Версія даної теми для друку

Автор: Rilian Nov 27 2007, 22:55

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1
* http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=169
* http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=163
* http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=164
* http://distributed.org.ua/index.php
* http://distributed.org.ua/index.php
* http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/wcg-hcc.html

http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=890

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. http://www.worldcommunitygrid.org/projects_showcase/hcc1/viewHcc1Main.do



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

Автор: Death Nov 28 2007, 11:21

грустно что только в боинке

Автор: drorion Nov 28 2007, 13:21

Почему грустно?

Автор: Rilian Nov 28 2007, 14:23

Грустно что под винду?

Автор: drorion Nov 28 2007, 15:50

(Rilian @ Nov 28 2007, 02:23 PM)

Автор: ReMMeR Nov 28 2007, 15:57

Дез видимо не любит боинк.
Я тоже както не особо ...

Автор: Rilian Nov 28 2007, 16:13

У нас одна команда в World Community Grid

насчет боинка под линух - не знаю. Но думаю 5000000 юзеров СЕТИ эту проблему както решили )

Я тоже после НГ сюда переключусь

Автор: drorion Nov 29 2007, 09:58

(Rilian @ Nov 28 2007, 04:13 PM)

Автор: Rilian Nov 29 2007, 13:51

(drorion @ Nov 29 2007, 09:58 AM)

(Rilian @ Nov 28 2007, 04:13 PM)

насчет боинка под линух - не знаю. Но думаю 5000000 юзеров СЕТИ эту проблему както решили )

Да, скачал бету для линукс command-line клиента.
Запустился, сказал что этот комп не присоединен ни к какому проекту.

Автор: drorion Dec 12 2007, 16:09

Вроде разобрался с этим БОИНКом. Даже 3 задания посчитал, на винде правда

А вот под линукс для WCG HCC заданий не раздают, и это грустно
Может после Н.Г. исправятся....

А вообще, боинк на винде приятно удивил.
Довольно таки удобная оболочка для кранчинга, плохо что ФАХ не поддерживают ее.

Автор: Rilian Jan 10 2008, 20:33

Я переключаюсь с фаха сюда



Задания выполняются за 4 с половиной часа

Автор: KoDAk Jan 11 2008, 00:09

(Rilian @ Jan 10 2008, 08:33 PM)

Автор: Rilian Jan 11 2008, 02:00

Не смотрел, но думаю до 100 МБ

Автор: drorion Jan 11 2008, 13:19

(Rilian @ Jan 10 2008, 08:33 PM)

(KoDAk @ Jan 11 2008, 12:09 AM)

Автор: nikelong Jan 11 2008, 15:05

http://dc-vault.com/showteam.php?team=433

он тут есть?

Ссылку на статистику!

А то вы все сваливаете с фолдинга, так хоть КОМАНДНУЮ межпроектную статистику сохранить нужно!

Вон, на дц-ваулте 16-ми были, а сейчас упали до 20-го ...

Автор: drorion Jan 11 2008, 15:22

(nikelong @ Jan 11 2008, 03:05 PM)

Автор: Rilian Jan 11 2008, 16:25

(drorion @ Jan 11 2008, 01:19 PM)

Автор: ReMMeR Jan 11 2008, 16:45

Это наши статсы ?

http://www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamInfo.do?teamId=J8H4J4QPN1

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewStatsByTeamAT.do?typeFilter=0&countryFilter=&sort=points&pageNum=8&numRecordsPerPage=50

Автор: nikelong Jan 11 2008, 16:47

Оуу ййеее!

Если 372 - это наша позиция, то на ДЦваулт идет таки правельная статистика.

Кстати, я так понял что проект ВЦГ имеет штук 6 разных подпроектов РВ, но все они считаются на одну копилку? О_0

Автор: drorion Jan 12 2008, 10:11

(ReMMeR @ Jan 11 2008, 04:45 PM)

(nikelong @ Jan 11 2008, 04:47 PM)

Автор: Rilian Jan 15 2008, 01:19

Судя по http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=17784, уже выполнено 4.3 миллиона ВЮ, что составляет 2.4% от проекта

Автор: Rilian Jan 24 2008, 18:54

Подключил еще один core 2 duo 2.66Ghz

итого
3 core 2 duo 2.66Ghz
1 core 2 duo 2.40Ghz

Автор: Rilian Jan 29 2008, 13:58

Подключил еще один core 2 duo 2.66Ghz

итого
4 core 2 duo 2.66Ghz
1 core 2 duo 2.40Ghz

Автор: Rilian Jun 23 2008, 14:00

Посчитано уже 8.44% проекта Help Conquer Cancer, фаза 1!

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1

всего существует 180 млн заданий, посчитано 15.2 млн

Автор: Death Jun 24 2008, 12:20

может сперва огр закончим? а то грид орг умер, вцг с калечным клиентом непонятно где, щас на боинк перешли. нененене шото я не уверен, что уних всё правильно щитается.

Автор: Rilian Jun 24 2008, 12:31

В HCC обрабатываются фотки с рентгеновской кристаллографии. Там все правильно считается. И потом, у нас демократия

Автор: Death Jun 24 2008, 15:11

блин торможу - реальни про ВЦГ подумал.

демократия или анархия? ;-)

Автор: Rilian Jun 24 2008, 15:13

HCC считается на боинке в рамках ВЦГ....

у нас больше развит по*уистический строй

Автор: nikelong Jun 24 2008, 15:59

(Rilian @ Jun 24 2008, 04:13 PM)

у нас больше развит по*уистический строй

Автор: Rilian Jul 14 2008, 16:32

У меня мегаслив - задания за 3 дня оффлайна

Автор: Dmitrio Jul 21 2008, 10:37

Эх, где это найти столько машин, чтобы и себе столько результатов выдавать У меня пока рекорд 6497 очков за день.

Автор: Rilian Aug 8 2008, 21:53

WCG запустил новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

Более 150 человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования. Для того чтобы присоединиться к команде Украины, прочитайте инструкцию на нашем командном форуме

http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=1214

Автор: Rilian Aug 11 2008, 21:29

Nikelong, ждем статьи на сайте!

На сегодняшний день выполнено 10.06% проекта!

Обработано 17.9 миллионов изображений белков, полученных с помощью рентгеновской кристаллографии. Всего проектом будет обработано 180 миллионов изображений. Значит осталось 160 миллионов - при текущей скорости 62000 ВЮ в день это может занять около 2550 дней ~ 6.98 лет

Автор: drorion Aug 12 2008, 12:28

(Rilian @ Aug 11 2008, 10:29 PM)

Обработано 17.9 миллионов изображений белков, полученных с помощью рентгеновской кристаллографии. Всего проектом будет обработано 180 миллионов изображений. Значит осталось 160 миллионов - при текущей скорости 62000 ВЮ в день это может занять около 2550 дней ~ 6.98 лет

Автор: Dmitrio Aug 13 2008, 10:28

Ну фишка WCG в том, что администрация решает, в какой пропорции делить вычислительные ресурсы. Т.е. если мы приведем 2000 человек, которые поставят в настройках кранчить только этот проект, это не значит что реальное время кранча HCC увеличится. Это означает, что часть народа, у которого в настройках стоит не только HCC, выпихнут в другие подпроекты. Так что тут продвинуть один какой-то проект невозможно...

Автор: Rilian Aug 13 2008, 10:56

У меня стоит в настройках ТОЛЬКО ХЦЦ. пусть со своим африканским климатом и рисом идут нафиг

Автор: mad Aug 13 2008, 14:03

(Rilian @ Aug 13 2008, 11:56 AM)

Автор: Rilian Aug 13 2008, 15:15

Да. Изучаются гены которые можно посадить чтобы рис содержал больше какихто веществ

Автор: drorion Aug 13 2008, 16:39

(Rilian @ Aug 13 2008, 11:56 AM)

Автор: Rilian Aug 14 2008, 12:32

Сейчас у меня в проекте такие мощностя

5 * Intel Xeon Duo 2Ghz 24/7
1 Core2Duo 2.66 15/7

Итого в ближайшие дни рассчитываю выйти на 3000 ППД

Автор: Dmitrio Aug 15 2008, 15:49

(Rilian @ Aug 13 2008, 04:15 PM)

Автор: Rilian Aug 15 2008, 16:19

Ого.. Что за машина дома?

Автор: Dmitrio Aug 15 2008, 16:28

Старая duron 650/384Mb/80Gb/GForce 2MX 400. Ну т.е. она реально старая Хотя до недавнего времени вполне меня устраивала, поскольку в игрушки играть особо некогда, а новые машины только для них и нужны...

Но все же пришлось поапгрейдится до Q9450/4Gb/400Gb/Radeon 4850 512Mb. Сейчас сижу ковыряюсь. Глючииит собака...

Автор: Rilian Aug 16 2008, 12:17

Посчитано 10,077215% проекта, то есть 18138987 ВЮ. Всего в проекте 180000000 ВЮ, и осталось досчитать 161861013 штук

при средней скорости в 62,764 ВЮ/день проект закончится через 161861013/62764 = 2578 дней

при вчерашней скорости 56228 ВЮ/день проект закончится через 2878 дней

Автор: Rilian Aug 16 2008, 23:53

я скачал две ПДФ-ки с самого официального сайта (Институт Рака в Онтарио)

http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/wcg-hcc.html

по мере наличия времени переведу. Сделаем статьи

Автор: Dmitrio Aug 17 2008, 19:01

Судя по скорости вычислений, победа над раком нам пока не светит...

