Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Rosetta@home, проектирование новых белков
Dimych
May 29 2007, 12:12
Пост #1


Так, я створив профіль!


Група: New Members
Повідомлень: 2
З нами з: 29-May 07
Користувач №: 522
Стать: Чол



IPB Image

Проект "Rosetta@home"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт

Официальная статистика по команде "Ukraine"

ТОП-20 участников:
IPB Image
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 12.04.2006 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://boinc.bakerlab.org/rosetta
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
BOINC 6 Versions Change Log
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Если у вас есть желание помочь команде, посчитать на командный аккаунт, можно использовать так называемый "слабый ключ аккаунта" (weak account key) который позволяет коннектиться к проекту не вводя пароли. Все очки будут присваиваться командному юзеру distributed.org.ua

Чтобы подключиться:
0) установите BOINC
1) создайте файл account_boinc.bakerlab.org_rosetta.xml в папке \data\
2) в файл поместите текст
CODE
<account>
    <master_url>http://boinc.bakerlab.org/rosetta/</master_url>
    <authenticator>46ed7286c5974c66fe43ee6b4828413a</authenticator>
    <project_name>rosetta@home</project_name>
</account>

3) перезагрузите BOINC
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Описание проекта:
Цель проекта - решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии - вычисление 3-х мерной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершенному проекту "Геном человека" известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, не существующих белков. В случае успешного решения данных проблем мы сможем бороться с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями.[/quote]
взято отсюда

PROMO VIDEO new!

Для большей научной пользы выставьте время рассчета ВЮ - 1 день.
Для этого:
1. зайдите в Ваши настройки на сайте, http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project
2. выберите Target CPU run time = 1 day
3. нажмите Update
4. откройте БОИНК менеджер
5. если у вас сокращенный вид, нажмите Advanced View
6. выберите первую вкладку
7. выберите проект Розетта и нажмите кнопку "Обновить" сверху слева
8. Готово! Теперь каждая молекула будет "предсказываться" 1 день вместо 3 часов (по умолчанию)

Статья в журнале LiveScience.com
Мини FAQ
Исследование болезней
Что мы хотим знать о проекте Rosetta@Home ?
Rosetta@Home FAQ
Описание структур и методов моделирования белков
Сравнение биомедицинских проектов распределенных вычислений

Реферат по Росетте

Инструкция по подключению на FreeBSD, боинк брать на оф сайте

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

IPB Image



Марка по теме проекта:

IPB Image

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:

IPB Image

Це повідомлення відредагував Rilian: May 10 2011, 13:12
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
18 Сторінки V « < 14 15 16 17 18 >  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(225 - 239)
Rilian
Oct 23 2012, 12:31
Пост #226


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(Александр @ Oct 23 2012, 13:25) *

Rosetta. Только хотел подключиться к Rosetta@home, но получилось mini.

ок, это немного не относится к форуму Змагання. ? huh1.gif

в розетте ядро рассчетов называется rosetta mini. все ок

если будут вопросы по проекту, пиши в соответствующем форуме http://distributed.org.ua/forum/index.php?showforum=26

как подключиться, тут есть полная инструкция http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=865


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Александр
Oct 27 2012, 10:01
Пост #227


Соромлюсь щось писати
*

Група: New Members
Повідомлень: 5
З нами з: 6-May 08
Користувач №: 739
Стать: Чол



Спасибо.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
Nov 10 2012, 11:25
Пост #228


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



Nov 8, 2012
Journal post from David Baker

With your help, we have made an exciting breakthrough in protein design that is reported in a research article titled "Principles for designing ideal protein structures" in the journal Nature today. You can read about it at

http://www.nature.com/news/proteins-made-to-order-1.11767

In this paper, we describe general principles for creating new proteins from scratch. The new Institute for Protein Design is using these principles to design new proteins to treat disease.

Rosetta@home was absolutely critical to this work as described in the news article; Figure 3 in the paper shows how all of your contributions were used to test designed sequences to see if they folded up to the right structure. Most of the work units we are sending out on Rosetta@home these days are for exactly these kind of tests on the new proteins we are designing--this is absolutely critical to the research and to the development of new therapeutic and other functions. Thank you again for all of your contributions!


