Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

 
Reply to this topicStart new topic
> FightAIDS@Home: конец начала уже скоро
Arbalet
Feb 26 2015, 19:01
Пост #1


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 764
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
FX-8320 + 1070Ti



FightAIDS@Home: конец начала уже скоро

Благодаря участникам объединения распределенных вычислений World Community Grid в проекте FightAIDS@Home удалось практически закончить важный этап исследований и приступить к анализу полученных результатов.



FightAIDS@Home – один из самых первых проектов, запущенных с помощью World Community Grid в 2005 г. За прошедшее десятилетие коллектив проекта значительно расширил область научных исследований – появились новые перспективные цели-мишени и кандидатные лекарственные средства, которые было сложно представить в самом начале.

С помощью участников проекта удалось выполнить огромный объем вычислительной работы. В настоящее время посчитаны все задачи под приложение для молекулярного докинга AutoDock (AD), а для приложения AD Vina остался окологодичный запас заданий. Теперь усилия исследователей в основном будут сконцентрированы на анализе полученных данных.

Анализ первичных результатов FightAIDS@Home усложнен из-за огромного количества данных. Такова специфика вычислений при молекулярном моделировании докинга (стыковки) целей-мишеней (белков вируса иммунодефицита – ВИЧ), структуры которых могут иметь несколько вариантов, с перспективными лекарственными молекулами, которых насчитываются миллионы штук. В результате получаются комбинации из сотен миллионов вариантов взаимодействия на каждую цель-мишень. Обрабатывать такие массивы данных непросто, поэтому применяются различные подходы. Например, изучают аминокислоты, участвующие в докинге с наиболее высокими значениями эффективности связывания. Другой подход сводится к исследованию координат атомов, участвующих в связывании исследуемых белков с лекарственными молекулами.

В качестве примера можно привести случай ингибирования протеазы ВИЧ-1 с помощью TL3. В рамках эксперимента №1 FightAIDS@Home было просчитано около 5,5 млн. вариантов стыковки ингибитора TL3, и это только для одного варианта структуры протеазы ВИЧ-1. Все эти вычисления «в кремнии» – необходимый этап исследований, чтобы отобрать для дальнейших лабораторных испытаний («в пробирке») наиболее перспективные лекарственные молекулы – будущие возможные лекарственные препараты.

Итак, работа продолжается, более того – начинается ее важнейший этап. При этом исследователи отмечают, что самого искреннего спасибо будет недостаточно за неоценимую помощь волонтеров-добровольцев, которые пожертвовали в общей сложности 330 тысяч лет процессорного времени на исследования в рамках проекта FightAIDS@Home.

Подготовлено https://distributed.org.ua по материалам World Community Grid: The end of the beginning is near for FightAIDS@Home


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

Reply to this topicStart new topic
2 Користувачів переглядають дану тему (2 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 18:43

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.