями эту общественную базу белков. smile.gif

Автор: Arbalet May 1 2010, 00:04

Пошла раздача заданий

Автор: mzhelo Jun 1 2010, 23:04

Подключайтесь, есть задания.

Автор: Arbalet Jun 2 2010, 21:45

Как-то не слишком много заданий нынче раздают на одну машину.

Автор: re_SET Jun 2 2010, 22:04

(Arbalet @ Jun 2 2010, 22:45) *

Как-то не слишком много заданий нынче раздают на одну машину.


Ну почему же, как всегда, 30 заданий на ядро закачивает...

Автор: Arbalet Jun 2 2010, 22:26

(re_SET @ Jun 2 2010, 23:04) *

Ну почему же, как всегда, 30 заданий на ядро закачивает...

Ага, потихоньку выправилось, а было:
02.06.2010 18:23:01 boincsimap Message from server: (reached daily quota of 22 tasks)

Автор: re_SET Jul 1 2010, 21:28

Подключаемся, есть задания! koc.gif koc.gif koc.gif

Автор: Tamagoch Jul 4 2010, 11:44

похоже, на этот раз заданий будет очень много
запущено исследование каких-то "метагеномов", на данный момент считаются только 2 стадии из 10-ти

помогайте! wink.gif

Автор: ReMMeR Jul 7 2010, 10:22

Реквестирую создание коммандного аккаунта distributed.org.ua, и инструкцию в шапку как подрубиться по слабому ключу на коммандный аккаунт.

Автор: re_SET Jul 10 2010, 01:40

К концу пачки будет на 48 месте! koc.gif

Автор: re_SET Jul 11 2010, 12:12

Итак, я нас всех поздравляю. Вчера утром вышли на 50-е командное место, а сегодня - мы уже на 48-м! cool2.gif В основном благодаря Tamagoch, который выдает 50% командного ППД! punk.gif.

Предлагаю накинуться всем и разобрать пачку до конца. заданий немного осталось уже.

Автор: Arbalet Jul 27 2010, 22:59

Да когда уже эта мегапачка то кончится?! thinklamo.gif

Автор: Zmey Jul 27 2010, 23:14

angry2.gif
а что случилось ?
почему минуса ?

Автор: ReMMeR Jul 27 2010, 23:20

минус 50к у меня.

Автор: Zmey Jul 27 2010, 23:29

после такого руки опускаются
кто ваще будет считать suicide.gif

Автор: Rilian Jul 27 2010, 23:47

Думаю какие-то проблемы с базой из-за большой пачки ВЮ. Не помню чтобы раньше в СИМАПе такое было, поэтому не могу сказать доначислят очки или нет

Автор: Arbalet Jul 28 2010, 00:13

Какие минуса? У меня как было пару-тройку часов назад 95 тыщ с хвостиком, столько и осталось. Может просто не заметил качель.

Короче, отставить паниковать, господа кранчеры! Это же немецкий проект, надежный как PzKpfw V, ферштейн? rtfm.gif

Автор: re_SET Jul 28 2010, 10:47

Да у меня вчера тоже сняли 65к, хотя если смотреть на офсайте, все ровно. Сегодня уже все вернули. Так что скорее всего это обычная просадка в стате.

Автор: Tamagoch Jul 28 2010, 11:08

еще не досчитали пачку, скоро новая пойдет smile.gif

Автор: ReMMeR Jul 28 2010, 20:01

Как видно по графику, вернули.

Автор: Arbalet Aug 21 2010, 02:03

Мегараздача "метагеномных" юнитов продолжится до конца августа, да и в сентябре подобные задания ожидаются - в плановом порядке. koc.gif swoon.gif

Автор: Tamagoch Aug 21 2010, 08:26

уже считаем первую пачку из трех wink.gif

Автор: Tamagoch Aug 24 2010, 07:46

даааа.... smile.gif

10081502 Similarities of new sequences from metagenomes, part 1/3
10081503 Similarities of new sequences from metagenomes, part 2/3
10081505 Similarities of new sequences from metagenomes, part 3/6

считать и считать...
проект становится регулярным, а не эпизодическим - "спасибо" "метагеномам"

Автор: nikelong Sep 6 2010, 23:11

2010-09-05: SIMAP - New workunits in September
In September we will crunch three series of workunits: parts 5 and 6 of the large series containing sequences from new metagenomes imported in July/August. Thereafter approx. 300,000 workunits containing new regular sequences imported in August will be calculated. Finally, there will be the very last 500,000 workunits containing sequences from new metagenomes imported in July/August. Altogether we expect to have work for about 3 weeks in September.