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Alien
Nov 10 2012, 17:43
Пост #229


Разработчик MolDynGrid
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 584
З нами з: 7-October 07
Користувач №: 594
Стать: Чол
Парк машин:
Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb



крутая новость... жду когда интегрируют алгоритмы в другие программы)

QUOTE(ander @ Oct 5 2012, 14:05) *

WCG HPF - це по суті і є Rosetta@Home, але Rosetta@Home - дослідницький проект, у якого дві мети: дослідження обчислювальних методів та винайдення нових структур.
Тому Rosetta@Home
1) має код клієнта менш оптимізований під нові процесори та відеокарти ніж інші проекти
2) має наукову перевагу над іншими проектами розподілених обчислень бо вдосконалює свої методи, що дозволяє rosetta@home показувати непогані результати у CASP (серед дослідницьких проектів).

Наверное, корректней сказать поиск нативной конформации по а.п.=)


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Bel
Nov 10 2012, 20:22
Пост #230


Мега ранчер
********

Група: Moderators
Повідомлень: 1 301
З нами з: 3-September 10
Користувач №: 1 476
Стать: Чол



Публикация точно лабы Бейкера. (Вот упрощенная журналистская версия, там же подкаст есть в исполнении самого др.Бейкера: http://www.nature.com/news/proteins-made-to-order-1.11767)
И одна из прорывных и важных за последнее время.

polyakoviv
А вы сэр громко сели в лужу со своими высказываниями типа
> вся проблема в том, что уж слишком давненько они обкатываются.


Давненько обкатывается решение задачи заключающейся в том, чтобы по известной первичной структуре (аминокислотной последовательности, которые уже известны для всех белков человека и многих животных) определить третичную структуру (3д модель свернутого белка).
Этой задачей ученые из множества лабораторий и университетов действительно уже больше десятка лет занимаются. Ну так вот - на данный момент она уже фактически решается для достаточно сложных белков (примерно до 600-1000 аминокислот, что перекрывает большинство натуральных белков кроме самых больших и сложных). И один из самых главных вкладов в этот прогресс внесла как раз Розетта и в частности R@H . Последние масштабные испытания ее алгоритмов показывают, что для большинства белков эта задача уже решается за разумное время (от нескольких дней до нескольких недель - при условии использования для расчетов суперкомпьютера или распределенной вычислительной сети) и с приемлемой (для практического использования) точностью.

А в этой последней статье речь идет уже об обратной задаче. На основе придуманной 3д структуру белка (а значит и его функций и свойств) определить его первичную структуру (аминокислотную формулу). Т.к. зная эту формулу, синтезировать нужный белок это уже легкая (по современным меркам) задача.
К решению этой задачи (в общем виде - для произвольного белка) сейчас еще только приступают, и этот результат один из первых заметных успехов на этом пути. И кстати белки по 70-100 аминокислот(1-2 тысячи атомов) с которыми работали не совсем уж такие маленькие - в некоторых случаях этого уже может быть достаточно для практического применения. И сомневаюсь, что формулу для таких белков можно "подобрать вручную". Вот один из созданных белков: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2kl8
А между тем, для разработки лекарств (а так же создания искусственных организмов с запрограммированными свойствами) эта задача даже важнее 1й. Т.к. обычно выяснить структуру целевого белка (например, критически важного белка в вирусе или болезнетворной бактерии) уже не представляет особых сложностей (а зачастую они и так уже известны - определены экспериментально с использованием рентгеновской кристаллографии и/или ядерно-магнитного резонанса). Определить в нем "активные центры" (воздействием на которые можно заблокировать/изменить функцию этого белка) тоже уже не очень сложно. Проблема заключается в том, чтобы найти (или создать) другой белок, который бы нужным образом взаимодействовал с этим(и) активным центром целевого белка. Сейчас для этого пытаются применять(не очень успешно) методы тупого перебора (моделирования взаимодействия) огромного числа случайных кандидатов + "направленная эволюция" после того (точнее если) нашелся хоть один кандидат, хотя бы с минимальной желаемой активностью (в него вносятся случайные мутации - замены 1-2 аминокислот, моделируют взаимодействие цель-кандидат заново, смотрят слабее или сильнее оно стало, делают следующую замену и т.д.).
После же достаточного развития методов изложенных в этой работе, для разработки белка-лекарства (или белка-«механизма») можно будет не тыкаться перебором, а просто рассчитать какая у белка должна быть аминокислотная формула, чтобы при ее сворачиванни сформировалась структура взаимодействующая с активным центром белка-мишени. И имея аминокислотную формулу - его легко синтезировать и проверить экспериментально.

