Docking@home, Изучаем механизм взаемодействия лиганда с белком |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Docking@home, Изучаем механизм взаемодействия лиганда с белком |
nikelong |
Aug 9 2007, 21:42
Пост
#1
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 12 443 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Проект "Docking@home" ----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников: ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 30.06.2008 Капитан - (_KoDAk_) ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://docking.cis.udel.edu/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Полезная информация: Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи: 1) пара e-mail/пароль 2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число. Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- О проекте: Docking@home - совместный проект, который стремится решить проблемы как информатики, так и биологической науки. С точки зрения биологической науки, целью проекта является дальнейшее расширение знаний об атомных деталях взаимодействий лиганда белка и, изучая это, возможные поиски и открытие новых фармацевтических препаратов. С точки зрения информатики, этот проект стремится расширить круг добровольных вычислений, чтобы помочь адаптивному моделированию мультимасштабных приложений: различные модели, которые представляют природные явления с различным уровнем точности и требований к ресурсам, будут выбраны для выполнения, основанного на результатах, разработанных пока для характеристик комплекса лиганда белка. Docking@home вовлекает сотрудничество среди Университета Техаса - Эль-Пасо, Научно-исследовательский институт Scripps (TSRI), и Университет Калифорнии - Беркли и включен BOINC. Docking@home - часть проекта DAPLDS (или Динамически Адаптивный проект Системы Стыковки Лиганда белка) и поддержан Национальным Фондом Науки (национальный научный фонд). Docking@Home привлекает к сотрудничеству Университет Техаса – Эль-Пасо, Научно-исследовательский институт Scripps (TSRI), и Университет Калифорнии – Беркли и использует для вычислений программное обеспечение с открытым исходным кодом – BOINC. Docking@Home – часть проекта DAPLDS (Dynamically Adaptive Protein-Ligand Docking System project или Динамически Адаптивный проект Системы Взаимодействия Белок-Лиганд) и поддержан Национальным Научным Фондом США (National Science Foundation). График ППД команды за последние 60 дней: (Show/Hide) ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Статус сервера выдачи заданий: http://www.boinc-af.org/content/view/245/219/ http://www.dp.by/wiki/Projects/Dockingathome http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Docking%40home/en http://www.polarseti.ru/page.php?23 http://distributed.ru/wiki/pro:docking Це повідомлення відредагував nikelong: Sep 18 2010, 19:59 |
corsar83 |
Jul 1 2010, 10:43
Пост
#61
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 426 З нами з: 28-January 10 Користувач №: 1 282 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750 |
Lentgh of cross-docking workunits
June 29, 2010 21:39 EST The current workunits are cross-docking ligands with different protein conformations. Each workunit should last between 4 and 6 hours. Текущие задания являются кросс-докинг лигандов с различными конформациями белка. Каждый из них должен считаться от 4 до 6 часов. -------------------- |
ReMMeR |
Jul 7 2010, 10:18
Пост
#62
|
----===[ oO ]===---- Група: Team member Повідомлень: 3 087 З нами з: 20-October 05 З: Quake arena Користувач №: 135 Стать: Чол Free-DC_CPID |
Реквестирую создание коммандного аккаунта distributed.org.ua, и инструкцию в шапку как подрубиться по слабому ключу на коммандный аккаунт.
-------------------- (Show/Hide) |
corsar83 |
Aug 14 2010, 12:09
Пост
#63
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 426 З нами з: 28-January 10 Користувач №: 1 282 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750 |
Начали считать другой какой-то комплекс. По времени считает столько же, а начисляют не 138, а 102 очка. Зажлобились чото
-------------------- |
corsar83 |
Aug 19 2010, 14:41
Пост
#64
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 426 З нами з: 28-January 10 Користувач №: 1 282 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750 |
Чо за задания понеслись по 30 секунд и 102 бала. Глюк какойто чоли.
-------------------- |
corsar83 |
Oct 14 2010, 08:44
Пост
#65
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 426 З нами з: 28-January 10 Користувач №: 1 282 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750 |
Best ligand structures displayed
October 13, 2010 4:09 EST Now our feature showcasing the best ligand conformations per complex is operational again!! You can see the most recent best results from here. Comunity->Best Results -------------------- |
corsar83 |
Oct 31 2010, 13:13
Пост
#66
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 426 З нами з: 28-January 10 Користувач №: 1 282 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750 |
Maintenance work in server room
October 29, 2010 2:11 EST During the first 2 weeks of November, there will be renovations in the server room where D@H is located, therefore we might experience some discontinuity in the job's production and validation. We will try to keep you informed before any major time down. Thanks for your patience!! -------------------- |
Rilian |
Mar 31 2011, 16:02
Пост
#67
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 393 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Want to read more about D@H results?
