Версія даної теми для друку
Натисніть сюди для перегляду даної теми у оригінальному форматі
Розподілені обчислення в Україні _ Завершені проекти WCG _ Help Fight Childhood Cancer
Автор: Rilian Mar 8 2009, 00:08
Помоги в борьбе с детским раком / Help Fight Childhood Cancer
http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=890 
- http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=178 - статья у нас на сайте
- http://www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamInfo.do?teamId=J8H4J4QPN1
- http://www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamMemberDetail.do?sort=points&teamId=J8H4J4QPN1
- http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hfcc
- http://www.worldcommunitygrid.org/projects_showcase/hfcc/viewHfccMain.do
- http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/index.html (http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html)
- http://www.nmg-tv.eu/Help.Fight.Childhood.Cancer.htm
В новой фазе проекта, запущеной в Августе 2010, исследуется 3 дополнительных цели
После этого ввиду успешност экспериментов добавлено еще 3 цели. Итого на апрель 2012 года рассчитано 8 целей, и еще 1 на очереди
Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках World Community Grid и один из 7 (на момент запуска) которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум http://distributed.org.ua/forum/index.php?showforum=55.
Часто задаваемые вопросы по проекту:
Что такое нейробластома?
Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком.
Что вызывает нейробластому?
Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны.
Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer?
Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии.
Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer?
Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы.
Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid?
На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года!
Что изображено на скринсейвере?
Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.
Скриншот графического клиента
Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте?
Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми:
* "Лев"
* "Розовые семена"
* "Упражнения по радио"
График производительности проекта:
Автор: Rilian Mar 8 2009, 16:00
Итак, детективы на оф форуме откопали больше информации
https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=24711&lastpage=yes#lastpost
Итак, проект будет медико-биологическим! 
That's normal behaviour for AutoDock.
Autodock - thanks for the hint wink. Interesting target too..
TRKB was in all the WU's I've seen:
TRKB, a member of the insulin receptor subfamily of Tyr protein kinases, is a receptor for brain-derived neurotrophic factor (BDNF), neurotrophin-3 and neurotrophin-4/5 but not nerve growth factor (NGF). This Type I membrane protein is involved in the development and/or maintenance of the nervous system. This is a tyrosine-protein kinase receptor. Known substrates for the TRK receptors are SHC, PI-3 kinase, and PLC-gamma-1. Isoform TrkB is widely expressed, mainly in the nervous tissue. In the CNS, expression is observed in the cerebral cortex, hippocampus, thalamus, choroid plexus, granular layer of the cerebellum, brain stem, and spinal cord. In the peripheral nervous system, it is expressed in many cranial ganglia, the ophtalmic nerve, the vestibular system, multiple facial structures, the submaxillary glands, and dorsal root ganglia. Isoform TrkB-T1 is expressed in multiple tissues, mainly in brain, pancreas, kidney and heart. Isoform TrkB-T-Shc is predominantly expressed in brain. TRKB is subject to ligand-mediated auto-phosphorylation. The structure contains 2 immunoglobulin-like C2-type domains and 2 leucine-rich (LRR) repeats.
Эти белки, докинг которых будет изучаться, участвуют в создании нервных тканей
Автор: Rilian Mar 13 2009, 18:20
проект по подбору лекарств от нейробластомы (рак)
запущен 5 минут назад!
Автор: Death Mar 14 2009, 00:33
сколько времени и памяти на ВУ?
Автор: Rilian Mar 14 2009, 00:49
Приложение - autodock 6.18
Память - 75МБ на ВЮ
Примерно 3 часа на 2.0ГГц
Примерно боинк 20 очков в час на среднем компе
Избыточность - нулевая, каждая ВЮ выдается 1 раз
Автор: nikelong Mar 14 2009, 01:05
Итак люди, вот о чем проект:
Help Fight Childhood Cancer — новый проект объединения World Community Grid, которое поддержало инициативу японских ученых из Центра по исследованию рака Чиба (Chiba Cancer Center Research Institute) и Университета Чиба (Chiba University) по разработке нового лекарственного препарата от страшного детского заболевания — злокачественной опухоли-нейробластомы.
Нейробластома наиболее часто встречается у детей в раннем возрасте, являясь самой распространенной причиной гибели детей от злокачественных опухолей. Японские ученые идентифицировали три специфические белка, связанные с нейробластомой. Подготовлены 3 миллиона кандидатов лекарственных веществ, которые пройдут исследования виртуальным скринингом с помощью программы AutoDock. Те вещества, которые будут наиболее эффективно "выключать" или повреждать белки, станут основой новых препаратов. Если миссия проекта увенчается успехом — препараты появятся в онкоцентрах по всему миру, спасая детские жизни.
Всего планируется выпустить 9 миллионов блоков заданий, вычисление которых на одном компьютеры займет около 8 000 лет! Поэтому нужна помощь участников распределенных вычислений, чтобы уложиться в 1-2 года. Время, в данном случае, означает жизни, детские жизни… Кранчеры, к бою!
Автор: Tamagoch Mar 14 2009, 09:22
надеюсь, картинка динамическая и можно будет следить за статусом отсюда:
upd by rilian: не, картинка это бэкграунд, и над ней будут выводиться человечки по достижении 10%, 20% итд
Автор: Rilian Mar 14 2009, 15:39
Проект "Помоги в борьбе с детским раком" (Help Fight Childhood Cancer Project)
World Community Grid рада объявить о запуске проекта Help Fight Childhood Cancer Project под руководством Института по Исследованию Рака в Чибо (Япония), а также Университета Чиба (префектура Чиба, Япония). Миссия проекта - используя мощности участников World Community Grid, найти лекарства которые смогут заблокировать три вида белков обычно связываемых с развитием Нейробластомы (вид рака) - одного из видов плотных опухолей которые чаще всего развиваются у детей. Нахождение лекарств, блокирующих эти белки, позволит более эффективно лечить этот вид опухоли с помощью химиотерапии. Нейробластома проявляется чаще всего в раннем детстве и обычно ведет к смерти. Если проект будет удачным, он может привести к прорыву в исследованиях этой болезни, которая до сих пор не поддавалась ученым, и это позволит намного увеличить шансы на лечение нейробластомы. Для дополнительной информации, заходите на форум украинской команды распределенных вычислений, посвященный проекту http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=3432
Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках WCG и один из 7 которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум http://distributed.org.ua/forum/index.php?showforum=55.
Часто задаваемые вопросы по проекту:
Что такое нейробластома?
Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком.
Что вызывает нейробластому?
Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны.
Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer?
Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии.
Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer?
Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы.
Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid?
На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года!
Что изображено на скринсейвере?
Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.
Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте?
Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми:
* "Лев"
* "Розовые семена"
* "Упражнения по радио"
Спасибо за участие в World Community Grid и вклад в передовые исследования на медико-биологическом фронте!
Для того чтобы принять участие в проекте, вам необходимо установить на свой компьютер клиент BOINC и подключить его к проекту World Community Grid. Для присоединения к команде Украины:
1. Зарегистрируйтесь на сайте проекта http://www.worldcommunitygrid.org/reg/viewRegister.do?teamID=J8H4J4QPN1
2. Загрузите http://boinc.berkeley.edu/download.php (Если его у Вас еще нет!)
3. В BOINC менеджере перейдите в "Расширенный Вид" (Advanced View)
4. В BOINC менеджере Выберите Сервис -> Добавить Проект (Tools -> Attach to Project)
5. В открывшемся окне введите адрес проекта http://www.worldcommunitygrid.org/
6. Если что, в настройках фаервола разрешите любые соединения для BOINC
7. Введите логин и пароль такой же как при регистрации (в пункте 1)
8. Теперь на сайте проекта в настройках вашего профиля http://worldcommunitygrid.org/ms/device/viewProfiles.do укажите в каком проекте участвовать либо отметьте галочку "Участвовать во всех проектах" ("If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project."). В любом случае активные проекты можно выбирать в любое время!
9. Если вы регистрировались по ссылке из пункта 1, то вас должно автоматически присоединить к команде Ukraine. Если по какой-то причине вас не присоединило, зайдите на страницу команды http://www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamInfo.do?teamId=J8H4J4QPN1 и нажмите "Join Team" ("Вступить в команду")
Автор: nikelong Mar 15 2009, 01:26
Статья на сайте:
http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=178
Автор: Rilian Mar 15 2009, 19:07
Я уже получил бронзовую медальку 
за 14 процессорных дней. 
Автор: Rilian Mar 16 2009, 01:40
Скриншот графического клиента
Автор: Tamagoch Mar 16 2009, 09:38
хоровод вокруг белка 
есть информация о планируемой продолжительности проекта?
Автор: nikelong Mar 16 2009, 09:45
Tamagoch,
Та выше ж писали.
Хотят обработать 9 млн соединений.
Ориентировочно - 2 года расчетов (!)
Автор: Rilian Mar 16 2009, 11:18
из 9000000 заданий 40000 уже готовы 
Автор: cosmo_vk Mar 17 2009, 12:11
если такими же темпами как HCC и FightAIDS будут задания обрабатываться то может намного быстрее, чем год и тем более два.
Автор: Rilian Mar 18 2009, 01:32
Поздравляем Freesom с ацким ППД 20000 очков, а также с бронзовой медалью в этом проекте
http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewMemberInfo.do?userName=Freesom
Автор: Rilian Mar 18 2009, 02:06
В проекте посчитано 80000ВЮ, что составляет 80000/9000000=0.88% и каждый день сейчас считается 25000ВЮ = 0.25% проекта!
Такими темпами проект будет завершен через 400 дней. Можно начинать педалить
Автор: Tamagoch Mar 18 2009, 07:57
Rilian,
ты считаешь 3 миллиона соединений на три белка, которые проверяются по очереди (сейчас к примеру педалим TrkB), но вот бардак с кворумом вообще сбивает с толку, то 1 то 2, наверное если это учитывать, будет еще больше фактических расчетных заданий.... только не понятно как учитывать
Автор: Red-O Mar 18 2009, 08:29
Ну написано "Statistics are unavailable until within 24 hours after returning your first result to the server."
Так вже вчора ввечері воно само показувало "Last Result Returned ... 24+ hour(s) ago"
на перший результат, зараз вже "12+ hour(s) ago" на другий, тобто вже ну точно быльше 24 годин. А досі нічого не показує, в магнетизмі хоч "pending" висять.
Як вкинуло перше завдання, то хоч почало показувати "Device installation 1", до того 0 було.
Тобто щось воно там собі рахує, а коли мені покаже?
Автор: lividum Mar 18 2009, 08:39
люди, а проект вообще работает? а то постави галочку на этом проекте, но мне почему то по прежнему идут только ВЮ от Хелп конквир Кансер...может еще что-то сделать надо?
Автор: Tamagoch Mar 18 2009, 09:17
может убери галочку с HCC вообще
проект-то работает, начисление очков по всем проектам https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewBoincResults.do
Автор: Red-O Mar 18 2009, 09:47
Автор: lividum Mar 18 2009, 09:54
о...только что посмотрел в список жаб, есть одно задание из нового проекта...знач все ок
Автор: Rilian Mar 18 2009, 11:03
Rilian,
ты считаешь 3 миллиона соединений на три белка, которые проверяются по очереди (сейчас к примеру педалим TrkB), но вот бардак с кворумом вообще сбивает с толку, то 1 то 2, наверное если это учитывать, будет еще больше фактических расчетных заданий.... только не понятно как учитывать
С кворумом все ок, каждый комп периодически проверяется так:
комп рандомно выбирается из списка непроверенных и копия ВЮ, которую он посчитал, высылается на заведомо проверенный комп. Если ВЮ валидируется, то все ок. Если у компа последние 15 ВЮ валидны, он заносится в список правильных компов и его кворум становится всегда 1 (до первой ошибки, конечно)
о...только что посмотрел в список жаб, есть одно задание из нового проекта...знач все ок
в первый день очень мало человек на официальном форуме жаловались что им не приходят задания ХФЦЦ. Сейчас таких жалоб нет. У меня стоит галочка на ХФЦЦ, а также "получать ВЮ других проектах если в выделенных нет заданий" и пока все ВЮ что приходят - ХФЦЦшные
У меня уже серебрянная медалька за 45 процессорных дней (иду со скоростью 12 в день!)
Автор: lividum Mar 18 2009, 17:56
Rilian,
а мне вот только 1 пришла, комп ее посчитал и больше нету.