Автор: Rilian Aug 19 2008, 20:20

Посчитано 10.1964778% проекта, то есть 18353660 ВЮ. Всего в проекте 180000000 ВЮ, и осталось досчитать 161646340 штук

при средней скорости в 62640 ВЮ/день проект закончится через 161646340/62640 = 2580 дней

при вчерашней скорости 65369 ВЮ/день проект закончится через 2472 дня!

Автор: Rilian Aug 29 2008, 12:08

Посчитано 10.55% проекта, то есть 19000000 ВЮ. Всего в проекте 180000000 ВЮ, и осталось досчитать 161000000 штук

при средней скорости в 62640 ВЮ/день проект закончится через 161646340/62640 = 2580 дней

при вчерашней скорости 73000 ВЮ/день проект закончится через 2200 дней!

Автор: Rilian Aug 29 2008, 23:20

скрин

Автор: Rilian Aug 30 2008, 21:47

Блин что-то меня проглючило. На самом деле в проекте обрабатывается 84,000,000 изображений 9,400 протеинов, а не 180,000,000 как я писал раньше.

Я позже пересчитаю текущий прогресс проекта и напишу новые данные

ПС: сейчас перевожу результаты проекта за Январь 2008

Автор: Rilian Aug 31 2008, 23:00

У нас на сайте появилсь статья про проект

http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=163

и скоро будет еще одна про результаты проекта за январь 2008

Автор: Rilian Sep 2 2008, 21:07

Переведена статья о результатах за январь 2008!

Ждем RеMMеЯа, он выложит на сайт!

Автор: Rilian Sep 3 2008, 00:19

Посчитано 22.9% проекта, то есть 19,300,000 ВЮ. Всего в проекте 84000000 ВЮ, и осталось досчитать 64700000 штук

при средней скорости в 63000 ВЮ/день проект закончится через 1027 дней то есть через 2.8 лет!

при вчерашней скорости 81100 ВЮ/день проект закончится через 797 дней то есть всего через 2.2 года!

Присоединяйтесь!

Автор: Rilian Sep 4 2008, 21:36

У нас новая статья о проекте - результаты за январь 2008

в ней рассказывается как идет обработка изображений

пс: сейчас я добавлю тегов

http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=164

переводил без словаря, так что особо не пинайтесь. если что-то можно перефразировать, говорите что и на что исправить

Автор: Rilian Sep 6 2008, 01:36

QUOTE(Rilian @ Aug 30 2008, 09:47 PM)

Автор: Rilian Sep 7 2008, 12:52

Автор: Rilian Sep 7 2008, 12:58

время работы в проекте, в часах

Автор: Rilian Sep 21 2008, 21:04

В проекте Help Conquer Cancer временно нет заданий, поэтому если вы не считаете другие BOINC-проекты на компьютерах с HCC, пройдите в раздел "Мои проекты" ( https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do ) и поставьте галочку "If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project." - таким образом ваши компьютеры простаивать не будут. Никаких других настроек на стороне клиента не требуется

Автор: Rilian Sep 21 2008, 21:15

Мдя не успел запостить новость (которой 2 дня, но меня не было в киеве и судя по всему никого кроме меня падение командного ППД на 15% не удивило??), как я нашел что проблему решили 19го числа. Видимо решили не до конца, потому что некоторые мои компы периодически не получают ВЮ

Автор: drorion Sep 21 2008, 23:13

QUOTE(Rilian @ Sep 21 2008, 22:15)

Автор: Rilian Sep 23 2008, 13:10

в Help Conquer Cancer задания снова выдаются !!

Автор: Rilian Sep 24 2008, 22:18

Посчитано 12.28% проекта, то есть 20,634,369 ВЮ. Всего в проекте 84000000 ВЮ (Каждая будет обработана 2 раза), и осталось досчитать 147000000 штук

при средней скорости в 62700 ВЮ/день проект закончится через 2344 дня то есть через 6.4 года!

Присоединяйтесь!

Автор: lividum Oct 23 2008, 19:54

Что-то не могу к проекту присоединиться

Автор: Rilian Oct 23 2008, 20:05

QUOTE(lividum @ Oct 23 2008, 19:54)

Автор: lividum Oct 23 2008, 20:59

(Rilian @ Oct 23 2008, 21:05)

(lividum @ Oct 23 2008, 19:54)

Что-то не могу к проекту присоединиться

какие проблемы, что пишет?

www в адресе есть?

Автор: Rilian Oct 23 2008, 21:07

www надо оставить

какой клиент боинка, официальный или WCGшный?

другие проекты работают?

антивирус есть?

фаервол?

винда не заблочила БОИНК ?

проект уже приаттачен?

Фетчинг кофигурейшн файл это значит что оно пытается скачать файл настроек

Автор: lividum Oct 23 2008, 21:14

(Rilian @ Oct 23 2008, 22:07)

Автор: Rilian Oct 23 2008, 21:19

При добавлении проекта юзер, емейл и пароль были нормально приняты?

Зайди плиз в настройки фаервола и на влякий случай проверь не добавлен ли клиент в блеклист

Скопируй сюда все со вкладки messages. Разберемся

Проверь в браузере открывается http://www.worldcommunitygrid.org/get_project_config.php ?

Автор: lividum Oct 23 2008, 21:29

(Rilian @ Oct 23 2008, 22:19)

Автор: Rilian Oct 23 2008, 21:30

Явно проблемы с подключением к инет на твоей машине. Прокси юзаешь?

По ссылке должен открыться код вида

Автор: lividum Oct 23 2008, 21:35

Сейчас у меня вот что открывает

World Community Grid 6 http://www.worldcommunitygrid.org/boinc/ windows_intelx86 i686-pc-linux-gnu i686-apple-darwin powerpc-apple-darwin x86_64-pc-linux-gnu i386-portbld-freebsd

Автор: Rilian Oct 23 2008, 21:37

Вроде нормально. И что сейчас говорит БОИНК ?

Автор: lividum Oct 23 2008, 21:40

(Rilian @ Oct 23 2008, 22:37)

Автор: Rilian Oct 23 2008, 21:41

Попробуй рестартнуть БОИНК.....

какое у тебя подключение?

Автор: lividum Oct 23 2008, 21:56

переставил клиент...ничего не изменилось. Подключение через PPPOE, анлим короче. Не судьба видать.

ура, разобрался, надо было сначало учетную запись на их сайте создать...все приступаем))))

Автор: Rilian Oct 23 2008, 22:03

QUOTE(lividum @ Oct 23 2008, 21:56)

Автор: lividum Oct 23 2008, 22:10

да все ок...я на предыдущей странице добавил..надо было учетную запись на сайте их создать...так что все ок. Спасибо за помощь)))

Автор: Rilian Oct 23 2008, 22:37

Тогда велкам ту зе клаб тру кранчеров!

Автор: Rilian Oct 26 2008, 21:28

Готовится к выпуску перевод статьи http://www.worldcommunitygrid.org/projects_showcase/hcc1/viewHcc1Faq.do?shortName=hcc1

Автор: Rilian Oct 27 2008, 12:07

насчитал 3 года компьютерного времени в проекте!

Автор: cosmo_vk Oct 27 2008, 12:36

нус начнем считать:
http://stat.polarseti.ru/user.php?uid=10601

Автор: Rilian Oct 27 2008, 13:36

QUOTE(cosmo_vk @ Oct 27 2008, 12:36)

Автор: cosmo_vk Oct 27 2008, 14:22

чуть позже когда стат обновиться, будет еще больше. Сейчас два сервера трудятся + 3 станции. Правда один из серверов не очень быстро. А так в среднем уходит около 4 часов на анализ Cancer'ов. На той неделе клиентов на работе придется стопорнуть(3 точно не будут сливать), т.к. я в отпуск на месяц ухожу.

Не-е команду я не сменю. Все равно трудимся на один и тот же проект. И чем быстрее они закончатся, тем лучше.

P.S. А давно в FightAIDS стал кворум 1, в начале лета было вроде 2?

Автор: Rilian Oct 28 2008, 01:46

У нас новая статья - http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=169

пасиба никелонгу за публикацию!

и ваще

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=169
* http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=163
* http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=164

Автор: Rilian Oct 29 2008, 00:10

QUOTE(crouni @ Oct 28 2008, 23:53)

QUOTE(Rilian @ Oct 28 2008, 23:42)

Вместо того чтобы получать мизерные очки на обычном консольном клиенте фолдинга, процессор можно кинуть на БОИНК-проекты

Я не против, просто как-то всё фолдинг, да фолдинг... Привычка такая

Вижу твою инструкцию - http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=1214
А что там с клиентом, есть выбор вариантов клиентов? Подробные инструкции по настройке...

Автор: cosmo_vk Nov 4 2008, 19:33

а где ты смотришь сколько посчитано вушек?
тут только репорты за январь и май: http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/wcg-hcc.html

Домашний комп настроил считать HCC. Благо там всего 3 часа с небольшим на одну вушку выходит.

Автор: Rilian Nov 4 2008, 20:39

QUOTE(cosmo_vk @ Nov 4 2008, 19:33)

QUOTE(cosmo_vk @ Nov 4 2008, 19:33)

QUOTE(cosmo_vk @ Nov 4 2008, 19:33)

Автор: cosmo_vk Nov 5 2008, 12:43

спасиб буду знать теперь.