March 29, 2011 8:48 EST Downlad this paper to read more about results you help us to achive with D@H. Thanks! -------------------- |
Rilian |
Oct 3 2011, 07:57
Пост
#68
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 393 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
2011-10-02: The cross-docking simulations of our set of HIV complexes is almost done. This will allow us to start the statical analysis ofthe data collected with your help while starting a new set of cross-docking for a new protein, the trypsin.
-------------------- |
Rilian |
Nov 11 2011, 12:07
Пост
#69
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 393 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Nov 10, 2011 13:00 EST
The Docking@Home team is pleased to release the fourth Docking@Home newsletter to our volunteers. Enjoy the reading! -------------------- |
Bel |
Apr 8 2012, 20:36
Пост
#70
|
Мега ранчер Група: Moderators Повідомлень: 1 301 З нами з: 3-September 10 Користувач №: 1 476 Стать: Чол |
Голландцы склепали дрим тим. Сливают по 2.5 млн/день. Вот только как можно было умудрится за месяц привлечь 300 с лишним активных кранчеров в этот проект? Ботнетом балуются что ли..?
http://ru.boincstats.com/stats/user_stats....ti=46&co=&date= |
niggativ86 |
Apr 8 2012, 21:43
Пост
#71
|
Так, я створив профіль! Група: New Members Повідомлень: 3 З нами з: 8-April 12 Користувач №: 2 994 Стать: Чол |
Голландцы склепали дрим тим. Сливают по 2.5 млн/день. Вот только как можно было умудрится за месяц привлечь 300 с лишним активных кранчеров в этот проект? Ботнетом балуются что ли..? http://ru.boincstats.com/stats/user_stats....ti=46&co=&date= Кажись с WCG перешли сюда |
nikelong |
Apr 8 2012, 23:11
Пост
#72
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 12 443 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Bel,
Дык это ж Dutch Power Cows ! Это они и придумали "педали". Еще с динозаврских времен конца 90-х ... -------------------- |
D@rs |
Oct 16 2012, 11:29
Пост
#73
|
Трохи обжився Група: Trusted Members Повідомлень: 17 З нами з: 16-October 07 Користувач №: 610 Стать: Чол Парк машин: Core i5-9500-T @2.2GHz, DDR4 16Gb |
Скажіть, будь ласка, в мене Boinc налаштований на кілька проектів. Останнім часом не рахує нічого, окрім Docking-гу. Але кожне завдання має обраховуватися приблизно по 2:30-2:40 години, а потім чарівним чином завдання розтягуються до 24-х годин. При цьому вже за період ~10 днів не нараховано жодного балу. (CPU: AMD Phenom II x4 970 (3.5 GHz), працює цілодобово)
|
Rilian |
Oct 16 2012, 11:39
Пост
#74
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 393 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
D@rs, странно, http://docking.cis.udel.edu/community/resu...21088&offset=20 я не вижу завершенных заданий у тебя
если хочешь включи team viewer, пришли мне в личку номер и пароль сессии, я посмотрю что творится -------------------- |
Bel |
Oct 16 2012, 19:21
Пост
#75
|
Мега ранчер Група: Moderators Повідомлень: 1 301 З нами з: 3-September 10 Користувач №: 1 476 Стать: Чол |
D@rs, не хочу мешать выбирать проекты самостоятельно, тем более у нас каждый кранчит что хочет, но относительно Докинга могу сказать, что проект уже не вызывает доверия, как ранее. Скоро уже будет год, как не обновлялась инфа по результатам проекта. Что сейчас моделируют, какие цели далее? Непонятно. Тем более для таких масштабов моделирования докинга белка, мощности проекта все равно очень мало. Нужно хотя бы раз в 10 больше, на временной отрезок как миниму год. Поэтому предлагаю перевести ресурсы на проект World Community Grid, который проверенный временем и фин. вливаниями IBM , или FightMalaria@Home(недавно запустили, сам кранчу и агитирую за него). Есть проекты еще Poem@home, Simap, Rosetta@Home которые тоже проверенные.
|
Lo-Fi Версія | Поточний час: 23rd April 2024 - 08:47 |