а если сделать как у тебя то будут какой-нибудь рис присылать, а если даже и нет, то Конквир Кансер тоже ж считать нужно...что придется чередовать их что ли...какая то система не гибкая...нет чтоб отслеживалась загрузка донора и прсылались апример напополам задания в выбраных проектах, например 4 ядра работают, так по 2 задания на них с двух проектов.
Автор: Rilian Mar 18 2009, 18:07
Увеличь кэш и убери галку "получать другие задания" (и проверь что у тебя галка поставлена только на HFCC)
У меня стабильно приходят ВЮ HFCC, еще ни одной левой не было Вообще, дефицита нет, проверяй настройки
Автор: Rilian Mar 19 2009, 10:24
Таки-да, за ночь поймал 2 ВЮ из других проектов. В процентном соотношении это примерно 0.5% других ВЮ
Еще на оф форуме я прочитал что если у вас явно выбран один проект, то его приоритет для вашего компа повышается и соответственно понижается для тех у кого выбрано несколько проектов. Поэтому ВЮ в первую очередь идут тем кто выбрал проект, а остальным - как останется. Таким образом контроллируется общее распределение ВЮ по всем компам
Автор: Tamagoch Mar 19 2009, 22:07
пять минут назад смотрел - 8.5% задания было выполнено, только что включил - 7.9%
т.е., процесс иногда откатывается при неудачной попытке просчета части задания? раньше не замечал...
Автор: Rilian Mar 19 2009, 22:18
Я тоже не замечал. Посмотри потом лог, когда ВЮ зальется на сайт. Если будет чето интересное, пиши
Автор: Rilian Mar 19 2009, 23:19
Поздравляем http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewMemberInfo.do?userName=vitalidze1 с бронзовой медалькой за 2 недели рассчетов:
Автор: Tamagoch Mar 20 2009, 22:18
сейчас пересчитываю HFCC_t1_00021013_TrkB_0000 (предыдущий хост прервал вычисления, вушку дали мне 
)
очень быстро набралось 3%, потом начались перескоки до 2.9%, снова набиралось 3.1 и снова 2.9
уже минуты 4-5 так прыгает - или действительно кривое задание, или расчетный движок сам себе добавляет вычислений по результатам предыдущих итераций
Автор: Rilian Mar 20 2009, 23:23
Так как избыточность нулевая, в начале ВЮ происходит определение скорости компьютера. Возможно процентные прыжки из-за этого
Автор: Rilian Mar 22 2009, 14:33
http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewMemberInfo.do?userName=rilian золотую медальку в проекте за 90 процессорных дней! 
Автор: Rilian Mar 24 2009, 00:55
из 9000000 ВЮ 290000 уже посчитаны за 157 процессорных лет
Автор: Rilian Mar 24 2009, 01:19
Поздравляем http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewMemberInfo.do?userName=Vzhik с бронзовой медалью в проекте!
Автор: Rilian Mar 26 2009, 01:07
Пришла рассылка от WCG
Alert to all members of World Community Grid - your donated computer cycle time may now help find a cure for childhood cancers! There is a group of cancers that are particularly loathsome because they normally only strike young children. Neuroblastoma is one of these cancers, arising in children under the age of two and resulting in a less than 40% survival rate.
While scientists have uncovered the three proteins that enable this cancer to grow, they now need to search the three million drug candidates for a treatment. And your computer can help us complete this search in the next year.
If you are currently contributing and want to check to see if you are contributing to this project, click here. If you are no longer contributing but would like to contribute to this project, please click here.
The cause of neuroblastoma is unknown, but most physicians believe that it is an accidental cell growth that occurs during normal development of the sympathetic ganglia and adrenal glands. It occurs most often during the first two years of a child's life, and has a high risk for disease relapse with survival rates of less than 40 percent.
The rapid advancement of genetic research at Chiba Cancer Center Research Institute holds great promise for treating neuroblastoma. The new Help Fight Childhood Cancer project will use the idle computational power from your computer to identify which of the three million potential drug candidates can inhibit growth of three particular proteins believed to prevent successful treatment via conventional approaches, such as chemotherapy.
"Our promising research will be further advanced by the free computing power we will use from World Community Grid," said Dr. Akira Nakagawara, the principal investigator at the Chiba Cancer Center Research Institute. "It would take us about 100 years using our own computing resources to make progress, but with access to one of the world's largest virtual supercomputers, we estimate to complete this project in two years, and begin laboratory trials."
Dr. Nakagawara recently earned the Princess Takamatsu Cancer Research Fund Prize 2008 for his neuroblastoma research. In his work, he discovered that one protein, TrkB, is expressed at high levels in aggressive neuroblastomas and enhances the tumor cell's growth. World Community Grid will conduct complex chemistry simulations to determine which drug candidates bond to TrkB, as well as the proteins ALK and SCxx, so that those can be tested further in the laboratory. All results will be made available to the general scientific community to advance the field of cancer biology and drug discovery.
For more information about the Help Fight Childhood Cancer Project and other projects running on World Community Grid, please click here.
We sincerely appreciate your wonderful support!
Вот основная информация (выделена в тексте курсивом):
Быстрое развитие генетических исследований в Институте Исследования Рака в Чиба дает многообещающие надежды на лечение нейробластомы. Новый проект "Помоги Бороться с Детским Раком" будет использовать лишние компьютерные ресурсы чтобы определить какие из трех миллионов лекарственных кандидатов смогут блокировать три определенных белка, которые, уверены ученые, затрудняют успешное лечение традиционными способами, такими как химиотерапия.
Доктор Акира Накагавара, главный исследователь из Института Рака в Чиба, заявляет, что на доступных его лаборатории вычислительных мощностях им бы понадобилось около 100 лет чтобы добиться хоть какого-то прогресса, но используя мощности одного из самых крупных виртуальных суперкомпьютеров, каким является World Community Grid, они оценили время на рассчеты примерно в 2 года, чтобы начать лабораторные исследования на полученных результатах рассчетов.
Доктор Накагавара недавно получил "приз принцессы Такамацу за исследования рака" (Princess Takamatsu Cancer Research Fund Prize 2008) за его исследования нейробластомы. В его работе, было обнаружено что в быстро развивающихся нейробластомах повышено содержание белка TrkB и оно вызывает рост клеток опухоли. Используя программный комплекс Autodock и компьютерную сеть World Community Grid, будут проведены комплексные химические симуляции чтобы определить какие молекулы способны блокировать белок TrkB, а также белки ALK и SCxx, чтобы позже протестировать эти молекулы в лаборатории. Все полученные результаты будут открыты для общего доступа для дальнейших исследований в биологии рака и открытий лекарств против рака.
Автор: tribal Mar 26 2009, 12:45
Rilian,
мне тож такое пришло вчера, но у миня пока старые задания досчитываются, его пока не считаю
Автор: EKONOMIST Mar 29 2009, 09:24
А сколько это чудо траффика кушает? С мобилы реально отправить\загрузить (либо то и другое)?
Автор: Sirchyk Mar 29 2009, 16:29
А сколько это чудо траффика кушает? С мобилы реально отправить\загрузить (либо то и другое)?
Найбільше трафіку іде на перше завантаження, коли качаються основні файли, а потім з кожним юнітом десь до половини мегабайту вхідного і вихідного трафіку (зараз дорахується юніт і скажу точну цифру). Цей проект ІМХО використовує найменше трафіку з активних зараз проектів WCG (наприклад вчорашній результат Clean Energy зайняв десь 8 мегабайт). З мобіли відправити реально, сам вже 2 роки користуюся мобільним інтернетом, спочатку був Life, а тепер Інтертелеком.
Автор: Rilian Apr 1 2009, 23:01
Проект Help Fight Childhood Cancer объявляется проектом месяца (апрель 2009) и предлагается для интенсивных рассчетов кранчерам команды Ukraine в течение 30 дней! Целью данной "педали" является достижение 100 места в общем рейтинге команд (на данный момент у нас 106 место).
На днях будет открыто голосование по проекту месяца Май 2009. HFCC в списке для голосования повторно не появится
Посмотреть прогресс команды можно тут:
https://secure.worldcommunitygrid.org/team/challenge/viewTeamChallenge.do?challengeId=2673
http://stat.polarseti.ru/index.php?t=11&p=56
Автор: r140140 Apr 2 2009, 12:33
А у меня уже вот столько натикало... Это вообще нормальный расклад или нет? И есть вообще какой-то рейтинг кранчеров по данной теме нашей команды?
Автор: Rilian Apr 2 2009, 12:53
А у меня уже вот столько натикало... Это вообще нормальный расклад или нет? И есть вообще какой-то рейтинг кранчеров по данной теме нашей команды?
круто!
конечно. в шапке есть ссылка на официальный рейтинг.
а в топике про World Community Grid вообще есть ссылки на разные статистичсеские сайты
Официальный рестинг и большинство сайтов обновляются раз в 12 - 24 часа, а статистика PolarSETI раз в полчаса
Кстати, у тебя выбран проект Fight AIDS @home (который подбирает молекулы против вируса СПИДа). Если ты хочешь считать Help Fight Childhood Cancer, то надо выбрать его на странице твоих проектов: https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do
Автор: r140140 Apr 2 2009, 14:18
Participate in All Projects
Help Fight Childhood Cancer
FightAIDS@Home
Human Proteome Folding - Phase 2
Discovering Dengue Drugs - Together
Help Conquer Cancer
Nutritious Rice for the World
The Clean Energy Project
у меня везде стоят галочки, а если я хочу считать Help Fight Childhood Cancer, то надо только там оставить галочку а со всех остальных убрать и потом сохранить?
Автор: Rilian Apr 2 2009, 14:22
Да. пока проект считается на пониженном приоритете (относительно других проектов WCG). Поэтому его ВЮ могут не выдаваться участникам у которых выбраны более приоритетные (для WCG) проекты
Автор: Algon Apr 7 2009, 23:10
Подключился к проекту месяца.
~30 часов, 3 хоста, результат - аж 143.6 очка. Если бы сразу засчитали pending то получилось бы 400-500. 
150 очков в сутки для C2D 2,8GHz это нормально?
Автор: Rilian Apr 7 2009, 23:38
в проекте в среднем 12 очков в час на средних процессорах (2ггц)
стат на сайте обновляется раз в 12 часов, и твои новые компы, которые еще не посчитали 15 результатов, могут перепроверяться другими "правильными" компами, и в это время ВЮ зависает в ожидании валидации. Через некоторое время ВЮ валидируются и очки будут начислены.
Автор: Rilian Apr 11 2009, 22:49
Посчитал 1000 ворк-юнитов за 231 процессорный день
Автор: r140140 Apr 13 2009, 22:39
а у меня че-то в проге - "error", "нет заданий для обработки"????
че за фигня??? сколько дней нормально считало и тут на те... сегодн во второй половине дня случилось...
Автор: Rilian Apr 13 2009, 23:22
что-то с компом делалось?
какая ось? какой боинк?
Автор: r140140 Apr 13 2009, 23:40
да нет... к компу вообще не подходил... когда вечером сел за комп, удивился еще че проц не грузится и оперативы мало хавается... а тут такая фигня... а может это из-за того что на диске "с" было всего пол гига свободного места, но я уже освободил местяк (ща полтора) и перезагрузился после этого...
и еще, когда я заметил глюк (error) в сообщениях проги были сообщения выделение красным, и насколько я понял там указывалось свободное пространство на жестком, и наверное его было маловато...
все ужО заработало
!!!!!!!!!!!!!!!!!!! все пучком!!!!!!!!!!
Автор: Rilian Apr 13 2009, 23:40
а, ну это поправимо . Не переживай за ерроры - эти заданий пересчитаются на других компах.
Разреши в настройках больше места
Автор: r140140 Apr 13 2009, 23:48
да, в настройках стоит "оставлять не менее 0,5 гига" у меня как раз столько и было свободного места, и ошибка выскочила из-за этого...
Автор: nick4eva Apr 22 2009, 13:05
Заработал себе серебряный бейджик
Автор: Death May 7 2009, 10:45
Вобщем цель педали достигнута.
Мы молодцы!
Автор: Rilian May 7 2009, 11:31
Да, команда рулит!!
Автор: Rilian May 12 2009, 13:06
Я тут подумал, а что если вот этот проект будет успешным 
, и с помощью подобранных лекарств можно будет победить данный вид рака (а возможно и еще какието сопутствующие виды). Вылеченные дети приобретут к нему иммунитет, который передастся их детям итд, и через несколько поколений человечество будет защищено от этой болезни? 
