Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Nutritious Rice For The World [complete], рассчет популяции нового, более питательного риса
Rilian
May 21 2008, 09:51
Пост #1


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



IPB Image

Nutritious Rice for the World

проект стартовал 12 мая 2008

Полезные ссылки:
Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid thumbsup.gif

Изучается строение протеинов риса, чтобы потом, не используя генeтические модификации, а просто за счет скрещивания, выводить новые виды. :flowers:

Mission
The objective of this project is to predict the structure of proteins of major strains of rice. The intent is to help farmers breed better rice strains with higher crop yields, promote greater disease and pest resistance, and utilize a full range of bioavailable nutrients that can benefit people around the world, especially in regions where hunger is a critical concern.

Determining the structure of proteins is an extremely difficult and expensive process. However, it is possible to computationally predict a protein's structure from its corresponding DNA sequence. The Computational Biology Research Group at the University of Washington has developed state of the art software to accomplish this. The difficulty is, there are thousands of distinct proteins found in rice. This presents a computational challenge that a single computer cannot solve within a reasonable timeframe. Therefore, volunteers of World Community Grid are invited to assist in this daunting task. Through collaboration with agricultural researchers and farmers, the hope is to eventually improve global rice yields and quality.

Significance
Hunger and malnutrition are the top risks to health worldwide. Nearly 30 percent of the world's population suffers from some form of malnutrition [1]. Every year, 10 million people die of hunger and hunger-related diseases. In fact, more people die from hunger and malnutrition annually than from AIDS, malaria, and tuberculosis combined [2].

Rice is the main food staple of more than half the world's population. 20 percent of the total food energy intake for every man, woman, and child in the world comes from rice. In Asia alone, more than 2 billion people get up to 70 percent of their daily dietary energy from rice and its by-products [3].

Improving strains of rice to yield larger, more resilient, and nutritionally-optimized harvests will positively impact the lives of billions of people.

Approach
Making better strains of rice has traditionally been accomplished through cross breeding of strains to produce hybrids with the best features. However, this is limited to crossing strains with easily observable traits.

Complex traits (such as high yield, disease resistance, or nutrient content) come from complex biochemical interactions of individual component proteins. Identifying such proteins and understanding their properties and interactions gives farmers the opportunity to affect these traits in a refined manner by choosing more subtle candidates for cross breeding. Predicting the structure of proteins can provide insight into the roles they play in the biochemistry of these traits.

Как работает рассчетное ядро
ВЮ содержит некоторые исходные параметры состояния белков. Каждое новое вычисление берет исходные параметры и генерирует новые значения в пределах некоторой нормы, и каждое такое состояние считается примерно 2 минуты на среднем по мощности компьютере. После каждого рассчета ВЮ сохраняется (чекпоинт) и проверяет, превышен ли интервал в 6 часов. Если да - ВЮ отправляется на сервер. Иначе - считается дальше. Таким образом мощные компьютеры могут посчитать примерно 500 состояний за ВЮ, а слабые компьютеры около 200. Соответственно, мощные компьютеры получают больше очков за то же самое время.

IPB Image

График проекта
IPB Image

Це повідомлення відредагував Rilian: May 20 2010, 20:26
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
4 Сторінки V < 1 2 3 4 >  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(15 - 29)
nikelong
Feb 13 2009, 17:24
Пост #16


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



http://www.boinc-af.org/content/view/947/219/

http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?...e_for_the_World


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 8 2009, 12:26
Пост #17


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Официальной новости еще нет, но на оф форуме пишут что "фаза Б" проекта ("фаза А" закончилась недавно) закончится в Августе 2009! После этого возможно будет пауза для разработки новой версии клиента которая будет считать практические данные



--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Anami
Apr 27 2009, 14:04
Пост #18


Соромлюсь щось писати
*

Група: New Members
Повідомлень: 7
З нами з: 27-April 09
Користувач №: 1 008
Стать: Чол



Самый полезный проект


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Apr 27 2009, 22:50
Пост #19


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



гречка самый полезный проект.
ещё nutritious lard может быть...