квад Q6600 разогнанный до 3.15GHz. Сегодня на нем добьются вушки от FightAIDS и начнет лопатить HCC.

Автор: drorion Nov 7 2008, 23:25

Наши колеги с xtremesystems раздобыли Core i7 и протестили его на WCG-HCC и фолдинг.
http://www.xtremesystems.org/forums/showthread.php?t=206572

Автор: Rilian Nov 7 2008, 23:36

QUOTE(drorion @ Nov 7 2008, 23:25)

Автор: nikelong Nov 8 2008, 14:35

QUOTE(drorion @ Nov 7 2008, 23:25)

Автор: Rilian Nov 8 2008, 18:35

Последние новости:

Посчитано 14.11% проекта, то есть 23,699,122 ВЮ. Всего в проекте 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 ВЮ), и осталось досчитать 144300878 штук

при средней скорости в 63400 ВЮ/день проект закончится через 2276 дней то есть через 6.2 лет!

при вчерашней скорости 75820 ВЮ/день проект закончится через 1903 дней то есть всего через 5.2 года!

Присоединяйтесь!

Автор: cosmo_vk Nov 8 2008, 21:48

хорошая штука i7, но дороговат.

По HCC вчера был как бы год со дня начала просчета проекта, судя вот по этой страничке: http://www.worldcommunitygrid.org/projects_showcase/viewResearch.do
Почти 15% просчитано. Выйду из отпуска - запущу опять на серверах до нового года задания. Пущай лопатят.

Автор: Rilian Nov 8 2008, 21:52

Да, в таком проекте за год 2 публикации и фазы это хорошо!

Cosmo_vk, ты в какой точно команде ХЦЦ?

Автор: drorion Nov 8 2008, 23:27

QUOTE(Rilian @ Nov 8 2008, 18:35)

при средней скорости в 63400 ВЮ/день проект закончится через 2276 дней то есть через 6.2 лет!
при вчерашней скорости 75820 ВЮ/день проект закончится через 1903 дней то есть всего через 5.2 года!

Автор: cosmo_vk Nov 9 2008, 07:25

в команде Russia: http://ru.boincstats.com/stats/user_graph.php?pr=wcg&id=449628

Я апгрейдится ближайшие полтора года точно не буду, покупка авто откладывает сие дело.

Если только какие-то рабочие компы на проект заверну. Благо техника современная большей частью

Автор: Rilian Nov 26 2008, 14:18

+ Quad 2.4Ghz на 24/7

одно задание за 4 часа --> 24 ВЮ в день

Автор: Rilian Dec 16 2008, 08:51

опубликованы результаты и достижения проекта на октябрь 2008

http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/UPDATE-OCT2008.pdf

Получается за год работы: 6.06 версий программы, 3 статьи

Автор: Rilian Dec 16 2008, 08:56

ПС: to date
24,502,692 results were returned, completing about 16% of the work

Автор: drorion Dec 16 2008, 14:44

QUOTE(Rilian @ Dec 16 2008, 08:51)

Автор: Rilian Dec 16 2008, 14:55

если ты переведешь - я не буду возражать

Автор: drorion Dec 16 2008, 15:03

QUOTE(Rilian @ Dec 16 2008, 14:55)

если ты переведешь - я не буду возражать

Автор: Rilian Dec 16 2008, 15:04

А я работаю на 2 работах

Автор: drorion Dec 16 2008, 15:05

QUOTE(Rilian @ Dec 16 2008, 15:04)

Автор: Rilian Dec 16 2008, 15:08

Пока можно юзать google translate

Автор: drorion Dec 16 2008, 15:17

QUOTE(Rilian @ Dec 16 2008, 15:08)

Пока можно юзать google translate

Автор: Rilian Dec 18 2008, 21:30

подключил pentium 4@2.4ghz на 20 часов в неделю

Автор: Rilian Dec 31 2008, 16:54

За последний час не получил ни одного задания ХЦЦ. Вместо него идут ВЮ с других проектов

Возможно это связано с переездом (8 января) и ВЦГ просто не генерирует новые пачки ВЮ для некоторых проектов, чтобы по возможности досчитать все что уже было сгенерировано раньше

пс: довел мощности до 2 квада, 1 пень, 6 коре дуо

Автор: Rilian Dec 31 2008, 20:53

Вроде уже задания появились. В любом случае галочку "получать задания с других проектов если в выбранных нет заданий" лучше держать включенной.

Автор: Rilian Jan 4 2009, 00:32

Да, была проблема с получением новых заданий, связанная с миграцией в новый датацентр 8го января. Сейчас проблему решили, о чем сообщил один из техников ВЦГ на оф форуме

Автор: Rilian Jan 4 2009, 08:34

QUOTE(ReMMeR @ Nov 28 2007, 15:57)

Автор: ReMMeR Jan 4 2009, 10:58

Автор: Rilian Jan 11 2009, 04:17

Кому-то задания приходят?

Кстати, у меня 5 процессорных лет рассчетов, 9100 ВЮ!

Автор: tribal Jan 11 2009, 10:19

Rilian,

Автор: -=Vzhik=- Jan 11 2009, 11:01

Мне приходят исправно.

Автор: Rilian Jan 11 2009, 21:19

Странно. У меня в профиле поставлены галочки CEP и HCC

на виндовые компы приходит CEP

на линуксовые и маки приходят HPF или FAAH

Автор: Rilian Jan 12 2009, 05:54

Посчитано 28909911 ВЮ из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 ВЮ), и осталось досчитать 139000000 штук

Средняя скорость 65854 в день. Один core2duo 2.5Ghz считает 12 ВЮ в день

Автор: Death Jan 12 2009, 11:32

139М
/
65к
=
2110 дней.
если ті конечно лишний нолик не вколбасил в остаток. )))

Автор: Rilian Jan 12 2009, 14:08

Средняя скорость все время увеличивается (за вчера было почти 75000 ВЮ)

Автор: Death Jan 12 2009, 14:34

84000000 ВЮ (с кворумом в 2 ВЮ), и осталось досчитать 139000000 штук

точно 139М??

а, фсё.... кворум 2.
понял

Автор: Rilian Jan 12 2009, 14:36

Всего 164 миллиона ВЮ

плюс неск сотен тысяч на ошибки

но я надеюсь что скоро кворум снизят до одного, как недавно сделали в FightAIDS@home

Автор: Rilian Jan 13 2009, 21:34

насчитал 5 компьютерных лет в этом проекте

Кстати в проекте за вчера посчитано 85000 ВЮ

Автор: Rilian Jan 16 2009, 16:18

Yesterday:
Total Run Time (y:d:h:m:s) 73:119:11:28:32
Points Generated 54,583,017
Results Returned 104,038

такими темпами до окончания проекта всего 1336 дней, и это не учитывая закон Мура!

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1

Автор: Rilian Jan 17 2009, 15:26

в проекте посчитано 104700 ВЮ за последний день!

Автор: Rilian Jan 31 2009, 11:55

Последние новости:

Посчитано 18.43% проекта, то есть 30,974,559 ВЮ. Всего в проекте 84,000,000 ВЮ (с кворумом в 2 ВЮ), и осталось досчитать 137,025,441 штук

при средней скорости в 68000 ВЮ/день проект закончится через 2015 дней то есть через 5.5 лет!

при вчерашней скорости 106000 ВЮ/день проект закончится через 1292 дней то есть всего через 3.5 года!

Присоединяйтесь!

Автор: nikelong Feb 13 2009, 17:23

http://www.boinc-af.org/content/view/814/219/

Автор: tribal Feb 13 2009, 19:05

nikelong,
хм.. классные наверное ссылки... но может все-таки не все французкий-то язык знают? предупреждай что-ли

Автор: Rilian Feb 13 2009, 19:16

QUOTE(tribal @ Feb 13 2009, 19:05)

Автор: nikelong Feb 13 2009, 21:35

Да. Рильян прав.

Делов том что во время моего предыдущего обсмотра буржуйских ресутсов (да и русских) у меня в закладках скопилось столько всего, шо аж тесно стало.

Прошло несколько месяцев...закладки до сих пор маринуются на винте.

Японял что это не дело, и теперь все шо мне будет на глаза попадатся по теме - буду поститьна форум в соответствующие ветки.
А красоту как нибудь потом наведем

Автор: Death Feb 13 2009, 22:51

потсил бі уже в шапку сразу.

Автор: nikelong Feb 14 2009, 19:51

http://www.dp.by/wiki/Projects/Helpconquercancer

Автор: Rilian Apr 11 2009, 00:31

Привет, кранчеры команды Ukraine в проекте World Community grid,

Отчет о статусе проекта на Апрель 2009 готов. http://www.cs.utoronto.ca/~juris/WCG/UPDATE-APR2009.pdf находится тут (PDF).

Выполнено уже 25% проекта! Распознано 3 миллиона кристализационных снимка 2000 протеинов. Последняя версия нашего классификатора может определить кристаллизационный снимок протеина в 4 из 5 случаев, что позволяет значительно уменьшить время ручного поиска среди изображений кристаллов, и таким образом ускорить определение структуры протеина. Используя этот классификатор на базе из 5.7 миллионов изображений, недавно мы идентифицировали 11 протеинов с благоприятным состоянием кристаллизации, которые являются гомологичными к протеинам которые встречаются в раковых клетках человека (а именно в раке легких, шейки матки, простаты и шеи). Находжение кристаллизационного состояния это еще один шаг к определению структуры протеинов, и, вследствие, их функций при образовании рака.