Цитата:
ну а уж от того, что сейчас есть до "The new Institute for Protein Design is using these principles to design new proteins to treat disease." такая пропасть, что даже представить ее тяжело на самом деле


А тут еще один жирный плюх. Такой институт до которого "такая пропасть" УЖЕ как раз создан совсем недавно и реальная работа по описываемой схеме уже началась! И др.Бейкер станет главной этого нового института. См. предыдущие новости на главной проекта, а подробности тут : http://depts.washington.edu/ipd/
(Еще была большая статья с виртуальной экскурсией по новому институту, но пока не было времени перевод сделать)

P.S.
Кстати в честь официального открытия этого нового института, грозятся отобрать несколько кранчеров (5-10 человек) из активных в R@H и пригласить уже на реальную экскурсию туда.

Добавлено спустя 44 минуты 13 секунд:
Еще поробности относительно статьи. Опубликовали имена кранчеров, кому повезло и досталась жаба в которой была определена наилучшая структура белка (из 5 описываемых в статье):
Fold-I : Aalelan (United States)
Fold-II : Jef (United States)
Fold-III : georgebg (Bulgaria)
Fold-IV: medvjet009(Czech Republic)
Fold-V : _2e_ (Russia).
------------------------------------------------------
Пост взят из форума команды TSC! Russia.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Bel
Dec 24 2012, 12:44
Пост #231


Мега ранчер
********

Група: Moderators
Повідомлень: 1 301
З нами з: 3-September 10
Користувач №: 1 476
Стать: Чол



Результаты CASP 10!

Hi ALL ROSETTA@HOME participants,

Good new from CASP10 meeting, which just ended yesterday at Italy!!! Having your contribution to Rosetta@Home project, the Baker lab did really good this time. With a lot of exceptional scientists' effort, in CASP10 we have improved our template-based modeling (TBM) method. And here are those results:

Let's focus on TBM easy/hard using "best model" (best out of five submission) as the criterion.

1. Baker Lab is ranked first in Server Prediction (fully automated structure prediction)
---------------------------------------------------
[1] [2] [3] [4] [5]
---------------------------------------------------
1. 330 s BAKER-ROSETTASERVER 111 79.614
2. 035 s Zhang-Server 111 79.365

[1] rank
[2] server id
[3] server name
[4] proteins count
[5] Z-score (how well you did compared to others using GDT-TS as metrics)

website: http://www.predictioncenter.org/casp10/gro...n&submit=Filter
2. Baker Lab is ranked second in Human Prediction (manually structure prediction):
---------------------------------
[1] [2] [3] [4] [5]
---------------------------------
1. 237 zhang 56 56.832
2. 477 BAKER 56 54.482

[1] rank
[2] server id
[3] server name
[4] proteins count
[5] Z-score (how well you did compared to others using GDT-TS as metrics)

website: http://www.predictioncenter.org/casp10/gro...n&submit=Filter
3. Baker Lab is ranked first in Human Contact-assisted Prediction (given few native contacts, to predict protein structure) with a tremendous distance to the group ranked second:

Here is the preliminary results the CASP organizer posted on website:
http://predictioncenter.org/casp10/results...ers&groups_id=4

, where for each graph with orange-color lines into it, you need to compare the black line to the rest- that's us. The main predictor, David Kim, will come here, explaining it clearly to you all with a summary table.

With the help and contribution to Rosetta@HOME from you all, we are able to make significantly progress to predict more accurate protein structures, which ends up would impact the real world by tackling human deseases, like, therapeutics protein design.