Автор: Tamagoch Sep 7 2010, 08:49

да, плотно я на симапе сижу и буду сидеть до конца месяца видимо
кстати, владельцам АМД советую - мой 2.8 ГГц Х2 "делает" в симапе кор2дуо 3.0 ГГц blink.gif

Автор: Rilian Sep 7 2010, 18:14

Помогу с СИМАПом в этом месяце

Автор: nikelong Dec 6 2010, 01:05

Внимание внимание! Аттэншин м просто АХТУНГ!

The renewed project will move to the new project URL

http://boincsimap.org/boincsimap

on Mon, Dec 6 approx. 6 p.m. UTC.
Thereafter, new work will be available for about 2..3 months.

After the project has changed its URL, please disconnect and reconnect your boinc client to the new URL. Sorry for this - this URL change to the new (institution independent) domain will remain an once-in-the-lifetime event for BOINCSIMAP.

Best regards and thanks for your support
http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/forum_thread.php?id=32

koc.gif

пс: Нике. никогда не выделяй УРЛ кавычками. Моветон

Автор: Tamagoch Dec 15 2010, 07:18

это что, моя неподконтрольная ферма перестанет скоро считать симап? sad.gif
а тут как раз метагеномы "нагадили" 1 млн. ВЮ ... и это только 1/7 vis.gif

Автор: re_SET Dec 15 2010, 12:56

(Tamagoch @ Dec 15 2010, 07:18) *

это что, моя неподконтрольная ферма перестанет скоро считать симап? sad.gif
а тут как раз метагеномы "нагадили" 1 млн. ВЮ ... и это только 1/7 vis.gif


Должны считаться, я так понял, там редирект сбацали, во всяком случае, у меня считает..

Автор: mzhelo Dec 26 2010, 14:56

Парни! А Кто таки капитан в этом проекте? telephone.gif
Капитан, измените http://boincsimap.org/boincsimap/team_display.php?teamid=212, пожалуйста. rtfm.gif

Автор: re_SET Dec 26 2010, 16:00

(mzhelo @ Dec 26 2010, 14:56) *

Парни! А Кто таки капитан в этом проекте? telephone.gif
Капитан, измените http://boincsimap.org/boincsimap/team_display.php?teamid=212, пожалуйста. rtfm.gif


О, правильно, я уже месяц собираюсь написать, да все как=то влом... Рильян, измени до 25 места цель... До конца 2011 дойдем..

Автор: Rilian Dec 27 2010, 00:36

Изменил на 25

Автор: re_SET Jan 13 2011, 13:44

Народ!! Помогите кто-нибудь! Заданий накидало - жуть! А нас тут мало ((

Автор: Death Jan 13 2011, 18:03

я 100% тут

Автор: Buck Jan 13 2011, 18:07

Подключил и себе его...

Автор: Tamagoch Jan 13 2011, 18:41

моя ферма кажется сдохла...
пока подключил все что есть + феном на 6 ядер, больше нету sad.gif

Автор: re_SET Jan 13 2011, 20:39

(Tamagoch @ Jan 13 2011, 18:41) *

моя ферма кажется сдохла...
пока подключил все что есть + феном на 6 ядер, больше нету sad.gif


Спасибо, Дима!

Автор: Death Jan 14 2011, 11:55

какой до конца 2011?

месяц.

Opportunities
Rank Team Score Average Daily Gain Days to Overtake
28 The Final Front Ear 7,139,569 18,324 15,169 5.03
27 Team-SciFi 7,300,905 9,599 23,894 9.95
26 The Knights Who Say Ni! 7,544,864 12,440 21,053 22.88
25 CANAL@Boinc 7,836,129 11,090 22,402 34.50
24 BAVARIA-UNITED 7,995,751 24,137 9,355 99.68

а если поднажать то и быстрее.

Автор: Buck Jan 14 2011, 12:07

Подключил 3 ядра, вечером перекину сюда ещё 8-мь

Автор: re_SET Jan 17 2011, 22:47

Итак, 28-е место по очкам, с чем нас всех и поздравляю koc.gif cool2.gif
По серднесуточным сливам уже 15-е! Жаль на одном кваде инет ушел ((

Автор: Buck Jan 18 2011, 11:32

Считаю 14-ю ядрами + время от времени ещё 8 включаю (сейчас от большого тазика инет отвалился)

Автор: mzhelo Jan 18 2011, 12:07

Подскажите, если кто знает, будет ли прирост ППД в этом проекте за счет перехода с 32-х биного линукса на 64-х битный?