Было бы круто
Автор: Death May 12 2009, 14:08
было бы круто но это бред ))))
Автор: YuRi May 12 2009, 14:23
Death,
По сути - согласен. Скорее рак приобретет иммунитет от лекарства и передаст его по наследству. ))
По форме - можно немного повежливей?
Автор: cosmo_vk May 24 2009, 09:54
а точно надо посчитать 9 лимонов заданий, а то судя по этому:
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
их поболе с учетом процентов, что сейчас готово
Автор: Rilian May 24 2009, 10:02
всего есть 9 миллионов пар которые надо посчитать.
но в каждой паре может быть много разных начальных условий, позиций итд
судя по тому что на оф сайте прогресс 4% и посчитано 3,000,000 ВЮ, всего будет около 75,000,000 ВЮ
Автор: cosmo_vk May 24 2009, 10:55
ну вообщем если округлить то примерно около 100 наверное.
С учетом того как считается HCC(примерно сопоставимого по объемам) года 1,5 - 2 минимум. А это уже плохо. 
Автор: Rilian May 24 2009, 11:18
ну вообщем если округлить то примерно около 100 наверное.
С учетом того как считается HCC(примерно сопоставимого по объемам) года 1,5 - 2 минимум. А это уже плохо.
в HCC 82 миллиона ВЮ (164 миллиона заданий), каждое считается в среднем по 6 часов, за 1.5 года посчитано 25%
Автор: cosmo_vk May 24 2009, 11:47
ну это в среднем так. В зависимости от процессора и его частоты время может быть очень разным: от 3,5 часов(например, на моих Q6600@3156 и Xeon5365) до 10 часов(на Xeon Nocona@3200).
HFCC на домашнем и на сервере у меня считается около 4 часов максимум.
Автор: Rilian Sep 9 2009, 23:56
Вчера был маленький бета-тест новых заданий типа s1
что за задания не знаю, но по ходы мы подошли к очередному stubspace 
Greetings,
We are going to start another BETA test on HFCC to make sure that the type "s1" work units will run properly in production. These new work units are created a little bit differently on the backend in comparison to what is used for the type "t1" work units that are in production at the moment. This BETA test is mainly to make sure that the new method as well as the results are valid.
Thank you for your participation in this BETA.
Please post any issues you notice in the forums so we can investigate.
Thanks,
-Uplinger
World Community Grid.
Автор: mzhelo Oct 23 2009, 19:32
Прочитал сегодня статью в газете, в частности затронута тема детской нейробластомы - можно воспользоваться для продвижения РВ в массы. Кто-нибудь, возьмитесь написать правильные комментарий к статье, давайте воспользуемся.
Вот ссылка: http://kp.ua/daily/231009/199253/
Статья в КП-Украина, "Донор способен не только подарить надежду, но и продлить жизнь".
P.S. Не нашел ветку о продвижении РВ, поэтому написал здесь.
Автор: Rilian Dec 10 2009, 13:36
Благотворительная организация Cancer Research UK, Великобритания, испытывает новую методику лечения нейробластомы. Этот недуг (рак тканей развивающейся нервной системы) поражает в основном детей младше пяти лет. Шестая часть детских смертей по онкологическим причинам приходится на эту болезнь, сообщает BBC News. Тестирование продлится более четырех лет, в нем примут участие 160 британских детей.
Нейробластома развивается в нервном валике – цепочке нервных клеток, расположенных параллельно спинному мозгу. Эти клетки участвуют в развитии нервной системы ребенка и других тканей. Опухоли часто развиваются в одной из надпочечных желез, но иногда формируются и нервных тканях в шее, грудной клетке, брюшной полости и тазу.
Шестерых из десяти детей вылечивают от нейробластомы с помощью хирургического вмешательства и химиотерапии, но как правило прогнозы для детей с прогрессирующей формой рака неутешительны.
Новая методика лечения предусматривает умерщвление клеток нейробластомы, уцелевших после традиционного лечения. Антитела прикрепляются к особым молекулам на поверхности клеток нейробластомы, мобилизуют иммунную систему организма, которая затем атакует и убивает клетки.
Первые результаты испытания новой методики в США показали, что у детей, перенесших иммунотерапию, меньше шансов на то, что болезнь вернется в течение следующих двух лет.
Автор: Rilian Mar 7 2010, 02:28
новости!
Мы закончили анализ первой "цели" T1 и отобрали 60 лекарственных кандидатов
Мы детально рассмотрим их на возможность использования как лекарственных компонентов, и выберем 10 из них для экспериментов на клетках нейробластомы 
We will make a detail consideration as drug like compounds on them and choose 10 candidates for next experiment using neuroblastoma cells.
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
Автор: Death Mar 7 2010, 18:50
Круто.
Как бы составить пресс-релиз на 1000 знаков?
Автор: Rilian Mar 11 2010, 18:31
Отмечаем годовщину проекта https://secure.worldcommunitygrid.org/team/challenge/viewTeamChallenge.do?challengeId=3322 за максимальное количество посчитанных ВЮ
Чтобы принять участие, с 17 по 23 марта 2010 нужно выбрать в https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do проект "Help Fight Childhood Cancer", а также галочку "If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project." (то есть "присылать ВЮ с других подпроектов если в HFCC внезапно(!) закончатся задания")
пс: из сильных команд в гонке - BOINX@MIXI, __in2my.net__, и за неделю подтянутся другие
Автор: Buck Mar 11 2010, 18:52
пс: из сильных команд в гонке - BOINX@MIXI, __in2my.net__, и за неделю подтянутся другие
А что это ты забыл упомянуть ещё одну - Ukraine ?
Keep on Cranching!
Автор: Rilian Mar 12 2010, 20:15
Отмечаем годовщину проекта https://secure.worldcommunitygrid.org/team/challenge/viewTeamChallenge.do?challengeId=3322 за максимальное количество посчитанных ВЮ
уже присоединилось около 50 команд, из них новые сильные это UK, France, BRASIL - BRAZIL@GRID, Vulture Central III
гонка начнется через 4 дня
Автор: Buck Mar 13 2010, 09:42
А график наметился плотный:
15 Марта - 24 часа Забег - Ides of March в прайме
17-23 Марта - этот забег...
Надо бы поразбираться с Кешами в Боинке чтобы везде максимально оперативно включаться...
П.С.
Или перед самым забегом просто резетить проект и всё <думаю...>
Автор: LaLechuzaBlanca Mar 14 2010, 01:02
Это ссылки на истории украинских детей с нейробластомой
(Для тех, кто выбирает себе проект для рассчетов и сомневается, стоит ли считать этот проект)
ЭТО ТЕ, КОТОРЫЕ БОРЯТСЯ С БОЛЕЗНЬЮ
Зубко Оксана (18.05.2004)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=1237
Безуглая Настя (11.03.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=1123
Кащавцев Дима (17.07.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=12&id=1246
Манюшкин Егор (12.03.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=1155
Федис Илья (02.08.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=18&id=1061
Сидоров Юрий (22.01.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=18&id=914
Прунчак Володя (17.03.1996)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=18&id=749
Шубелка Даша (29.10.2002)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=15&id=875
Шапилова Лиза (07.03.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=14&id=832
Калашник Миша (23.11.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=12&id=1239
Ковалевская Катя (31.08.1995 )
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=12&id=999
Белоконова Марьяна (21.08.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=3&id=1234
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=893826
Присяжнюк Аня (26.03.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=3&id=1191
Сулейманова Халиде (14.02.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=3&id=1134
Баскова Даниэла (13.01.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=1137
Серак Роман (10.09.2006)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=1095
Дымов Миша (03.01.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=991
Гуленко Мария (09.01.2003)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=803
Голембиевская Таня
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=615
Черепенко Анастасия
http://www.donor.org.ua/index.php?module=arnews&act=show&c=1&id=3979
Тернавский Кирилл (25.07.2004)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=313
и вот эта новость не слишком утешительна:
http://www.donor.org.ua/index.php?module=arnews&act=show&c=1&id=5992
Ворошилов Славик (01.09.06)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=915
http://pomogi-slave.ucoz.ru
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=295126&st=0
Стинковый Денис
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=166687
А ЭТО ТЕ, КОТОРЫЕ ЗАКОНЧИЛИ ОСНОВНОЕ ЛЕЧЕНИЕ, НО ДЛЯ КОТОРЫХ ОСТАЕТСЯ ОПАСНОСТЬ РЕЦЕДИВА
Ларионова Катя (13.11.2006)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=1&id=746
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=321030&st=0
http://katyalariohelp.ucoz.ru
Гаврюшенко Даниил (15.03.2006)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=192
Лопатинский Дима (17.02.2003)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=183
Подворная Александра
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=128
Слынько Валерия
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=121
Повх Диана (25.07.2003)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=87
Белоусова Лена (10.12.1996)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=86
Терновая Маша
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=35
Шиндер Богдан (03.04.2005)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=925
Котенко Богдан (26.05.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=1067
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=666350&st=0
Козелева Вика (9.04.1994)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=1004
Мусийчук Никита (07.07.2006)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=1003
Стинковый Денис (12.04.2005)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=797
Хижняк Илья (16.02.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=582
Ткачук Карина (20.04.2004)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=567
Морозова Елена
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=540
Зинченко Данил (29.01.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=534
Шедько Юля (16 ноября 2002)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=478
Венько Александр
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=439
Лазаренко Валерия (05.06.2005)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=372
ТЕ, КОМУ ПОМОЧЬ НЕ УДАЛОСЬ
Овчаров Артем (20.05.2005 - 27.01.2010)
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=711494&st=0
http://artem-ovcharov.com/
http://www.donor.org.ua/index.php?module=arnews&act=show&c=1&id=3393
Рягузов Саша (29.12.2008 - 29.12.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=144
Денис Гордеев (18.10.2001 - 13.02.2007)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=137
Барабаш Миша (16.11.2004 - 15.12.2006)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=81
Дамаскин Майя (13.11.2001 - 9.03.2006)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=49
Фадеев Олег ( - 20.12.2005)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=16
Балашов Богдан, (10.02.2006 - 10.08.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=785
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=223954&st=0
Печегина Настя (27.10.2005 - 31.03.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=738
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=125885&st=0
Авдюхина Аня ( - 14.07.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=14&id=896
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=269762&st=0
Годунова Настя (4.07.2007 - 15.10.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=3&id=685
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=136777&st=0
Романик Максим (05.06.2003 - 10.06.2008), Львов
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=18&id=503
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=89832&st=0
Игнатенко Софья (29.09.2004 - 10.01.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=1&id=195
http://forum.materinstvo.ru/index.php?showtopic=70664
http://help.is.ua/diary
Кирилюк Диана (28.06.2008 - 22.02.2010)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=1205
Аравенко Никита (11.10.2007 - 07.01.2010)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=1156
Величко Даниил (15.01.2001 - 11.08.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=1002
выдержал лечение нейробластомы, но из-за перенесённой химиотерапии развился, как побочное действие, вторичный миелолейкоз
Карпутов Артем (06.03.2006 - 14.12.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=898
Белов Женя (03.10.2006 - 05.11.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=897
Шевчук Володя (24.07.2005 - 27.02.2010)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=840
Колесник Ангелина (6.12.1998 - 16.09.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=800
Онищенко Владислав (04.12.2004 - 12.05.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=758
Коренной Павел (19.07.2001 - 20.09.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=513
Тымкив Миша (15.03.2003 - 18.12.2008)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=512
Николашин Даниил (4.01.2001 - 22.09.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=373
Мазур Диана (27.06.2004 - 01.09.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php?module=help&act=show&c=4&id=368
Грицык Марк (- 11.10.2009)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=help&act=show&c=4&id=164
Автор: Rilian Mar 14 2010, 01:15
думаю, это далеко не полный список
интересно, сколько посетителей сайта donor.org.ua и аналогичных знают о био-медицинских проектах РВ ?
Автор: LaLechuzaBlanca Mar 14 2010, 01:18
думаю, это далеко не полный список
конечно, не полный
это лишь те люди, которые обратились за финансовой помощью к волонтерам и, следовательно, о которых есть информация в инете
Автор: Rilian Mar 15 2010, 01:57
Еще полтора дня до гонки, и намечается серьезная конкуренция (не только мы знаем как выбирать нужный проект в настройках WCG 
)
Автор: Buck Mar 15 2010, 11:21
Ничё, прорвёмся
Автор: Rilian Mar 18 2010, 02:23
Вышла новая версия приложения HFCC 6.11
в ней исправлен критический баг, "Powerd by IBM" -> "Powered by IBM"
Автор: vitalidze1 Mar 18 2010, 10:08
Нада було не 6,11 робити а одрузу сьому версію лупити. Ці зміни не еволюційні а революційні . Ура товаріщі
Автор: mzhelo Mar 19 2010, 14:41
Люди, нужна подсказка!
