Версія даної теми для друку

Автор: nikelong May 26 2008, 23:01

Проект "The Clean Energy project - phase 1"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

• http://cleanenergy.harvard.edu
• http://www.worldcommunitygrid.org/team/viewTeamInfo.do?teamId=J8H4J4QPN1
• http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/listthreads?forum=341
• http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=171

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=890



----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 28.02.2005 Капитан - rilian
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

О проекте:

Dear World Community Grid users: We want to thank you all for contributing your computer's idle power to the Clean Energy Project! Our team here in the Department of Chemistry and Chemical Biology at Harvard University is very excited about having the opportunity to closely work with you in finding new materials for alternative energy applications. We are jointly searching thousands of possible compounds as candidates for producing solar cells made of organic materials.

Most of the solar cells are made of highly structured semiconductor substrates. In contrast, our approach seeks to understand how photosynthetic organisms such as plants harvest sunlight using not-so-structured organic molecules. We plan to use the natural design principles of these organisms to create solar cells that behave similarly. Early stages of the project will help us understand many fundamental aspects of how to improve the performance of these organic-based materials. With your help, we will study how organic molecules stack to form thin films that can be used to develop flexible, lightweight solar cells, and possibly solar paint! Isn't that amazing? In later stages, we will study the electronic properties of these molecular compounds to better understand how the energy flows in these materials. One of our goals is to collaborate with experimental research groups that will synthesize the most promising chemical compounds; compounds that would be identified by using your donated computer time.

In this respect, your contribution is very important because you are helping us to dramatically accelerate the process of understanding the fundamental science behind these novel solar cells made of organic materials. Remember: the deployment of this technology has the potential to systematically lead the development of the next generation of solar cells. We will keep you posted as the project advances on our findings in this forum. You can also visit our website for more information: http://cleanenergy.harvard.edu.

Thank you again for donating your computer time for this project.

The Clean Energy Project team.

Project Status and Findings:
Information on the Clean Energy Project can be found on these pages and on the http://cleanenergy.harvard.edu/. The latest status updates can also be found at this site. To discuss or ask questions about this project, please visit The http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/listthreads?forum=341.

Mission
The mission of the Clean Energy Project is to find new materials for the next generation of solar cells and later, energy storage devices. By harnessing the immense power of World Community Grid, researchers can calculate the electronic properties of tens of thousands of organic materials – many more than could ever be tested in a lab – and determine which candidates are most promising for developing affordable solar energy technology.

Significance
We are living in the Age of Energy. The fossil fuel based economy of the present must give way to the renewable energy based economy of the future, but getting there is the greatest challenge humanity faces. Chemistry can help meet this challenge by discovering new materials that efficiently harvest solar radiation, store energy for later use, and reconvert the stored energy when needed.

The Clean Energy project uses computational chemistry and the willingness of people to help look for the best molecules possible for: organic photovoltaics to provide inexpensive solar cells, polymers for the membranes used in fuel cells for electricity generation, and how best to assemble the molecules to make those devices. By helping us search combinatorially among thousands of potential systems, World Community Grid volunteers are contributing to this effort.

Approach
Researchers are employing molecular mechanics and electronic structure calculations to predict the optical and transport properties of molecules that could become the next generation of solar cell materials.

a) Molecular mechanics calculations: Some of the computers contributing to the Clean Energy Project are carrying out molecular mechanics calculations of molecular crystals, thin films and molecular and polymer blends to study the packing arrangements and for predicting charge and excitation energy transport properties of the candidate materials. These calculations will be carried out using the CHARMM molecular mechanics package developed by the Karplus group at Harvard University.

B) Electronic structure calculations: To obtain the relevant optical and electronic transport properties, some of the computers connected to the Clean Energy Project will be computing calculations using wave function methods (such as Hartree-Fock or second-order perturbation theory) and density functional theory. These calculations will help researchers build a database of molecular properties that together with the results of the molecular mechanics calculations will help us identify potential candidate materials. The electronic structure calculations will be performed with the Q-Chem quantum chemistry code, developed by Q-Chem, Inc.