Спасибо за ваш вклад в проект HCC

Christian A. Cumbaa, Research Associate
Ontario Cancer Institute

Автор: kornq May 19 2009, 23:32

Бронза умня

Автор: kornq Jul 16 2009, 22:19

Одно задание с Nutritious Rice for the World попалось, хотя всегда Help Conquer Cancer считал. В нём - Replication:19. Minimum Quorum:10. Наверно что-то важнное, раз внаглую дали . Просчитал около 6 часов.

Автор: vitalidze1 Jul 17 2009, 07:28

Коли планують ввести підтримку відеокарт у ВЦГ, а то рахую нафіг нікому непотрібний мілківей, хотілось би щось корисне.

Автор: Tamagoch Jul 17 2009, 12:19

vitalidze1,
АТИшкой можно Фолдинг кранчить, но он и проц жрет, вроде
а ВЦГ пока я смотрю даже платформу х64 не пытается обживать

Автор: vitalidze1 Jul 17 2009, 12:26

(Tamagoch @ Jul 17 2009, 13:19)

Автор: Rilian Oct 31 2009, 21:31

25 Jul 2009 – Presentation at Annual Meeting of the American Crystallographic Association, Toronto Ontario - "Crystallization image analysis on the World Community Grid"

Презентация на Ежегодном Собрании американской Кристаллографической Ассоциации, Торонто, Онтарио (Канада) - Анализ кристализационных изображений на World Community Grid

Файл с презентацией тут:

http://www.chtsb.org/Images/Results/Presentations/presentations/PSI_08_Cumbaa.ppt

Автор: Rilian Mar 11 2010, 19:01

Посчитано 63,517,942 тасков из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 ВЮ), и осталось досчитать 105,000,000 тасков

Средняя скорость 73,686 тасков в день.

пс: Один core2duo 2.5Ghz считает 12 ВЮ в день

Автор: Death Mar 11 2010, 22:31

1400 дней. фаааааааак.
стоко грантов и не пітаются куду и 64 подрубить.
денег на программистов не хватате чтоли????

Автор: Rilian Mar 11 2010, 22:51

64 нужно для эффективного хранения больших чисел. В HCC обрабатываются изображения с меньшей битностью, и в существующем алгоритме 64bit пользы не приносит. Где-то на оф форуме уже про это писали

Автор: Rilian Mar 21 2010, 23:32

Посчитано 64,342,210 тасков из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 таска на ВЮ), и осталось досчитать 103,500,000 тасков

Вчерашняя скорость 79,757 в день, с такой скоростью проект завершится через 1300 дней

пс: Один core2duo 2.5Ghz считает 12 ВЮ в день

Автор: Rilian Mar 23 2010, 18:21

ООООООООММММММММГГГГГГГГГ

Ученые из проекта Help Conquer Cancer нашли способ оптимизировать процессорный клиент! Альфа тестирование завершено, и показало что скорость вычислений повысилась почти в 2 раза! Сейчас проводится Beta тестирование и если все будет хорошо, приложение будет обновлено

Автор: tiss Mar 23 2010, 18:45

(Rilian @ Mar 23 2010, 18:21)

Автор: Rilian Mar 23 2010, 18:52

QUOTE(tiss @ Mar 23 2010, 18:45)

QUOTE(Rilian @ Mar 23 2010, 18:21)

Ученые из проекта Help Conquer Cancer нашли способ оптимизировать процессорный клиент! Альфа тестирование завершено, и показало что скорость вычислений повысилась почти в 2 раза! Сейчас проводится Beta тестирование и если все будет хорошо, приложение будет обновлено

Я поймал это бета задание - 2 часа считается в отличии от HFCC которое считается 5

Автор: tiss Mar 23 2010, 19:02

(Rilian @ Mar 23 2010, 18:52)

Повезло, а я ни одной беты не поймал

Тока не HFCC а HCC

Средняя скорость за вчера в HCC - 5.5 часов. Если бета посчиталась за 2 часа, то прирост производительности - больше 50%

Посмотрим когда официально выпустят.

Автор: Rilian Mar 23 2010, 19:12

HFCC считается от 4 до 27 часов. HCC - обработка изображений, HFCC - докинг.

Автор: Rilian Mar 23 2010, 19:48

В ветке про этот http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,28741_lastpage,yes пишут что скорость обработки увеличилась почти в 3 раза

Автор: EKONOMIST Mar 23 2010, 21:37

И мне одно упало, за 31 мин - 22 % Не слишком и революционно, они так и считаются обычно 3-3.5 часа

UPD Кто хочет беток - почаще давите апдейт, их все еще раздают

Автор: Rilian Mar 23 2010, 21:53

QUOTE(EKONOMIST @ Mar 23 2010, 21:37)

Автор: EKONOMIST Mar 23 2010, 23:24

Досчитал, цпу-тайм 1.93, второе примерно с тем же результатом будет - таки да, телега походу долго разгонялась... Начислили 44 попугая. Однако непонятно, как JmBoullier'у удалось на ку 6600 3ггц посчитать их за час

Автор: vitalidze1 Mar 24 2010, 09:25

Не всі завдання однаково жирні, навіть бети.

В мене Звичайні HCC -10 годин , Бета -3,5. Прирост єсть.

Автор: Rilian Mar 24 2010, 11:40

Досчитал 4 ВЮ на одном и том же компе 2.1GHz

в нативном MacOS 10.6.2 (64bit) BOINC 6.10.21 время ВЮ 1.29 и 1.34

в виртуалке WinXP SP3 (32bit) BOINC 6.10.32 время ВЮ 3.01 и 3.77

точно время не помню, но раньше HCC на маке считалось порядка 4-5 часов. В виртуалке HCC не считал

Автор: Death Mar 24 2010, 17:34

поставь вирт винду тоже 64 )))

Автор: Rilian Mar 26 2010, 01:31

The major optimization was to rearrange a calculation that allocated/deallocated multiple arrays per pass through an inner loop (called millions of times). Now the largest two arrays in the calculation have been factored-out, greatly reducing the memory-juggling. Our tests on a CentOS 64 platform showed a 2x improvement. I like your 3x results even more!

Christian A. Cumbaa
Research Associate, Ontario Cancer Institute

Автор: Rilian Mar 26 2010, 13:21

Выпустили http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/UPDATE-MAR2010.pdf

Dear WCG members.

Thank you for your generous donation of computing resources to our project. We are excited about our progress, which we summarize in the March 2010 progress update: http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/index.html

Importantly, an updated version of our image analysis program has passed the Bete testing and has been released today. Resulting from a collaboration with the IBM Toronto Software Lab, the optimized HCC software will process work units in less than half the time.

Since the launch of HCC project in November 2007, WCG members contributed over 46,906 years of run time, averaging over 53 years of computation per day. To date 64,724,807 results were returned (Statistics Last Updated: 3/26/10 00:05:59 (UTC)).

Using 12,375 primary features computed by the HCC project are augmented by a set of 2,533 features computed from the primary, creating a final set of 14,908 features. These image features and a massive training set of 165,351 hand-scored images were used to train multiple Random Forest classifiers that accurately recognize multiple crystallization outcomes, including crystals, clear drops, precipitate, and others. The system successfully recognizes 80% of crystal-bearing images and 95% of clear drops. Some of these results have recently been summarized and published in the Journal of Structural and Functional Genomics: Cumbaa, C. A. and Jurisica, I. Protein crystallization analysis on the World Community Grid, J Struct Funct Genomics, 11(2): R13, 2010.

We are happy to announce a significant performance improvements to the Help Conquer Cancer project. Resulting from a collaboration with the IBM Toronto Software Lab, the optimized HCC software will process work units in less than half the time.

thank you,

Igor Jurisica

Автор: vitalidze1 Mar 26 2010, 13:28

Цікаво коли 6,08 бета стане дефолтною?

Автор: Rilian Mar 26 2010, 13:37

QUOTE(vitalidze1 @ Mar 26 2010, 13:28)

Автор: vitalidze1 Mar 26 2010, 14:23

(Rilian @ Mar 26 2010, 13:37)

(vitalidze1 @ Mar 26 2010, 13:28)

Цікаво коли 6,08 бета стане дефолтною?

Кстати! Новая оптимизированная версия уже выпущена в продакшн с 25 марта.

Сейчас досчитывается последняя пачка заданий на старом клиенте!

Еще через некоторое время WCG админы планируют объединять по несколько ВЮ в одну, чтобы уменьшить кол-во отправляемых заданий и нагрузку на серверы, а также уравнять среднее время ВЮ до "стандартных" 6 часов

Автор: Tamagoch Mar 26 2010, 20:49

помогу досчитать 6.06
заодно бэджиков наберу

Автор: vitalidze1 Mar 26 2010, 22:36

В мене в черзі вже накачало 6,08, чекаю поки 6,06 доопрацюю.

Автор: Rilian Mar 27 2010, 00:08

У меня уже идет 6.08

Итак, проект официально ускоряется в 2-3 раза

Автор: kornq Mar 27 2010, 15:41

(Rilian @ Mar 27 2010, 00:08)

У меня уже идет 6.08

Итак, проект официально ускоряется в 2-3 раза

Автор: Rilian Mar 27 2010, 15:54

По моим прогнозам эта фаза проекта закончится менее чем через 400 дней, до августа 2011

todo: посмотреть на этот пост через 400 дней

Автор: kornq Mar 27 2010, 22:01

Задания на 6.08 стали короче чутли не в два раза и кредиты тоже, оперативки немного меньше требуют хотя и раньше было немного.