Слетает уже третье подряд задание HFCC_s2 - ошибка вычислений! Кто-нибудь встречался с подобной проблемой?
В Праймгриде, OGR-27, Yoyo/ECM и Help Conquer Cancer - никаких проблем. Комп работает стабильно...
Комп такой (отчет из EVEREST v5.02.1765):
Тип ЦП Intel Celeron D 330, Prescott-256, CPU 2.66GHz
Частота ЦП 3319.7 MHz (исходное: 2667 MHz, overclock: 24%)
CPU FSB 166.0 MHz (исходное: 133 MHz, overclock: 25%)
Шина памяти 207.5 MHz; Соотношение DRAM:FSB - 5:4
Чипсет системной платы Intel Springdale i865PE
Тайминги памяти 2.5-4-4-8 (CL-RCD-RP-RAS)
DIMM1: 512 Мб PC3200 DDR SDRAM (3.0-4-4-8 @ 200 МГц)
DIMM2: 256 Мб PC3200 DDR SDRAM (2.5-4-4-8 @ 200 МГц)
DIMM3: 512 Мб PC3200 DDR SDRAM (3.0-4-4-8 @ 200 МГц) - в скобках "парспортные".
Может я с таймингами накосячил?
Автор: vitalidze1 Mar 19 2010, 15:13
mzhelo,
В мене на феноміII 920, також декілька збоїв було на дуже довгих завданнях 20 годин і вище.
Автор: Rilian Mar 19 2010, 15:17
Пишите плиз конкретный лог ошибки в задании. Если что-то важное и связано с проектом, я отправлю на оф форум
Автор: mzhelo Mar 19 2010, 15:24
Какая именно ошибка вычислений? Пиши конкретнее, ошибки разные бывают
Примерно в районе 10% выполнения задания (вкладка BOINC "Задания") прогресс сразу становится 100%, в поле "Состояние" появляется надпись "Ошибка вычислений". И запускается следующее задание.
Соответственно, на вкладке "Сообщения" вот такая запись:
19.03.2010 13:45:50 World Community Grid Computation for task HFCC_s2_00762278_s2_0000_0 finished
Пишите плиз конкретный лог ошибки в задании. Если что-то важное и связано с проектом, я отправлю на оф форум
Где смотреть, я не нашел?
Автор: KarLaeda Mar 19 2010, 15:31
У себе в лозі найшов такі стрічки:
18/03/2010 14:24:40 World Community Grid Output file HFCC_s2_00632482_s2_0001_0_1 for task HFCC_s2_00632482_s2_0001_0 exceeds size limit.
18/03/2010 14:24:40 World Community Grid File size: 11285369.000000 bytes. Limit: 10485760.000000 bytes
Збільшив максимальний розмір з 10 до 20 гб - вроді "полёт нормальный"
Глянь, може і в тебе щось подібне пише?
Автор: Rilian Mar 19 2010, 15:32
Пишите плиз конкретный лог ошибки в задании. Если что-то важное и связано с проектом, я отправлю на оф форум
Где смотреть, я не нашел?
https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewBoincResults.do?filterDevice=0&filterStatus=1&projectId=-1&sortBy=sentTime&pageNum=1
в колонке Status находишь "Error" и нажимаешь на ссылку. Дальше будет написано что-то вроде
<![CDATA[
<message>
BLAH BLAH
</message>
<stderr_txt>
</stderr_txt>
]]>
вот это и пришли сюда, записав внутри тегов [cоde][/cоde]
Автор: mzhelo Mar 19 2010, 15:41
Вот этот самый лог:
Автор: Rilian Mar 19 2010, 15:50
Понятно
http://boincfaq.mundayweb.com/index.php?language=1&view=223
проблемы с железом
Автор: mzhelo Mar 19 2010, 16:34
Понятно
http://boincfaq.mundayweb.com/index.php?language=1&view=223
проблемы с железом
OK! "Будем искать".
KarLaeda, спасибо, но это не оно.
Автор: mzhelo Mar 20 2010, 21:05
С проблемой разобрался - таки переразгон памяти.
Устранено небольшим доразгоном процессора 
Автор: Rilian Mar 20 2010, 21:43
С проблемой разобрался - таки переразгон памяти.
Устранено небольшим доразгоном процессора
Автор: tribal Mar 20 2010, 22:10
в сад, вываливается с ошибкой вычислений - ему комп мой не нравится видно, то заданий не дает то ошибки (
возвращаюсь считать Fightaids и HCC
Автор: Rilian Mar 20 2010, 23:20
в сад, вываливается с ошибкой вычислений - ему комп мой не нравится видно, то заданий не дает то ошибки (
возвращаюсь считать Fightaids и HCC
Пришли сюда лог ошибки (берется при клике на статус ВЮ на сайте). Разберемся
Автор: mzhelo Mar 21 2010, 00:13
в сад, вываливается с ошибкой вычислений - ему комп мой не нравится видно, то заданий не дает то ошибки (
возвращаюсь считать Fightaids и HCC
Пришли сюда лог ошибки (берется при клике на статус ВЮ на сайте). Разберемся
tribal, может быть проблема со стабильностью системы? Прогони super_pi, помогает убедиться, что действительно есть проблема.
Автор: Tamagoch Mar 23 2010, 07:22
Miho Tanaka provided us some pictures that expressing her encouragement for the children fighting with cancer.
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
в проекте уже завершено 57%
Автор: KING100N Mar 23 2010, 14:48
в проекте уже завершено 57%
и это только за год расчетов. Неплохая скорость
Автор: Rilian Mar 23 2010, 15:18
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
We are preparing the screening experiment by neuroblastoma cells to evaluate 10 candidates as a drug for neuroblastoma.
Мы готовим эксперимент по http://uk.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D1%96%D0%BB%D0%BE%D0%BA-%D0%B1%D1%96%D0%BB%D0%BA%D0%BE%D0%B2%D0%B0_%D0%B2%D0%B7%D0%B0%D1%94%D0%BC%D0%BE%D0%B4%D1%96%D1%8F с клетками нейробластомы для оценки 10 кандидатов лекарств против нейробластомы. 
Miho Tanaka provided us some pictures that expressing her encouragement for the children fighting with cancer.
Кстати, прогресс на сегодня - 58.4%, будем надеяться первая фаза проекта закончится уже в этом году (2010)
Автор: Rilian Mar 25 2010, 02:31
Поздравляем https://secure.worldcommunitygrid.org/stat/viewMemberInfo.do?userName=LaLechuzaBlanca-у с первой медалью в проекте! 
пс: надо бы наладить скрипт с медальными поздравлениями ...
Автор: LaLechuzaBlanca Mar 25 2010, 09:34
За поздравления спасибо!
А за что даются медали? Число очков вроде не круглое, число отданых заданий - 45.
Было бы хоть 50... А так догадаться не представляется возможным...
Автор: Rilian Mar 25 2010, 09:40
За поздравления спасибо!
А за что даются медали? Число очков вроде не круглое, число отданых заданий - 45.
Было бы хоть 50... А так догадаться не представляется возможным...
бронза - 15 дней рассчетов в проекте
серебро - 45 дней
золото - 90 дней
рубин - 180 дней
изумруд - 1 год
сапфир - 2 года
поговаривают что будет еще медаль за 5 лет рассчетов
Автор: vitalidze1 Mar 25 2010, 14:45
Rilian,
В мене HFCC вже 9 років розрахунків, так, що вже 10 років треба вводити)
Автор: tiss Mar 25 2010, 15:01
Rilian,
В мене HFCC вже 9 років розрахунків, так, що вже 10 років треба вводити)
эээээ так у тебя же вроде только сапфировая - за два года.
Автор: vitalidze1 Mar 25 2010, 15:08
Так 9 років, а максимальний бейдж дають за 2 роки, от така несправедливість.
Автор: Rilian Mar 25 2010, 15:38
Так 9 років, а максимальний бейдж дають за 2 роки, от така несправедливість.
Поэтому ждем 5-летней и 10-летней медали
Автор: LaLechuzaBlanca Mar 28 2010, 18:41
Еще одна жертва нейробластомы
Тернавский Кирилл (25.07.2004 - 28.03.2010)
http://www.donor.org.ua/index.php/index.php?module=arnews&act=show&c=1&id=6223
Автор: Rilian Apr 1 2010, 14:53
у меня сапфировая медаль за 2 процессорных года вычислений!
Автор: Rilian Apr 16 2010, 15:59
Видео, составленное командой NMG-NETWORK
http://www.nmg-tv.eu/Help.Fight.Childhood.Cancer.htm
Автор: Rilian Apr 25 2010, 00:14
Первая фаза проекта закончится через 30 с чем-то дней!
Автор: Rilian Apr 28 2010, 23:54
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,28975
Help Fight Childhood Cancer has an estimated 30 days left of new work. We would like to thank everyone for their contributions into this project so far and look forward to the push to completion!
If you have any questions, please feel free to ask.
Again, Thanks to all the crunchers!
-Uplinger
ОСТАЛОСЬ ДОСЧИТАТЬ МЕНЬШЕ 30 ДНЕЙ!
педалим!
Наша команда участвует в соревновании http://www.worldcommunitygrid.org/team/challenge/viewTeamChallenge.do?challengeId=3393
Автор: Death Apr 29 2010, 13:06
сразу после прайма запущу.
Автор: Rilian Apr 30 2010, 21:51
На офсайте обновили индикатр прогресса
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
Новости:
Miho Tanaka provided us some new pictures that expressing her encouragement for the children fighting with cancer.
Что в переводе означает: Мы уже приготовили 50 лекарственных кандидатов и проводим эксперимент вживую
Автор: Rilian May 2 2010, 00:11
92.5% complete
Автор: Rilian May 7 2010, 08:17
Осталось заданий на 13 дней.
Теоретически у каждого с 2+-ядерной машиной есть шанс хотя бы на бронзовую медаль проекта
Первая фаза проекта закончится через 30 с чем-то дней!
сделали 17 дней за 12
Автор: Brodyaga May 7 2010, 08:36
уууу, а я на золото губу раскатал
Автор: Khvastov Maxim May 7 2010, 12:29
Может имеет смысл нагрести заданий побольше ? У меня у самого 16 дней до золота не хватает, и работают 3 ядра...
Автор: Brodyaga May 7 2010, 16:24
Мне смысла нет гребсти больше. Я серебро только позавчера получил, а на выполнения задания дают 10 дней. От того, что я просрочу результат, пользы никакой. Считаю в 2,5 ядра 
Автор: Rilian May 11 2010, 08:38
Заданий осталось на 6 дней, а проект побил отметку 100 Терафлоп (это рекорд в WCG для одного подпроекта)
Может имеет смысл нагрести заданий побольше ? У меня у самого 16 дней до золота не хватает, и работают 3 ядра...
думаю успеешь
Автор: gladiator_maximus May 11 2010, 17:24
Rilian,
Я так понял, это первая фаза проекта скоро закончится?
А следующая когда?
Автор: Abbath May 11 2010, 21:19
ого.. лихо! впервые участвую в чем-то что может закончится раньше чем "хз когда" я уже и забыл что когда-то ради него вырубил временно fightaids
з.ы. пока насчитал на какой-то Ruby Bage, на моем стареньком мониторе это пятно загадочного бордового цвета )) знаю бронзу, серебро и золото, а это шо?
Автор: Arbalet May 11 2010, 21:27
з.ы. пока насчитал на какой-то Ruby Bage, на моем стареньком мониторе это пятно загадочного бордового цвета )) знаю бронзу, серебро и золото, а это шо?
Рубиновая плюха за 180 дней счета. Дальше идет изумрудная (зеленая) - за год. А за два дают синенькую, только как называеццо - надо у Рильяна спрашивать, который их уже вон сколько насинячил.
Автор: Abbath May 11 2010, 21:32
спс, уже разобрался в профиль так давно не заходил что и не знал даже про изумрудную, думал то у меня просто лого проекта FightAIDS висит ) жаль тут до такого уже не успею досчитать
Автор: KING100N May 11 2010, 21:51
следующая - за 2 года счета - сапфировая, синего цвета.
Неплохо под конец проект разогнался. На графике за последние два месяца мощности выросли почти вдвое
Должен успеть получить рубиновый баджик - осталось 4 дня расчетов
Автор: Rilian May 11 2010, 23:31
Rilian,
Я так понял, это первая фаза проекта скоро закончится?