Ссылки по теме:

• http://renewables.ru/modules.php?name=PagesAd&pa=showpage&pid=43

Как происходят рассчеты: программа подбирает структуру поглощающей поверхности и подвергает ее воздействию освещения. Поверхность выделяет электроэнергию и нагревается. Программа измеряет эти параметры со временем

Как выглядит графический клиент:

Автор: Sirchyk Aug 3 2008, 10:57

Проект знаходиться в режимі розробки. Нових завдань поки-що не видають. Коли завдання будуть обов'язково повідомлю тут.

Автор: ReMMeR Aug 3 2008, 21:22

Проект практичний, як ніколи. Якщо доведуть до виробництва - буде супер.

Автор: Sirchyk Aug 3 2008, 21:39

ReMMeR,
В порівнянні з моментом коли я вперше відвівдав їхній сайт, можна сказати, що його розробку вже майже закінчено. Думаю, до кінця року такими темпами мали б запустити.

Автор: (_KoDAk_) Aug 3 2008, 21:55

Sirchyk,
малодец опередил )

Автор: cosmo_vk Dec 5 2008, 21:20

кстати вот чего мне загрузилось при обмене с серверами WCG:

видать это как раз новый проект.

а вот и сам проект: http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=22540

а вот к трафику они не гуманно подошли. Примерно 7 метров на задание вроде выходит. Хотя могу ошибатся на этот счет. Толи они картинки первоначальные засунули вместе с заданием, посмотрим в дальнейшем...
Вообщем одно задание словил на домашнем. Очередь к нему дойдет только в воскресенье с утра.

Автор: Некто Dec 5 2008, 22:11

где-то я это видел..

Автор: KING100N Dec 5 2008, 23:24

Я так понял, будут "искать" более эффективные и дешевые солнечные ячейки. Актуально. Думаю, можно будет поучаствовать

Автор: Rilian Dec 6 2008, 00:53

переношу в ВЦГ!

Автор: Rilian Dec 6 2008, 00:59

Dear World Community Grid users: We want to thank you all for contributing your computer's idle power to the Clean Energy Project! Our team here in the Department of Chemistry and Chemical Biology at Harvard University is very excited about having the opportunity to closely work with you in finding new materials for alternative energy applications. We are jointly searching thousands of possible compounds as candidates for producing solar cells made of organic materials.

Most of the solar cells are made of highly structured semiconductor substrates. In contrast, our approach seeks to understand how photosynthetic organisms such as plants harvest sunlight using not-so-structured organic molecules. We plan to use the natural design principles of these organisms to create solar cells that behave similarly. Early stages of the project will help us understand many fundamental aspects of how to improve the performance of these organic-based materials. With your help, we will study how organic molecules stack to form thin films that can be used to develop flexible, lightweight solar cells, and possibly solar paint! Isn't that amazing? In later stages, we will study the electronic properties of these molecular compounds to better understand how the energy flows in these materials. One of our goals is to collaborate with experimental research groups that will synthesize the most promising chemical compounds; compounds that would be identified by using your donated computer time.

In this respect, your contribution is very important because you are helping us to dramatically accelerate the process of understanding the fundamental science behind these novel solar cells made of organic materials. Remember: the deployment of this technology has the potential to systematically lead the development of the next generation of solar cells. We will keep you posted as the project advances on our findings in this forum. You can also visit our website for more information: http://cleanenergy.harvard.edu.

Thank you again for donating your computer time for this project.

The Clean Energy Project team.

Автор: Rilian Dec 6 2008, 01:05

обновил немного шапку

Автор: Rilian Dec 7 2008, 18:28

Ура!

У меня досчиталась первая ВЮ

Процессор: Core2Duo 2.66Ghz
Время: 19 часов
Очки: 300

итого в час 15 очков

итого ппд с машины: 15*2*24 = 720

Автор: KING100N Dec 7 2008, 19:27

У меня еще днем ушла одна вюшка - 11 часов считалось. Результатов пока 0

Автор: KING100N Dec 8 2008, 15:25

Ооо, результаты пришли: За 11 часов работы получил аж 64 очка. Так надо вообще?? Если да, то я лучше в фах или магнетизм

Автор: Rilian Dec 8 2008, 16:13

За вторую ВЮ получил 240 очков на том же процессоре за 14 часов (коре 2 дуо 2.66ГГц). Для этого процессора - среднее ппд по палате в пределах нормы

Кингстон, какой процессор ?