Автор: vitalidze1 Mar 28 2010, 00:11

В мене була надія, що ППД підніметься, що б привабило нових кранчерів до проекту(

Автор: Rilian Mar 28 2010, 00:21

QUOTE(vitalidze1 @ Mar 28 2010, 00:11)

Автор: Rilian Mar 28 2010, 00:47

на графике в шапке уже хорошо видно ускорение в hours per task

Автор: vitalidze1 Mar 28 2010, 11:37

(Rilian @ Mar 28 2010, 01:21)

(vitalidze1 @ Mar 28 2010, 00:11)

В мене була надія, що ППД підніметься, що б привабило нових кранчерів до проекту(

Ммм, почему ППД должно измениться? Изменяется только кол-во ВЮ которое теперь успевает посчитать комп за день

Хотя да, если ВЦГ будет раздавать очки как АКВА@home, то спокойно перетянет на себя бОльшую часть кранчеров

Автор: Rilian Mar 30 2010, 11:45

Судя по графику, кредиты в час немного выросли

Автор: tribal Mar 30 2010, 17:09

чета я задание какое-то крупненькое подцепил - 9 часов считается и пишет еще 12 осталось %)
ядро кстате 6,08 типа быстрое по идее *crazy*

Автор: Rilian Mar 30 2010, 17:10

tribal,

о_о

если хошь, давай всю инфу по ВЮ, я спрошу на оф форуме

Автор: tribal Mar 30 2010, 18:18

это из боинк-менеджера - аттач hcc01
это из описания WU - аттач hcc02

Автор: Rilian Mar 30 2010, 18:47

tribal, так процессор же не тратится. Выясняй что еще на компе грузит ядро

Автор: Tamagoch Mar 31 2010, 05:44

у меня так бывало: ВМварь зависнет (точнее винда под ней) и вушка считается по 30 часов

Автор: tribal Mar 31 2010, 06:13

Rilian, хех, интересно, как же не тратится если в догонку (читается как паралельно), к этому заданию посчиталось 3 FightAids?

ядра 2 и одновременно считается 2 задания - одним висит вот то, а вторых уже 3 шт. посчиталось. в диспетчере заданий на кадый расчетный модуль примерно поровну CPU времени показывает

Автор: Rilian Mar 31 2010, 09:11

tribal, Tamagoch, у меня тоже такое бывало, в виртуалке

я не говорю что ядро не тратится, а что возможно оно тратится на что-то другое одноядерное с бОльшим приоритетом. либо памяти мало (хотя для такой вю это маловероятно), и оно все время тратит на своп. надо разбираться... Может и банально завис explorer.exe. Такое бывает

посмотри на свойства ВЮ с интервалом в 5 сек. если процессор работает, значит ВЮ должна досчитаться оч быстро

Автор: tribal Mar 31 2010, 13:59

Rilian, не, памяти норм у мя почти в реальном времени и загрузка ЦП и объем памяти мониторится
вобщем после перезагрузки WU досчиталось таки за 12ч38мин... видимо просто глюкс был - обидно конечно, я б за это же время больше WU посчитать смог (
а след. посчиталось за 1 ч. - это наверное мне бонус за длительные расчеты предыдущего

Автор: Rilian Mar 31 2010, 14:14

tribal, гуд

глянь на всякий случай в Диспетчере Задач какой процесс отожрал 10 часов вместо HCC

Автор: Rilian Apr 6 2010, 03:25

Посчитано 66,508,234 тасков из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 таска на ВЮ), и осталось досчитать 101,500,000 тасков

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 в день, с такой скоростью проект завершится через 497 дней

Автор: Rilian Apr 14 2010, 11:53

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 68,203,337 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 99,800,000 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 470 дней

Автор: Rilian Apr 18 2010, 18:49

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 69,009,448 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 98,900,000 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 512 дней

Автор: Rilian Apr 19 2010, 23:27

Вчера было небольшое (выходные?) падение мощности.

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 69,300,000 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 98,700,000 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 475 дней

Автор: Rilian Apr 21 2010, 00:02

Вчера поставили рекорд проекта по сливам!

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 69,560,000 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 98440000 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 418 дней

Автор: Yurr May 1 2010, 10:56

О! Интересно. Значит остается год с лишним, а может и меньше, если будет рост вычислительной мощности

Автор: Rilian May 5 2010, 01:41

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 43.74% - 72,563,255 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 95436745 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 416 дней

Автор: Rilian May 11 2010, 08:29

HCC выпустили статью

Summary
The Help Conquer Cancer project researchers have developed an image-analysis and classification system for automatically scoring images from high-throughput protein crystallization trials.

Non-technical abstract:

The structure of cancer related proteins is important to know because their shape determines their function and role in the disease process. These proteins are usually large, so the only way to determine their structure is using x-ray crystallography. What makes this exceedingly time consuming is the necessary first step of getting the protein to crystallize. To do this, the scientists mix in varieties of compounds in the hope that this will help spur the crystallization of the protein. Using robots, many thousands of crystallization attempts are made. To determine if a crystal actually formed requires human observation and this is very time consuming.

By using World Community Grid, the scientists were able to developed an automated system for analyzing the images of the crystallization attempts and recognizing whether crystallization occurred. They have already trained the system to successfully recognize 80% of crystal-bearing images and eliminate 98% of clear drops. This significantly reduces the time required for human inspection, which should lead to much faster structure determination of proteins under study.

Eventually this should lead to a better understanding of the role of certain proteins in cancers and other diseases, which in turn should lead to identifying better treatments for these diseases.

Technical Abstract:

We have developed an image-analysis and classification system for automatically scoring images from high-throughput protein crystallization trials. Image analysis for this system is performed by the Help Conquer Cancer (HCC) project on the World Community Grid. HCC calculates 12,375 distinct image features on microbatch-under-oil images from the Hauptman-Woodward Medical Research Institute’s High-Throughput Screening Laboratory. Using HCC-computed image features and a massive training set of 165,351 hand-scored images, we have trained multiple Random Forest classifiers that accurately recognize multiple crystallization outcomes, including crystals, clear drops, precipitate, and others. The system successfully recognizes 80% of crystal-bearing images, 89% of precipitate images, and 98% of clear drops.

For access to the paper, please click http://www.springerlink.com/content/750430466h336142/fulltext.pdf.

Автор: EKONOMIST May 11 2010, 15:35

Переводил вышезапощенное для себя, подредактировал и выложил для тех, у кого проблемы с инглишем. Незнакомые мне и трудноусвояемые термины помечены (?). Редактирование теми, кто в теме, приветсвуется.

Исследователи проекта HCC разработали систему анализа и классификации изображений для автоматического отбора изображений с испытаний высокопропроизводительной крисстализации протеинов.

Не технические подробности:

Весьма важным является изучение структуры протеинов, связанных с раком, т.к. их форма определяет их роль и функции в процессе заболевания. Эти протеины обычно достаточно велики, потому единственным способом определить их структуру является использование рентгено-кристаллографии. Первым непосредственным шагом является весьма времязатратный процесс получения протеина для кристаллизации. Для этого ученые в разных вариациях смешали соединения в надежде, что это поможет стимулировать кристаллизацию протеина. С помощью роботов были сделаны тысячи попыток кристаллизаций. Для определения, действительно ли сформировался кристал,необходим человеческий анализ и на это уходит очень много времени.

Используя WCG, ученые смогли разработать автоматическую систему для анализа изображений попыток кристаллизации и определения, произошла ли кристаллизация. Они уже смогли обучить систему успешно распознавать 80% кристалло-несущих(?) изображений и исключать до 98% чистых капель(?). Это значительно сокращает время, расходуемое на анализ результата человеком, что должно привести к значительному ускорению определения структуры протеинов в исследовании.

В конечном итоге это должно привести к более глубокому пониманию роли отдельных белков в раковых и других заболеваний, что в свою очередь должно привести к выявлению лучшего способа лечения этих недугов.

Технические подробности:

Мы разработали систему анализа и классификации изображений для автоматического отбора изображений с высокопроизводительных испытаний крисстализации протеинов. Анализ изображений для этой системы выполняется проектом HCC в WCG. HCC вычисляет 12375 характерных особенностей изображений, поставляемых Высопроизводительной скрининг-лабораторией Института медицинских исследований Хауптман-Вудвард. Используя вычисленные с помощью HCC особенности изображений и массивный набор из 165351 вручную отобранных изображений, мы подготовили множество классификаторов, которые могут точно распознавать множество результатов кристаллизации, включая кристаллы, чистые капли, оплошности(?) и другие. Система успешно распознает 80% кристаллонесущих изображений, 89% изображений с осадком(?) и 98% чистых капель.

Автор: Rilian May 11 2010, 16:28

EKONOMIST, тока непонятно, это уже после 45% подсчета проекта система научилась распознавать 80% раковых следов на кристаллах ?