А следующая когда?
На первой фазе они уже отобрали нужные молекулы (выше по топику были новости). На следующей фазе, возможно, они будут изучать что-то другое. Пока что про вторую фазу на оф форуме не было ни слова.
Автор: Rilian May 12 2010, 21:39
заданий осталось на 7 дней
Автор: Brodyaga May 13 2010, 08:33
Rilian, а где можно посмотреть на сколько дней осталось заданий по проектам?
Автор: Rilian May 13 2010, 09:15
Rilian, а где можно посмотреть на сколько дней осталось заданий по проектам?
Автор: tiss May 13 2010, 09:50
Rilian, а где можно посмотреть на сколько дней осталось заданий по проектам?
Т.е. нигде. Разве что проджект администратор напишет на форуме...
Автор: Brodyaga May 13 2010, 10:02
Rilian, а где можно посмотреть на сколько дней осталось заданий по проектам?
Т.е. нигде. Разве что проджект администратор напишет на форуме...
Так и понял
.
Автор: Rilian May 13 2010, 10:45
Rilian, а где можно посмотреть на сколько дней осталось заданий по проектам?
Т.е. нигде. Разве что проджект администратор напишет на форуме...
Как вариант, можно посмотреть на график производительности, почитать о кол-ве воркюнитов и кворуме в описании проекта, добавить процент ошибочных ВЮ, посчитать прирост производительности по дням, а также приставить своего человека в лабораторию, который будет следить за кол-вом ВЮ, которые присылаются в ВЦГ, а также кол-вом результатов, которые забираются из ВЦГ, и посчитать дни самостоятельно.
Или следить за графиками, которые генерирует кранчер Sekerob:
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=18277
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=26012
Автор: Khvastov Maxim May 15 2010, 17:42
думаю успеешь
Таки успел
Автор: tiss May 15 2010, 21:49
Оу! А я рубиновый беджик успел получить!
Автор: Buck May 16 2010, 13:52
Да ребята - вы не то что бы монстры - вы реальные динозавры... ПОЗДРАВЛЯЮ
Автор: Rilian May 17 2010, 18:54
Еще 2 дня будут задания, потом будем ждать пока все досчитают медленные компьютеры и кранчеры с большим запасом.
По моим расчетам это будет где-то до 30 мая, и до этого времени на "надежных" компьютерах (которые вернули последние несколько десятков ВЮ быстрее чем за 2 дня) есть шанс еще поймать ВЮ
Автор: Rilian May 19 2010, 10:41
официальные новости
Проект считался очень быстро последнее время и мы завершим рассчеты трех первых целей приблизительно 20 мая 2010. Это означает что после 20го числа не будет новых заданий для рассчетов.
Однако, ученые идентифицировали две дополнительных цели, которые они хотят посчитать на WCG. Поэтому, после подсчета первых заданий, проект приостановится до тех пор пока ученые не подготовят новые исходные данные для рассчетов. Это займет примерно 2 месяца. Более подробно о новых рассчетах будет написано через несколько дней.
Мы хотим поблагодарить всех участников за огромный вклад и за то что удалось рассчитать данные даже быстрее чем предполагалось!
We would like to thank the membership for their generous contribution of computer power to this project thus far. The scientists are very delighted that so much processing was accomplished ahead of our estimated schedule.
--
Viktors
World Community Grid Tech
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,29084
Автор: Brodyaga May 21 2010, 06:02
Вот и закончились задания...
21.05.2010 05:33:24 World Community Grid Message from server: You have selected to receive work from other applications if no work is available for the applications you selected
21.05.2010 05:33:24 World Community Grid Message from server: Sending work from other applications
Автор: re_SET May 21 2010, 11:46
У меня тоже сапфировый баджик
Автор: Rilian May 21 2010, 11:59
Переключаемся на http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=1214!
И у меня сапфировый, а на следующей раздаче надеюсь набрать 10 лет в проекте
Автор: Brodyaga May 21 2010, 15:53
Поддерживаю предыдущего оратора
Автор: KING100N May 22 2010, 21:41
Вот теперь похоже действительно все
Автор: Rilian Jun 11 2010, 10:29
Можно сказать, что первые 3 цели были успешно досчитаны.
The research team at Chiba Cancer Center would like to thank World Community Grid members for their valuable CPU time contributions to the Help Fight Childhood Cancer project. Because of your generous support, World Community Grid has processed the first three drug targets faster than expected. The preliminary results look very promising and we will provide more information about this at a later time. In the meantime, we have identified two other drug targets that we would like to process on World Community Grid and should have this work unit data ready in about 2 months or earlier. Again, thank you for your all of your help. We are pleasantly surprised at how World Community Grid has so rapidly advanced our research on curing childhood neuroblastoma cancer.
Thank you,
Dr. Akira Nakagawara
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,29186
Автор: Brodyaga Jun 15 2010, 08:09
Проект получил на сайте WCG статус "Intermittent". И график в шапке темы это подтверждает Ждем августа!
P.S.
А я таки возьму золото в этом проекте
Автор: Brodyaga Jul 22 2010, 06:08
Появились beta-задания по HFCC. Похоже, до запуска проекта осталось немного.
Автор: Rilian Jul 28 2010, 01:31
Хорошие новости!
We have received new work from the researchers for this project. They have identified three additional targets they would like to process. They never expected to be able to run this much work through the grid so quickly and are very excited about being able to submit this additional work. The prior computations have identified some promising drug candidates. After they do some more testing and verifying of these results, they will be working on writing papers and providing more information about them. In the meantime, we thank our membership for the generous contribution to this project and hope you continue to contribute your spare computer power!
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,29417
несколько я понял, вместо одной цели, будут считаться целых три новых!
Автор: Brodyaga Jul 28 2010, 05:42
Появились полновесные задания! Все на абордаж!
Автор: Rilian Jul 28 2010, 17:41
По некоторым оценкам, новые данные будут рассчитываться ~9 месяцев
eviltoad, we need to see how fast these work units run. Personally I believe these targets will last about 9 months. But again, without information, my estimate could be WAY off.
-Uplinger
Автор: gladiator_maximus Aug 7 2010, 16:28
Самый низкокалорийный из всех проектов,которые я считал.
В среднем, 440 очков в сутки.
Автор: vitalidze1 Aug 7 2010, 17:12
Самый низкокалорийный из всех проектов,которые я считал.
В среднем, 440 очков в сутки.
Що є то є, рахується довго від 5 до 12 годин на різних машинах , вихлоп слабенький.
Автор: Rilian Aug 7 2010, 18:39
Самый низкокалорийный из всех проектов,которые я считал.
В среднем, 440 очков в сутки.
зато японцы уже что-то тестируют
в лабораториях на основе наших вычислений. я считаю не из-за "калорий"
Автор: Rilian Aug 18 2010, 18:47
Новости
Now the calculation for N1, the 4th target of this project, has been proceeding.
For T1, we identified 6 compounds that are effectively repress the cell growth among 50 compounds had selected by computer simulation. We continue further detail examination.
For S1 and S2, we started data analysis of the computer simulation.
We appreciate on your co-operation.
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
Автор: gladiator_maximus Sep 19 2010, 18:58
Новости 14.09.10
We have finished the calculation for the second target as S1.
Now we are preparing the screening experiment by neuroblastoma cells.
Thank you .
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
Автор: Ukrkeeper Nov 5 2010, 13:32
Вот и стукнул один год жизни моих верных электронных трудяг в сия благородном проекте … ха…теперь с уверенностью могу сказать…Я видел зеленого человечка
Автор: gladiator_maximus Nov 18 2010, 14:41
Новости 16.11.10
We have done more than 60% calculation of this project (T1, S1, S2, N1, L3, L4).
Dr. Nakagawara elected a President of Asian Region of International Society of Pediatric Oncology.
World Community Grid greeted the 6th anniversary.
Thank you.
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
Проект посчитан на 60% !
Отличная новость!
Автор: Rilian Dec 3 2010, 23:04
разбавим грустные посты...
Автор: StanislavZ Jan 12 2011, 18:59
Проект посчитан на 80%
Переключаю все тачки на него, пора добивать! 
Автор: gladiator_maximus Jan 12 2011, 19:04
StanislavZ, а откуда у вас это информация.
на оф.сайте ничего про 80% не сказано.
Автор: StanislavZ Jan 12 2011, 19:07
StanislavZ, а откуда у вас это информация.
на оф.сайте ничего про 80% не сказано.
А вверху в этой теме на рисунке, разве оно не показывает 80%? или это не те проценты?
Автор: gladiator_maximus Jan 12 2011, 19:09
Rilian, это в самом деле так?
Автор: Rilian Jan 12 2011, 19:35
Rilian, это в самом деле так?
да, по текущим целям
возможно еще добавят цели, если все будет ок
Автор: Yuriy V Jan 12 2011, 20:30
да, по текущим целям
возможно еще добавят цели, если все будет ок
Ну тогда добавляю галочку в настройках
Автор: Rilian Jan 12 2011, 20:47
Я тоже щяс 10 лет в HCC наберу и переключусь
Автор: Rilian Jan 13 2011, 17:36
Как было сказано в ноябре 2010,
Сейчас кранчится L3
ps: набрал 10 лет в HCC, переключаюсь сюда
Автор: Rilian Jan 16 2011, 21:10
Начались вычисления последней цели, L4!
Это значит что проект посчитан на 86.66% !
Автор: Rilian Jan 16 2011, 21:22
В связи с тем что проект завершится в течение 1.5 месяцев (по моим рассчетам), предлагаю нажать на педаль и ускорить это замечательное событие!
Автор: Rilian Jan 17 2011, 17:58
Сейчас кранчится L3 batch 250xxxx
оно продлится до 287xxxx, а дальше L4
в день кранчится 70000 ВЮх 
Автор: Brodyaga Jan 17 2011, 23:01
В связи с тем что проект завершится в течение 1.5 месяцев (по моим рассчетам), предлагаю нажать на педаль и ускорить это замечательное событие!
Переключаюсь
Автор: Rilian Jan 18 2011, 09:47
Последняя пачка L4 будет также с ВЮ с номерами от 0xxxxxx до 287xxxxxx
У меня уже считается L3_253xx
Автор: Rilian Jan 26 2011, 16:25
Один из приемных серверов в университете Чиба не работает, пожтому в ВЦГ понизили приоритет HFCC при выдаче новых ВЮ. Для тех у кого это единственный включенный проект, никаких изменений видно не быдет и ВЮ будут выдаваться. Для тех кто считает несколько проектов, будет заметно уменьшение раздачи ВЮ HFCC
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30760
Тем временем уже считается пачка заданий номер 278xxxx, осталось 9 пачек до 287xxxx, а потом 2879999 ВЮ типа L4 до конца этой фазы проекта!
Автор: Bel Jan 26 2011, 16:36
У меня заметно, раньше выдавалось по 8-10 проектов за раз, сейчас по 3-4. Кранчу пока HFCC, хочу успеть добыть золотую медальку
Автор: Rilian Jan 26 2011, 16:54
я уже 3 года тут накранчил. Надеюсь успею до 5 лет дойти
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30705
Q: Do we know how many tasks in total L4 is going to have?
A: The same library, the same number of batches, cut the same way... each compound docking is split over 2 tasks, so 2854000 * 2 * error factor (Uplinger posted the exact calculation somewhere July / August of 2010 ).
Автор: cosmo_vk Jan 27 2011, 09:40
тоже переключил все свои мощности на проект. добъем его быстрее.
Автор: Rilian Jan 30 2011, 17:23
Уже кранчится L3 281xxxx
Автор: cosmo_vk Jan 31 2011, 10:50
L3 282-е пошли в обработку
Автор: Rilian Feb 1 2011, 10:21
HFCC has now been restored to it's original feeder priority.
Seippel
World Community Grid Tech
ПС: считается L3 283xxxx
Автор: Rilian Feb 1 2011, 12:12
Да, реально ускорилась выдача заданий, уже L3 284хххх почти раздалось!
Автор: Brodyaga Feb 2 2011, 07:25
Начали раздавать задания L4
Автор: Rilian Feb 2 2011, 10:08
Уже L4 002xxxx
Автор: Rilian Feb 4 2011, 00:00
Новый график by Sekerob! (смотреть также в шапке топика)
Also added the cumulative CPU years crunched, we just passed 30,000 last week. Interesting from this to derive the growing power of the grid: Did we need 20,000 years for the first 3 targets, will we need just over 15,000 years to do the second 3.
