Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Folding@home: помоги победить коронавирус
Arbalet
Mar 11 2020, 19:03
Пост #1


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 665
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Компания Folding@home объединяет исследователей по всему миру, которые работают над тем, чтобы лучше изучить коронавирус 2019-nCoV и ускорить научные усилия по разработке новых методов спасения людей. Установив предлагаемое программное обеспечение, каждый человек может пожертвовать неиспользованные вычислительные ресурсы своего компьютера консорциуму Folding@home, исследователи которого работают над улучшением понимания структур потенциальных мишеней для лекарств против 2019-nCoV, и помочь в разработке новых методов лечения.



Данные, которые пользователи таким образом помогут генерировать, будут быстро и открыто распространяться в рамках открытого научного сотрудничества нескольких лабораторий по всему миру, предоставляя исследователям новые инструменты для разработки жизненно важных лекарств.

2019-nCoV является близким родственником коронавируса SARS (SARS-CoV) и действует аналогичным образом. Для обоих коронавирусов первый этап заражения происходит в легких, когда белок на поверхности вируса связывается с белком-рецептором на клетке легкого. Этот вирусный белок называется шипом (отмечен красным цветом на изображении ниже), а рецептор – ангиотензинпревращающий фермент 2 (ACE2).


Иллюстрация, созданная Центрами по контролю и профилактике заболеваний США (CDC), показывает ультраструктурную морфологию коронавируса. Обратите внимание на шипы, расположенные на внешней поверхности вируса, которые придают ей вид короны, окружающей вирион.

Терапевтическое антитело представляет собой белок, который может блокировать связывание вирусного белка с рецептором и предотвратить заражение вирусом клетки легкого. Терапевтическое антитело уже было разработано для SARS-CoV, но для создания терапевтических антител или малых молекул против 2019-nCoV ученые должны лучше понять структуру белка вирусного шипа и механизм его связывания с рецептором ACE2, необходимым для проникновения вируса в клетки человека.

Белки все время движутся – они раскачиваются, складываются и разворачиваются, принимая различные формы. Поэтому необходимо изучить не одну форму вирусного шипа, а все возможные варианты с учетом колебания белка и складывания в альтернативные формы. Это позволит лучше понять, как шип взаимодействует с рецептором ACE2, и подобрать терапевтическое антитело. Уже существуют структуры вирусного шипа SARS-CoV, но они с низким разрешением, а формы шипа различаются у SARS-CoV и 2019-nCoV. У нас есть возможность оказать помощь в моделировании структуры белка-шипа 2019-nCoV и идентифицировать участки, на которые может быть нацелено терапевтическое антитело. Для этого нужно построить математические модели, но они требуют достаточной вычислительной мощности.

Каждый желающий может поучаствовать в работе, установив программу Folding@home и выбрав вкладку «Any Disease» (любое заболевание) – разработчики пока не сделали опцию для направления ресурсов конкретно на коронавирус, но обещают оповестить, когда реализуют эту функцию. Один белок 2019-nCoV, протеаза, кодируемая вирусной РНК, уже кристаллизован. И хотя интересующий белок-шип 2019-nCoV еще не расшифрован, можно использовать гомологичную структуру шипа SARS-CoV для идентификации мишеней терапевтических антител.

Аминат Аджиева, портал «Вечная молодость» <a href="http://vechnayamolodost.ru" target="_blank">http://vechnayamolodost.ru</a> по материалам FOLDING@HOME: FOLDING@HOME Takes Up The Fight Againist COVID-19/2019-NCOV.

koc.gif

Немножечко полезного FAQ от Cullorblind, чтобы повысить отдачу от железа:
Вижу в теме GTX 1070 на скринах , но с очень низким PPD как для GTX 1070, у которого PPD должен быть от 600к до 800к в зависимости от частоты чипа и задания.
Как будто не введён passkey, а если не введён - тогда не начисляется Quick Return Bonus, с которым PPD в зависимости от мощности железа и задания в 2-10 раз выше чем без passkey.