Автор: KING100N Dec 8 2008, 18:58

Rilian
С2D E8200@3.12

Вот вторая досчиталась(или третья), посмотрим, что за нее дадут

Автор: Rilian Dec 8 2008, 19:30

KING100N, да бывает начисляется меньше очков за ВЮ посчитанную быстрым компом. Но это обычно компенсируется тем что быстрый комп может посчитать большее количество ВЮ и в итоге в среднем получит больше очков. Это все дополнительно усредняется тем что очки выставляются одинкаово всем кто посчитал эту ВЮ. То есть сегодня ты получишь меньше по какой-то причине, а завтра та получишь больше.

Автор: KING100N Dec 8 2008, 19:56

Получается одну вю считают два или более раз?? Как-то неправильно они используют ресурсы

Автор: Rilian Dec 8 2008, 20:00

Всмысле? В 99% проекта ВЮ считается больше одного раза, или даже больше 2.

В TCEP минимальный кворум 2. В ХЦЦ кстати тоже 2. В Фолдинге 3. В рисе - 15. В СЕТИ - 40

Помнишь в Магнетизме Константин целый месяц перепроверял данные прежде чем смог выдать результат? Это потому что он решил сэкономить на ресурсах и включил нулевую избыточность. Сейчас Магнетизм тоже работает с коврумом 2.

Автор: KING100N Dec 8 2008, 22:25

Я, кажется, понял, почему такие большие задержки при получении очков - сервер ждет, пока не придет это же задание с другого компа(более медленного) , а только потом начисляет очки.

Не понял только, как я получу больше

Автор: Rilian Dec 8 2008, 22:33

Да, сервер ждет пока второй комп посчитает то же задание. После этого если оба компа сходятся во мнениях - начисляются очки.

Ты можешь получить больше очков если у второго компа бОльший claimed credit. шансы - примерно 50%, то есть каждая вторая ВЮ

Автор: Rilian Dec 10 2008, 03:48

размер и очки за задания будут пересматриваться и "скоро" все войдет в норму

покопавшись на оф форуме я прочитал что при начислении очков также учитывается RAC (recent average credit) компьютера и также скорость его сообщений о посчитанном ВЮ.

получается, как всегда в бета проектах, грубо говоря, можно либо считать и не обижаться на "нечестно (не)выданные" очки, либо считать другие проекты.

Подробнее на английском можно прочитать тут

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=6105

Автор: nikelong Dec 10 2008, 20:42

Исследователи из IBM и Гарвардского университета привлекут добровольцев к разработке солнечных батарей

Специалисты компании IBM и исследователи из Гарвардского университета запустили проект, целью которого является поиск органических материалов, которые помогли бы создать высокоэффективные, но дешевые солнечные батареи. Особенностью проекта является привлечение вычислительных ресурсов большого количества персональных компьютеров, имеющих подключение к сети Интернет.

Идея задействовать свободное «машинное время» персональных компьютеров не нова. Более того, организаторы проекта используют для ее реализации уже опробованный механизм — World Community Grid. Таким образом, в создании новых солнечных батарей смогут участвовать добровольцы из разных стран мира.



Как известно, солнечная энергия является одной из наиболее привлекательных альтернатив современным источникам электричества. К сожалению, эффективность современных кремниевых батарей примерно равна 20%, а стоимость электроэнергии, вырабатываемой с их помощью, выше, чем стоимость электричества, получаемого от более привычных источников. Новые батареи, которые надеются создать в IBM и Гарварде, будут изготавливаться из пластика. Предполагается, что они будут гибкими, легкими, и главное — дешевыми и высокоэффективными.

Проект World Community Grid является самым крупным в своем роде — сообщество насчитывает более 413 тысяч участников из 200 стран мира, в распоряжении которых находится более миллиона компьютеров. Применение такого большого числа компьютеров позволяет ускорить решение научных задач, что наглядно демонстрируют успешные проекты, организованные с участием World Community Grid.