Please let me know if I said something unclear. Again, thank you so much for the support. We will keep you updated about our triumph in contact-assisted protein structure prediction in CASP10.


Sincerely,
Baker Lab CASP10 Team
-----------------------------------------------------------------
Hi all,
As Ray posted below, we did well! Here are a couple plots and images of our results from the contact assisted category. Points above the line are best. The y-axis is the GDT (how close we are to the correct structure, higher is better) of our best models for each of the contact assisted targets vs on the x-axis for the left plot, the GDT of the best models of all predictions without using contact information, and for the right plot, the best models of other predictors using contact information. As you can see we are above the line for many of the targets. An outstanding prediction was for T0680o, which is a tetramer. There were other outstanding predictions. See below.

Thank you all for contributing to this effort. I'll see if I can find users who provided the actual predictions that led to the final submitted models. It might be tough though.













User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Dec 24 2012, 13:04
Пост #232


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Great success!


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 11 2013, 15:37
Пост #233


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Mar 11, 2013
Journal post from David Baker

We have learned to design a new class of proteins which could be useful both as drugs and in sensors. As I've explained before, most drugs are small molecules with fewer than 50 atoms. There are many drugs, such as blood thinning agents, which are very dangerous if given in too large doses. We have succeeded in designing proteins which bind to specific small molecules very tightly. These proteins could be used as antidotes in case of overdose with the target small molecule-for example we've designed a protein which could be useful to treat toxicity due to overdose of the drug digoxin used to treat heart disease. With collaborators, we are working to use these designed proteins to detect levels of the target small molecules in the blood or in the environment.


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
eugeny
Apr 27 2013, 06:27
Пост #234


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 438
З нами з: 2-May 09
З: Запорожье
Користувач №: 1 016
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
i7-8700K@4300 32GB@3200 GTX1080Ti@1900



Приложение Rosetta Mini обновили до версии 3.46.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
May 23 2013, 16:43
Пост #235


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



David Baker's Rosetta@home journal
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum_thread.php?id=1177

Posted 20 May 2013

We have discovered how to make several new classes of protein structures! Rosetta@home has been absolutely critical in this work: when we design a sequence to fold into a new structure, the last thing we do before ordering a synthetic gene so we can make the protein in the laboratory is to send it out to you to predict the structure-if it folds to the structure we designed, we go ahead with it, but if you find that the lowest energy state is a different structure we go back to the drawing board. Our success rate in making brand new structures is far higher than I or anybody else ever expected, and the reason the success rate is so high is that your calculations provide a very stringent test of whether the designed sequence will actually fold the way it is supposed to. In the next few weeks I and other scientists here will describe to you the new classes of proteins we are making, and the many applications they will be useful for. Thank you for your absolutely essential contributions to this newly emerging scientific field!

-- David Baker


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jun 24 2013, 14:28
Пост #236


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



To our awesome Rosetta@Home contributors:

At the beginning of 2012 we told you that it looked like eight designed proteins stuck to EED as desired. Further experiments showed us that of our eight initial hits, only two were real, and those two proteins were too weak to be improved with laboratory techniques. We've gone back to the drawing board, using more aggressive modeling techniques to design better binding proteins to mimic Ezh2. It turns out that no known protein structure is similar enough to the Ezh2 binding helix to allow us to simply transplant key amino acids from Ezh2 to a new host protein, as we tried before. What were doing now is making new proteins from scratch that have the exact shape that we need to mimic Ezh2. The "EED" runs you'll now see on Rosetta@Home are structure prediction of designs to see if they have the desired curvature when Rosetta folds them up. Thanks again for all of your donated computer time!

