Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> The Lattice Project, Биологический проект-комбайн, с широким кругом целей
nikelong
Aug 9 2007, 22:02
Пост #1


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



IPB Image

Проект "The Lattice Project"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт
Статистика по команде "Ukraine"
Статистика проекта на фришниках
Статистика по команде "Ukraine" на фришниках

ТОП-20 участников:
IPB ImageIPB Image
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 05.06.2007 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://boinc.umiacs.umd.edu/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------


О проекте:
Один из биологических проектов. Целей много. Эволюционные изменения последовательности ДНК, вероятные предсказания бактериальных геномов, изучение географического распространения Птичьего Гриппа в Соединенных Штатах, моделирование структур больших белков и взаимодействий таких белков с различными лигандами итд. Насколько я понял, это будет что-то вроде WCG, когда в рамках одного проекта существуют подпроекты для решения различных типов задач.

Читайте подробнее об исследованиях проекта

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

IPB Image


Ссылки
http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Lattice/en
http://www.boinc-af.org/content/view/632/219/
http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...lattice-project

Кому попадалась на глаза дата старта проекта? Это точно 2005 год. А вот точнее бы узнать ...

Це повідомлення відредагував Rilian: Mar 6 2010, 22:06
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
8 Сторінки V « < 5 6 7 8 >  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(90 - 104)
corsar83
Apr 20 2010, 17:57
Пост #91


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



Поймал задание bq.gif


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
nikelong
Oct 18 2010, 11:43
Пост #92


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



http://boinc.umiacs.umd.edu/boinc_map.php

Кто где качает/проверяет задания.

В Украине на данный момент это Киев и Черкассы smile.gif


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
nikelong
Aug 3 2011, 10:57
Пост #93


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол



We have released GARLI-2.0 for the following platforms: Linux (x86), Mac OS X (Intel), and Windows (x86 and x64). These are all version "5.00" -- the executables themselves may have a different name depending on the platform. We have officially dropped PPC/OS X support; apologies to that subset of our participants. The next GARLI job you run via The Lattice Project should be GARLI version 2.0.

http://boinc.umiacs.umd.edu/forum_thread.php?id=633


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
T@r@s_Bulb@
Jan 19 2014, 13:52
Пост #94


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 275
З нами з: 12-May 13
З: ZP.UA
Користувач №: 3 242
Стать: Чол
Free-DC_CPID



QUOTE(ReMMeR @ Jan 6 2008, 13:40) *

1 задание считается очень быстро - до 20ти Минут...


Не розумію...

1. - відсоток виконання майже не рухається

2. - вже рахує майже три години

3. - а час до кінця показує 8 хвилин (три години тому теж показувало 8 хвилин до завершення).

Якийсь ступор?

P.S. BOINC перевантажував...

(Show/Hide)



--------------------
Моя статистика:
(Show/Hide)






*************



User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
tiss
Jan 19 2014, 22:28
Пост #95


Мега ранчер
********

Група: Moderators
Повідомлень: 1 662
З нами з: 28-February 09
Користувач №: 952
Стать: Чол
Free-DC_CPID



QUOTE(T@r@s_Bulb@ @ Jan 19 2014, 13:52) *

Якийсь ступор?


wink2.gif

Ты ещё не видел, как процент выполнения задания откатывается назад.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 6 2014, 21:49
Пост #96


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



хо-хо,

крупные задания поймали меня на дефиците памяти...

им подавай 2Гб на 1 поток, а у меня 18гб и потому ядра простаивают

кстати, на Оптеронах(ddr2) недавно абортировал, т.к. процент почти не двигался, решил, что ему интеловские SSE4(?) нужны, а то, видимо, просто крупные задания попались, т.к. вижу - ща вот на Интеле также время ого-го рассчитывается

а то уж было подумал, что какие-то магические оптимизации под Интель (кстати, ничего не нагуглилось по этому поводу...)