Источник: IBM

http://www.ixbt.com/news/hard/index.shtml?11/41/22

Автор: Rilian Dec 14 2008, 01:18

Статистика по ВЮ на core2duo 2.6Ghz

time(h) claimed credit -> granted credit

8.92h 124 -> 126
17.9h 283 -> 285

Статистика по Xeon 2Ghz (2 физических, 4 логических ядра)

29.7h 242 -> 247
42.5h 340 -> 327
35.8h 286 -> 272

Автор: Rilian Dec 18 2008, 21:27

График по проекту (картинка статическая, не обновляется)

Автор: Rilian Dec 19 2008, 15:42

у меня в аккаунте появилась "бронзовая медаль" за 14 рассчетных дней



так как проект в бета стадии, и начисление очков работает не так как хотелось бы, этот проект пока не считаю

Автор: Rilian Dec 21 2008, 04:33

Началось BETA-тестирование проекта под Linux и MacOS X

для того чтобы участвовать необходимо зайти в настройки Beta testging в вашем профиле на сайте и поставить галочку "участвовать". Также для этого желательно знать английский язык чтобы если WU на вашем компьютере (с нестандартными настройками) упадет то вы могли бы рассказать об этом. Конечно большая часть информации о компе и так отправляется на сервер, но иногда что-то уточнить не помешает

Автор: Rilian Dec 21 2008, 05:49

Как происходят рассчеты: программа подбирает структуру поглощающей поверхности и подвергает ее воздействию освещения. Поверхность выделяет электроэнергию и нагревается. Программа измеряет эти параметры со временем

Автор: Rilian Dec 23 2008, 01:37

Много ВЮ сейчас вылетает с ошибками. Поэтому пока не исправят алгоритмы, с научной точки зрения эти рассчеты могут быть бесполезными. Если вы хотите тратить проц время только на полезные ВЮ, переключитесь пока на другие проекты ВЦГ

Автор: Rilian Dec 23 2008, 20:58

Поймал аццкую ВЮ.

Считалась на core 2 duo 2.66Ghz 26.93 часа, и я получил за нее 425 очков

Автор: cosmo_vk Dec 24 2008, 20:22

E000035_ 595A_ 00045e00r_ 1-- IBM3650 Valid 16.12.08 07:06:24 19.12.08 03:35:25 29.29 573.7 / 559.6

Автор: Rilian Dec 25 2008, 00:06

E000027_ 381A_ 00035t003_ 4-- MSY Valid 12/21/08 12:07:56 12/24/08 17:18:54 44.66 744.6 / 738.3

пс: сам шоке

Автор: cosmo_vk Dec 25 2008, 19:30

ух-х здоровая какая попалась!
Бронзовую медальку уже получил по проекту?

Автор: Rilian Dec 25 2008, 21:36

Через пару дней будет серебрянная

Автор: cosmo_vk Dec 27 2008, 11:09

молодец!

Мне правда не особо нравится система начисления очков и медалек в WCG.
Можно подключить ораву слабеньких компов и получить медальку раньше, чем подключив пару-тройку "сильных" машин, которые очень быстро считают по времени.

Автор: Rilian Dec 28 2008, 19:23

ммм, я думал серебро дают за 30 дней (а не за 45)

вобщем по обновленным данным еще около 2 недель. Сейчас посчитано 32 дня и CEPделит мощности с HCC

Автор: Rilian Dec 29 2008, 17:44

Иногда попадаются ВЮ которые вылетают с ошибкой

И начинают бесконечно рестаротоваться.

Рекомендую проверить все активные компы и сделать аборт этим ВЮ

Если вы не можете часто проверять что творится на компах с CEP, временно отключите этот проект из активных проектов https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do

Автор: Rilian Dec 30 2008, 20:47

Dear WCG users,

This is a new year's message and status updated from the Harvard team. As you know, we launched this project in December 5. Since then, it has been almost a month, and we have amassed a great amount of data that will help us predict the structure and packing of solar cells made of organic molecules. When we launch the Q-Chem code (phase II) we will be able to combine these results with quantum mechanical calculations.

I want to briefly address a few of the points that have been made throughout the month on the forums.

