--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Donate spare CPU time
If you would like to join the BOINC community who are donating screensaver CPU time, then please go here:
{link to be added when BOINC goes live}
If you would like to get involved with the development of the BOINC server, then please contact Anthony Chubb (below).
Энд, ВТФ?
когда настроят боинк дадуд ссылку на него.
http://boinc.ucd.ie/fmah/
Ukraine http://boinc.ucd.ie/fmah/team_display.php?teamid=21
About FightMalaria@Home
FightMalaria@Home is a research project that uses donated CPU time to perform docking simulations on malaria proteins. You can participate by downloading and running a free program on your computer.
PLEASE NOTE: FightMalaria@Home is still in testing. Although you may join the project, there may not be a constant supply of tasks until the launch day (23rd July). The server may also be unavailable up until this time.
By participating in this project you are agreeing to our terms of use.
FMAH is based in http://www.ucd.ie/casl/
Project Homepage - http://www.fight-malaria.org/
+1
пока даунлоад не включили
FM@H up and running
We have just fired off the first 144,000 docking runs.
If you'd like to see the details behind the 1,000,000,000 docking runs planned, please go to the 'Idea' page on our website:
http://www.fight-malaria.org/index.php?option=com_content&view=article&id=99&Itemid=108
After the first 94 million docking runs, we'll have achieved our first major milestone.
We may have a small delay next week between experiments, then it's all systems go.
Thanks again for your your help with this.
ciao,
Ant
Имя Всего очков В среднем за день Страна
1) Death 1,076 98.24 Ukraine
Интересный проект вырисовывается. Сделаем проектом месяца для суперкомпьютера?
я абортнул 1500 вушек.
Computing status
Work #
Tasks ready to send 1,096
Tasks in progress 35,264
врядли что-то будет свободно завтра
если бы в нем были таски то можно было бы.
а так он больше смахивает пока что на тестовый проект
Переподключите проект!!
Update
Hi everyone,
We have a few updates:
1. We have regenerated our signing keys but due to a technical problem they will not be distributed automatically. Please detach and reattach to the project in order to receive new workunits. We apologise for the inconvenience and will ensure that it does not happen again.
2. We are having issues with a small percentage (less than 1%) of Windows computers and a very small percentage of Linux computers. We are working to release new app versions in order to address these problems.
3. We have limited the number of tasks in progress per computer to 20 per CPU core. Although this has not been an issue for some, we have had a large number of aborted tasks as a result of sending too much work to each node.
Thanks for your your help.
Kevin
23 Jul 2012
Computing status
Work #
Tasks ready to send 15,538
Tasks in progress 27,481
Launching on 30th July
We are still doing a few final tests of the BOINC server. Then on 30th July we plan to officially launch the project. Thanks to those who have already signed up! We're able to do over 30,000 docking calculations per day, so testing is going well.
Test experiment A is finished!
"We have the first set of 144000 data points to sift through from our 'control' experiment. The system seems to be working well. The next batch of 1.2 million docking calculations is in the queue and ready to go. "
Sat Jul 28 16:54:41 2012 | fightmalaria@home | Computation for task vina_20373_1343480243.286858-1118-PF14_0077_1.pdbqt-265-MMV665827_0.pdbqt-4-_0 finished
Sat Jul 28 16:54:41 2012 | fightmalaria@home | Starting task vina_20373_1343480244.719091-1127-PFB0660w_1.pdbqt-265-MMV665827_0.pdbqt-4-_0 using vina version 200 in slot 1
Sat Jul 28 16:54:42 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:43 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:43 2012 | fightmalaria@home | Started upload of vina_20373_1343480243.286858-1118-PF14_0077_1.pdbqt-265-MMV665827_0.pdbqt-4-_0_0
Sat Jul 28 16:54:44 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:45 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:46 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:46 2012 | fightmalaria@home | Finished upload of vina_20373_1343480243.286858-1118-PF14_0077_1.pdbqt-265-MMV665827_0.pdbqt-4-_0_0
Sat Jul 28 16:54:47 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:48 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:49 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
Sat Jul 28 16:54:50 2012 | fightmalaria@home | app reporting negative CPU: -1.998364
в десьять раз больше ву.
и даунлоад лежит
Валидатор выключен
Server down
The BOINC server will be down for maintenance for a while. We're installing new apps for all OSs, and new shorter work units.
------------
Отакої.
Кстати, малярия у всех нормально работает или с глюками? У меня к примеру выдает ошибки на 7-8 секунде расчета.
Надеюсь после этого апдейта заработает как надо.
Hi everyone,
We're still having problems with the server. However, the good news is research IT have agreed to provide us with two far better servers. We hope to move the project to these over the weekend but it will likely be Wednesday before we are back up and running. We will not be sending new workunits until then.
Thanks for you patience,
Kevin
Bel, откуда информация что этот проект будет успешнее WCG GFAM ?
2) прдлагаю тебе оформить шапку проекта в fm@h
В мене на калькуляторах XP SP2 (x32) були глюки Error while computing.
Встановив FrameWork 3.5 - запрацювало.
Сервер уже работает, обновление прошло успешно. Админы подготовили 1.5 млн заданий к отправке. Время на выполнение около минуты, глюки исправили. В течении следующей недели еще немного оптимизируют проект. Можно кранчить!
Еще одна новость: показатель процента завершения проекта прикручен не будет, как к примеру в SIMAP. Но админы будут сообщать о завершении этапов, которых насчитывается 30. К всему этому, будут опубликованы новости о результатах этапов - какие задачи считаются, хиты и т.д.
ЗЫ: LSA, на чем малярию кранчиш, а то смотрю газу не плохо поддал?
QA90 інженерник. 8 ядер + HT
Сегодня команда поднялась на 20 место! Впереди еще 8 команд, которые можем спокойно сейчас обходить. Лучший ппд по 50тыс. у Team Musketeers и SETI.Germany. У нас пока 7-8к. в день и кранчат только 3 человека. Собственно предложение: так как проект только запустили и у конкурентов не так много человек в команде, может залупиться и вытянуть команду на 1 место?! Хоть в одном проекте будем первые! К примеру как TSC! Russia в Rosetta@Home.
Понимаю, что формат суперкомпьютера может кому поднадоел, но если сделать рывок - можно спокойно догнать 2 лидеров проекта. Тем более на поддержание ппд на уровне топов на данный момент, нужно человек 10-15.
15 Hardware Canucks 2 5,769 243,714 Canada Computer type
16 Team Starfire World BOINC 3 4,842 243,258 International None
17 Ukraine 12 9,220 243,164 Ukraine National
гарно пливем
Уже на 15 месте!
We have collected the experiments into groups, each aimed at a separate paper to be submitted to an open-access journal in the near future.
A - Docking of MalariaBox compounds against the P. fal. proteome (MMV_400) - Exp=A,Ap,1p,2p,4p,6p
B - Using vHTS to find the malarial targets of repurposed drugs (NPC) - Exp=8p-11p
C - FightMalaria@Home – using vHTS to find targets for hit compounds (MMV_full) - Exp=B,Bp,3p,5p,7p,12p-15p
D - FightMalaria@Home update – the effect of flexible active sites on vHTS (all) - Exp=16p-44p
E - Using BOINC to identify novel antimalarial compounds (ZINC, CycloPs) - Exp=45p-47p
We have over 4 million results thus far, and % completion is as follows:
A - 78%
B - 20%
C - 1%
D - 0%
E - 0%
Progress has slowed as we're now docking larger molecules with more rotatable bonds.
інтересно!
если бы я не боролся с малярией на ВЦГ, то я бы подключился сюда
http://www.ucd.ie/casl/newsmedia/caslmedia/title,135839,en.html
Команда на 13 месте!
Polish National Team - единоличные лидеры проекта. Сливают просто фантастически, как для такого проекта, порядка ~ 1-2 млн. очей в день.
Сервер уже почистили, задания стали поступать. LSA, Woldemar Olesk, go закранчивать проект обратно и тянуть команду на высшие позиции!
Ну я спецом один фен пока выделю...
Hi everyone,
We are currently working on a new credit system which will ensure that everyone is awarded a fair amount of credit. The current system is failing as some users are receiving far more credits than others for the same amount of work.
To fix this we will predefine the amount of credit for each workunit. The amount will be based on a multiple regression of previous results from my own trusted hosts. It will likely be ready early next week.
Thanks to everyone who has pointed out these problems.
Kevin
------------
Работают сейчас над новой системой начисления очей...
Вчера прекратили выдачу заданий. Временно! Обещают скоро запустить сервер.
Сервер работает. Есть задания.
-----------------------------------------------------
"Мы вернулись в онлайн. Теперь, мы используем дополнительный сервер для базы данных результатов, который должен повысить производительность основного сервера."
Progress report - over 20 million results so far:
A - 61% - 1,328,976 results
B - 60% - 9,002,545 results
C - 7% - 10,111,084 results
D - 0%
E - 0%
20,442,605 results in total!
This is lower than previous % completions as we've added 950 models (18% of the proteome) to the list of receptors we're searching against. We now cover 44% of the proteome in 3D, which is quite substantial.
В течении ближайших 5 дней, админы попытаются прикрутить счётчик процента завершения проекта.
Ну как - прикрутили? Мне заданий хватит на первое место выйти?
tiss, пока еще не прикрутили. Ждемс...
В среднем на серваке находится готовых к отправке ~ 55 000 вью. В обработке находится в среднем ~ 170 000 - 180 000. Выгребай что есть
-----
Из новостей: сейчас считается эксперимент №5 из этого списка http://www.fight-malaria.org/index.php?option=com_content&view=article&id=99&Itemid=108. Таблица будет обновлятся в ходе дальнейших исследований. Появилась некоторая избыточность в рассчетах, поэтому о финише говорить пока рано. Также Кевин(один из организаторов проекта) сообщает, что уже скоро можно будет ожидать первый промежуточный доклад о результатах проделанной работы.
у мну выхлоп где-то тыщ 20 в день. больше вряд ли выжму
Чёт у них пломалось
10.01.2013 10:31:26 | fightmalaria@home | update requested by user
10.01.2013 10:31:30 | fightmalaria@home | Fetching scheduler list
10.01.2013 10:31:45 | fightmalaria@home | Master file download succeeded
10.01.2013 10:31:50 | fightmalaria@home | Sending scheduler request: Requested by user.
10.01.2013 10:31:50 | fightmalaria@home | Reporting 600 completed tasks, requesting new tasks for CPU
Куча заданий вывалилась с ошибкой. До этого была одна ошибка на 10 тыщ заданий
Новая команда в проекте - CHARITY TEAM CONTEST.
http://boinc.ucd.ie/fmah/forum_thread.php?id=69
http://boincstats.com/ru/stats/136/user/list/0/0/229/0
Аж приятно смотреть на эту вакханалию =) Заданий выгребли кучу, готовых к отправке штут 50 крутится в среднем каждую секунду. Боюсь на ночь остнусь на сухпайке.
Таааак... Перед выходными у ЛХЦ задания кончились. Ну теперь вся моща сюда переключится!
За неделю кпд поднялся с 300,000 до 530,000 обрабатываемых заданий в день!
CHARITY TEAM CONTEST 2013 by Project FightMalaria@Home is finished now.
Жаль, что всего на две недели... зато есть куча вью. Налетай!
Hi Guys,
We've decided to change the planned experiments. We now have the results required for paper 1 and are close to finishing the results for paper 2. Unfortunately we are lagging behind fmah with the actual analysis of results as there is a phenomenal amount of data.
We are currently docking some high quality protein models against the MMV dataset. After that we will be docking molecules from chembl assays. We haven't fully decided what we will be docking after that. We have a few choices but we need to prioritize the most important ones. I'll keep you posted.
Thanks for your help!
Kevin
Invision Power Board
© Invision Power Services