Автор: EKONOMIST May 11 2010, 17:36

Да я без понятия, я перевел только кусок, выложенный тобой. Но судя по всему это изначальные данные. Исходя из описания, докторам нужно было автоматизировать процесс распознания определенных факторов и отсеивания лишнего, чтобы не сидеть над каждым снимком, что они и сделали

Автор: Rilian May 11 2010, 23:47

QUOTE(Rilian @ May 11 2010, 17:28)

Автор: Rilian May 13 2010, 13:09

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 45.5% - 74,437,488 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 93562000 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 399 дней

Автор: Rilian May 18 2010, 23:28

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 46.4% - 75,634,416 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 92365584 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 388 дней

Автор: re_SET May 21 2010, 11:43

Думаю, через день-два будет рост вычислительных мощностей в проекте за счет переброса части мощностей из закончившего выдавать задания HFCC .

Автор: Rilian May 24 2010, 10:23

В связи с освободившейся после HFCC мощностью (100 терафлоп), за вчера посчитано 254000 тасков!

Автор: Brodyaga May 27 2010, 15:05

То ли все ломанулись за заданиями и мне не хватило, то ли на серваке проблемы какие-то, но сегодня вместо НСС мне на второй машине выдало задание HPF. А машина медленная, да и работает не всегда, сутки чистой работы ей на это задание (а реального времени так дня три)

Автор: Rilian Jun 7 2010, 14:29

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 49.35% - 80,718,658 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 87300000 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 322 дня

Автор: Rilian Jun 8 2010, 17:44

За вчера посчитано 300,067 заданий. Это новый рекорд!

Автор: Gelo Jun 8 2010, 20:28

Вот если бы они забабахали GPU-клиент - рекорды были бы другие

Автор: Rilian Jun 12 2010, 01:12

ПОСЧИТАНО БОЛЕЕ 50% ПРОЕКТА

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 50.32% - 82,012,992 заданий из 84000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 85987008 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 309 дней

Автор: Gelo Jun 12 2010, 06:14

вобсчето 82012992 заданий из 168000000 будет 48,83%

ЗЫ: в два ночи надо спать

Автор: Rilian Jun 12 2010, 10:19

Gelo, 50.32% это инсайдерская информация

Автор: Rilian Jun 19 2010, 19:19

World Community Grid project automates tedious process to determine if protein samples are ready for x-ray examination.

Using World Community Grid, the Help Conquer Cancer project scientists have devised a way to automate and accelerate a manual, complex process that enables researchers to more easily discover the structure of cancer-related proteins, and, eventually, formulate cancer cures. This new, automated approach may also help the exploration of other diseases and food-related research.

To read more about this exciting announcement, please click here:

http://www-03.ibm.com/press/us/en/pressrelease/31902.wss

Автор: Rilian Jun 30 2010, 20:50

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,29243

Исходное кол-во картинок для обработки увеличено с 85млн до 115млн

Это добавляет примерно 6-7 месяцев к рассчетам этой фазы проекта

на текущий момент обработано 37% проекта

Автор: Rilian Jul 1 2010, 01:32

ПОСЧИТАНО БОЛЕЕ 37% ПРОЕКТА

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 37.45% - 87,054,663 заданий из 115000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 142,945,337 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 541 день



на core2duo 2.1ghz 64-bit за день считается 20 заданий

Автор: Buck Jul 1 2010, 11:47

То 50% то 37%.... как копирование группы файлов в винде.... то 10сек - то - 14 мин...

Автор: gladiator_maximus Jul 1 2010, 16:58

Rilian,
на моем атлоне задание считается 4 часа,т.е. на двух ядрах за сутки считается 12 заданий, частота 2,6, ОС 32 бита, неужели ОСь64 бита дает такой прирост скорости?

Автор: Rilian Jul 1 2010, 17:41

QUOTE(gladiator_maximus @ Jul 1 2010, 17:58)

Автор: gladiator_maximus Jul 1 2010, 18:01

Нифига себе! На том же самом железе но при разных ОСях производительность может достигать 40%!
Буду думать.

Автор: Tamagoch Jul 2 2010, 13:43

2 часа 20 минут на разогнанном до 3.3 ГГц ядре Атлона 240 и ХР 64-бит
на "32-битных" машинах нет разгона и нагрузка периодическая, не могу сравнить, но где-то видел 2ч 40м
вроде пропорционально частоте ядра....

Автор: gladiator_maximus Jul 2 2010, 16:37

Подскажите, если ли смысл ставить виртуалку, на нее линукс 64 бит?
Будет ли выигрыш от производительности?

Автор: Rilian Jul 2 2010, 16:53

QUOTE(gladiator_maximus @ Jul 2 2010, 17:37)

Автор: ReMMeR Jul 2 2010, 21:40

Автор: Rilian Jul 3 2010, 12:04

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 37.72% - 87,686,825 заданий из 115000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 142,345,337 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 571 день



На core2duo 2.1ghz 64-bit за день считается 20 заданий. Грубо говоря нам надо 1500000 компов на 1 день

Автор: Rilian Jul 6 2010, 11:20

на Ubuntu 64bit на 2.6Ghz 1 WU считается за 55 минут

Автор: corsar83 Jul 6 2010, 11:35

Не глюк точно Может попробовать эту убунту

Автор: Rilian Jul 6 2010, 11:45

QUOTE(corsar83 @ Jul 6 2010, 12:35)

Не глюк точно Может попробовать эту убунту

Автор: Brodyaga Jul 6 2010, 12:54

QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 12:20)

на Ubuntu 64bit на 2.6Ghz 1 WU считается за 55 минут

Автор: ReMMeR Jul 6 2010, 12:59

Автор: corsar83 Jul 6 2010, 13:21

У меня на 64 бит Win7 считает не намного быстрее чем на XP 32 бит. И уж никак не за час. А где-то 2-2,5. Знач всё же линух.

Автор: drorion Jul 6 2010, 13:26

QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 12:20)

на Ubuntu 64bit на 2.6Ghz 1 WU считается за 55 минут

Автор: corsar83 Jul 6 2010, 13:57

Ну 1.30 это еще нормально. У меня на том же проце на XP 32 бит считает где-то за 3 часа, а иногда и больше. НСС с этим процом чото не дружит. А вот например Docking i Fight Aids, довольно быстро. Не медленней чем интел это уж точно.

П.С. Попробую и я убунту

Автор: Rilian Jul 6 2010, 14:06

QUOTE(drorion @ Jul 6 2010, 14:26)

Это что ж получается, одно ядро Core i7 2.6Ghz быстрее в 2 раза чем Phenom 2.8 Ghz????
Похоже я лоханулся с покупкой

QUOTE(drorion @ Jul 6 2010, 14:26)

Автор: drorion Jul 6 2010, 14:16

QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 15:06)

QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 15:06)

Автор: Peret Jul 6 2010, 16:12

Может дело еще и в компиляторе, вон в ейнштейне AMD тоже Intelу сливает, так там дело именно в оптимизированном под интел компилляторе.

Автор: Brodyaga Jul 6 2010, 16:36

QUOTE(ReMMeR @ Jul 6 2010, 13:59)

Автор: Rilian Jul 6 2010, 22:50

Добавил в шапку видео о проекте

Автор: gladiator_maximus Jul 10 2010, 10:41

Установил ХР 64 бит.Посмотрел время выполнения заданий на сервере грида с 32 бит и 64 бит.Сделал среднею выборку.Так вот- прирост составил аж целых 5 %!
Т.е. ничего.В Космологии тоже самое, прироста нет.
Установил на варю убунту 10.04, боинк заданий не получает, пишет вот что Суб 10 Июл 2010 11:29:23 World Community Grid [error] App version has unsupported platform i686-pc-linux-gnu
Получаетя, что не поддерживает эту платформу.
Но люди же считают на убунте, в чем тут проблема?
Да и еще-при запущенной варе,в фолдинге падает производительность, печально, наверное, откажусь от использования виртуалок.

Автор: gladiator_maximus Jul 12 2010, 15:47

У меня такая идея появилась: создать в контакте группу с названием "Помоги Победить Рак". И заняться рассылкой приглашений вступить в группу и считать проект. Привлечь этим внимание людей к этому проекту.
Как вам эта идея?

Автор: ReMMeR Jul 12 2010, 16:26

Отличная идея.
ТСК! давно так рекрутов набирает.

Автор: huangdi Jul 13 2010, 07:25

А не лучше ли разложить стопку буклетов по онкодиспансерам?

Автор: Brodyaga Jul 13 2010, 14:35

QUOTE(huangdi @ Jul 13 2010, 08:25)

Автор: huangdi Jul 13 2010, 17:07

Для остальных людей рак слишком абстрактен (вон Atlas насколько мотивированно фолдит). А компьютер есть не у всех, кто читает/смотрит СМИ.

P.S. В очередной раз не сойдемся, где и что делать, и не будем делать ничего

Автор: gladiator_maximus Jul 13 2010, 17:18

Люди,в контакте сидит большая часть населения, затрат материальных нет, целевая аудитория огромна, по-моему,стоит попробовать!
Rilian,,ты как кэп команды скажи,что думаешь по этому поводу.

Автор: tiss Jul 13 2010, 17:48

(gladiator_maximus @ Jul 13 2010, 18:18)

Автор: nikelong Jul 13 2010, 21:21

gladiator_maximus,
Лучше сделай как ты считаешь нужным, чем вообще никто не сделает (!)

Алсо, Рильян врядли будет против каким-либо действиям, которые способствуют популяризации команды Украины (!)