----
и снова про память: а ведь странно, что оно не хотит распределять память:

есть 2 сокета по 8 НТ-ядер Интел (т.е. 16 потоков):

ОЗУ: на одном сокете 3*4Гб, на втором - 3*2Гб, т.е. 12 + 6 Гб

- так поначалу запустилось 9 заданий (может, бОльшего на тот момент просто сервер не выдал)
- заняли они ~16Гб ОЗУ , а потом 4 задания перешли в состояние ожидания и память опустилась до 10гб,

т.е. в расчете осталось 5 заданий = 10Гб (это "брутто")

и хоть доступно ещё 8Гб, как ни пинай - считаются только 5 потоков...


=-=-=-=-=
ЗЫ: просто }{eon L5630 2.13GHz 8 threads = 40W а Opteron 8439SE 2.8GHz 6 cores = 135W
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 6 2014, 22:09
Пост #97


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



ок, сделаем эксперимент:

выдеру из осн. компа 8Гб (4гб*2) и докину сюда и посмотрим, что получится ))

будет: 12 + 14 = 26Гб


__________
гы:

8 заданий запустилось и 1шт. - всё ещё ожидает очереди,
при этом занято (брутто) 14,6 Гб рам

стало быть - полностью загрузился только 1 сокет (1ЦП, 8 потоков), на котором 14гб рам

а 12гб - не хочэт?


интересно, где-то можно увидеть привязку процессов к ядрам - топологически...



______________

хотя нет, тут всё динамично:

на короткое время запустилось 11 заданий и 18+Гб рам (см. подъем на графике)

зы - скачанных заданий, не то, чтоб много, но они есть в запасе...


http://yadi.sk/d/aWYW7XUFHTDMx

http://yadi.sk/d/b6Pdjm9kHTDv5
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 6 2014, 22:54
Пост #98


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



гулять, так гулять! включу 2 оптерона для поднятия своих позорных очков

если конечно наскребутся задания, попробуем таки окончательно разобраться с расходованием ОЗУ в больших заданияхъ

ту би континьюд, как говорят французы

.........
пока ещё не накапало...

.........

за почти сутки загрузилось (только) 4 задания, чего мало...

на Интеле, помимо обнаруженной ранее резкой динамики, достоверно зафиксировал, что 1 задание раздулось до чуть более 3Гб ОЗУ...


........

никаких разгонов нет, а на Интеле 3 задания получиьи статус "ошибка вычислений" после 27 ч расчетов и ещё несколько при таком же пройденном времени пока показывают прогресс около 5% (т.е. давно перестал двигаться) у всех накачанных заданий в свойствах уровень = 600 000 Гфлопс

На Оптероне пока самое большое задание кушает 1,6 Гб ОЗУ и не раздувается, но прогресс также висит в <5% (также 600 000Гф)


----------
писать с ноута - просто мрак, я избегаю пользоваться мышью, и не могу - не изогнутой (эрго) клавой Майкрософт. Как другие люди такие пластичные...

Це повідомлення відредагував Sergyg: Feb 7 2014, 23:58
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 8 2014, 11:17
Пост #99


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



вести с полей:


на Интеле (к простаивающим ядрам подключил /как маложрущую память ))) / Розетту) есть такая стрёмная вещь, как 40+ ч расчёта и прогресс ~5%. Может, это какие-то неправильные задания и им предрешено получить ошибку расчётов...
Скрин:
http://yadi.sk/d/JThZXZE2HWvsL

на Оптеронах - накапало заданий, также оч длительных, но пока не спешат раздуваться: только 2 шт. достигли 1,6 Гб. На все ядра задания в работе.
Скрин:
http://yadi.sk/d/cGN86yiiHWvxM

Вообще, всё это странно. Т.к. именно на Интел НЕ жалуются с выделением памяти на ЦП-потоки. Как раз на Оптероны (конкретно: 12-ядерные МагниКоре, склейка двух 6-core, socket G34, 4-CPU mobo) один чел сильно жаловался при рендеринге очень обльших проектов (по использ. ОЗУ) - что данные кочуют по ЦП-ядрам, находясь в общем пуле и как бы, не желая привязаться к ID-ядра, что, по его наблюдению, чудовищно замедляет просчёты. Действительно, его резалт (в одном тесте, но в реальной рабочей программе) на 48 ядрах (2.3ГГц) был на 20% лучше, чем у меня на 12 ядрах Opteron8439 (2.8ГГц) \т.е. мои ЦП - это предыдущее поколение перед его, фактически то же, но, может, и правда на G34 AMD внесли неприятные улучшения против прошлого socketF_nForcePro3600\

это, в качестве примера, а в данном случае вопрос вызввает именно Интел (для отностительно свежего 1366)


----------------

что-то задания стрёмные.

