Версія даної теми для друку

Автор: -=Vzhik=- Jan 18 2005, 08:14

Здесь будет выкладываться информация относительно заданий, которые находятся на данный момент в работе.

Find-a-Drug searched for drugs to fight major diseases. The project studied cancer, bioterrorism diseases, respiratory diseases, multiple sclerosis, HIV (AIDS), Malaria, and CJD, as well as studying the human proteome in general, and the methodology for testing potential drug compunds against disease protein targets. The non-project was run by http://www.treweren.com/, creators of the THINK screensaver.
On June 30, 2003, the project http://www.find-a-drug.org/press5a.htmlthat it successfully found some potential cancer-inhibiting drugs. After testing over 500 million molecules, it produced a set of candidates. 39 candidates were tested in a laboratory, and 7 of those (20%) showed the desired anti-cancer properties. Only 2-3% were expected to show the desired properties. On November 12, 2003, the project http://www.find-a-drug.org/press6.htmlthat it had found growth inhibitors for 5 anti-cancer protein targets. "42 of the 200 molecules tested [so far] showed the desired anti-cancer properties." On March 22, 2004, the project announced that it had "found more molecules which inhibit the growth of cancer cells," and had now discovered "growth inhibitors for 7 anti-cancer protein targets." On April 16, 2004, the project http://www.find-a-drug.org/press8.htmlthat it had found 18 molecules which inhibit the growth of HIV protease, an AIDS protein. More of its cancer-fighting drugs were confirmed to be effective in laboratory tests as of July 2, 2004. On March 14, 2005, the project published a http://www.find-a-drug.org.uk/certify.htmlof 1,279 molecules, tested in a lab, which showed desired anti-cancer properties. These molecules were discovered by 626 project volunteers.

The project ended on December 16, 2005. Questions about the project's closing are answered in the project http://www.find-a-drug.org.uk/faq.html. The project's discussion http://www.find-a-drug.org.uk/phpbb/may also remain active for a while.

Автор: -=Vzhik=- Jan 18 2005, 08:16

Для закачки доступна новая цель

1r6n-q1 (HPV-11) - Cancer

Автор: GreyWolf Jan 19 2005, 09:35

Для любителей "быстрых жаб"
2src-q1 - Cancer
4 часа на 1.7 Ghz Celeron

Автор: -=Vzhik=- Jan 20 2005, 06:55

Добавлены 2 новые цели:

1J3I-Q2 - малярия. Скоко будут считаться - добавлю позже, по описанию слегка непонятно.

1NMT-Q2 - протеома. Считаться будут долго с малым количеством хитов.

Автор: forever Jan 20 2005, 12:38

отличные хитовые джобы - 1wms-q1 .. я уж соскучился по хитам..

Автор: -=Vzhik=- Jan 21 2005, 08:24

Очередь 1i8t-q1 - завершена.

Автор: -=Vzhik=- Jan 28 2005, 08:03

Добавлены для обсчета 2 очереди
2std-q2 - протеома
1jqd-q2 - респираторные заболевания

Автор: Red Panda THINKs Mar 8 2005, 01:47

Вчера Кейт добавил первую очередь (1QM3-Q3) для цели CJD (болезни Кройцфельдта-Якоба), которая возникает у человека, принимавшего в пищу говядину, зараженную bovine spongiform encephalopathy (BSE), также известной как "коровье бешенство".
http://www.cdc.gov/ncidod/diseases/cjd/bse_cjd.htm

Автор: Oasis Mar 20 2005, 23:15

Как говорил великий Ленин: Только свинина товарищи, только свинина


Нифига себе жабы пошли: 1uu3-q1 Cancer * m124 Время: 24:42 Рейтинг проца: 110.0 20 Mar 2005 06:14 pm

Автор: -=Vzhik=- Mar 21 2005, 12:30

После той мелочи, что была, уже давно хочется посчитать нечто большое.

Автор: Tamagoch Mar 21 2005, 13:50

Автор: Oasis Mar 22 2005, 23:11

Автор: Oasis Mar 26 2005, 08:15

Cancer 1S78-Q1 - очень быстро считаються.
На проце с рейтингом 150 - до 10 работ за 6 часов )))

Автор: NiM@X Mar 27 2005, 14:24

Привет всем немного поотсутствовал. зато приобщил еще одного: Mihaska.
Вот что хотю сказать sorry что немного не в тему: http://www.ixbt.com/news/hard/index.shtml?news115207id я вот о чем посчитав суммарный объем вычисленных хлопов и поделив на мощность такой машинки я получил что она просчитала бы ВСЕ что уже просчитано за 77 часов. У меня 2 вопроса где подсмотреть дату старта проэкта. И второй: мы тут не в "бирюльки"играем?

Автор: drorion Mar 28 2005, 08:52

Автор: Oasis Mar 28 2005, 22:18

drorion
Легко...
Кому здавать деньги )))))

Автор: Arbalet Aug 16 2005, 11:23

Привет!

В этой теме обязуюсь выкладывать краткие переводы с английского целей и задач новых проектов в Find-a-Drug. Раньше делал это только для себя, потом и для своих коллег на работе, которых пришлось увлечь нашей благородной целью поиска новых лекарств, чтобы поставить клиентов на их машины

Перевод, замечено на собственном опыте, помогает поддерживать интерес, а также более рационально распределять задания между машинами. Перевод не профессиональный , заранее прошу прощения, но помогает понять основную идею того или иного проекта.

Похожую тему уже начинал -=Vzhik=-, я же шагну немножко дальше и постараюсь быть более регулярным и последовательным

Итак, на днях руководство Find-a-Drug озадачило разношерстную армию своих кранчеров множеством новых проектов:

1AM6-Q1 Поиск лекарств снижающих кровяное давление внутри глаза, вызывающее глаукому, которая в последнее время часто поражает молодежь, проводящую много времени за компьютерами Ужас!

1GS4-Q1 Против рака простаты Надеюсь не придется воспользоваться

1C70-Q1 Против ВИЧ

1YCJ-Q1 Разработка обезболивающих препаратов с меньшим, чем у современных обезболивающих, количеством побочных эффектов. Проект направлен на исследование взаимодействия с глутаматом (первичным медиатором в нервной системе человека и млекопитающих) ингибитора GluR5 kainate

1Q8T-Q1 Против раковых опухолей

1Y6A-Q1 Проект направлен на исследование VEGF, стимулирующего рост кровеносных сосудов. Рост раковых клеток требует интенсивного кровотока. Ограничение кровообращения между раковыми клетками и организмом может уменьшить рост опухоли

1FX9-Q1 Против артрита

1NBU-Q1 Исследования фермента, играющего ключевую роль в синтезе фолата, который необходим бактериям, в т.ч. болезнетворным, но которые не могут поглощать его из окружающей среды, в отличие от людей и др. млекопитающих

4ERK-Q1 Против рака и других болезней

1SB8-Q1 Исследование ферментов, играющих большую роль в биосинтезе компонентов клеточных оболочек. Цель проекта – разработка антибактериальных лекарств

1PBQ-Q1 Против болезни Альцгеймера

1E7A-Q1 Проект направлен на исследование альбумина сыворотки - важного транспортного белка в крови, играющего ключевую роль в транспорте жирных кислот, метаболитов, и некоторых лекарств. Однако, альбумин сыворотки может давать нежелательные побочные эффекты при взаимодействии с некоторыми молекулами, а также долго выводится из организма

1F45-Q3 Разработка новых антибактериальных препаратов Когда ж его досчитают то?!

Автор: Arbalet Aug 16 2005, 11:26

Почему столько копий темы?!! Удалите лишние, плиз!

Автор: forever Aug 16 2005, 12:20

Привет!

В этой теме обязуюсь выкладывать краткие переводы с английского целей и задач новых проектов в Find-a-Drug. Раньше делал это только для себя, потом и для своих коллег на работе, которых пришлось увлечь нашей благородной целью поиска новых лекарств, чтобы поставить клиентов на их машины

Перевод, замечено на собственном опыте, помогает поддерживать интерес, а также более рационально распределять задания между машинами. Перевод не профессиональный , заранее прошу прощения, но помогает понять основную идею того или иного проекта.

Похожую тему уже начинал -=Vzhik=-, я же шагну немножко дальше и постараюсь быть более регулярным и последовательным

Итак, на днях руководство Find-a-Drug озадачило разношерстную армию своих кранчеров множеством новых проектов:

1AM6-Q1 Поиск лекарств снижающих кровяное давление внутри глаза, вызывающее глаукому, которая в последнее время часто поражает молодежь, проводящую много времени за компьютерами Ужас!

1GS4-Q1 Против рака простаты Надеюсь не придется воспользоваться

1C70-Q1 Против ВИЧ

1YCJ-Q1 Разработка обезболивающих препаратов с меньшим, чем у современных обезболивающих, количеством побочных эффектов. Проект направлен на исследование взаимодействия с глутаматом (первичным медиатором в нервной системе человека и млекопитающих) ингибитора GluR5 kainate

1Q8T-Q1 Против раковых опухолей

1Y6A-Q1 Проект направлен на исследование VEGF, стимулирующего рост кровеносных сосудов. Рост раковых клеток требует интенсивного кровотока. Ограничение кровообращения между раковыми клетками и организмом может уменьшить рост опухоли

1FX9-Q1 Против артрита

1NBU-Q1 Исследования фермента, играющего ключевую роль в синтезе фолата, который необходим бактериям, в т.ч. болезнетворным, но которые не могут поглощать его из окружающей среды, в отличие от людей и др. млекопитающих

4ERK-Q1 Против рака и других болезней

1SB8-Q1 Исследование ферментов, играющих большую роль в биосинтезе компонентов клеточных оболочек. Цель проекта – разработка антибактериальных лекарств

1PBQ-Q1 Против болезни Альцгеймера

1E7A-Q1 Проект направлен на исследование альбумина сыворотки - важного транспортного белка в крови, играющего ключевую роль в транспорте жирных кислот, метаболитов, и некоторых лекарств. Однако, альбумин сыворотки может давать нежелательные побочные эффекты при взаимодействии с некоторыми молекулами, а также долго выводится из организма

1F45-Q3 Разработка новых антибактериальных препаратов Когда ж его досчитают то?!

Автор: Arbalet Aug 17 2005, 12:39

Автор: GreyWolf Aug 18 2005, 12:19

Автор: Alexey Aug 18 2005, 12:47

Автор: Arbalet Aug 18 2005, 14:46

Лучше всего рассылку пустить, через Subscribe.ru, т.к. у них более 2 млн. подписчиков и каждая новая рассылка попадает в новостийный выпуск, который рассылается всем! Кроме того, в Subscribe.ru еще много других способов раскрутить рассылку.

Таким образом, если есть у кого в нашей команде соответствующий опыт создания и ведения рассылки в Subscribe.ru, который вязлся бы за организацию всего, то это было бы замечательно А в авторах материалов для нашей рассылки недостатка не будет

Важно, чтобы рассылка не превратилась в инструкцию для технарей и админов, а была написана живым языком, была понятна широкой аудитории и тогда у нашей команды не будет отбоя от новобранцев

Автор: Paul B.Atton Aug 18 2005, 14:51

Хлопці! Перебирайтеся з цими розмовами в http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=227.

Автор: Arbalet Aug 18 2005, 15:17

Автор: Arbalet Aug 31 2005, 10:13

1PME-Q1
Cancer
Проект исследования активированного протеина митогена (АПМ) киназы. АПМ, участвующий в разнообразных клеточных реакциях, выявляет протеины, потенциально полезные в терапии воспалительных процессов, рака и др. болезней. Данный проект основан на кристаллической структуре ранее рассчитанных 3erk-q1 и 4erk-q1.

Автор: Arbalet Sep 2 2005, 09:17

1UTT-Q1
Proteome
Металлопротеиназа 12 (MMP-12), известная также как макрофагальная эластаза, предлагается в качестве возможного препарата для лечения болезни Альцгеймера. Кроме того, MMP-12 эффективна против воспалительных процессов, включая эмфизему, восстанавливая легочную ткань, а также против рассеянного склероза, депонируя амилоидные протеины.

Судя по статистике на http://fadstats.com/ "жабки" проекта обещают быть обильными на "хиты" (в среднем 150) и считаться недолго!

Автор: Arbalet Sep 5 2005, 15:36

1DY8-Q1
Proteome
Проект поиска лекарства от вируса гепатита С на основе исследования сывороточной протеазы NS3. Хотя некоторые высокомолекулярные пептиды показали хорошие результаты в лаборатории, тем не менее они не могут служить подходящими препаратами. Проект основан на измененной кристаллической структуре ранее просчитанного 1DY9-Q2.

Хитов совсем мало, но считаются очень быстро.

Автор: Arbalet Sep 7 2005, 16:03

1Y6B-Q1
Cancer
Исследование сосудистого эндотелиального рецептора фактора роста 2 (VEGFR2), стимулирующего рост кровеносных сосудов. Нерегулируемый рост раковых клеток требует большой интенсивности кровотока. В теории, если ограничить рост кровеносных сосудов, то возможно добиться и замедления роста раковой опухоли. Проект основан на новой кристаллической структуре недавно рассчитанного 1y6a-q1.

Малое количество хитов за небольшое время расчета.

Автор: Arbalet Sep 7 2005, 16:10

1FDK-Q1
Proteome
Фосфолипаза A2 (PLA2) расщепляет эфирные соединения в глицерофосфолипиды, выпускающие в свободном состоянии жирные кислоты и лизофосфолипиды. Поэтому чрезмерные уровни непанкреатического PLA2 в организме человека связаны со множеством болезней, включая артрит и атеросклероз. Ингибирование PLA2 может иметь терапевтический потенциал в лечении артрита. Проект основан на измененной кристаллической структуре рассчитанного ранее 1fx9-q1.

Хиты скорее исключение, нежели правило - в среднем один хит на 15 жаб
Поэтому, был приятно удивлен таким своим результатом:
12:06 10-Sep-05 1fdk-q1 m272 Arbalet 7023372 13592 7 9696 0:09 51 ok

Автор: Arbalet Sep 11 2005, 10:57

1GI8-Q1
Cancer
Активатор плазмогена урокиназы (uPA) - компонент сывороточного протеазного семейства белков. Предполагается, что эти ферменты играют важную роль в переносе раковых клеток внутри организма. Поэтому, если блокировать данные ферменты, воздействуя на uPA, то можно добиться замедления вторичного рака, часто являющегося фатальным. Данный проект основывается на измененной кристаллической структуре 1sqo-q1 и 1vj9-q2.

Жабки проекта скромны на хиты, но считаются быстро.

Автор: Arbalet Sep 13 2005, 13:46

Переводы новых проектов ФАД будут теперь также включаться в выпуски почтовой рассылки "Крестовый поход против смертельных болезней"

Всю информацию о рассылке можно узнать http://subscribe.ru/catalog/science.health.fadmedic

Автор: Arbalet Sep 13 2005, 23:11

1PQ1-Q2
Cancer
BCL-XL играет роль в стимулировании гибели клетки, которая еще не полностью понятна. BCL-XL - признанная цель для антираковых препаратов.

Тритончики считаются шустро, а потому небольшое количество хитов можно простить.

Автор: Arbalet Sep 13 2005, 23:16

1QKM-Q1
Proteome
Рецептор эстрогена-b принадлежит семейству ядерных рецепторов, которые вызывают белковый синтез (через транскрипцию ДНК). Предполагается, что стимулирование рецептора эстрогена-b в мозге могло бы быть терапевтически полезно в лечении болезни Альцгеймера. Тогда как ингибирование лиганда эстрогена-a имеет потенциал в терапии рака (см. проект 1sj0-q1).

На хорошей машине вполне реально просчитать 3-4 жабы за день, но хитов не дюже багато.

Автор: Arbalet Sep 13 2005, 23:21

На офсайте вывесили описание проекта-призрака, жабы которого еще не готовы к рассылке. Перевел на всякий случай

821P-Q2
Cancer
Протеины RAS - своего рода химические "сигналы", которые активизируют рост клетки. Без этого фактора передачи сигналов, клетка не может развиваться. Замедление RAS в раковых клетках означает конец их нерегулируемому росту. Это исследование - пересмотр проекта 821P-Q1, выполненное для 51352 jobs (приблизительно 0.5 миллиарда молекул).

Автор: Arbalet Sep 20 2005, 17:44

1M2Z-Q1
Proteome
Рецептор глюкокортикоида предлагается в качестве цели против диабета второго типа. При этом, любой ингибитор должен быть проверен на рецепторах печени, чтобы уменьшение выработки глюкозы не сопровождалось побочными эффектами.

Жабки 1m2z отличаются проворством расчета, но далеко не самыми высокими показателями в плане хитов.

Автор: Arbalet Sep 20 2005, 17:47

1UOM-Q1
Сancer
Рецептор эстрогена принадлежит семейству ядерных рецепторов, вызывающих белковый синтез (посредством транскрипции ДНК). Ингибирование лиганда эстрогена, как предполагают, имеет потенциал в терапии рака. Эта белковая цель основана на измененной кристаллической структуре 1sj0-q1.

Задания данной цели считаются не очень долго и дают среднее число хитов.

Автор: Arbalet Sep 24 2005, 13:23

1PQ1-Q3
Proteome
BCL-XL играет не до конца изученную роль в стимулировании гибели клеток. Поэтому BCL-XL - перспективная цель для разработки антираковых препаратов. Этот вопрос предназначается для другого участка белка из цели 1pq1-q2.

Считаются жабки очень быстро, но вот с хитами напряг. Нет, это, конечно, не то, что творилось с 1fdk-q1, но хитов, все-таки, мало. Впрочем, жабки из третьей очереди, а это что-то да значит

Автор: Arbalet Sep 24 2005, 13:27

1TL9-Q1
Proteome
Определенные нейродегенеративные состояния связаны с повреждением аксонов (окончаний) нерва. Известно, что ингибиторы Calpain предлагают некоторую защиту от таких повреждений. Такие ингибиторы могут иметь потенциал как препараты против аутоиммунных и других нейродегенеративных болезней. Этот вопрос основан на другой кристаллической структуре рассчитанного ранее 1nx3-q1.

Задания 1tl9-q1 считаются дольше обыкновенного, принося среднее количество хитов.

Автор: Jarilo Sep 25 2005, 09:29

Я понимаю что вопрос не втему но что такое третья очередь, что такое вообще такое очередь, и что такое протеома и с чем связаны болезни

Автор: nikelong Sep 25 2005, 23:36

насчёт очереди: это как сито: сначала первая очередь, много молекул, мало хитов. Вторая-уже отброшено ненужное с 1-й, поетому считаем более полезное, ну а третья-это самый цимус.

Автор: Arbalet Sep 26 2005, 12:05

Мне нечего добавить к тому, что говорит nikelong
Разве что проекты Proteome содержат белковые цели против тех болезней, что не попали в категории Рак, ВИЧ, ОРЗ, Малярия

Автор: nikelong Sep 26 2005, 12:48

и последний штрих
методология - просчёт вариантов, как лучше считать болячки, так скать, улучшение улучшеного.

Автор: GreyWolf Sep 26 2005, 15:22

насчёт очереди: это как сито: сначала первая очередь, много молекул, мало хитов. Вторая-уже отброшено ненужное с 1-й, поетому считаем более полезное, ну а третья-это самый цимус.

Автор: GreyWolf Sep 26 2005, 15:34

и последний штрих
методология - просчёт вариантов, как лучше считать болячки, так скать, улучшение улучшеного.

Автор: Jarilo Sep 26 2005, 19:00

Что за цель 1w2g lung(TB) вроде написанно респраторные, а чо за болезнь такая грипп может, и еще вопрос как за работать звездочку? и за что их дают и какая зач то я имею ввиду по цвету

Автор: nikelong Sep 26 2005, 19:46

наберёш сто тыщ, получиш коричневую

http://www.find-a-drug.org.uk/forums/viewtopic.php?t=5091

а сто тыщ мильйонов-это десять больших красно-жёлтых звёзд

ПС:пиши в тему...

Автор: Arbalet Sep 26 2005, 22:03

1W2G-Q1
Respiratory Diseases
Киназа тимидилата (ТМРК) преобразовывает монофосфат тимидина (ТМР) в ди- и трифосфаты. Замедление этого процесса могло бы прервать (замедлить) цикл развития клетки. Существует разновидность TMPK в клетках млекопитающих, которая могла бы стать основой для разработки препарата против возбудителей туберкулеза. Эта цель основывается на изменной кристаллической структуре ранее просчитанной 1g3u-q1.

1AJ6-Q1
Proteome
Гираза B - признаваемая противобактериальная цель. Однако, существующие ингибиторы не имели терапевтического потенциала из-за серьезных побочных эффектов и устойчивости мутаций. Может быть возможно найти альтернативные ингибиторы, которые не имеют этих ограничений?

Жабки этих целей очень и очень шустрые - считаются быстро, правда, хитов не дюже.

Автор: Arbalet Sep 30 2005, 23:31

1EV2-Q2
Cancer
Рецептор фактора роста фибробласта 2 (FGFr-2), как предполагают, сигнализирует о росте клетки и поэтому является интересной целью терапии рака.

Время просчета заданий и количество хитов отличается капризным непостоянством.

1B8Y-Q1
Cancer
Стромельсин принадлежит к классу металлопротеиназ (MMPs), таким образом позиционируя себя как антираковое соединение, связанное с кровоснабжением опухолей. Стоит заметить, что пока не удается обнаружить клинически эффективных молекул в данном направлении исследований.

Жабки часто радуют обилием хитов, считаются с переменным успехом.

1H9Z-Q1
Methodology
Белок сыворотки - важный транспортный белок в крови, играющий ключевую роль в транспортировке жирных кислот, метаболитов, и некоторых препаратов. Однако, возможны нежелательные побочные эффекты от молекул, показывающих исключительные фармакокинетические свойства с неоправданно длинным сроком выведения из организма. Эта цель основывается на альтернативном участке измененной структуры кристалла белка, рассчитанной недавно цели 1e7a-q1.

Жабки считаются достаточно долго, но хитов приносят значительно больше, чем это было в случае 1e7a-q1.

1NHU-Q1
Рroteome
На офсайте до сих пор (!) не выложена информация о задаче, которую разработчики хотят решить просчетом жабок этой цели. Видимо многих данное обстоятельство не слишком заботит, т.к. цель просчитана уже на 2/3.

Автор: tyoma Oct 3 2005, 08:50

Автор: Arbalet Oct 3 2005, 21:18

Таки считаем какое то бактериологическое оружие втихаря! 

Автор: Arbalet Oct 3 2005, 21:22

1TXF-Q1
Рroteome
Глутамат - первичный нейромедиатор в нервной системе млекопитающих. Рецептор Kainate (GluR5) связан с передачей болевых импульсов. Ингибитор может быть использован для разработки болеутолящих препаратов с меньшим количеством побочных эффектов. Эта цель основана на измененной кристаллической структуре недавно просчитанной 1ycj-q1.

Жабки - торопыги, считаются быстро. Количество хитов - нормальное.

Автор: Arbalet Oct 5 2005, 14:43

1B6L-Q1
проект: HIV
ВИЧ-протеаза - перспективная цель для противодействия вирусу иммунодефицита. Однако, мутации этого фермента делают неэффективными многие из ингибиторов ВИЧ-протеазы.

Время просчета жабки и количество хитов - слегка выше нормы.

1DXP-Q1
проект: Рroteome
Цель для поиска лекарства от вируса гепатита С на основе исследования сывороточной протеазы NS3. Несмотря на то, что некоторые высокомолекулярные пептиды показывают хорошие результаты в лаборатории, тем не менее они не могут служить основой для лекарственных средств. Цель основывается на измененной кристаллической структуре ранее просчитанных 1DY9-Q2 и 1DY8-Q1.

Жабы вредные - достаточно долго считаются, чтобы вывести из терпения, но хитов валом.

Автор: nikelong Oct 9 2005, 17:24

откуда ты берёш сведенья о том, как долго считаются жабки, и сколько в них предположительно хитов?

Автор: Arbalet Oct 9 2005, 18:51

откуда ты берёш сведенья о том, как долго считаются жабки, и сколько в них предположительно хитов?

Автор: Arbalet Oct 9 2005, 19:40

1L2I-Q1
Cancer
Рецептор эстрогена-a принадлежит семейству ядерных рецепторов, которые вызывают белковый синтез (через транскрипцию ДНК). Посредством замедления лиганда эстрогена исследователи предполагают добиться прогресса в терапии рака. Этот вопрос основан на измененной кристаллической структуре недавно просчитанных 1sj0-q1 и 1uom-q1.

Жабы считаются долго, предупреждаю сразу, да и хитов от них не очень много.

1KIJ-Q1
Proteome
Гираза В - признанная противобактериальная цель. Однако, существующие ингибиторы не имеют терапевтического применения из-за серьезных побочных эффектов и устойчивости мутаций. Может быть возможно найти альтернативные ингибиторы, которые не имеют этих ограничений? Эта цель основывается на альтернативной кристаллической структуре 1aj6-q1.

Жабки 1kij-q1 считаются быстро, хитов – выше нормы.

1YZL-Q1
HIV
Rab9 GTPase - центральный регулятор транспорта липидов и белков между определенными клеточными компонентами. Данная цель предполагает поиск эффективных ингибиторов обратной транскриптазы вируса иммунодефицита, путем воздействия на данный фермент вируса через Rab9 GTPase. Эта цель основывается на измененной кристаллической структуре просчитанных ранее 1S8F-Q1 и 1WMS-Q1.

Расчет жабки длится недолго (менее 12 часов на обычном ПК) и приносит много хитов.

Автор: Arbalet Oct 12 2005, 09:04

1ATK-Q1
Proteome
Катепсин К играет ключевую роль в поглощении костной ткани. Замедление его действия, вероятно, поможет по крайней мере некоторым людям, страдающим остеопорозом.

Жабки считаются молниеносно! Кто не успел наловить - торопитесь, т.к. более половины уже посчитано. Хитов немного.

Автор: Arbalet Oct 13 2005, 20:16

1BIW-Q1
Cancer
Стромельсин принадлежит к классу металлопротеиназ (MMPs), таким образом позиционируя себя как антираковое соединение, связанное с кровоснабжением опухолей. Стоит заметить, что пока не удается обнаружить клинически эффективных молекул в данном направлении исследований. Эта цель основывается на измененной кристаллической структуре белка из недавно просчитанной 1b8y-q1.

Жабки считаются и дают хитов больше обыкновенного.

1FTM-Q1
Proteome
Ишемический удар среди болезней занимает третье место по уровню смертности. Глутаматный рецептор 2 (GluR2) играет важную роль в передаче нейросигналов в мозге, являясь составной частью рецептора AMPA. GluR2 предлагается как цель для терапии последствий ишемического удара, так как может восстанавливать передачу сигналов между поврежденными нейронами мозга.

Время расчета жабки 1ftm-q1 - величина непостоянная, но хитов, как правило, достаточно много.

Автор: Arbalet Oct 17 2005, 00:50

3ERK-Q1
Cancer
51352 jobs
Активизированный белок митогена (MAP) киназы, выполняющий сигнальную функцию, участвует в разнообразных клеточных процессах и является потенциальной целью для противодействия воспалению, раковым и др. заболеваниям. МАР киназы известна также как ERK2 (внеклеточный сигнал регулирования киназы 2), которая играет роль в клеточном дифференцировании или пролиферации.

Хитов - околосредние величины, жабы считаются долго, иногда по полсуток и дольше.


1PB7-Q1
Proteome
4097 jobs
N-метил-D-аспартат (NMDA) антагонисты признаны потенциально полезными в терапии болезни Альцгеймера. Возбуждение этого белка-рецептора, предположительно, связано с нейродегенеративными изменениями. Следовательно, блокирование NMDA может иметь определенный терапевтический эффект. Этот подход отличается от многих других, использующихся при разработке препаратов от болезни Альцгеймера. Данная цель основывается на измененной кристаллической структуре белка 1pbq-q1.

Хитов ОЧЕНЬ мало - готовьтесь к тому, что большинство жаб будут просчитаны без единого хита! Аналогичная ситуация была в случае с целью 1fdk-q1. При этом, учтите, что эти жабы-скряги еще и считаются долго.

Автор: Arbalet Oct 17 2005, 22:08

1RQL-Q1 | HIV | 4097 jobs
Ингибирование cинтазы диоксифузина сдерживает образование и активацию фузина (мембранного протеина) - кофактора, позволяющего ВИЧ-1 проникать в клетки. Это замедляет репликацию (воспроизводство) вируса иммунодефицита. Данное исследование - перспективная цель для разработки лекарственного средства с небольшим набором побочных эффектов, устойчивого к мутациям вируса и действию других препаратов. Этот вопрос базируется на измененной кристаллической структуре белка 1DHS-Q1.

Разработчики предполагают, что время просчета жабки будет выше средних величин, а кол-во хитов - небольшое.

ЗЫ: Эх, разработчики, разработчики! Жабы считаются быстро, а от хитов одни "баранки"

Автор: Arbalet Oct 24 2005, 15:43

821P-Q4 | Cancer - Methodology | 4097 jobs
Протеины RAS - своего рода химические "сигналы", которые активизируют рост клетки. Без этого фактора передачи сигналов, клетка не может развиваться. Ингибирование RAS в раковых клетках означает конец их нерегулируемому росту. Этот вопрос - часть ряда, который исследует использование менее строгих методов, которые дают больше хитов. Разработчики надеются понять, возможно ли вообще выявление лучших хитов.

Жабы этой интересной цели дают много хитов, но и считаются долго.

Автор: nikelong Oct 24 2005, 15:49

"спустя 6 минут"

всё, уже грузанул

Автор: Arbalet Oct 25 2005, 08:12

1AU4-Q1 | Proteome | 4097 jobs
Катепсин К играет ключевую роль в поглощении костной ткани. Замедление его действия, вероятно, должно помочь, по крайней мере, некоторым людям, страдающим остеопорозом. Эта цель основывается на измененной кристаллической структуре белка 1atk-q1.

Жабки считаются быстро, хитов – средние величины.

1PB8-Q1 | Proteome | 4097 jobs
N-метил-D-аспартат (NMDA) антагонисты признаны потенциально полезными в терапии болезни Альцгеймера. Возбуждение этого белка-рецептора, предположительно, связано с нейродегенеративными изменениями. Следовательно, блокирование NMDA может иметь терапевтический эффект. Этот подход отличается от многих других, использующихся при разработке препаратов от болезни Альцгеймера. Данная цель основывается на измененной кристаллической структуре белков 1pbq-q1 и 1pb7-q1.

Эта белковая цель недалеко ушла от 1pb7-q1, просчитанной совсем недавно. Хитов опять очень мало, а считаются жабки еще дольше!

Автор: Arbalet Oct 28 2005, 19:43

1KSW-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Киназы тирозина широко представлены в человеческих тканях. Киназа тирозина C-SRC - перспективная цель антиракового лекарственного средства. При этом, для ограничения побочных эффектов, важно достичь селективности (избирательности) действия препарата при длительном его употреблении.

Жабки 1KSW-Q1 считаются быстро, хитов не много.

Автор: Arbalet Oct 31 2005, 23:20

1A8G-Q1 | HIV | 4097 jobs
ВИЧ протеаза - перспективная цель для разработки лекарственного средства против вируса иммунодефицита. Однако, мутации ВИЧ-протеазы делают неэффективными многие из ее ингибиторов.

Жабы тугие, но хитов ого-го

Автор: Arbalet Nov 4 2005, 01:16

1LCJ-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Данная цель - клон 1KSW-Q1
Киназы тирозина широко представлены в человеческих тканях. Киназа тирозина C-SRC - перспективная цель антиракового лекарственного средства. При этом, для ограничения побочных эффектов, важно достичь селективности (избирательности) действия препарата при длительном его употреблении.

Жабки считаются чрезвычайно быстро, хитов чрезвычайно мало.

Автор: Arbalet Nov 4 2005, 21:48

1P45-Q1 | Malaria | 51352 jobs
Редуктаза Enoyl (ENR) играет критическую роль в Plasmodium falciparum (паразит, который вызывает малярию), участвуя в создании длинных молекулярных цепочек (жирных кислот), которые используются в синтезе клеточной оболочки паразита. Эффективное ингибирование (замедление) этого фермента имеет потенциал в терапии малярии.

Ингибирование редуктазы Enoyl в Mycobacterium tuberculosis также может стать основой эффективного противотуберкулезного средства, устойчивого к мутациям паразита.

Жабки данной цели скромны на хиты, считаются довольно шустро!

Автор: Arbalet Nov 9 2005, 00:44

1FGI-Q2 | Methodology | 4097 jobs
Рецептор фактора роста фибробласта 1 (FGFr-1), как предполагают, играет роль в развитии кровеносного сосуда. Так как VEFGr играет ключевую роль в этом процессе, то допускается, что ингибирование FGFr-1 может быть альтернативой ингибированию VEGFr с меньшим количеством побочных эффектов.

Эта белковая цель исследует возможность использования менее строгих методов, которые дают больше хитов. Исследователи также надеются понять, возможно ли вообще выявление лучших хитов.

Жабки считаются не так уж и быстро, но хитов немало.

Автор: Arbalet Nov 12 2005, 23:09

1EAW-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Matriptase принадлежит к сывороточному протеазному семейству белков и совсем недавно была http://www.nih.gov/news/pr/aug2005/nidcr-15.htm как антираковая цель.

Среднее задание считается около суток, но хитов приносит достаточно много.

1LS5-Q2 | Malaria | 19154 jobs
Plasmodium falciparum (паразит, вызывающий малярию) проникает в клетки эритроцита и потребляет гемоглобин хозяина. Пласмепсин играет ключевую роль в усваивании паразитом белка, поэтому является перспективной целью разработки антималярийного препарата. Ингибирование разложения гемоглобина приводит к токсическим концентрациям и смерти паразита в культуре. Этот вопрос основан на измененных структурах кристалла белков 1lf2-q1 и 1lee-q1.

Жабы не слишком медленные и хитов дают нормально.

Автор: Arbalet Nov 14 2005, 19:56

1KZN-Q1 | Proteome | 4097 jobs
Гираза - признанная противобактериальная цель. Однако, существующие ингибиторы не имели до сих пор терапевтического потенциала из-за серьезных побочных эффектов и устойчивости мутантных форм. Может быть, удастся найти альтернативные ингибиторы, которые не имеют этих ограничений. Этот вопрос основан на измененной кристаллической структуре просчитанного ранее белка 1a6j-q1.

Жабы считаются быстро, только хитов дают немного.

Автор: Arbalet Nov 16 2005, 21:48

1EAX-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Matriptase принадлежит к сывороточному протеазному семейству белков и совсем недавно была идентифицирована как антираковая цель. Цель основывается на измененной кристаллической структуре белка 1eaw-q1, который, кстати, еще не досчитали. Пральна, что особо не налегал на этот белок

Автор: Arbalet Nov 28 2005, 22:17

1E7U-Q4 | Cancer – Methodology | 4097 jobs
Фосфатидилинозитол 3 киназы (PI3K), регулирующий Akt/PKB, является существенным фактором выживания клетки. Ингибирование PI3K приводит к апоптозу (смерти) клетки вследствие действия на Akt/PKB, перестающего фосфорилировать белки, включая факторы транскрипции, Bad, caspase-9 и ASK-1. Есть причина предполагать, что раковые клетки могут быть выборочно уничтожены ингибитором PI3K.

Эта цель - часть более широкой выборки заданий, на которой применяются менее строгие методы. Разработчики надеются понять, возможно ли вообще выявление лучших хитов. Жабки считаются очень долго, но приносят хиты просто таки распухшие от конформеров

1O4P-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Киназы тирозина широко представлены в человеческих тканях. Киназа тирозина C-SRC - перспективная цель антиракового лекарственного средства. При этом, для ограничения побочных эффектов, важно достичь селективности (избирательности) действия препарата при длительном его употреблении. Цель основывается на измененной кристаллической структуре белка 1lcj-q1.

Жабки шустрые, но не очень то и хитовые.

1BDQ-Q1 | HIV | 4097 jobs
ВИЧ протеаза - перспективная цель для разработки лекарственного средства против вируса иммунодефицита. Однако, мутации ВИЧ-протеазы делают неэффективными многие из ее ингибиторов.

Жабки считаются очень быстро, хитов - средние количества.

1BQO-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Stromelysin принадлежит к металлопротеиназам (MMPs). Это - перспективная антираковая цель, связанная с кровоснабжением опухоли, несмотря на то, что обнаружение клинически эффективных молекул оказалось затруднительным. Этот вопрос основан на измененной кристаллической структуре белков из 1b8y-q1 и 1biw-q1.

Жабы считаются по полдня и меньше, при этом достаточно прилично хитов.

1FXF-Q1 | Proteome | 4097 jobs
Фосфолипаза A2 (PLA2) расщепляет эфирное соединение в глицерофосфолипиды, образующие в свободном состоянии жирные кислоты и лизофосфолипиды. Чрезмерные уровни человеческого непанкреатического PLA2 связаны с множеством болезней, включая артрит, заражение и атеросклероз. Ингибирование PLA2 может иметь терапевтический потенциал в лечении артрита. Этот вопрос основан на измененной кристаллической структуре белка из 1fx9-q1.

Средние количества хитов, малые времена просчета.

1RRI-Q1 | Respiratory Diseases | 4097 jobs
7,8-Dihydroneopterin альдолаза (DHNA) не имеет никакого человеческого эквивалента, но является важным ферментом в бактериях, включая Mycobacterium Tuberculosis, игра критическую роль в синтезе фолата. Это - новая противобактериальная цель, которая является интересной, потому что бактерии в отличие от людей (и других млекопитающих) не могут абсорбировать фолат извне. Без фолата не могут расти бактерии! Этот вопрос основан на измененной кристаллической структуре белка из 1nbu-q1.

Жабки считаются долго, но хитов приносят выше среднего.

Автор: Arbalet Dec 2 2005, 00:31

1JD4-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Фактор транскрипции 4 (TCF4) известен своей способностью взаимодействовать с бета-катенином несколькими различными способами. Эта его особенность - перспективная антираковая цель, несмотря на возможные побочные эффекты и избирательность действия.

Очень, очень интересные жабки с большим количеством хитов и конформеров, считающиеся довольно быстро. Вот пример: m2642#29-18(77)


2SHP-Q2 | Proteome | 4097 jobs
Молекулярная передача сигналов, связанная с диабетом и ожирением усложнена и не полностью понятна. Фосфатаза тирозина SHP-2 играет роль в этих процессах и предполагается, что может стать адекватной целью для разработки лекарственного средства.

Жабки считаются долго, достаточно много хитов.

Автор: Arbalet Dec 4 2005, 20:26

1M2G-Q1 | Cancer | 4097 jobs
Регулятор передачи сигналов 2 (Sir2) может дезактивировать p53 (белок супрессора опухоли), который является нежелательным в опухолях. Ингибиторы Sir2 имеют потенциал как новые антираковые препараты.

Жабки считаются долго, но зато очень много хитов и конформеров!
4-DEC-05 15:51 Found 121: m510#36-25(61)
4-DEC-05 16:07 Found 122: m510#36-21(10)
4-DEC-05 16:30 Found 123: m510#36-14(51)
4-DEC-05 16:35 Found 124: m510#36-13(1)
4-DEC-05 16:41 Found 125: m510#36-12(14)