Crunch On
Sekerob пишет:
Подкрутил график работы проекта, сейчас показывает полное время работы, а не только последний 3 месяца. Также поставил метки на начало вычислений каждой из целей проекта. (спасибо кранчеру gb009761 за выкапывание https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30705_offset,0#311851
Также добавил накопленное процессорное время, кстати мы недавно накранчили 30000 процессорных лет! Интересно отметить постоянное возрастание мощности WCG: для первой тройки целейнам понадобилось 20000 лет, и при текущей скорости нам понадобится около 15000 лет (из них 10000 уже потрачено на 4 и 5 цели) для второй тройки!
Приятного кранченья
--------
Кстати при текущей скорости проекта нам осталось меньше 50 дней до завершения!
Автор: vitalidze1 Feb 4 2011, 09:39
Переводжу всі потужності на HFCC
Автор: Rilian Feb 6 2011, 11:41
уже выдаются ВЮ L4 016xxxx
осталось 2710000
Автор: Rilian Feb 8 2011, 10:47
84%
предлагаю всем переключиться эксклюзивно на этот проект и сделать его! 
( а также не забываем выставить Beta , все проекты из Intermittent и также DDDT2 )
уже выдается L4 024хххх, осталось 287 - 24 = 263хххх
Автор: Rilian Feb 11 2011, 21:56
Выдаются задания L4 00 36x xxx - осталось 2 510 000
Автор: Rilian Feb 13 2011, 16:15
Present plots suggest about April 29 +/- 2 days for the last *original* WU to go out (present mean 7 day is 74,661 results). When winding down target 3, it took 22 days until validations completely ended after that, but after the 11th day, dailies really became repair/no reply/too late trickles.
Автор: Rilian Feb 14 2011, 10:00
выдаются L4 0045xxxx
еще 2.5 месяцев рассчетов!
Автор: Rilian Feb 16 2011, 09:27
Выдаются L4 0052хххх
Автор: tiss Feb 17 2011, 18:32
02/17/11 18:28:30 World Community Grid Message from server: No work is available for Help Fight Childhood Cancer
02/17/11 18:28:30 World Community Grid Message from server: No work is available for Discovering Dengue Drugs - Together - Phase 2
02/17/11 18:28:30 World Community Grid Message from server: No work is available for Discovering Dengue Drugs - Together - Phase 2 (Type A)
02/17/11 18:28:30 World Community Grid Message from server: You have selected to receive work from other applications if no work is available for the applications you selected
02/17/11 18:28:30 World Community Grid Message from server: Sending work from other applications
Автор: Death Feb 17 2011, 20:34
все ушли играть в Jeopardy )))))))) ИНФА 100%
Автор: Rilian Feb 18 2011, 11:53
какой-то глюк в начислении очков, уже на протяжении дня
рекомендую "спортсменам" воспользоваться, и заодно ускорить проект 
Автор: Rilian Feb 18 2011, 15:17
http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hfcc 40,111,655 заданий
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30868 45,270,000 заданий
http://i137.photobucket.com/albums/q210/Sekerob/WCGYearsPi1Project.png 80, 000
итого еще 60-70 дней до окончания
Автор: Rilian Feb 26 2011, 11:26
http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=hfcc 40,690,462 заданий - 88.05%
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30868 45,270,000 заданий
http://i137.photobucket.com/albums/q210/Sekerob/WCGYearsPi1Project.png 79, 000
То есть 4 579 538 / 79 000 = 58
итого еще 58 дней до окончания
все сюда!
Автор: Rilian Mar 11 2011, 12:49
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
2011.03.09
We have done more than 76% calculation of this project (T1, S1, S2, N1, L3, L4).
We are now preparing the toxicity check experiment for the drug candidates (T1; 7 compounds, S1; 3 compounds).
These experiments are covered with the prize money which IBM Watoson Computer won by an American popularity TV program “Jeopardy”.
Thank you.
Автор: Rilian Mar 12 2011, 10:03
https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,30705_lastpage,yes#317106
примерно 40 дней до конца проекта!
ps: набрал 8 процессорных лет
Автор: Rilian Mar 14 2011, 16:12
We checked with the research team and Dr. Nakagawara's and Dr. Tamura reported that they were ok. They reported that their lab sustained some damage but that damage probably would not affect this project.
bbover3
World Community Grid Admin
После землетрясения, с проектом и лабораторией все ок (есть мелкие повреждения но на проект это не повлияет)
Автор: Rilian Mar 16 2011, 15:15
Уже раздается L4_0144xxxx, а это значит что половина последнего таргета, L4, пройдена!
Автор: Allineer Mar 17 2011, 16:17
поздравьте мну с первой лычкой!
Автор: Rilian Mar 17 2011, 16:19
поздравьте мну с первой лычкой!
поздравляю!
успеешь 5 лет откранчить до завершения этой фазы?
Автор: Allineer Mar 17 2011, 16:37
шанс есть
с проекта все-равно не слезу пока не закончится.
Автор: Rilian Mar 17 2011, 17:08
16-00. Новые афтершоковые толчки в Токио, силой до 5,8 баллов. Эпицентр расположен в префектуре Chiba, пишет в своем твиттере корреспондент CNN в Японии.
следим за развитием событий тут http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,31018_lastpage,yes
Автор: Rilian Mar 23 2011, 10:39
93% проекта завершено!
приглашаю пропедалить команду в топ
Автор: Rilian Mar 25 2011, 18:34
осталось 34 дня до завершения этой фазы проекта!
поднажмем!
Автор: Rilian Mar 29 2011, 09:42
Официально - осталось меньше 30 дней до конца проекта!
Greetings all,
This is the official statement saying there is an estimated 30 days left of new work to be sent out. The project is expected to have an additional 2 weeks to clean up the remaining batches after that. The last batch of work units from the researchers is L4_287 which has been built and loaded already.
Thank you again for all your help with this project! Let me know if you have any questions.
Seippel
Кранчим сколько можем!
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,31083
ps: Alexus78, у тебя машины потянут переход на связку HCC+HFCC (ты ж щяс на HCC-only) ? HFCC потребляет 80МБ памяти на ядро
Автор: Death Mar 29 2011, 12:43
добавил 2 ядра на итлуа ))
Автор: Rilian Apr 18 2011, 14:47
(287-259)*10,000*2/81,000 = 6,9 days left
осталось работы на 1 неделю
Автор: Rilian Apr 21 2011, 12:27
Задания почти закончились
ученые готовят еще 2-3 таргета, которые будут доступны для рассчетов в Июне 2011
We have finished the calculation for the third target as S2.
Now we are preparing the screening experiment by neuroblastoma cells.
Thank you .
Автор: vitalidze1 Apr 21 2011, 13:47
Заначить вже можна переключатись на HCC
Автор: akostyrin Apr 26 2011, 17:24
Похоже, все! ВЮ уже не выдаются!
Автор: Allineer Apr 26 2011, 21:08
последнее задание получил в четверг. самые слабые машины сейчас их досчитывают.
Автор: Rilian Apr 27 2011, 10:07
Ура! Свершилось!
перебрасываю все силы на HCC. Чему очень способствует их малое потребление памяти
Автор: Bel Apr 27 2011, 10:44
Так уже всё? Досчитали наконец то или будет 2 фаза проекта?
Автор: Rilian Apr 27 2011, 12:25
Так уже всё? Досчитали наконец то или будет 2 фаза проекта?
см више на 6 сообщеній..
Автор: Allineer Apr 27 2011, 13:36
а можно для идиотов: таргет это нечто небольшое по объему или...?
Автор: Rilian Apr 27 2011, 14:32
а можно для идиотов: таргет это нечто небольшое по объему или...?
таргет (цель) это место на раковом белке, через которое можно запустить механизм его разрушения.
на данный момент мы вычисляли докинг различных белков против 6 предполагаемых целей. В каждом из рассчетов было по 3000000 пар белков для докинга. Найдено некоторое кол-во белков которые на комп симуляции показали свою эффективность в разрушении ракового белка через эти цели. Сейчас оно проверяется вживую в лаборатории, и готовятся данные для рассчетов докинга еще на 2 или 3 цели. (то есть еще по 3 млн)
В шапке есть описание
Автор: Allineer Apr 27 2011, 14:56
Rilian, спасибо!
Автор: serymba Apr 28 2011, 20:30
а мне вот еще пришло,
HFCC_L4_02620693_L4_0000_1
кто то наверно бросил,аль не успел
Автор: Water Aug 15 2011, 21:28
У меня пошли блоки из этого проекта. В официальных новостях тишина.
Автор: serymba Sep 4 2011, 19:14
а эт нормально что у меня по 11 часов считается это
HFCC_target-7_00658313_target-7_0000_00658313_target-7_000
Автор: Rilian Sep 5 2011, 10:32
а эт нормально что у меня по 11 часов считается это
HFCC_target-7_00658313_target-7_0000_00658313_target-7_000
Бувають дуже великі завдання, можуть рахуватись біля 24 годин. Це нормально
Автор: Salmonella Sep 18 2011, 09:52
Не про нейробластому, но... информация.
http://www.poisknews.ru/theme/science/2038/?print
http://www.dkfz.de/en/presse/pressemitteilungen/2011/dkfz-pm-11-35-Award-Winning-Research-on-Childhood-Brain-Tumors.php
Автор: nikelong Sep 19 2011, 13:43
http://esquire.ru/chalikova
Автор: Rilian Sep 27 2011, 10:28
Новости!
http://www.m.chiba-u.ac.jp/class/bioinfor/wcg/e/hfcc_e/news.html
Thank you .
пишут что нашли 7 белков, которые смогли убить клетки
нейробластомы. Сейчас испытывают токсичность на мышах, а также молекулярный механизм убийства раковых клеток... great success, имхо!
Автор: Rilian Oct 4 2011, 14:24
Найдено средство против самой агрессивной формы лейкемии
Схема взаимодействия белков MLL, BET и гистонов (вверху); те же и препарат I-BET151 (внизу).
(Рисунок авторов работы)
Новый препарат смешанного происхождения совмещает эффективность и точность, препятствуя взаимодействию онкобелка и ДНК, но не разрушая ни первого, ни вторую.
Исследователи из британского http://www.cancerresearchuk.org/ сообщают, что им удалось найти лекарство от так называемой лейкемии смешанного происхождения (MLL). Среди различных http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9B%D0%B5%D0%B9%D0%BA%D0%BE%D0%B7 MLL находится на особом счету. В последнее время наука сильно продвинулась в лечении злокачественных заболеваний крови. Но эта разновидность проявляет исключительную устойчивость к любой терапии и после курса лечения стремится вернуться обратно. Кроме того, лейкемия смешанного происхождения считается одной из самых распространённых форм рака крови. Это наиболее общая форма лейкемии у детей до двух лет; на неё также приходится каждый десятый случай рака крови у взрослых.
Как это обычно бывает со злокачественными заболеваниями, причиной смешанной лейкемии является «противозаконная» молекулярная перестройка. В предшественниках кровяных клеток есть белки MLL, которые работают генетическими переключателями и в норме регулируют производство и дифференцировку клеток крови. Но порой случается так, что несколько генов MLL оказываются выстроены в одну линию. В результате считывания информации с такой ДНК получается слитный MLL-белок, в котором несколько полипептидных цепей сшиты в одну. Этот белковый монстр, как считается, и запускает лейкемию смешанного происхождения.
MLL-белки взаимодействуют с ДНК, активируя гены клеточного деления. При мутации эти белки никого не слушают, продолжая изо всех сил стимулировать производство новых клеток. Очевидно, если бы MLL-белки удалось выключить, это значило бы конец раку. Но для этого нужно было бы выяснить, как и с какими напарниками работают MLL. В журнале http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature10509.html учёные рассказывают о другой группе белков под названием BET, которые служат посредниками между MLL и ДНК. ДНК в клетке находится в комплексе с хромосомными белками http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%93%D0%B8%D1%81%D1%82%D0%BE%D0%BD%D1%8B. Активация того или иного гена часто означает его «разархивирование», «распаковку» от гистонов. Белки BET — это что-то вроде адаптера, соединяющего онкобелки MLL с гистонами, а MLL как раз и разворачивают гистоновую обёртку вокруг генов.