Я понимаю, что расчет прогресса во многих случаях - сложная, а иногда вообще не выполнимая задача, но что-то тут не так. Более 60 ч счёта - прогресс не меняется. Молодые задания - и вовсе прогресс 0,0%, а после паузы и вовсе обнуляется датчик процессорного времени. Задействование ОЗУ не растёт, сидит на уровне 0,3 Гб/задание
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 9 2014, 16:02
Пост #100


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



что ж,

опасения подтвердились: ошибка вычислений и на Оптеронах, на 32 часу расчётов, без разгона и с буферизованной памятью...

так что проблема программистов на лицо((

http://yadi.sk/d/rX0HvmFBHaKie

очков за потраченное время не начисляют(


---------------------

на Xeon'ах 2 задания-долгожителя уже считаются 75 часов, прогресс, всё также никак не подберётся к 5%... наверное, тоже будут трупы

Це повідомлення відредагував Sergyg: Feb 9 2014, 19:41
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
T@r@s_Bulb@
May 26 2014, 15:04
Пост #101


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 275
З нами з: 12-May 13
З: ZP.UA
Користувач №: 3 242
Стать: Чол
Free-DC_CPID





--------------------
Моя статистика:
(Show/Hide)






*************



User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
T@r@s_Bulb@
Jun 6 2014, 11:13
Пост #102


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 275
З нами з: 12-May 13
З: ZP.UA
Користувач №: 3 242
Стать: Чол
Free-DC_CPID



QUOTE(T@r@s_Bulb@ @ May 26 2014, 16:04) *

(Show/Hide)




Нічого не допомагає: зупиняв БОІНК і перевантажував проект - результат все той же - доходить до 99,999% (навіть 100%) і ступор.
Хоча процесор рахує. Може так висіти цілий день. Якщо перевантажую БОІНК, починає розраховувати с початку... huh.gif


--------------------
Моя статистика:
(Show/Hide)






*************



User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Dromage
Jun 6 2014, 20:26
Пост #103


Мега ранчер
********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 102
З нами з: 6-March 12
З: Кривий Ріг
Користувач №: 2 942
Стать: Чол
Парк машин:
домашня конячка: i5-4690K, домашній ішачок: pentium B970



Я чекав i через деякий час задання успiшно фiнiшували та вiдсилалися на сервер...


--------------------


(Show/Hide)


Паралельний світ: https://s.bbgam.com/?152127
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Jun 7 2014, 13:21
Пост #104


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



а я весной так и не смог понять проблемы ...

на Хеоне 1366 (без разгонов), память ЕСС, да и на Оптеронах с рег озу -- задания считались 300+ (ч) ---- и так НИ ОДНО и не увенчалось успехом.

Также странно шёл прогресс, а в конце завершались ошибкой. озу было много. Процесс скриншотил для форума, но имхо как-то это уже не интересно. Думаю, это траблы авторов проекта. Ведь и раньше народ жаловался...
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
T@r@s_Bulb@
Jun 7 2014, 19:46
Пост #105


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 275
З нами з: 12-May 13
З: ZP.UA
Користувач №: 3 242
Стать: Чол
Free-DC_CPID



QUOTE(Sergyg @ Jun 7 2014, 14:21) *

Думаю, это траблы авторов проекта


Відключився поки від проекту. Може через пару місяців знову спробую порахувати...


--------------------
Моя статистика:
(Show/Hide)






*************



User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

8 Сторінки V « < 5 6 7 8 >
Reply to this topicStart new topic
2 Користувачів переглядають дану тему (2 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 18:18

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.