Поэтому, чтобы не профукивать PPD - и свой и команды - просьба в standalone-клиенте жамкнуть Configure, потом на вкладке Identity - на соответствующую ссылку для получения passkey на мыло, а потом из почты нужно скопипастить passkey в клиент в поля passkey и reenter.
Для новичков считающих с 0 заданий - после получения passkey и 10 посчитанных заданий PPD существенно вырастет, см. скрины.

Как установить небраузерный standalone-клиент:
https://forums.overclockers.ru/viewtopic.php?f=21&t=395883
https://foldingathome.org/support/faq/insta...guides/windows/



Последние дней 10 - сильная напряжёнка с генерацией новых заданий в связи с огромным наплывом и новых участников и переключением нескольких кластеров из майнинга, железо может простаивать до часа в попытках дождаться у серваков своей очереди на скачивание заданий.

Современные GPU имеют больше терафлопс и всегда приносят больший PPD на ватт по сравнению с CPU, условно 100 ватт на ничзкочастотном AMD 8 ядернике это 100к PPD, 100 ватт на GTX 1060 - это 500к PPD c passkey.
Поэтому оптимальные по энергоэффективности конфиги - срендне-малоядерный процессор от 3 ГГц и GPU на какой есть деньги, желательно Nvidia; AMD 5700 XТ считает только последнее 22 ядро, на Vega10 считает и 21 и 22 ядро, но на них чаще бывают ошибки с последними COVID-19 related проектами


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
2 Сторінки V < 1 2  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(15 - 29)
rpisarev
Mar 22 2020, 21:37
Пост #16


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 373
З нами з: 10-December 11
Користувач №: 2 868
Стать: bot



https://www.youtube.com/watch?v=KU4qOebhkfs
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
Mar 23 2020, 08:57
Пост #17


отрабатываю карму
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 023
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 4.2 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 16 GB (1600MHz); SSD ADATA 128 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+1Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/8Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/Sata 149 Gb



Не было бы счастья, да несчастье помогло.
Форум оживился, появился интерес к фолдингу.

И первыми майнерами были как раз кранчеры, которые по фану и начинали майнить биткоин.
Сейчас, когда майнинг на гпу приносит копейки, как раз в свете событий с коронавирусом вырос интерес к фолдингу, когда можно задейстовавать свои видеокарты для борьбы с болезнью.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Dromage
Mar 23 2020, 12:36
Пост #18


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 944
З нами з: 6-March 12
З: Кривий Ріг
Користувач №: 2 942
Стать: Чол
Парк машин:
домашня конячка: i5-4690K, домашній ішачок: pentium B970



Согласен.

Эпидемия - зло...
Но я очень рад видеть снова старые знакомые ники на форуме (новые, если что, - тоже рад)! wink2.gif
Не пропадайте и в годы благополучия.


--------------------


(Show/Hide)



Параллельный мир: https://s.bbgam.com/?152127
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
re_SET
Mar 23 2020, 19:41
Пост #19


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 442
З нами з: 26-January 09
З: Волинська обл., смт. Любешів
Користувач №: 911
Стать: Чол
Парк машин:
1х Athlon X2 BE2300 (2.2 Ghz) 1x C2D E8200 1x C2D E2180 (2.34 Ghz) 1x C2D E2160 1x C2D E5200 (2.9 Ghz) 9x C2D E6500 (Up 3.24 Ghz) 1x C2Q Q8300 (Up 3 Ghz)



(Dromage @ Mar 23 2020, 12:36) *

Согласен.

Эпидемия - зло...
Но я очень рад видеть снова старые знакомые ники на форуме (новые, если что, - тоже рад)! wink2.gif
Не пропадайте и в годы благополучия.
Не повірите, щойно зловив себе на пошуку кнопки лайк на форумі, st.gif . ФБ - Зло..


--------------------
Нельзя попасть в Рай одной религии, не попав при этом в Ад всех остальных...





(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
dimus8210
Mar 25 2020, 14:58
Пост #20


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 546
З нами з: 24-November 13
З: Київ
Користувач №: 3 348
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Ryzen 1700, 16Gb озу, GTX 1070Ti 8Gb, Ubuntu 16.04 і7 4790, 16Gb озу, P104-100 4Gb, Ubuntu 16.04



https://itc.ua/news/belyj-dom-ibm-nasa-i-dr...perkompyuterov/


Белый дом, IBM, NASA и другие компании объединились для борьбы с коронавирусом с помощью суперкомпьютеров


--------------------
Science knows no country, because knowledge belongs to humanity, and is the torch which illuminates the world. Science is the highest personification of the nation because that nation will remain the first which carries the furthest the works of thought and intelligence. Louis Pasteur
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Cullorblind
Mar 25 2020, 19:21
Пост #21


Так, я створив профіль!


Група: New Members
Повідомлень: 1
З нами з: 25-March 20
Користувач №: 3 755
Стать: Чол



Всем добрый вечер!

Вижу в теме GTX 1070 на скринах , но с очень низким PPD как для GTX 1070, у которого PPD должен быть от 600к до 800к в зависимости от частоты чипа и задания.
Как будто не введён passkey, а если не введён - тогда не начисляется Quick Return Bonus, с которым PPD в зависимости от мощности железа и задания в 2-10 раз выше чем без passkey.

Поэтому, чтобы не профукивать PPD - и свой и команды - просьба в standalone-клиенте жамкнуть Configure, потом на вкладке Identity - на соответствующую ссылку для получения passkey на мыло, а потом из почты нужно скопипастить passkey в клиент в поля passkey и reenter.
Для новичков считающих с 0 заданий - после получения passkey и 10 посчитанных заданий PPD существенно вырастет, см. скрины.

(чтобы сразу было видно новичкам - лучше скопипастить эту тему c passkey в верхний OП-пост, если есть F@H группа на Facebook - нужно закинуть и туда, меня в FB или прикрыли или ломанули)

Как установить небраузерный standalone-клиент:
https://forums.overclockers.ru/viewtopic.php?f=21&t=395883
https://foldingathome.org/support/faq/insta...guides/windows/

Последние дней 10 - сильная напряжёнка с генерацией новых заданий в связи с огромным наплывом и новых участников и переключением нескольких кластеров из майнинга, железо может простаивать до часа в попытках дождаться у серваков своей очереди на скачивание заданий.

Современные GPU имеют больше терафлопс и всегда приносят больший PPD на ватт по сравнению с CPU, условно 100 ватт на ничзкочастотном AMD 8 ядернике это 100к PPD, 100 ватт на GTX 1060 - это 500к PPD c passkey.
Поэтому оптимальные по энергоэффективности конфиги - срендне-малоядерный процессор от 3 ГГц и GPU на какой есть деньги, желательно Nvidia; AMD 5700 XТ считает только последнее 22 ядро, на Vega10 считает и 21 и 22 ядро, но на них чаще бывают ошибки с последними COVID-19 related проектами

Це повідомлення відредагував Cullorblind: Mar 25 2020, 19:25


Приєднані зображення
Приєднане зображення Приєднане зображення
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Mar 25 2020, 22:18
Пост #22


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 665
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Cullorblind, вот спасибо тебе, добрый человек! Уже получил по почте и ввел passkey, а полезную инструкцию добавил в шапку smile.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
Mar 26 2020, 07:42
Пост #23


отрабатываю карму
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 023
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 4.2 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 16 GB (1600MHz); SSD ADATA 128 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+1Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/8Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/Sata 149 Gb





Тоже решил пофолдить. Скромный вклад.
Вот только инфа о проекте не грузится, видно на скрине, через разные браузеры пробовал.

И очень долго можно ожидать заданий, тут же нет буфера.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Mar 26 2020, 08:13
Пост #24


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 665
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Хм, после ввода passkey у меня сбросилась статистика и я начал считать с 0 очков, хотя ни ник, ни номер команды не поменялись... idontno.gif
Приєднане зображення


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
cadet-ua
Mar 26 2020, 16:49
Пост #25


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 93
З нами з: 23-September 07
З: Павлоград
Користувач №: 582
Стать: Чол
Парк машин:
AMD FX 3820, AMD FX 8150, AMD X6, AMD X4, Intel 3770, Intel 4770 ....



Сейчас их сервера перегружены желающими.

Задания могут не приходить несколько часов.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
ArsenEverlast
Mar 26 2020, 19:57
Пост #26


мрію про ферму...
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 144
З нами з: 8-February 14
З: Lviv
Користувач №: 3 385
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Dell Inspiron 7720 (i7-3632QM, Radeon HD 7730M), ARTLINE Gaming X93 (i7-6700K, GeForce GTX 970)



Мощности сети Folding@Home перевалила за 1 ExaFLOPS. Это на порядок больше, чем у самого быстрого суперкомпьютера в мире


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
fram
Mar 27 2020, 09:51
Пост #27


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 330
З нами з: 17-March 10
З: Харьков
Користувач №: 1 349
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
fx8370, RX588x2



никогда не любил фолдинг с их клиентом. Все через жопу.

Г Где мой старый аккаунт? ffuuuuu.png


--------------------
Жить, конечно, хорошо....а хорошо жить - еще лучше
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
Вчора, 12:26
Пост #28


отрабатываю карму
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 023
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 4.2 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 16 GB (1600MHz); SSD ADATA 128 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+1Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/8Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/Sata 149 Gb



Посчитал несколько заданий. Последнее пару суток назад.
Посмотрел статистику, количество вьюшек всего на пару штук увеличилось, хотя их больше посчитано, очки не увеличились.
Это реджекты?
Тут нет нормальной статы как в боинке, чтобы увидеть какие задания валидны, какие нет?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
ArsenEverlast
Вчора, 19:14
Пост #29


мрію про ферму...
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 144
З нами з: 8-February 14
З: Lviv
Користувач №: 3 385
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Dell Inspiron 7720 (i7-3632QM, Radeon HD 7730M), ARTLINE Gaming X93 (i7-6700K, GeForce GTX 970)



переключайтеся із цього галімого проекту на GPUGRID, якраз зараз дофіга завдань є



--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
dimus8210
Вчора, 19:51
Пост #30


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 546
З нами з: 24-November 13
З: Київ
Користувач №: 3 348
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Ryzen 1700, 16Gb озу, GTX 1070Ti 8Gb, Ubuntu 16.04 і7 4790, 16Gb озу, P104-100 4Gb, Ubuntu 16.04



(ArsenEverlast @ Mar 29 2020, 20:14) *

переключайтеся із цього галімого проекту на GPUGRID, якраз зараз дофіга завдань є


проект не галімий, просто дохреніші народу набігло після закриття SETI, ще й фішка Folding що запустили вивчення коронавірусу на хвилі інформаційного поносу, от і скінчились завдання, в GPUGRID також зараз нові кранчери прибувають досить стрімко. В Rosetta до речі теж за останні дні багатенько кранчерів приєдналось.


--------------------
Science knows no country, because knowledge belongs to humanity, and is the torch which illuminates the world. Science is the highest personification of the nation because that nation will remain the first which carries the furthest the works of thought and intelligence. Louis Pasteur
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

2 Сторінки V < 1 2
Reply to this topicStart new topic
4 Користувачів переглядають дану тему (4 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 30th March 2020 - 18:57

Rambler's Top100 Рейтинг@Mail.ru
Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.