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
nikelong
Apr 28 2009, 07:39
Пост #20


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



Anami,
Аргументы?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Apr 28 2009, 10:50
Пост #21


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



nikelong, та тю.

раком болеет 1 из 100000 а жрать хотят 1 из 1.

возражения?


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
nikelong
Apr 28 2009, 11:17
Пост #22


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



Один из одного хотят жрать рис? Не не не ...


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Apr 28 2009, 11:41
Пост #23


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



даешь Nutritious Potatoes For the World!


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Apr 28 2009, 12:03
Пост #24


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 429
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



картофель это семейство паслёновых. та ну нах его есть...


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Oct 31 2009, 01:25
Пост #25


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Статус проекта, апдейт

To visualize the work of this project at the protein level, each protein is drawn below as a color dot on a 200x200 grid. The color indicates the status of each protein. Approximately 65,000 proteins are now being processed in this project. Enough work will go into the processing to generate 100,000 three dimensional structures for each protein.

IPB Image
Completed - Currently processing - Not yet started


Sep 15, 2009

Most of our efforts in the fast few months have been spent trying out to tease more domains from the rice protein/proteome to increase the size of the project. These domains have been packaged into work units and are now crunching. So we have raised the number of protein structure predictions from roughly 40,000 initially to about 65,000 when all the larger sequences have been processed. Of these, we have roughly 35,000 completed so we still have about 30,000 to go (so it looks as though we're about halfway done now).

The logic and goal here is that the more comprehensive picture of the individual protein domains in rice we have, the more we can use that to inform us about the structures of other unknown domains in rice as well as other food crops. That is, partial information is much better than zero information. This enables us to obtain a better understanding of the pathways involved at atomic level detail.


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
kornq
Feb 2 2010, 17:21
Пост #26


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 116
З нами з: 10-April 09
З: Киев
Користувач №: 991
Стать: Чол
Парк машин:
Intel E6700@3,00Ghz + ATI RADEON 5870 1GB



Не знаю кто считает этот проект но скоро финиш(где-то до апреля будут WU) , просчитано 92%.


--------------------
Медали в WCG -
(Show/Hide)

 

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Feb 2 2010, 17:34
Пост #27


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(kornq @ Feb 2 2010, 17:21) *

Не знаю кто считает этот проект но скоро финиш(где-то до апреля будут WU) , просчитано 92%.

Откуда информация?


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
kornq
Feb 2 2010, 19:57
Пост #28


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 116
З нами з: 10-April 09
З: Киев
Користувач №: 991
Стать: Чол
Парк машин:
Intel E6700@3,00Ghz + ATI RADEON 5870 1GB



QUOTE(Rilian @ Feb 2 2010, 17:34) *

QUOTE(kornq @ Feb 2 2010, 17:21) *

Не знаю кто считает этот проект но скоро финиш(где-то до апреля будут WU) , просчитано 92%.

Откуда информация?


IPB Image


--------------------
Медали в WCG -
(Show/Hide)

 

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Feb 2 2010, 21:22
Пост #29


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Организовал соревнование до 1 апреля smile.gif

http://www.worldcommunitygrid.org/team/cha...hallengeId=3254


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Mar 3 2010, 13:53
Пост #30


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 764
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
FX-8320 + 1070Ti



Через 3 недели в проекте Nutritious Rice For The World планируют начать отгрузку новых заданий
This is the official statement saying there is an estimated 30 days left of new work to be sent out. The project is expected to have an additional 3 weeks to clean up the remaining batches after that. The last batch of work units from the researchers are 00627 which has been built and loaded earlier today.[Feb 23, 2010 3:15:12 PM]

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,28575


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

4 Сторінки V < 1 2 3 4 >
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 11:51

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.