Автор: Rilian Jul 26 2010, 00:17

Насчитал 7 процессорных лет в проекте

gladiator_maximus, я за любые действия для популяризации ВЦГ

тем временем проект считается со скоростью 260000 ВЮ в день и уже посчитано 40%

Рекорд на Core i7 - 0.83 часа за ВЮ

Автор: Rilian Jul 27 2010, 23:09

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 40.45% - 93,709,379 заданий из 115000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 136 290 621 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 524 дня

Автор: Arbalet Jul 27 2010, 23:14

(Rilian @ Jul 28 2010, 00:09)

с такой скоростью проект завершится через 524 дня

Автор: Rilian Jul 27 2010, 23:22

Arbalet, медали обещают уже давно... Они решают какую шкалу сделать, чтобы хватило на много процессорных лет вперед

[offtop]Я думаю до конца этого года будут[/offtop]

Автор: cosmo_vk Aug 23 2010, 10:37

а между делом мы подбираемся к заветной циферке 100 мульёнов!

Автор: gladiator_maximus Aug 25 2010, 18:22

Статья о проекте http://www.cybersecurity.ru/prognoz/96211.html

Автор: Rilian Sep 3 2010, 12:24

http://www.facebook.com/video/video.php?v=103977142955935

Автор: vitalidze1 Sep 4 2010, 18:08

Rilian,

В шапці написано, що 64 бітні ОС дають приріст 40 процентів, але ж самі завдання HCC -32 бітні?

Автор: Rilian Sep 4 2010, 22:42

vitalidze1, сами задания HCC это jpeg-картинка. Алгоритм в 64-бит системах каким-то образом эффективнее юзает память и поэтому быстрее работает.

У меня на 32-бит винде на ноде задание считается за 5.5 часов. На той же ноде (3.2ггц, логические 4 ядра) на линупс64 (убунта) задание считается за 3 часа

Автор: gladiator_maximus Sep 5 2010, 07:57

У меня на амд на 64-бит, может процентов на 5 быстрее стали считаться.
Видимо, под интел проект заточен.

Автор: vitalidze1 Sep 5 2010, 09:34

(Rilian @ Sep 4 2010, 23:42)

Автор: serymba Sep 11 2010, 20:05

да аква канешно хорошо ,но буду считать HCC (всеж на 2 ядрах)
кстати не заметил разницу 32 и 64
пробовал на 7 - 64 ,что там 2 ч с хвостом,что на хр - 32 одинакого(может что то провтыкал)

Автор: gladiator_maximus Sep 18 2010, 16:43

Проект посчитан на 44,90%.
В среднем, 2% в месяц.
Таким темпами понадобится более 2-х лет до завершения проекта.

Автор: Yurr Oct 7 2010, 16:39

Мнда... не быстро

Автор: StanislavZ Oct 8 2010, 23:27

Уже 46.52%, и результатов в день все больше и больше!

Так что давайте поднажмем и может через год закончим!

Автор: Rilian Oct 14 2010, 05:32

Автор: cosmo_vk Oct 14 2010, 08:44

да уж изменили и сразу файловая система рухнула.... шутка.
млин хотел до конца года на нем остаться и только во вторник перевел все машинки на обработку заданий, ан нет... придется подождать.

Автор: Brodyaga Oct 14 2010, 08:50

QUOTE(Rilian @ Oct 14 2010, 06:32)

Автор: Rilian Oct 16 2010, 13:52

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 47.21% - 108 582 719 заданий из 115000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 121 417 281 заданий

Вчерашняя скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 589 дней

Автор: cosmo_vk Oct 18 2010, 07:40

Sekerob обмовился что на самом деле добавили не 30 лямов новых заданий, а только 20. В итоге сейчас проект завершен на 55%
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,18662_offset,50#299461

Автор: Yurr Oct 18 2010, 15:24

Очень плохо что ВЮ в Help Conquer Cancer идут через https Ибо у меня выход в инет для компов с Боинком организован через прокси и по логин-паролю, но как оказалось, через secure-соединение не идет трафик, если клиент аутентифицируется по логину-паролю, если по IP - тогда работает отлично.

Автор: Rilian Oct 18 2010, 15:28

QUOTE(Yurr @ Oct 18 2010, 16:24)

Автор: Yurr Oct 18 2010, 15:59

(Rilian @ Oct 18 2010, 16:28)

Автор: Rilian Oct 23 2010, 23:25

QUOTE(Yurr @ Oct 18 2010, 16:59)

QUOTE(Rilian @ Oct 18 2010, 16:28)

ccproxy тебе в помощь (ищи по форуму)

спс, поищу и попробую ccproxy

Автор: Rilian Oct 23 2010, 23:31

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 54.9% - 110339666 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 99 660 334 заданий

Средняя недельная скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 424 дня

Автор: Rilian Oct 26 2010, 12:53

corsar83, подпишись на этот топик: http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30185

Автор: corsar83 Oct 26 2010, 13:38

(Rilian @ Oct 26 2010, 13:53)

Автор: Buck Oct 26 2010, 17:16

В последних дровишках для АТИ Catalyst 10.10 - OpenCL уже официально включён!

Автор: corsar83 Oct 26 2010, 20:39

(Buck @ Oct 26 2010, 18:16)

Автор: Yurr Oct 29 2010, 12:31

(Rilian @ Oct 24 2010, 00:25)

Автор: Rilian Nov 2 2010, 16:31

Статья о результатах проекта за октябрь 2010!

Dear World Community Grid members,
We have a new progress report on the HCC project web site. We have lately enhanced our automatic image classifier by simultaneously considering multiple images from the same crystallization trial:



These images were taken one week apart during a single crystallization trial. The state of the trial changes from precipitate at week 0 (left), through mixed precipitate and crystal at week 1, to crystal at weeks 2, 3, and 4. By evaluating multiple images in the same time course, a more consistent classification is obtained. We are also studying the effect of expanding the context of the image in other dimensions.

Thank you for your continued donations of CPU time and enthusiasm to this project and others on the World Community Grid. Your contributions make this research possible.

Christian A. Cumbaa
Research Associate
Ontario Cancer Institute

Если очень кратко: теперь анализатор изображении кристаллографии может работать с изображениями одного и того же кристалла но за разные периоды времени, и на основании изменений делать какие-то выводы

Скачать пресс-релиз (на английском): http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/UPDATE-OCT2010.pdf

Автор: Rilian Nov 3 2010, 16:22

Умер Виктор Черномырдин. По этому поводу грянул хор ответственных и не очень лиц: "Какой был замечательный человек! Какого масштаба! Да, как жаль!" Впереди роскошные похороны в прямом эфире. Дань уважения, о которой человек и не мечтал при жизни. Хотя, конечно, это уважение и забота, когда человек жив, ему гораздо полезней. Люди придают излишне большое значение похоронам, украшая смерть: торжественно, цветы, замечательный гроб, вереница людей, красивые и добрые слова в адрес усопшего. Вместо того, чтобы хоть часть этих усилий направить на то, чтобы человек жил! Черномырдин умер от рака. Вот лучше бы все задумались, что рак - это плохо и с ним нужно бороться. Что у нас в стране из рук вон плохо обстоят дела с профилактикой, лечением и научными изысканиями в онкологии. Тем не менее в мире существуют исследования, эксперименты, идеи которые могут существенно снизить смертность от онкологических заболеваний, продлить жизнь человеку. Что необходимо внедрять в клинику новые методы биоинформатического поиска, моделирования заболеваний, драг-дизайна, секвенирования ракового генома. Что нужно финансировать борьбу с раком! Необходимо изучать фундаментальные механизмы старения, как основной причины раковых заболеваний.
На похоронах люди сожалеют о смерти человека, но это уже поздно. Надо действовать, когда человек жив, когда вы сами ещё живы.

http://m-batin.livejournal.com/88182.html

пс: рекомендую подписаться на его ЖЖ

Автор: nikelong Nov 4 2010, 12:57

Письмо с того света...

Приветствую вас, Живые!

Моё имя вам ничего не скажет, так что и называться не буду. Мне, по большому счёту, и дела до вас никогда не было. Но теперь, когда я могу посмотреть из того мира, в котором я сейчас нахожусь, в тот, в котором вы живёте, всё моё существо сжимается от боли и сострадания к вам. Ведь и я когда-то был точно таким же, как вы. Я совершал те же ошибки, которые из поколения в поколение с каким-то маниакальным упорством совершаете и вы. В вашей жизни появилось много всяких красивых и полезных штук: вы зовёте их мобильниками, компьютерами, автомобилями, Интернетом… да всего и не перечесть. Но ваши ошибки практически не отличаются от тех, которые совершали ваши прапрадеды… И я!

Я умер от рака лёгких в одной далёкой деревеньке, каких полным полно на просторах нашей необъятной страны. Всю свою жизнь я курил. Точно так же, как сейчас это делаете и вы. Сигареты тогда были ещё в диковинку, проще было купить упаковку мелко нарезанного табака и курить трубку. Я курил, не обращая внимания ни на что. Ни на то, что в тридцать лет почти остался без зубов и задыхался по утрам от чудовищного кашля. Ни на то, что в сорок лет стал выглядеть на все шестьдесят. Это вы, по какой-то необъяснимой глупости, считаете, что ваши курящие сверстники выглядят ровно на столько, сколько им есть на самом деле.