Ключевым моментом в исследовании является то, что удалось выяснить способ состыковки BET и гистонов. Белки BET присоединяются к модифицированным аминокислотам гистонов — http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9B%D0%B8%D0%B7%D0%B8%D0%BD, к которым пришит остаток уксусной кислоты. Узнав, что «любят» белки BET, исследователи подобрали некое соединение I-BET151. Этот реагент прилипал к BET как раз в том месте, которым они пристыковывались к гистонам. Таким образом, BET держатся подальше от ДНК, и соединённые с ними MLL не имеют возможности активировать клеточное деление. Эксперименты подтвердили эффективность I-BET151. Раковые клетки, обработанные этим соединением, переставали расти и погибали. Лекарство повышало выживаемость мышей даже с самой агрессивной формой лейкемии: как пишут авторы, через 40 дней после начала курса лечения более 60% животных оставались в живых, что для этого заболевания более чем значительная цифра.
Учёные подчёркивают оригинальность предложенного ими лекарства. Бóльшая часть противораковых лекарств бьёт либо по самой ДНК, либо выводит из строя поверхностные рецепторы раковой клетки. Несколько экспериментальных препаратов, как и I-BET151, имеют целью гистоновую обмотку ДНК, но они обладают гораздо меньшей специфичностью: авторы сравнивают I-BET151 с пулей снайпера, тогда как предыдущие аналоги похожи скорее на заряд дроби.
Следующий шаг — клинические исследования. Учёные не собираются ограничиваться только одним видом рака крови; по их мнению, таким же образом можно воспрепятствовать развитию самых разных злокачественных опухолей.
Видео - Potential new leukaemia drug
Подготовлено по материалам http://scienceblog.cancerresearchuk.org/2011/10/02/potential-leukaemia-drug-could-be-a-good-bet.
http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=3758808
Автор: Brodyaga Dec 9 2011, 10:39
Пошли задания из target-8.
Автор: Rilian Feb 11 2012, 21:51
По инсайдерской информации осталось 33 дня роботы в этой фазе проекта!
Ориентировочная дата окончания примерно 15 марта
Автор: corsar83 Feb 14 2012, 10:49
Вроде добавили target-9, считать еще где-то 4 месяца
UPD: При кранче круглосуточно мне понадобится 60 реальных суток для 3го сапфира, думаю успею, перехожу сюда
Автор: Rilian Feb 14 2012, 11:20
Я буквально сегодня докранчиваю сапфир в ГФАМе и перехожу на смесь HCC+HFCC
Автор: Rilian Apr 16 2012, 21:05
Help Fight Childhood Cancer - 30 days left of new work remaining for target-8 (as of Mar 21, 2012)
Hello all,
This is the official statement saying there is an estimated 30 days left of new work remaining on target-8 to be sent out. After this, there will be a period of about 2 weeks where work will be intermittently available as work units are reissued for lack of response. The last batch of work units from the researchers is target-8_0287 which has been built and loaded already. The researchers have confirmed there will be another target available after target-8 which may or may not become available before work units from target-8 are depleted.
Thank you again for all your help with this project! Let me know if you have any questions.
Seippel
осталось 5 дней до завершения рассчетов 8 цели, и в этой фазе проекта осталась еще 9я цель
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,32860
Автор: Rilian Apr 16 2012, 21:16
По прогнозам, 9 цель буджет посчитана примерно к сентябрю 2012!
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,32860
Автор: Rilian Apr 20 2012, 22:42
The Chiba research team has provided the first set of 70 batch inputs for target-9 and these work units are currently being built and indexed into BOINC. The remaining work units for target-9 are expected to be made available in 1-2 weeks. As a result, we aren't anticipating any period of time where work units for HFCC will be depleted until the end of the project (target-9 is currently the last planned target for HFCC).
Seippel
Начали присылать задания из последней - 9й цели проекта. Напоминаю, в каждой цели есть 287 пачек, итого 6.5 млн заданий
ориентировочно проект завершится через 200 дней!
планов продолжить эту фазу проекта рассчетами новых целей пока нет
Автор: Rilian May 21 2012, 08:14
Пишут что рассчеты цели №9 закончатся через 90 дней!
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,31741_lastpage,yes#lastpost
Автор: MAGADAN May 21 2012, 16:25
Пишут что рассчеты цели №9 закончатся через 90 дней!
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,31741_lastpage,yes#lastpost
Да они там много чего пишут
Вон уже сами в шоке 82 дня осталось
Глядиш завтра закончим с такими темпами
Автор: Rilian May 28 2012, 20:50
проект HFCC ориентировочно закочнится через 70 дней
у кого нет сапфировой медальки - поспешите 
Автор: MAGADAN May 29 2012, 08:46
Тут хоть бы то изумруда успеть добраться
Автор: Dromage May 29 2012, 10:04
Тут хоть бы до золота успеть добраться 
Автор: MAGADAN May 29 2012, 20:12
Ну и как это понимать ??????
Кто там у них за калькулятором сидит
Разве это реально ?????? 
УЖЕ 60 дней осталось
Темпы просто бешеные что весь мир считает HFCC
Автор: Rilian May 29 2012, 20:27
MAGADAN, просто админы подняли приоритет, а также на других проектах (2 последних) приоритет понижен
Автор: Sonechko May 29 2012, 22:00
Да шо там добиратись, 2 тижні діла (до синенького баджика)) Ех хочеться у Бурпі потащити команду поки комп топовий, і форма, ато скоро у багатьох вже буде 16 Гб опери...)
Автор: MAGADAN May 30 2012, 05:52
Да шо там добиратись, 2 тижні діла (до синенького баджика)) Ех хочеться у Бурпі потащити команду поки комп топовий, і форма, ато скоро у багатьох вже буде 16 Гб опери...)
ХА ,Sonechko , ты видел мои показатели по производительности
Мне до сапфир более 4 месяцев непрерывного счета нада
Автор: MAGADAN May 30 2012, 08:25
Раз такая петрушка пошла, то есть предложение.
На форуме как то вл время проведения челенджа "ПЕДАЛИЛИ" ( не хочу никого обидеть просто слово запомнилось ) помоему Tis-a
Вопрос: Кто готов помочь мне набрать сапфир
Ответ: готов помочь откликнувшимуся и считать для него тот проект который он скажет до той отметки которую укажет.
Вот в общем то и всё предложение.
Просто медельку хочеться
Автор: re_SET May 30 2012, 09:02
Раз такая петрушка пошла, то есть предложение.
На форуме как то вл время проведения челенджа "ПЕДАЛИЛИ" ( не хочу никого обидеть просто слово запомнилось ) помоему Tis-a
Вопрос: Кто готов помочь мне набрать сапфир
Ответ: готов помочь откликнувшимуся и считать для него тот проект который он скажет до той отметки которую укажет.
Вот в общем то и всё предложение.
Просто медельку хочеться
Давай ключ. Сколько Тебе ядер нужно?
Автор: MAGADAN May 30 2012, 11:36
А какой ключь если не подскажите .
Ядер не знаю если честно Ну что бы хватло насобирать сапфир
Автор: serymba May 30 2012, 19:12
А какой ключь если не подскажите .
Ядер не знаю если честно Ну что бы хватло насобирать сапфир
зайди в настройки профиля в WCG,напротив Weak Account Key ,там многа цифир и букв, это и есть слабый ключ
ну и тему про Педали почитай,для общего понимания http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=5508
Автор: MAGADAN May 30 2012, 20:45
А какой ключь если не подскажите .
Ядер не знаю если честно Ну что бы хватло насобирать сапфир
зайди в настройки профиля в WCG,напротив Weak Account Key ,там многа цифир и букв, это и есть слабый ключ
ну и тему про Педали почитай,для общего понимания http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=5508
Спасибо то что доктор прописал
Weak Account Key: 792904_cc0092da4feefd31e38e9f5befcfa107
Ядер ну пускай будет 10
Автор: MAGADAN May 31 2012, 14:45
А вот теперь надеюсь с помощью ( честно, не знаю, но 2 писибота считают для меня ) получиться набить сапфир
Автор: Dromage May 31 2012, 15:17
А вот теперь надеюсь с помощью ( честно, не знаю, но 2 писибота считают для меня ) получиться набить сапфир
А зачем именно сапфир? Я вот знаю что своими мощностями никогда выше золота не заработаю... потому сильно и не парюсь) А если просить помощи, то отдавать долг буду вечность ))
Автор: MAGADAN May 31 2012, 15:27
А вот теперь надеюсь с помощью ( честно, не знаю, но 2 писибота считают для меня ) получиться набить сапфир
А зачем именно сапфир? Я вот знаю что своими мощностями никогда выше золота не заработаю... потому сильно и не парюсь) А если просить помощи, то отдавать долг буду вечность ))
Ну мощности у меня всё таки в планах будут повышаться
Грядет замена парка ПК в течении года.
А сапфир хочеться сейчас
да и это самый завершающийся проект на данный момент.В чём сила брат, в команде брат
Автор: Dromage May 31 2012, 15:53
А вот теперь надеюсь с помощью ( честно, не знаю, но 2 писибота считают для меня ) получиться набить сапфир
А зачем именно сапфир? Я вот знаю что своими мощностями никогда выше золота не заработаю... потому сильно и не парюсь) А если просить помощи, то отдавать долг буду вечность ))
Ну мощности у меня всё таки в планах будут повышаться
Грядет замена парка ПК в течении года.
А сапфир хочеться сейчас
да и это самый завершающийся проект на данный момент.В чём сила брат, в команде брат
А я не знаю чего я хочу))) Так как мой парк расширяться не собирается... Как было 2 газонокосилки, так и останется в лучшем случае )
Автор: MAGADAN Jun 8 2012, 16:52
Всем спасибо за помощь, кто мне считал отключайтесь и выставляйте счета. 
У меня поменялись планы.
Автор: Bel Jun 8 2012, 22:27
К концу проекта осталось около 50 дней. Может поднажмем на этот проект и уже поскорее докранчим его? Сделаем минисуперкомп для wcg-кранчеров..!? Так освободим мощности для других проектов. Я уже переключился...
Автор: Rilian Jun 8 2012, 22:29
Bel, i'm in
Автор: Andrey Fenchenko Jun 8 2012, 23:04
Bel, Как только докранчу SIMAP - сразу же присоеденяюсь!
Автор: Brodyaga Jun 9 2012, 09:55
К концу проекта осталось около 50 дней. Может поднажмем на этот проект и уже поскорее докранчим его?
Сделаем минисуперкомп для wcg-кранчеров..!? Так освободим мощности для других проектов. Я уже переключился... И оставим тех, кто не успел, без сапфиров? Я с вами!
Автор: Dromage Jun 9 2012, 10:26
Я не успел))
Да и не успею...(
Автор: Khvastov Maxim Jun 9 2012, 12:32
Brodyaga, Dromage, я в деле ) через несколько дней изумруд возьму, ну а сапфир пролетает. Дадим жару!
Автор: Bel Jun 9 2012, 19:02
tiss, vitalidze с вами будет быстрее ..
Автор: Rilian Jun 19 2012, 23:18
We have reduced the feeder priority of the Help Fight Childhood Cancer project due to an outage on the research server. The reduced priority will still allow users with only the HFCC project selected to continue to receive work while users with a mix of projects selected will receive a smaller percentage of HFCC work units.
Seippel
понизили приоритет
включайте эксклюзивно HFCC чтобы были задания
Автор: vitalidze1 Jun 20 2012, 10:25
tiss, vitalidze с вами будет быстрее ..
Мужики. Я на морі допоможу,коли приїду.
Лежу в 3м від моря, сонечко, морське повітря мммм)
Автор: Rilian Jun 20 2012, 10:25
Khvastov Maxim, твой шанс получіть сапфір!
Автор: Khvastov Maxim Jun 20 2012, 12:46
Rilian, я и так всем, чем могу, считаю HFCC 300 дней мне ещё
Автор: Brodyaga Jul 5 2012, 12:30
Соревнование закончилось, продолжаем педалить HFCC? Там осталось-то на 2-3 месяца при сегодняшних темпах.
Автор: Rilian Jul 8 2012, 13:39
я продолжаю
на C4SW нет ВЮ, еще 1 год считать ...
Автор: Rilian Jul 12 2012, 13:13
http://blogs.korrespondent.net/celebrities/blog/sjumar/a70544
Автор: Bel Jul 22 2012, 12:28
Мне вот интересно, НСС планируют полностью перевести на ГПУ или оставят задания и на ЦПУ? Кто в теме?
Автор: Rilian Aug 2 2012, 12:10
37 дней до конца 9 таргета!
учитывая что 9 дней до конца Clean Water то HFCC может завершиться еще быстрее, например за 35 дней
делаем финальный рывок!