- Work unit length and errors: Based on the results that we are receiving and together wtih IBM, we are building a predictive model of how long will calculations last, so we can distribute work units of reasonable time duration. Some of the work units will still need to go for long times, as we sometimes will require results from larger simulation cells. We have found some errors in some of the input files that we prepared for the initial batches. As we have analysed work units with errors, we have either removed or modified the subsequent input files to address the errors. Although it might be frustrating, during this first month you have been helping us fine-tune a complicated batch process that starts with a molecular structure in 2D representation all the way to a 3D simulation box. We expect that the number of erroneous units will be reduced dramatically in the next couple weeks sa we are implementing these changes together with IBM. Thank you again for allowing us to explore such a vast amount of materials in such a short time.

- Scientific goals: The calculations that we are doing with you are helping us to advance the understanding of the principles behind how organic solar cells assemble and transport electrons, holes and excitations. The search over many compounds is an adaptive one: The results from early calculations on the WCG will help guide the combinatorial search towards better compounds as the project continues. The valid results from the WCG calculations will be made available, it will take some time to analyse and process the data, but when it is presentable and useful, it will of course be provided to the community at large.

- Mac and Linux clients: We are Linux users ourselves (and one of us is a Mac user), so of course we are also waiting for the clients. The debugging process makes sure that we have great clients. Thank you to the IBM team for working so hard on these. As I understand, these are in beta testing right now.

- Phase II: We are starting to work with IBM on the quantum chemistry module. It will work in tandem with the molecular mechanics calculations to understand both the packing and the transport aspects of the materials. We expect to have both "Phase I" and "Phase II" calculations running at the same time, as they are complementary. Right now, we are running all our quantum calculations (a smaller number of what we could be able to do with WCG) in-house.

It is in our best interest to obtain good and exciting scientific results from this effort, and we hope to keep you updated in 2009 both here in the forums and in the http://cleanenergy.harvard.edu website under the "News" menu item.

Greetings and wishing you a great 2009,

The Clean Energy Project team.

------------------------------

Уважаемые пользователи WCG,

Это новый год в сообщение и статус обновленный из Гарвардской команды. Как вы знаете, мы запустили этот проект в декабре 5. С тех пор он был почти месяц, и мы накопили большой объем данных, что позволит нам прогнозировать структуру и упаковки солнечные батареи из органических молекул. Когда мы обращаемся Q-химические код (фаза II), мы сможем объединить эти результаты с квантово-механических расчетов.

Я хотел бы коротко остановиться на нескольких моментах, которые были сделаны в течение всего месяца на форумах.

- Время рассчета ВЮ и ошибки: На основе результатов, которые мы получаем, и вместе с IBM, мы строим прогностическую модель, как долго будет последним расчетам, так что мы можем распределить работу подразделений разумные сроки продолжительности . Некоторые работы подразделения будут по-прежнему нужно идти в течение длительного времени, как мы иногда потребует больших результатов моделирования клеток. Мы обнаружили некоторые ошибки, в некоторых из входных файлов, которые мы подготовили для первоначальной партии. Как мы уже проанализировали работу подразделений с ошибками, мы либо удалены или изменены в последующих входных файлов для устранения ошибок. Хотя это может быть досадным, в течение первого месяца вы были помочь нам осуществить точную настройку сложных пакетных процесс, который начинается с молекулярной структурой в 2D представительства всех способов моделирования 3D окне. Мы ожидаем, что количество ошибочных подразделения будут резко сокращены в ближайшие пару недель са мы осуществляем эти изменения вместе с IBM. Еще раз спасибо за предоставленную нам возможность изучить такой огромный объем материалов, в такой короткий промежуток времени.

- Научно-исследовательские цели : Расчеты, которые мы делаем с Вами помогает нам заранее понять принципы, лежащие в основе как органических солнечных элементов сборки и транспортировки электронов, отверстий и возбуждения. Поиск на протяжении многих соединений адаптивного один: результаты с начала расчетов на WCG помогут комбинаторного поиска в направлении более соединений, как проект продолжается. Действительные результаты WCG расчеты будут представлены, это займет некоторое время для анализа и обработки данных, но когда это презентабельно и полезным, оно, конечно, быть предоставлены обществом в целом.