Ха! Да вам просто уже не с кем сравнить свои изуродованные тела. Ведь среди вас здоровых людей почти не осталось. Ваши матери рожали вас с сигаретой в зубах, а ваши невесты и жёны курят, как матросы китобойного судна. Да и сами вы курите так, будто ничего важнее в вашей жизни нет. Ваши дети, ещё каким-то чудом не вступившие в армию любителей табачно-бумажной соски, уже сейчас травятся табачным дымом, коим вы их окутали со всех сторон. Мне больно и страшно смотреть, как вы, гуляя со своими крохотными детишками в парке или на природе, курите не просто в их присутствии, а прямо рядом, находясь от них на расстоянии вытянутой руки. Вы до того одурманили себя этим проклятым зельем, что некурящих людей уже считаете если не ненормальными, то странными – точно!

Не думайте, что я не знаю, о чём говорю. Ведь я не просто побывал в вашей шкуре. Я не просто был таким же курильщиком, как и вы. Я умер от этого. Я прошёл весь этот мучительный, тупиковый путь от начала и до конца. От первой папиросы, стащенной у отца, до смерти от раковой опухоли, которая превратила мои лёгкие в кучу протухшего окровавленного мяса, разрушила лимфатическую систему и, в конечном счёте, уничтожила мой мозг. Но если в наше время не было никого, кто бы открыто заявил, что эта безобидная на вид травка – самый настоящий убийца, то вам об этом буквально кричат на каждом углу. А вы, как дураки, считающие себя умнее планеты всей, не просто продолжаете курить, но и пополняете свои ряды, затаскивая туда уже детей.

Бросайте это дело. Сейчас, когда вы ещё молоды и сильны, вам тяжело поверить в то, что вы обречены. Вам всё ещё кажется, что вы «контролируете ситуацию» и сможете бросить курить, «когда придёт время». Но это время не придёт никогда. И каждая выкуренная вами сигарета делает пропасть между вашей свободой и вашей смертью всё шире и шире. И чем дольше вы тянете резину, тем меньше шансов у вас освободиться от курения.

Знаю, что вам тяжело поверить в то, что чаша сия вас не минует. Вы, в силу своей молодости или неистребимой тупости, не можете поверить в то, что эта дымящаяся штучка в ваших руках – орудие самоубийства, которым вы себя изничтожаете каждый день. Но когда вы окажетесь на смертном одре, вы будете готовы продать душу дьяволу лишь бы избавиться от чудовищных мук и будете обливаться совершенно бесполезными слезами покаяния от того, что когда-то давно решили стать старше и круче и взяли в рот свою первую сигарету.

Вы будете грызть локти из-за того, что по собственной дурости расплачивались собственным здоровьем за имидж, когда в душной сауне выкуривали с компаньонами и партнёрами по бизнесу толстые, как сарделька, сигары, или раскуривали трубку перед объективами видеокамер. Перед смертью вы все пожалеете о том, что курите. Но я не хочу, чтобы вы и ваши дети умерли от табака. Я знаю, каково это. Я умер от этого. Освободитесь и сделайте ваших потомков свободными!

Искренне ваш, Мёртвый…
http://ne-kurim.ru/articles/pismo-s-togo-sveta/

Автор: vitalidze1 Nov 4 2010, 15:43

Папіроси - признак поганого виховання батьками.

Автор: gladiator_maximus Nov 4 2010, 15:53

В Англии на пачках сигарет помещают фото людей умерших от рака легких.
Помни о смерти...

Автор: StanislavZ Nov 4 2010, 17:18

У Стенфорда есть проектик, нанесли на карту все сигаретные фабрики в мире: https://www.stanford.edu/group/tobaccoprv/cgi-bin/wordpress/

Я даже помогал им находить точное расположение некоторых

Автор: ReMMeR Nov 5 2010, 09:46

Щоб сигарети перестали виробляти треба перестати їх купувати =)
Все ж так просто =)

Автор: vitalidze1 Nov 5 2010, 09:47

gladiator_maximus, , і ще в англії пачка мальборо коштує 10 фунтів, не дуже і покуриш. Хоча, паління, це показник культурного і морального розвитку суспільства.

Автор: Yurr Nov 10 2010, 10:43

Сорри, за нубский вопрос - что такое Points Generated еще понятно, а вот что такое Results Returned, что значит или как считается?

Автор: Rilian Nov 10 2010, 11:43

QUOTE(Yurr @ Nov 10 2010, 10:43)

Автор: Rilian Nov 20 2010, 13:27

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 55.23% - 116000000 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 94 000 000 заданий

Средняя недельная скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 439 дней

Автор: Mr Alter Ego Nov 24 2010, 09:15

мне вот интересно стало ... то что показывается в экранной заставке, это просто для красоты, или эти круги действительно обрабатываются ? там же разрешение картинки никакое, и в ней вообще порой ничего нету. какой нибудь красный круг ....
что там можно анализировать 2 часа?

спасибо

Автор: Rilian Nov 24 2010, 13:08

Mr Alter Ego, это фото рентгеновской кристаллографии, и программа ищет "характерные особенности" белков на этих фотках. почитай статью в шапке, там описан процесс

Автор: Rilian Dec 3 2010, 16:11

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 56.6% - 118851122 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 91 150 000 заданий

Средняя недельная скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 440 дней

Автор: Rilian Dec 10 2010, 23:54

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 57.3% - 120326622 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 89 673 378 заданий

http://tinyurl.com/WCGHCC скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 433 дня

Автор: tribal Dec 12 2010, 22:43

плин.. а убунта 64 довольно шустро щелкает это проект, жалко что очков меньше дают.. а так бы прирост еще больше был!

Автор: Rilian Dec 21 2010, 13:59

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 58.35% - 122,546,892 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ) - 210000000 всего,
и осталось досчитать 87 450 000 заданий

http://tinyurl.com/WCGHCC скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 418 дней

Автор: Brodyaga Dec 28 2010, 12:52

Мне кажется, или проект обороты набрал? Обычно у меня четыре страницы заданий на валидации висит, а тут буквально за последние дни сократилось до двух. И текущие задания практически все сразу проверку проходят.

Автор: Rilian Dec 28 2010, 13:57

хз, у меня 250 заданий в день клепается, и все время висит 15 страниц валидации (на 1 стр 15 ВЮ)

Автор: Rilian Jan 1 2011, 16:44

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 59.44% - 124,836,155 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ) - 210000000 всего,
и осталось досчитать 85 163 845 заданий

http://tinyurl.com/WCGHCC скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 419 дней

Автор: Rilian Jan 9 2011, 11:26

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 63.3% - 126 000 000 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ) - 210000000 всего,
и осталось досчитать 84 000 000 заданий

http://tinyurl.com/WCGHCC скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 396 дней

Автор: Yurr Jan 14 2011, 14:35

Ну что там? Годовую отметку в 365 дней уже преодолели?

Автор: omega.zp Jan 14 2011, 18:48

Yurr,
Нет еще
При текущей скорости 212 850 заданий в день, проект завершится через 387 дней.
Осталось досчитать 82 380 192 заданий.

Rilian
сорри

Автор: Rilian Jan 14 2011, 21:01

QUOTE(Yurr @ Jan 14 2011, 14:35)

Автор: Rilian Jan 25 2011, 17:30

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 65.37% - 130000000 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ) - 210000000 всего,
и осталось досчитать 80 000 000 заданий

http://tinyurl.com/WCGHCC скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 369 дней

Автор: Rilian Jan 30 2011, 15:50

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 65.72% - 131,149,628 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ) - 210000000 всего,
и осталось досчитать 78 850 372 заданий

http://tinyurl.com/WCGHCC скорость http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hcc1 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 355 дней



можно сказать, после 3 лет рассчетов, преодолен годичный рубеж до конца этой фазы проекта

Автор: Rilian Feb 1 2011, 10:25

в проекте приблизительно 6% тасков - с ошибками или отправленные на валидацию

поэтому, по уточненным данным, посчитано 131 533 157 тасков, из них реальные 131 533 157 * 0.94 = 123 641 168

осталось досчитать 210000000 - 123641168 = 86 358 832

при средней недельной скорости 235 000 это 86 358 832 / 235 000 = 367 дней + (6% = 22 дня) = 389 дней

Автор: StanislavZ Feb 1 2011, 23:37

Щогодини від раку помирає 10 українців - МОЗ

http://life.pravda.com.ua/society/2011/02/1/71311/

Страшно жить...

Автор: Alien Feb 2 2011, 01:24

от ДТП больше =)

Автор: Rilian Feb 2 2011, 10:12

QUOTE(Alien @ Feb 2 2011, 01:24)

Автор: ReMMeR Feb 2 2011, 10:16

оффтоп
Alien, Делаем новій проект "Stay-at-Home" =)

Автор: StanislavZ Feb 2 2011, 10:24

(Alien @ Feb 2 2011, 01:24)

Автор: vitalidze1 Feb 2 2011, 10:41

Рак, це жахлива хвороба, що може прийти навлть до людини, котра веде здоровий образ життя. Жуть якась. Але про це потрлбно менше думати, менша влроглднлсть, що це з тобою станеться.

Автор: Rilian Feb 17 2011, 12:23

Меланому можно победить - по крайней мере, у мышей...

Меланома - одна из самых злокачественных форм рака
Меланома относится к самым опасным формам рака: она не только быстро прогрессирует, но и плохо поддается химиотерапии. Теперь кельнские ученые смогли полностью излечить от меланомы лабораторных мышей.

http://test.org.ua/usefulinfo/zdorovie_kosmetika/news/126