Автор: Death Aug 2 2012, 19:24
после симапа сразу )
Автор: Bel Aug 4 2012, 10:21
Задания на CFCW кто то получает? Неужели досчитали?)
Кстати на HCMD2 еще есть немного вьюшек.
Автор: tribal Aug 4 2012, 20:10
ко мне еще приходят
Автор: Rilian Aug 10 2012, 21:52
осталось 21 дней до конфа рассчетов 9 цели!
Автор: Rilian Aug 12 2012, 17:00
19 дней до конца проекта!
Автор: Rilian Sep 5 2012, 16:16
Выдаются задания HFCC_ target-9_ 02616677_
Это означает что осталось около (2860000-2616677)*2.3 = 559642 тасков = 9.3 дня до того момента как таски прекратят выдаваться!
Автор: Rilian Sep 6 2012, 00:14
Появилась инфа что будет 10й таргет. Что в нем рассчитывается пока неизвестно, наверное это один из "хороших" белков из прошлых официальных новостей
Автор: MAGADAN Sep 6 2012, 08:11
Появилась инфа что будет 10й таргет. Что в нем рассчитывается пока неизвестно, наверное это один из "хороших" белков из прошлых официальных новостей
А это точная инфа ? Или всеголиш предположение ?
Я вот думаю тогда до сапфира добраться
Автор: Rilian Sep 6 2012, 09:51
https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewpostinthread?post=390797
Автор: Rilian Sep 14 2012, 13:15
Осталось 145 дней до окончания рассчетов
Автор: MAGADAN Sep 15 2012, 12:21
Осталось 145 дней до окончания рассчетов Где-то я уже это видел
Автор: Rilian Sep 15 2012, 13:16
Осталось 145 дней до окончания рассчетов Где-то я уже это видел
ну так новый таргет же ж
Автор: Brodyaga Sep 18 2012, 11:58
Пошли задания по 10-ке.
Автор: Solo196 Sep 18 2012, 20:51
Пошли задания по 10-ке.
Блин, а я думал что уже все финиш ......
Хотя мне до 2-лет всего 40 дней осталось.
Автор: Rilian Sep 18 2012, 23:06
Пошли задания по 10-ке.
Блин, а я думал что уже все финиш ......
Хотя мне до 2-лет всего 40 дней осталось.
наоборот хороо - больше данных переберем и будет больше исследований в лаборатории
хотя уже год прошел с "официальных" новостей на оф сайте http://www.worldcommunitygrid.org/research/hfcc/news.do , и полгода с официальных новостей с официального форума http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewpostinthread?post=379560
( новости с других проектов на форуме можно почитать тут http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=25100 )
Thank You,
Dr. Akira Nakagawara
Автор: Rilian Sep 19 2012, 16:44
Thanks,
armstrdj
Будет еще 11 таргет!
Автор: Solo196 Sep 19 2012, 18:44
Thanks,
armstrdj
Будет еще 11 таргет!
Просто хотелось что бы один проект ЗАКОНЧИТЬ ! ведь мы считаем не бесконечно!
Автор: Rilian Sep 19 2012, 21:07
Thanks,
armstrdj
Будет еще 11 таргет!
Просто хотелось что бы один проект ЗАКОНЧИТЬ ! ведь мы считаем не бесконечно!
В ближайшее время заканчиваются HCMD2 и C4SW - ты еще можешь успеть поучаствовать
Автор: Rilian Nov 29 2012, 12:40
Осталось 29 дней до конца тсков 10 таргета!
Автор: Rilian Nov 30 2012, 23:32
Help Fight Childhood Cancer project update, November 2012
The Help Fight Childhood Cancer project is progressing very well. The number of targets for drug discovery has been increased from initial 3 to now 11 because the project is getting good results. Testing of the candidate chemical compounds is showing very promising results. We are working on preparing a paper for publication about what we have discovered so far. Thus the HFCC project is going well. All of the team members appreciate your generous donation to World Community Grid for developing new drugs to save the patients with childhood cancer.
--
Akira Nakagawara
Help Fight Childhood Cancer Scientist
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=34332
Автор: Bel Dec 1 2012, 14:37
Походу начался 11 таргет. Пишет, что к окончанию осталось 112 дней. Было в разы меньше.
Автор: Rilian Dec 2 2012, 10:07
Итак!
Таргет 11 официально объявлен и задания с ним иногда попадаются, для тестирования
По официальным данным пока что таргет-12 не предвидится
Это значит что проект завершится через 112 дней, при текущем темпе
Таргет-10 завершится через 25 дней
Предлагаю ускорить эти счастливые даты
Автор: Rilian Dec 16 2012, 19:03
We have reduced the feeder priority of the Help Fight Childhood Cancer project as we are nearing the end of target-10. This means that users with multiple projects selected are less likely to get HFCC work units, however users with only HFCC selected should continue to get work units without interruption. The next target is estimated to be available in April (this is only an estimate) and by reducing the feeder priority, users with only HFCC selected will continue to get work units for a longer period of time.
Seippel
понизили приоритет проекта
в апреле 2013 обещают таргет-12
https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,34418
Автор: Rilian Dec 20 2012, 14:39
посчитано 2280000/2860000=80% таргет-10
на очереди таргет 11 и 12, на каждый по 3 месяца рассчетов (примерно)
Автор: Rilian Jan 5 2013, 00:20
85% target10 посчитано
осталось таргет11 и таргет12, по моим рассчетам таргет12 будет посчитан через 7 месяцев
Автор: Rilian Jan 18 2013, 11:58
23 days of work remaining for target-10
Seippel
Автор: Rilian Jan 19 2013, 15:34
По информации админов ВЦГ таргет-11 еще не готов!
Seippel
Ожидаются задания от ученых в Апреле 2013
Щяс в течении 23 дней докранчиваем таргет-10
--
Я через 20 дней буду кранчить поровну HCC + FAAH потому что по моему мнению эти проекты приносят хорошие результаты в изучении своей области
Автор: Rilian Feb 7 2013, 21:09
Внимание! заданий осталось на 1 день и они закончатся вечером 8 февраля!
Если у вас включен прием заданий только из этого проекта, настоятельно рекомендую зайти в свой профиль и включить другие проекты
Если вы не используете разные профили, выберите проекты тут https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do
Если вы используете профили, выберите проекты тут https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/device/viewProfiles.do или в дефолтном профиле https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/device/viewBoincProfileConfiguration.do?name=Default
например я считаю щяс связку HCC+HFCC, а буду считать HCC+FAAH пока не появится таргет-11 в HFCC
Автор: Rilian Feb 9 2013, 12:53
Seippel
Автор: Rilian Apr 4 2013, 21:43
We are hoping for a new target11 later in April or May 2013. However it depends on how soon the target's protein structure can be determined. This is being done by another research organization. Large proteins are difficult to crystallize and this time consuming step is required before they can use x-ray crystallography to determine the exact structure of the target.
Автор: Rilian Apr 13 2013, 11:04
Обновление на официальном сайте!
http://www.project-hfcc.jp/e/hfcc_e/news.html
Мы идентифицировали 2 многообещающих кандидата для T1, результаты исследования поданы в журнал Cancer Research
Также в статье мы описываем работу над следующими кандидатами
Это успех
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=34993
Автор: Rilian Feb 21 2014, 12:22
Проект нашел 7 лекарственных кандидатов которые уничтожают опухоли нейробластомы без видимых побочных эффектов
You're improving the odds for children with neuroblastoma!
With your help, the Help Fight Childhood Cancer research team in Japan has discovered seven drug candidates that show great promise as new treatments for neuroblastoma, one of the most common and dangerous forms of childhood cancer. In lab tests, these drug candidates were very effective at destroying neuroblastoma tumors without any apparent side effects.
This breakthrough marks one of the most significant scientific discoveries to date for World Community Grid and was made possible by your contribution. Thank you! 
Learn more about this groundbreaking discovery in this blog post from Dr. Nakagawara, who leads the Help Fight Childhood Cancer research team, and share the exciting news!
The World Community Grid Team
=====================
http://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=342Breakthrough in the fight against childhood cancer
20 Feb 2014
Summary
The research team behind the Help Fight Childhood Cancer project has just published a groundbreaking paper. It reveals seven promising drug candidates - identified with the help of World Community Grid members – for neuroblastoma, one of the most common and dangerous forms of childhood cancer.
The Help Fight Childhood Cancer research team at the Chiba Cancer Center in Japan has discovered drug candidates that show great promise as new treatments for neuroblastoma, one of the most common and dangerous forms of childhood cancer. This breakthrough marks one of the most significant scientific discoveries to date for World Community Grid.
Thanks to the contribution of over 200,000 World Community Grid members, the researchers were able to screen three million compounds and identify seven that destroy neuroblastoma tumors in mice without causing any apparent side effects.
The Chiba team plans to partner with a pharmaceutical company for further development, while also expanding their future work on World Community Grid to address other forms of childhood cancer.
In http://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=341 Dr. Akira Nakagawara, who leads the research team at Chiba, explains the significance of this exciting finding and its potential implications on treatments for other forms of cancer.
====================
http://www.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=341 New hope in the fight against childhood cancer
By: Dr. Akira Nakagawara, MD, PhD
President, Chiba Cancer Center
20 Feb 2014
Summary
Blog post announcing a breakthrough in the search for a new treatment for neuroblastoma, written by Dr. Akira Nakagawara, principal investigator for Help Fight Childhood Cancer
Today, thanks to advances in modern medicine, 80% of children diagnosed with cancer are cured. But the prognosis is not nearly as good for children with neuroblastoma, the most common form of cancer diagnosed in infants. Neuroblastoma is a tumor of peripheral nerve tissues that often starts in the adrenal glands and sympathetic ganglia of the neck, chest, or abdomen, and affects approximately one in 8,000 children in the United States and Japan.
More than half of neuroblastoma cases are classified as high risk, and only 30% of these children are cured – a rate that has not improved for two decades. New treatments are urgently needed for this dangerous disease.
Our research team at the Chiba Cancer Center in Japan has been working to develop a new treatment for neuroblastoma. With the help of volunteers participating in the IBM World Community Grid initiative, we have just discovered seven new drug candidates that could potentially be used in new medicines that fight childhood neuroblastoma. These drug candidates work by activating a self-destruct mechanism present in neuroblastoma cancer cells, killing them without affecting healthy cells.
Neuroblastoma cells have a receptor on their surfaces called TrkB. When molecules bind to the TrkB receptor and inhibit its function, a tumor suppressor gene called p53 is activated, causing the neuroblastoma cell to self-destruct in a process called apoptosis. Apoptosis is one of the body's natural processes, and ordinarily helps to eliminate damaged cells before they can form a tumor. However, the TrkB receptor in neuroblastoma suppresses this self-destruct function. A similar TrkB process is involved when many adult cancers, including breast, lung, pancreatic, prostate, and colon cancers, metastasize (i.e. spread beyond an initial site). This means our findings may have implications for treating adult cancers as well.
Our strategy was to search for small molecules that would bind to and inhibit the TrkB receptor on cancer cells. There were millions of potential molecules to examine, making it infeasible to synthesize and test each of them in the laboratory. Instead, we partnered with World Community Grid to create the Help Fight Childhood Cancer project, using computer-based modeling on a massive scale to conduct this search. With the help of over 200,000 volunteers around the world contributing their spare computing power, we screened three million molecules in just two years – a process that would have taken more than 55,000 years on a single computer – and identified seven promising drug candidates for further study.
After additional laboratory testing, we have discovered that the seven drug candidates are very effective at destroying neuroblastoma tumors in mice, even at very low dosages, with no immediately apparent side effects. These results have been published in the peer-reviewed journal Cancer Medicine, available online since January 2014.
Based on these very promising findings, we are now seeking a pharmaceutical partner to collaborate on the further development and testing needed to produce an approved medicine.
This breakthrough was made possible by the support of volunteers around the world who donated their computing power through World Community Grid. On behalf of our research team, I would like to thank World Community Grid volunteers from the bottom of my heart.
Akira Nakagawara, MD, PhD, President, Chiba Cancer Center
Автор: Rilian Oct 15 2014, 12:17
переношу в завершенние!
Автор: Arbalet Jan 20 2015, 19:28
Многообещающие новости по результатам проекта - http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=6477
Говорят про скорый старт второй фазы!
Автор: Rilian Jan 21 2015, 13:40
Многообещающие новости по результатам проекта - http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=6477
Говорят про скорый старт второй фазы!
вау!
Invision Power Board
© Invision Power Services