- Mac и Linux клиенты : Мы сами пользователи Linux (и один из нас является пользователем Mac), так что мы, разумеется, также ожидают клиентов. Отладки процесса гарантирует, что мы возлагаем большие клиентов. Спасибо за IBM команды для работы так сильно, по этим. Как я понимаю, они находятся в бета-тестирование прямо сейчас.

- Фаза II : Мы начинаем работать с IBM по квантовой химии модуля. Она будет работать в тандеме с молекулярной механики расчеты понять, как по упаковке и перевозке аспектов материалов. Мы ожидаем, так "Фаза I" и "Фаза II" расчеты показываются в то же время, как они дополняют друг друга. Сейчас мы работает все наши квантовых вычислений (меньшее количество, что мы могли бы иметь возможность делать с WCG) в доме.

Это в наших силах интерес для получения хороших и интересных научных результатов от этих усилий, и мы надеемся на то, чтобы держать вас в обновленный в 2009 году как здесь, в форумах и в http://cleanenergy.harvard.edu сайт под "Новости" в меню предмет.

Приветствую и желаю вам большое 2009 году

Автор: Rilian Jan 5 2009, 01:19

[звук фанфар]

Благодаря переводческим усилиям Algon-а, а также спеллчекингу King100n и Death, родилась статья про проект

http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=171

[/звук фанфар]

Автор: Rilian Jan 9 2009, 15:19

Проект в БЕТА-версии, но скоро обещают перейти в статус production

Автор: Rilian Jan 10 2009, 10:50

Вышла версия ядра 6.19

Автор: Rilian Jan 11 2009, 06:49

В погоне за золотой медалью проекта временно перевожу сюда 5 компов. Еще осталось посчитать 50 процессорных дней

Автор: Rilian Jan 12 2009, 02:22

Мдя...... ученые проекта отожгли.

начиная с 000117 пачки ВЮ, задания запускаются и скачаиваются, но при старте зависают и так и висят с 0 процессорным временем и 0% выполнения.

зайдите в My Projects и отключите CEP из проектов! также зайдите на все свои виндовые компы и проверьте не занимают ли такие нулёвые ВЮ рассчетные слоты!

Когда ситуация улучшится, я отпишусь

Автор: Rilian Jan 12 2009, 04:20

Админы приостановили проект до выяснения обстоятельств

Пока рекомендую поставить галочку "Receive work from another projects" на странице ваших проектов: https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do

Автор: KING100N Jan 12 2009, 08:23

Уже пришлось прекратить две вюхи из-зи этих "обстоятельств". Сейчас скачало 1 задание Fight@AIDS, хотя я на него не подписывался.

Автор: Rilian Jan 12 2009, 14:09

Любое задание полезно

Автор: cosmo_vk Jan 12 2009, 16:38

млин у меня таких 3 задания из 126-пачки. Тоже запустилось, одно два с лишним часа на нуле стояло, второе час. Приехал с работы пришлось приостанавливать.

Автор: Rilian Jan 12 2009, 16:48

Да. Как известно в бета проектах бывают критические глюки.

проект остановлен до исправления.

пс: у меня серебрянная медалька

Автор: Rilian Jan 14 2009, 08:24

We are still doing our internal testing of the new version of the clean energy project code and are fixing all of the problematic workunits. If our testing goes well we will start a beta test, which could come as early as tomorrow. We will update the forums with the results. And again thanks to all of the members for the help in diagnosing these issues.

Сейчас идет внутреннее тестирование нового кода. После этого будут выданы ВЮ на Beta- тестирование (если хотите поучастововать , включите бета-тестирование в вашем профиле. Очень желательно обо всех ошибках сообщать на официальном сайте)

Если все будет ОК то на оф форуме сообщат, и активируют проект

ПС: спасибо всем участникам которые помогали диагностировать эту проблему

Автор: Death Jan 14 2009, 12:32

ALÁN ASPURU-GUZIK


http://aspuru.chem.harvard.edu/

Assistant Professor
Department of Chemistry and Chemical Biology
Harvard University
12 Oxford Street, Room M113
Cambridge, MA 02138
Tel. (617) 384-8188
Fax. (617) 496-9411

E-mail:

Postdoctoral Researcher, UC Berkeley (2005-2006)
Ph.D., UC Berkeley (2004)
B.Sc., Universidad Nacional Autónoma de México (1999)



Research in the Aspuru-Guzik group focuses on three areas of
theoretical physical chemistry and its applications:

(1) the connections between quantum computation,
quantum information and chemistry;
(2) theoretical studies of renewable energy materials;
(3) methods development for electronic structure theory:
first-principles methods, density functional theory, and quantum Monte Carlo.

