Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

nikelong
Aug 3 2011, 10:47
Пост #1


Тера ранчер
**********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 12 443
З нами з: 19-March 05
Користувач №: 92
Стать: Чол





Correlizer

http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.de/correlizer/
 

http://www.bc-team.org/viewtopic.php?p=3432

Команда Украины: http://svahesrv2.bioquant.uni-heidelberg.d...y.php?teamid=16

проект сравнивает последовательности генов в ДНК, примерно так же как в проекте SIMAP

Genomes are fantastic keepers of genetic information and are the outcome of evolutionary replication, mutation and selection. Genomes organize functions from the cellular level, via the organismic level, up to the complex basis of mind. In human cells the genetic information controlling most processes from the cellular level, over embryogenesis to cognitive ability, manifests in a diploid set of 23 DNA molecules (chromosomes), combined they consist of ~3x10e9 base pairs (bp) stored in ~2.80 GB of data. This whole genome, whose added molecular length totals ~2 m, is kept in comparably small cell nuclei with typical diameters of ~10 µm or volumes of 500 µm3. The sequential organization of genomes, i.e. the relations between distant base pairs and regions within sequences, and its connection to the three-dimensional architectural organization of genomes is still a largely unresolved problem.

Correlizer has been set up to unravel these mysteries, and we found long-range power-law correlations on almost the entire observable scale of 132 completely sequenced chromosomes of 0.5 x 10e6 to 3.0 x 10e7 bp. Varying from Archaea, Bacteria, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster, and Homo sapiens. The local correlation coefficients show a species-specific multi-scaling behavior: close to random correlations on the scale of a few base pairs, a first maximum from 40 to 3,400 bp (for Arabidopsis thaliana and Drosophila melanogaster divided in two submaxima), and often a region of one or more second maxima from 10e5 to 3 x 10e5 bp. Within this multi-scaling behavior, an additional fine-structure is present and attributable to codon usage in all except the human sequences, where it is related to nucleosomal binding.
Computer-generated random sequences assuming a block organization of genomes, the codon usage, and nucleosomal binding explain these results. Mutation by sequence reshuffling destroyed all correlations. Thus, the stability of correlations seems to be evolutionarily tightly controlled and connected to the spatial genome organization, especially on large scales.
In summary, we found that genomes show a complex sequential organization related closely to their three-dimensional organization, which has resulted in entire new insights into genomes. This is important for the general understanding of genomes, from which then new diagnostics and treatments can be developed. With modern high-throughput sequencing techniques now entire genomes are sequenced on a daily basis for a very low price. Actually thousands of completely sequenced genomes fill the public databases meanwhile. Consequently, the analysis of the genetic sequence gets more and more important as well.

Here we ask for your support by donating your computer resources for Correlizer, to reveal these mysteries further and thus lay the foundation for better diagnosis and treatment of diseases.

Це повідомлення відредагував nikelong: Jul 11 2013, 23:51
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
 
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(1 - 8)
Rilian
Nov 14 2011, 10:16
Пост #2


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 333
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



сайт проекта лежит sad.gif

а мне 5 очков до 10к facepalm.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Nov 24 2011, 17:59
Пост #3


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 333
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



внезапно начислили по 10 очков за невалидные задания ... добавив к моему trigglsу 240 очков facepalm.gif

ps: в free-dc milestones статистике triggl это когда набираешь milestone +X, x < 99

http://stats.free-dc.org/stats.php?page=mm...ubproj=trigggls


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
x3mEn
Nov 24 2011, 21:29
Пост #4


snow catcher
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 208
З нами з: 4-August 07
Користувач №: 563
Стать: Чол
Free-DC_CPID



угу, мені таку саму западлянку зробили в DistrRTgen.
було 1.002.117, раптом чогось нарахували 25.920


--------------------

(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
May 25 2012, 10:43
Пост #5


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 333
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



http://www.dc-vault.com/showteam.php?team=433

надо прібавіть тут темп! получім кучу очков smile.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
LSA
Jan 27 2013, 07:16
Пост #6


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 626
З нами з: 7-October 07
З: Kyiv
Користувач №: 596
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Й9450 8G DDR2 QA90 16G DDR3 GTX 482



Появились завдання.


--------------------
(Show/Hide)


GF100 GF114
+++++,++++

<a href="http://allprojectstats.com/showuser.php?id=1333992"><img src="http://allprojectstats.com/s1333992m0a.png" border=0>
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
LSA
Jan 30 2013, 19:45
Пост #7


кранчер з фермою
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 626
З нами з: 7-October 07
З: Kyiv
Користувач №: 596
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Й9450 8G DDR2 QA90 16G DDR3 GTX 482



Після вчорашнього падіння сервера, я залишив рахувати без доступу до Network.
Зараз почав зливати, те що нарахувалось. Боюсь сервер знов загнеться.
ЗИ.. Витримав.


--------------------
(Show/Hide)


GF100 GF114
+++++,++++

<a href="http://allprojectstats.com/showuser.php?id=1333992"><img src="http://allprojectstats.com/s1333992m0a.png" border=0>
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Asket
Jul 11 2013, 14:26
Пост #8


Трохи обжився
**

Група: Trusted Members
Повідомлень: 27
З нами з: 25-June 13
Користувач №: 3 256
Стать: bot



Добавьте, пожалуйста, краткое описание проекта на русском.


--------------------
(Show/Hide)

http://stats.free-dc.org/cpidtagb.php?cpid=1f6fcf1f3056eccb9083507e255a7bc2&theme=6&cols=1
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 11 2013, 15:20
Пост #9


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 333
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



проект сравнивает последовательности генов в ДНК, примерно так же как в проекте SIMAP


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 26th July 2017 - 02:47

Rambler's Top100 Рейтинг@Mail.ru
Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.