Автор: re_SET Jan 18 2011, 23:17

(mzhelo @ Jan 18 2011, 12:07) *

Подскажите, если кто знает, будет ли прирост ППД в этом проекте за счет перехода с 32-х биного линукса на 64-х битный?


Не скажу... У меня виндовые клиенты

Знаю только что на АМД-шных процыках щустрее бегает )))

Автор: Buck Jan 19 2011, 13:17

За 5ть дней вошёл в топ 20-ку в комманде smile.gif

Автор: re_SET Jan 19 2011, 13:40

(Buck @ Jan 19 2011, 13:17) *

За 5ть дней вошёл в топ 20-ку в комманде smile.gif

dance.gif cool2.gif punk.gif koc.gif

Автор: Rilian Jan 22 2011, 11:47

Project status: running
Hosts active: 12,209
Work distributed: 40 %
Remaining: 62 days

Автор: re_SET Jan 22 2011, 15:25

И мы уже на 27 командном месте по очках, и 14-е по суточным сдивам! amo006.gif koc.gif

Автор: Rilian Jan 25 2011, 17:52

QUOTE
Project URL changed and new work starting
We have now changed the project URL. Please reattach to the project using the new URL http://boincsimap.org/boincsimap.

The new workunit batches will appear in the batchmonitor during the next weeks. We will calculate the sequence similarities and domains of about 400.000 new sequences imported until Dec 5, plus about 20 million new sequences from metagenomes to be imported in December. In total we expect work for 2..3 months. The estimate for progress and remaining work can be seen directly on the project web pages and will be updated automatically in the future.

We hope that you like the refurbished web pages. If you have any ideas for improvement, please post them in the forum.

Thanks for your support,
best regards
Thomas 6 Dec 2010 18:17:33 UTC ·


импортировали какую-то огромную базу данных для обработки, работы хватит на 3 месяца

по текущему состоянию,

Project status: running
Hosts active: 12,209
Work distributed: 43 %
Remaining: 58 days

Автор: re_SET Jan 25 2011, 21:50

Rilian, Мы ее уже месяц считаем! Присоединяйтесь!

Автор: Rilian Feb 6 2011, 13:24

Project status: running
Hosts active: 11,735
Work distributed: 52 %
Remaining: 58 days

koc.gif

Автор: Rilian Mar 31 2011, 15:59

SIMAP: Last workunit series before returning to periodic work

2011-03-30: The tremendous update of millions of new environmental sequences is almost finished. Thanks to all users for crunching these many workunits. We will now calculate the new sequences from protein databases available until end of March, to generate the April 2011 release of SIMAP. After these workunits we will return to the periodic operation of BOINCSIMAP, having new workunits only in the beginning of every month. Best, Thomas

Автор: re_SET Apr 12 2011, 10:39

Накранчили 10 лямов в проекте! cool2.gif dance.gif

Текущая цель на 2011 год (25 место) - Выполнено! (24) punk.gif yahoo.gif


Текущий статус проекта:

Hosts active: 10,943
Work distributed: 89 %
Remaining: 17 days

Досчитываем последние большие пачки, после чего переходим к привычным http://boincsimap.org/boincsimap/forum_thread.php?id=36 (выдача небольших порций заданий вначале каждого месяца)

koc.gif koc.gif koc.gif

Автор: Death Apr 12 2011, 10:44

надеюсь учёным это поможет )))

Кстати, кто хочет может себе скачать базу симапа

http://fileshare.csb.univie.ac.at/simap/


Index of /simap

Name Last modified Size Description
Parent Directory -
blast2go.gz 14-Mar-2011 21:34 346M
environmental/ 14-Mar-2011 21:34 -
features_BlastProDom.gz 14-Mar-2011 09:18 9.5M
features_Coil.gz 14-Mar-2011 19:59 57M
features_FPrintScan.gz 14-Mar-2011 09:28 132M
features_Gene3D.gz 14-Mar-2011 19:56 421M
features_HAMAP.gz 14-Mar-2011 21:17 29M
features_HMMPIR.gz 14-Mar-2011 18:40 24M
features_HMMPanther.gz 14-Mar-2011 16:10 337M
features_HMMPfam.gz 14-Mar-2011 18:39 494M
features_HMMSmart.gz 14-Mar-2011 18:49 145M
features_HMMTigr.gz 14-Mar-2011 18:53 89M
features_PatternScan.gz 14-Mar-2011 19:09 96M
features_ProfileScan.gz 14-Mar-2011 19:03 178M
features_Seg.gz 14-Mar-2011 21:16 348M
features_SignalP.gz 14-Mar-2011 20:14 243M
features_TMHMM.gz 14-Mar-2011 20:49 165M
features_TargetP.gz 14-Mar-2011 20:37 310M
features_superfamily.gz 14-Mar-2011 19:32 405M
proteins.gz 14-Mar-2011 09:18 941M
readme.txt 05-Dec-2010 16:34 1.9K
sequences.gz 14-Mar-2011 09:14 2.5G

мало ли, зачем такое в хозяйстве может пригодиться...