In our laboratory, we are developing novel ways of carrying out quantum chemistry calculations. Some of the projects that we are engaged in this area are summarized below:

GENERAL-PURPOSE GRAPHICS PROCESSING UNITS FOR QUANTUM CHEMISTRY
We are exploring the use of video graphics cards (general-purpose graphics processing units or GPGPUs) to carry out correlated electronic structure calculations (Moller-Plesset Perturbation theory) with speedups of up to 20X. We are closely collaborating with Q-Chem, Inc.

DISTRIBUTED COMPUTING AND QUANTUM CHEMISTRY.
In the context of The Clean Energy project and in collaboration with IBM's World Community Grid, we are working on carrying out tens of thousands of simultaneous quantum chemistry calculations using the BOINC infrastructure.

QUANTUM MECHANICS IN COMPLEX ENVIRONMENTS.
In the context of our DARPA SERS fundamentals interaction with the groups of Ken Crozier and Eric Mazur, we are working on the development of novel electronic structure approaches that take nano-scale environments into account.This is a collaboration with Dr. Michael Stopa, from Harvard's Center for Nanoscale Sciences.

NOVEL ELECTRONIC STRUCTURE APPROACHES
Electronic structure theory allows us to understand and predict the behavior of chemical processes. Nevertheless, practical methods are approximate and fail in certain cases. We are working on improving and developing methods for the determination of the electronic structure of atoms and molecules. In particular, we are working on new methods for density functional theory (DFT) and on improvements to the quantum Monte Carlo method. These techniques are complementary: DFT is fast and reasonably accurate, and quantum Monte Carlo can be used in benchmark studies, where a definitive answer is required.

DEVELOPMENT OF SEMI-CLASSICAL DYNAMICS METHODS.
In collaboration with Dr. Michele Ceotto, from the University of Milan, our group is developing practical first-principles semi-classical methods for nuclear propagation. We are working in integrating semi-classical propagation into mainstream quantum chemistry packages, and in particular finding ways to make it as efficient and convenient as regular classical first-principles dynamics propagation.

Автор: Rilian Jan 19 2009, 18:15

Вышла новая версия клиента в которой исправлены предыдущие баги

Задания выдаются!

Автор: Rilian Jan 25 2009, 12:01

Dear WCG Crunchers,

We want to give everyone a quick update about the scientific status of the project. First, we want to apologize for the bad work units. While it is no excuse, the errors occur in only some of each randomized set and we somehow avoided them in our in-house testing. There are two main causes of the errors that we have seen:

1) If you have been following the progress of your work units on the graphs, you can see that the energy of the system fluctuates with each step. Sometimes, the position of atoms late in the run causes the energy of the system to change by more than is "reasonable" for the simulation and the work unit errors out.

2) The work units that error out faster are due to the random placement of the molecules causing a lot of atoms to be close to "edge" of the simulation, which causes an error when the energy of the system is evaluated.

And now for the good news: both of these errors are more prevalent in certain types of simulations we are running, so we have removed these from the queue. We have also been learning from the results we have already gotten back. The next batch of work units we send will take everything we have learned so far into account.

The CEP team is very thankful to everyone who has been crunching away. This is the biggest set of simulations we have ever had the chance to run and we are really excited about the future of the project! biggrin

The CEP Team

---------------------------
Уважаемые WCG Crunchers,

Мы хотим дать каждому быстро обновлять по поводу научного статуса проекта. Во-первых, мы хотели бы извиниться за плохой работы подразделений. Хотя это не оправдание, ошибки случаются только в некоторых рандомизированных каждого набора, и мы каким-то образом избежать их в нашем доме в тестировании. