Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

2 Сторінки V  1 2 >  
Reply to this topicStart new topic
> Volpex@UH, Поведение протеинов в клетках
Rilian
Oct 16 2011, 07:32
Пост #1


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера





Проект "Volpex@UH"

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников:

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 29.03.2011 Капитан - Death
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://volpex.cs.uh.edu/VCP/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Новичкам: статья со скриншотами, как поставить и настроить BOINC-менеджер
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же Именем и EMAIL. если при регистрации в проекте указать другой e-mail , BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! В этом случае рекомендуется зайти во все ваши аккаунты и во все проекты и где надо поменять емейл на нужный. Через некоторое время ваши аккаунты сольются в один с одним cross-project-id.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

О проекте:
Volpex@UH is a research project that uses Internet-connected computers to do research in creating effective parallel computing on multiple volatile nodes.



Most desktop computers are virtually idle most of the time. They represent an immense pool of unused computation, communication, and data storage capacity. Available compute power is expanding rapidly with the advent of multi-core systems. But these nodes are "volatile" as their owners can make them unavailable suddenly and without notice. The goal of Volpex is to address the challenge of parallel computing on such volatile nodes. Here are some specific directions:

Volpex MPI

This project is developing an implementation of MPI customized for robust execution on volatile nodes. Message passing exchanges are converted to Put/Get operations executed asynchronously. VolPEx design is based on execution of 2 or more replicas of each MPI process - the application progresses at the rate of the fastest replicas and continues seamlessly on failure, as long as at least one replica for each process is alive.

Volpex Dataspace

Current systems for execution on volatile nodes such as, BOINC and Condor primarily support execution of independent tasks on nodes. The central goal of Volpex Dataspace is to enable execution of communicating parallel programs on volatile ordinary desktops. We need a robust communication layer that facilitates data exchanges between tasks. Key features:

Abstract dataspace that acts as (intermediary) for data exchange between tasks
Asynchronous exchange of data objects
Well suited to redundant computation of tasks to handle volatile nature

Volpex Simulation

The objective of this work is to simulate the performance of parallel applications on desktop grids by creating a virtual model of the real world network, which has all of the characteristics of a real world network plugged in, and to obtain the simulation results for different parallel applications for different combination of network parameters on different varieties of network configurations. More information about Volpex Simulation can be found here.


This work is supported by:NSF


Death, вот ты создал команду. А на форуме топик создать?

Account data for x3mEn
Volpex@UH member since 8 Jun 2011
Account data for Death
Volpex@UH member since 29 Mar 2011

facepalm.gif

10 Oct 2011 6:37:42 UTC

Hi everyone,

We have just successfully put on our custom credit granting. The old credit has also been normalized.

Credit statistics are now published in http://volpex.cs.uh.edu/VCP/stats

We will probably announce our project to public very soon.

Thank you guys very much for having been staying with us.

Best,
Project adminstrator group


Ссылки по теме:
  • http://forum.boinc.ru/yaf_postst839_Proiekt-Volpex-UH.aspx
  • http://www.setiusa.us/showthread.php?2312-Volpex-UH
  • http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Volpex%40UH/en&setlang=ru
  • http://forum.boinc-af.org/index.php/topic,3840.0.html
График ППД команды "Ukraine"


Це повідомлення відредагував nikelong: Nov 22 2011, 00:27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Oct 16 2011, 11:43
Пост #2


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



проект похоже мертвій до рождения. )) имхо


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Oct 19 2011, 21:39
Пост #3


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Есть ВЮ

New Folding v1.70


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Oct 19 2011, 21:46
Пост #4


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE
Hi everyone,

I have just tried connecting a client to our project using both URLs:

volpex.cs.uh.edu/VCP
129.7.248.104/VCP

Both of them worked fine for me and I did not receive any error message at all. I am using the latest BOINC client for Windows.

My guess is that, even if your clients receive that error message of "wrong project URL", it should not cause any problem for them to receive work from our project.

We will try to generate a lot of work from today, please let us know if your clients encounter any error when receiving work from our project.

Thank you very much!

Best,
Admin Team.


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Oct 19 2011, 23:40
Пост #5


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



Sever for testing Bolpex ))


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Oct 20 2011, 09:37
Пост #6


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



248472 3629 20 Oct 2011 6:37:37 UTC 20 Oct 2011 7:13:29 UTC Error while computing 2,079.77 0.09 0.00 --- New Folding v1.70
248423 3629 20 Oct 2011 6:34:37 UTC 20 Oct 2011 6:37:37 UTC Error while computing 112.20 0.05 0.00 --- New Folding v1.70
248292 3629 20 Oct 2011 6:28:47 UTC 20 Oct 2011 6:34:37 UTC Error while computing 279.06 0.06 0.00 --- New Folding v1.70
248192 3629 20 Oct 2011 6:22:34 UTC 20 Oct 2011 6:28:47 UTC Error while computing 304.80 0.06 0.00 --- New Folding v1.70
248086 3628 20 Oct 2011 6:16:38 UTC 20 Oct 2011 6:20:05 UTC Error while computing 137.02 0.05 0.00 --- New Folding v1.70
247950 3629 20 Oct 2011 6:10:40 UTC 20 Oct 2011 6:14:11 UTC Error while computing 138.14 0.02 0.00 --- New Folding v1.70
247717 3627 20 Oct 2011 5:01:38 UTC 20 Oct 2011 5:03:07 UTC Error while computing 18.17 0.06 0.00 --- New Folding v1.70
247606 3626 20 Oct 2011 5:00:30 UTC 20 Oct 2011 5:01:37 UTC Error while computing 0.00 0.00 0.00 --- New Folding v1.70


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Oct 24 2011, 15:04
Пост #7


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Проект работает на БОИНКЕ от 6.12 и выше

ВЮ получает задания периодически, остальное время спит. Если ВЮ завершилась с ошибкой - это ничего не значит.


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
nikelong
Nov 21 2011, 00:58
Пост #8


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



Привел в порядок шапку. Добавил в БТП.

http://distributed.org.ua/index.php?go=dis...n=full_list#386

Кстати, напишите вкратце по русски что считает проект.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Nov 21 2011, 09:45
Пост #9


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



inCell@Home is an application of Volpex; this project simulates how proteins behave and make function in a real cell-like environment which can be applied in biological drug design.

поведение протеинов в клетках


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Dec 3 2011, 22:27
Пост #10


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



проект считает какой-то folding, в реальном времени

враппер все время онлайн, и периодически получает задания


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Dec 11 2011, 09:15
Пост #11


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Yes, the difference of our project from other projects is that: many volunteer hosts work together at the same time and communicate with each other to solve a common problem. The credit is granted separately and periodically though.

Even for our project, volunteer computers do not interact directly with each other and we do not control your computers too. Explanation on how we exactly do it is a little bit lengthy to write down here and will be found in our upcoming publication.

Currently, BOINC is able to support only one kind of parallel computation - embarrassing parallel (or like you said "DL a WU and crunch it autonomous"), which limits the range of scientific applications that can be used with volunteer computing. Therefore, our research is hoped to solve the problem.

Best,
Admin Team


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Aug 11 2012, 18:15
Пост #12


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Задания снова валидируются и начисляются очки! koc.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Nov 30 2012, 21:50
Пост #13


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



есть ВЮ


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Dec 22 2012, 15:34
Пост #14


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



набрал 5000

Assumed foundership of Ukraine

Congratulations, you are now the founder of team Ukraine Go to Your Account page to find the Team Admin options.

sorry Death wink.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
tiss
Dec 24 2012, 23:24
Пост #15


Мега ранчер
********

Група: Moderators
Повідомлень: 1 662
З нами з: 28-February 09
Користувач №: 952
Стать: Чол
Free-DC_CPID



QUOTE(Rilian @ Nov 30 2012, 21:50) *

есть ВЮ

Рильян, ты мне объясни чё за хреновые у них ВЮ? У меня 60 тасков вылетели с ошибкой. Ради интереса посмотрел на один таск

http://volpex.cs.uh.edu/VCP/workunit.php?wuid=160

Чёт как-то нахер улетают ЦПУ-часы.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

2 Сторінки V  1 2 >
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 13:20

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.