Автор: Rilian Aug 17 2011, 15:54

2011-08-17: Due to regular construction work the power in one of our server rooms will be completely shut down on Aug 24 and 25. This will also affect the BOINC database and web servers. We will therefore shut down the entire BOINC project from Aug 24, approx. 10 a.m. to Aug 25, approx. 3 p.m. During this time BOINCSIMAP will not be available at all. We apologize for this outage and will keep the downtime as short as possible. Best regards, Thomas

Проект будет выключен 24 И 25 августа 2011 всвязи со строительными работами в их серверной комнате

Автор: Володимир Nov 1 2011, 12:17

Є завданняexcl.gif
Нас всі обходять sad.gif - Налітай!

Автор: re_SET Nov 1 2011, 13:13

(Володимир @ Nov 1 2011, 12:17) *

Є завданняexcl.gif
Нас всі обходять sad.gif - Налітай!


Ще вчора налетів )))

Автор: DarkWater Nov 2 2011, 15:13

Ребята, я с вами. wink.gif
Вошел в статистику.

Автор: re_SET Nov 3 2011, 10:15

(DarkWater @ Nov 2 2011, 15:13) *

Ребята, я с вами. wink.gif
Вошел в статистику.

cool2.gif koc.gif

Автор: Salmonella Dec 6 2011, 09:47

Кто-то, где-то здесь спрашивал про диабет. Премьер-министр Баварии Хорст Зеехофер, открывает Diabetes Research Department в Helmholtz Zentrum München вместе с техническим университетом Мюнхена (TUM). А TUM в партнёрах у SIMAP. Это конечно, практически мало что значит, но так вокруг, да около. smile.gif
http://www.helmholtz-muenchen.de/en/press-and-media/press-releases/press-releases-2011/press-releases-2011-detail/article/15504/index.html

Автор: Rilian Feb 1 2012, 18:05

2012-02-01: With the new server software release installed in the end of January we experienced that many more workunits are sent to the hosts as usual. We are currently investigating this, seems that the project contiguration settings are differently interpreted by the new software. To avoid total overload of hosts by SIMAP results, we have reduced the daily maximal number of results per host to 300. We will check and adapt this limit during the next days continuously. Best regards Thomas

с этого дня на хост выдадут не более 300 ВЮх

Автор: Death Feb 1 2012, 20:46

...ежедневно.

Автор: Bel Apr 3 2012, 11:56

Задания за апрель посчитаны, новые вю ожидаются с 1 мая.

Автор: Rilian Jun 1 2012, 10:56

http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=5675 и рекомендован к кранчингу на полных мощностях с 00:00 1 Июня 2012 по 23:59 7 Июня 2012

Автор: corsar83 Jun 1 2012, 11:13

Затаривайтесь заданиями на весь период, а то могут вдруг резко закончится

Автор: Rilian Jun 1 2012, 11:21

Лучшему участнику будет приз (на никелонговке в октябре) smile.gif

Автор: smilesvua Jun 1 2012, 11:32

Потихоньку включаюсь

Автор: LSA Jun 1 2012, 11:45

запряг двухголового. ввечері ще добавлю 4.

Автор: x3mEn Jun 1 2012, 12:05

Мені нема сенсу включатися, я на відстані 3 завдань від 10К і +1 Trigggls

Автор: ternolex Jun 1 2012, 12:45

Почесав поки на стаціонарному і на ноуті!

Автор: nikelong Jun 1 2012, 12:50

Делаем чекпойнт: В данный ммент команда на 31-м месте. И на 16 - по ППД.

http://stat.polarseti.ru/index.php?t=11&p=42

Автор: Rilian Jun 1 2012, 12:55

x3mEn, тебе дать вик кей ?

Автор: netphil Jun 1 2012, 17:53

народ что то я не понял....почему нет Join Team ????
http://boincsimap.org/boincsimap/team_display.php?teamid=212

Или там уже кранчеров не нужно....?

Автор: Володимир Jun 1 2012, 18:27

Таке буває якшо не залогівся - або залогівся, але не поставив галочку навпрти "Stay Logged In"
http://boincsimap.org/boincsimap/login_form.php?next_url=home.php
Зологися, і тоді йдди на сторінку команди.

Автор: treestar Jun 1 2012, 19:29

Я тоже кинул все 8 своих ядер. Чем смогу, помогу.

Автор: plotnik Jun 1 2012, 20:07

Ну,и чё я буду делать с другими заданиями?! В рассылку бросили мне только сегодня.По дедлайну-4.06 на все остальное,и так хорошо идет!Пришло задание на 36 минут,не знаю,чё и делать,блин. angry2.gif

Автор: Rilian Jun 1 2012, 20:24

plotnik, не переживай

пусть БОИНК разрулит приоритет smile.gif

пс: в каком проекте у тебя задания с дедлайном 4 июня ? Если они не начаты, и в проекте много заданий, то можешь их выделить и нажать Аборт

Автор: varador Jun 1 2012, 20:47

все запустился, но вот беда - хотел погнать проц с 3,2 до 3,8 - 4,0 , повесил две видяхи на второй БП 850 Вт, чтоб разгрузить первый БП который питает систему +3 видяхи ,так тот на 850 вырубается и комп не проходит загрузку винды. Как такое может быть чтоб такой мощный БП не мог поднять только 2 х 5870? Что делать?

Автор: treestar Jun 1 2012, 21:05

varador, Ему может мало нагрузки по 5 вольтам. Поєтому он и уходит в защиту. Такие умные блоки питания сейчас. Я это говорю, потому, что занимаюсь ремонтом компов.

plotnik, Я тоже седня только получил рассылку. ждал пол дня, пока фолдинг досчитается. Потом подключился к суперкомпу biggrin.gif

Автор: plotnik Jun 1 2012, 21:08

Rilian.Тут надо внести ясность:ввиду слабой конфигурации(особенно видео),я выбирал проекты под цпу,а недавно подгрузил колатц,так для меня вообще красота-считаю и цпу и гпу одновременно.Вот и нападало -космологи до 4,и эйнштейн до 8,небольшие.но все-таки,а на симап приоритет поставил повыше,так что,чем богаты-тем и рады koc.gif

Автор: varador Jun 1 2012, 21:42

treestar, а как тогда быть, что сделать чтоб можна было повесить на него две видяхи и он норм работал?

Автор: treestar Jun 2 2012, 06:49

varador, надо мудрить какую-то нагрузку (с тех же лампочек автомобильных) на 5-ти вольтовый канал. По другому никак.

Автор: serymba Jun 2 2012, 08:59

QUOTE(treestar @ Jun 2 2012, 07:49) *

varador, надо мудрить какую-то нагрузку (с тех же лампочек автомобильных) на 5-ти вольтовый канал. По другому никак.

добавлю,надо не меньше 21Ват 12В(пробовал 10Ват нихрена 12В не поднялось)
варадор а ты как второй запускаешь?(кинул от мамы проводок?)

Автор: varador Jun 2 2012, 10:01

serymba, есть специальный шлейф для двух БП, купил за 8 у.о. Уточните - доп.нагрузка нужна на канал 5 В ? Куда и что тогда тыкать?

Автор: treestar Jun 2 2012, 10:29

varador, Да. Нагрузка нужна на 5-ти вольтовый канал.

Автор: Rilian Jun 2 2012, 10:41

Заданий много, думаю на неделю хватит. Там еще не роздано пол миллиона

http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php

Автор: serymba Jun 2 2012, 10:54

QUOTE(varador @ Jun 2 2012, 11:01) *

serymba, есть специальный шлейф для двух БП, купил за 8 у.о. Уточните - доп.нагрузка нужна на канал 5 В ? Куда и что тогда тыкать?

попробуй на него еще ченить повесить(ну может винт,привод)
вобщем нада нагрузить 5В,он без нагрузки жить не может

Автор: varador Jun 2 2012, 10:57

treestar, ясно. Тогда конкретно чего и куда воткнуть для создания этой нагрузки?

serymba, где этот канал 5В, и как и чего к нему подключить?

Автор: treestar Jun 2 2012, 11:07

varador, 5-ти вольтовый канал - это красный провод на четырехконтактном разъеме. serymba правильно советует. Попробуй навешай на него винтов. Ну а так, надо между красным и черным проводом цеплять нагрузку.

Автор: Rilian Jun 2 2012, 11:41

посты отсюда будут перенесены в форум "Железо"

Автор: varador Jun 2 2012, 12:23

Rilian, так же для дела хочу погнать проц на всю катушка, а БП не выдерживает, а второй "собака" никак норм пахать не хочет, вот и уточняю у знающих .

Автор: plotnik Jun 2 2012, 18:53

Rilian, Ниччё не понятно-заданий не приходит,а то вчерашнее-то ли посчиталось,то ли нет.
Подправил клиента-нападало десяток,благо короткие-макс.52 минуты.
Так что посчитаем!

Автор: Rilian Jun 2 2012, 19:53

QUOTE(plotnik @ Jun 2 2012, 19:53) *

Rilian, Ниччё не понятно-заданий не приходит,а то вчерашнее-то ли посчиталось,то ли нет.
Подправил клиента-нападало десяток,благо короткие-макс.52 минуты.
Так что посчитаем!

То что там http://boincsimap.org/boincsimap/server_status.php пишется ready to send 95000 заданий, так это не все что есть для этого месяца. Их постепенно загружают на сервер выдачи заданий

То есть как видно в batch monitor http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php всего аданий будет 884373 + 354666 + 1861 штук

Автор: plotnik Jun 3 2012, 17:11

Кстати, 3 ссылка ведет на место команд с 81-100,наша команда на 25.

Автор: Rilian Jun 6 2012, 14:59

Залишилось завдань на 4 години!

запасайтесь кешами

Computing status
Work #
Tasks ready to send 66,180

Автор: Death Jun 6 2012, 15:05

Opportunities
Rank Team Score Average Daily Gain Days to Overtake
24 Canada 13,686,835 6,984 84,935 4.29

Автор: Володимир Jun 6 2012, 15:38

Я от все дивлюся на Канаду, і думаю - "Встигнемо чи ні?" biggrin.gif koc.gif koc.gif koc.gif

Д.Р. Дез - ВІТАННЯ ! punk.gif aristokrat.gif dk.gif drinks2.gif drinks.gif

Автор: Rilian Jun 6 2012, 20:43

Project status: no work
Next work expected: around Jul 1

Computing status
Work #
Tasks ready to send 0
Tasks in progress 417,523

всім дякую smile.gif Дораховуємо кеши та побачимося через 3 тижня.

Пропоную не відключати проект - хай висить і чекає на завдання. Персонально попробую тут дорахувати до 1 МЛН

Автор: tiss Jun 7 2012, 19:12

Сайт симапа лёг. У меня посчитаные задания не отправляются... Кеш на основных компах оказался выставленным в 3 дня. Ещё полтыщи заданий есть...

Автор: UA_Lex Jun 7 2012, 19:21

Аналогично, жабы не отправляются, сервера лежат.

Автор: tiss Jun 8 2012, 16:40

Ожил проект. У меня в пендинге 31к очей висит. И ещё около 150 заданий считается...

Автор: Володимир Jun 8 2012, 17:31

Ооооо!
Нарешті можу вивантажити всі остаточні порахован завдання - з мене все biggrin.gif

Автор: re_SET Jun 8 2012, 19:14

Мои тоже в основном отгрузились ))

Автор: Володимир Jun 8 2012, 19:27

Як хто думає, оці останні завдання - достатньо шоб Канаду обійти, чи тільки трохи не вистачить? smile.gif

Автор: Death Jun 8 2012, 21:00

у меня ещё штук 40
если комп как обычно не зависнет

Автор: smilesvua Jun 8 2012, 22:08

Я начал выгребать запасы...больше сотни точно, возможно две.

Автор: Dromage Jun 8 2012, 22:19

А я свои остатки в СИМАПе солью только в понедельник утром )

Автор: Rilian Jun 8 2012, 22:27

у меня на ноуте еще штук 40 недокранчено

Автор: Andrey Fenchenko Jun 8 2012, 22:50

У меня на основном компе еще 267 заданий в работе.
Если бы не поломка материнки, то уже успел бы их обработать.

Автор: Rilian Jun 9 2012, 12:26

Мне перепало еще 20 заданий.

Итого недосчитано 64 шт

Автор: Andrey Fenchenko Jun 9 2012, 12:36

Rilian,
У меня 81 задание осталось, до вечера отдам их.
А есть смысл сейчас разрешать получение новых заданий? Будут они?

Автор: Rilian Jun 9 2012, 12:42

Andrey Fenchenko, они выдаются если кто-то не успел досчитать до дедлайна

Автор: re_SET Jun 9 2012, 12:51

(Andrey Fenchenko @ Jun 9 2012, 13:36) *

Rilian,
У меня 81 задание осталось, до вечера отдам их.
А есть смысл сейчас разрешать получение новых заданий? Будут они?


Новая пачка будет в начале следующего месяца. Сейчас досчитываем эту.

Автор: tiss Jul 2 2012, 10:32

Есть ВЮ!

Автор: Володимир Jul 2 2012, 11:38

Так - вже другий день!
тільки зараз помітив - приєднуюся smile.gif

налітай excl.gif koc.gif

Автор: Rilian Jul 30 2012, 16:53

Workunits for August upcoming
The workunits for the about 480.000 new protein sequences (for the August release of SIMAP) will be available from Mon, Jul 30 (morning). We estimate that the August batch will need about one week of work.

Best,
Thomas
28 Jul 2012

Автор: Death Jul 30 2012, 18:11

о! поставлю пока судоку на паузу

Автор: re_SET Jul 31 2012, 00:29

Переключился сюда

Автор: Bel Aug 18 2012, 23:24

"Мы начинаем интеграцию новых метагеномов, таких как Человека проекта микробиомом в SIMAP. Это требует дополнительных расчетов SIMAP в течение двух последовательных шагов расчета метагеномов. Мы начнем с серии работ единиц, которые будут нужны около 2 недель, чтобы вычислить. Другие серии будет сопровождаться регулярными частями работу в сентябре.

SIMAP workunits экологической последовательности метагенома и характеризуется коротким средней длины последовательности. Таким образом, более последовательностей хранятся в каждой работе устройства. Это приводит к увеличению времени вычислений, и, следовательно, более высокие кредитов за единицу работы, чем обычно.
"
-----------------------------
Новость за 14 августа. http://boincsimap.org/boincsimap/forum/viewtopic.php?f=45&t=1135
Есть вю. Статус проекта - активный! koc.gif

Автор: corsar83 Oct 2 2012, 09:40

Заданий немеряно amo006.gif

Автор: re_SET Oct 2 2012, 10:40

В теме. Чего и вам желаю. koc.gif

Автор: re_SET Oct 23 2012, 20:11

Запрашиваю помощьexcl.gif 12 дней расчетов осталось! Помогите в этом проекте поднять командуexcl.gif amo006.gif koc.gif koc.gif koc.gif

Автор: LSA Oct 23 2012, 20:22

підключу 16 ядер.

Автор: Death Oct 23 2012, 21:26

чой-то они в середине месяца заданий кинули?

Автор: re_SET Oct 23 2012, 22:29

(Death @ Oct 23 2012, 22:26) *

чой-то они в середине месяца заданий кинули?


С начала месяца считаем. Просто больше обычного накидали...

Автор: Bel Nov 2 2012, 20:44

Ещё докинули заданий за ноябрь!

Автор: LSA Nov 2 2012, 21:07

Поки я пас.

Автор: corsar83 Jan 28 2013, 23:19

Перевалил за 500 тыщ очей. Пойду чото другое уже посчитаю amo006.gif

Автор: Rilian May 5 2013, 15:18

Проект участвует в http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=5945

Из последних новостей:

SIMAP integrates the http://commonfund.nih.gov/hmp/. We are not alone: our body contains about as many microbial as human cells. Most of these microbes are concentrated in the intestinal tract. But microorganisms are also found on our skin and on many other locations of our body. These microbial are crucial for our health, as they support our organism and prevent us from infections by pathogens. Due to the high diversity of the human microbiome its biological and medical investigation has just started during the last years. Modern research technologies, such as DNA sequencing, play a key role in this research. Sequences, e.g. from healthy and sick patients or from different body locations, are analyzed by sophisticated computational methods. SIMAP supports the researchers studying the human microbiome by integrating the sequences from HMPDACC into its exhaustive similarity matrix. This will help to understand the evolution and function of the microbes living with us.

Автор: Rilian May 5 2013, 16:37

Project status: running
Hosts active: 10,868
Work distributed: 39 %
Remaining: 25 days

а еще с утра было 32 дня

пентатлон рулит!

Автор: Rilian May 5 2013, 19:20

Hi CharlesL,

indeed a GPU based SIMAP would be fine. The reason why it is not yet available is that the underlying FASTA algorithmus is only available for CPUs. There is no GPU implementation of http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA yet.

Alternative algorithms (Smith-Waterman) have been implemented on GPUs and show remarkable speedup there. For http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA it is not yet clear if we can expect any speedup from GPUs. It seems that during the database search phase, transfer of data between CPU and GPU might even slow down the search compared to CPU only. In this case only parts of the final alignment algorithm might go through the GPU. This needs to be investigated in detail and we have applied for funding to work on this topic. If the GPU-based implementation should be faster than CPU only, we will provide such an app here. We hope to finish our work on this later next year.

Best regards
Thomas

в конце 2013 обещают пояснить возможно ли ускорение алгоритма http://en.wikipedia.org/wiki/FASTA с помощью GPU

Автор: Morlock May 5 2013, 22:49

А в этом проекте участвует CPU или и видеосистема тоже?

Автор: CrazyBigCat May 6 2013, 03:41

(Morlock @ May 5 2013, 23:49) *

А в этом проекте участвует CPU или и видеосистема тоже?


В этом проекте задействован только CPU, видеокарты не используются...

Автор: Rilian May 22 2013, 13:14

Судя по статусу сервера http://boincsimap.org/boincsimap/ и http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php -- , в этом месяце работы еще на 38 дней

подключайтесь!

Автор: Rilian May 26 2013, 14:28

Недельное соревнование в СИМАПе

http://boincstats.com/en/bam/teamChallenge/detail/385

Автор: Rilian May 31 2013, 22:13

С 1 июня стартует 7-дневный CPU челендж

http://boincstats.com/en/stats/challenge/team/chat/385

цель челенджа - досчитать пачку метагеномов http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php koc.gif

Автор: Death Jun 3 2013, 12:53

извините у нас сети. хоть и гпу но всё же

Автор: Rilian Jun 3 2013, 18:54

Project status: running
Hosts active: 8,773
Work distributed: 69 %
Remaining: 27 days

Автор: Rilian Jun 7 2013, 09:51

Новые задания из майской пачки закончились

Начали выдавать задания из метагеномов!

Мой БОИНК показывает что метагеномы считаются в 5 раз дольше

сейчас выдаются таски из ВЮ номер 620_000, а всего в метагеномах 1_140_000 ВЮ http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php

Итого ориентировочно надо посчитать 520_000*2 = 1_040_000 тасков

Автор: Rilian Jun 14 2013, 22:30

Метагеномы посчитаны на 65%! Еще на 11 дней работы!

К нам в команду присоединился крутой кранчер vvv с 600к очками !

http://stat.polarseti.ru/index.php?t=11&p=42&sort=week

Автор: Rilian Jun 21 2013, 09:58

Осталось 240_000 новых тасков!

Посчитано 914229 из 1140958 ВЮ

http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php

Автор: Death Jun 21 2013, 11:25

ранше за 2 недели успевали. щас месяца не хватает.

вот закончится судоку...........

Автор: Rilian Jun 22 2013, 09:34

QUOTE(Death @ Jun 21 2013, 12:25) *

ранше за 2 недели успевали. щас месяца не хватает.

нет, с этим все ок

просто в июле 2012 было выпущено 1.14М дополнительных заданий "metagenomes" которые считаются в 3 раза дольше обычного СИМАП-задания. Итого получается таких тасков 2.29М

http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php

В Июне 2013 не было ежемесячного обновления базы, и благодаря этому, а также пентатлону в мае, удалось посчитать практически 0.5М оставшихся заданий метагеномов

Возможно в Июле 2013 выдадут двойную дозу ежемесячных заданий koc.gif

Автор: Rilian Jun 24 2013, 09:43

Осталось заданий на 24 часа!

То есть около 60_000 ВЮ, или 120_000 тасков

http://boincsimap.org/boincsimap/batchmonitor.php

Автор: Володимир Jun 24 2013, 10:53

Теж вирішив приєднатися, поки слінка не паше.
Навантажив купу завдань на 3 компи

Автор: re_SET Jun 24 2013, 16:36

(Володимир @ Jun 24 2013, 11:53) *

Теж вирішив приєднатися, поки слінка не паше.
Навантажив купу завдань на 3 компи


ООООexcl.gif! Чудовоexcl.gif

Автор: Rilian Jun 24 2013, 22:43

Осталось заданий на 10 часов!

http://boincsimap.org/boincsimap/

re_SET, за тобой не угнаться smile.gif

Автор: re_SET Jun 25 2013, 07:58

Задания разобрали. Все успели набить кеш? koc.gif

Автор: Rilian Jun 25 2013, 09:18

Я кэш не набирал - щяс подключил на все FAAH и Rosetta

Автор: Rilian Jun 25 2013, 14:12

Work #
Tasks ready to send 0
Tasks in progress 115,646

Project status: no work
Next work expected: around Jul 1

Автор: Rilian Jun 30 2013, 22:54

Project status:
preparing new work
Scheduled start: Mon, Jul 1 (06:00:00)

New protein sequences for SIMAP release 2013/07 simap

The workunits for the about 980.000 new protein sequences (for the July release of SIMAP) will be available from Mon, Jul 1. We estimate that the batch for July will need about three weeks of work.

Best,
Thomas

Автор: Dromage Jul 2 2013, 15:30

Project status: running
Hosts active: 8,079
Work distributed: 10 %
Remaining: 22 days

Invision Power Board
© Invision Power Services