For those new to this thread/message board, here is what I wrote previously about the EED project:

The second of these interactions involve a protein called EED and another called Ezh2. If you think about DNA as a ladder, then each of our cells has about six billion rungs worth of ladder. In order to keep all of that DNA from getting hopelessly tangled, our cells keep it on little spools, called histones, when not in use. Think of this like a massive film archive. It turns out that there is a lot of DNA that never gets used, so the cells put special flags on those spools (histones) that say something like "never use this section of DNA". EED is a large protein that attaches to those flags and brings along Ezh2, a "flagging machine" for the ride. EED makes sure that Ezh2 adds flags to histones that are supposed to get them, and not to histones carrying DNA the cell actually wants to use. Some cancer cells reduce the amounts of EED or Ezh2 to prevent flagging of DNA regions that they want to use to take over our bodies. Other cancer cells expand the amounts of EED or Ezh2 to flag DNA regions that are getting in the way. Scientists are working hard to better understand how EED, Ezh2, and friends work in normal cells and what goes wrong in cancer cells. Some are trying to develop drugs that prevent Ezh2 from attaching to EED. This means that the drugs have to stick to EED more tightly than Ezh2. Although Ezh2 attaches relatively loosely to a large patch on the surface of EED, their aren't any drugs yet available that do what we want.

I'm trying to make proteins that will do the same job. I used Rosetta@home to design a set of proteins that mimic Ezh2 in order to block it from attaching to EED. Just to give you a sense of how much computing I need for a project like this, I submitted just under two million work units to Rosetta@home, and donor's computers ran my protocol just under a billion times to give me about 54 designs to look at, from which fourteen were suitable for testing. This took about a month to run on Rosetta@home. From initial experiments, it looks like eight of the designs stick to EED, and one in particular sticks three times better than the Ezh2 found in our cells. Now I'm working to improve the best design at the lab bench and hope to send it to co-workers for testing in living cells. There's still a lot of work to be done to make sure that everything is working right with this design, but I want to give a big thank-you to all of you who donated your computer time to make this possible! For more information about EED, Ezh2, and related proteins, please visit:

http://en.wikipedia.org/wiki/EED
http://en.wikipedia.org/wiki/SUZ12
http://en.wikipedia.org/wiki/EZH2
http://en.wikipedia.org/wiki/PRC2
http://en.wikipedia.org/wiki/Polycomb-group_proteins

Work units for this project carried the word "EED" in their name.

link.gif

koc.gif koc.gif koc.gif koc.gif awesome.png


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Sep 15 2013, 13:22
Пост #237


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Набрав 500К cool2.gif koc.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
CrazyBigCat
May 7 2014, 10:39
Пост #238


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 433
З нами з: 15-February 13
Користувач №: 3 172
Стать: Чол
Парк машин:
Intel Xeon E5440 @ 3,2 GHz GeForce GT 440 1024MB GDDR3 Windows 7; MINIX Neo X7 Quad-Core ARM Cortex-A9 @ 1,6 GHz Android 4.2.2; SAMSUNG Galaxy Tab 2 Dual-Core ARM Cortex-A9 @ 1,2 GHz Android 4.4.4; 2 x Intel Xeon E5-2670 @ 2,6 GHz GeForce GTX 560Ti 1024MB GDDR5 Linux Mint... powerdown...



Rosetta@home включен в дисциплину Natural Sciences в 5th BOINC Pentathlon 2014 - любители медицинских проектов подключайтесьexcl.gif Еще есть время "нахомячить" заданий и помочь команде UKRAINE в соревнованиях...


--------------------




User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Asket
May 9 2014, 21:34
Пост #239


Трохи обжився
**

Група: Trusted Members
Повідомлень: 27
З нами з: 25-June 13
Користувач №: 3 256
Стать: bot



Парни, а зачем "Для большей научной пользы выставьте время рассчета ВЮ - 1 день.", что конкретно это дает? Обьясните пожалуйста.


--------------------
(Show/Hide)

http://stats.free-dc.org/cpidtagb.php?cpid=1f6fcf1f3056eccb9083507e255a7bc2&theme=6&cols=1
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
May 9 2014, 21:39
Пост #240


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Asket, розетта рандомно подбирает конфигурацию белка. Теоретически выставив самое больше время попытки каждая структура будет исследована максимально возможным кол-вом способов. То есть вдруг именно в самом конце работы ВЮ комп найдет самую классную конфигурацию ?


А вообще, в данный момент и еще 2 дня будет идти BOINC Pentathlon http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=6361 , и в нем очень рекомендуется выставить время ВЮ на 1 час, для максимальной отдачи http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

18 Сторінки V « < 14 15 16 17 18 >
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 10:24

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.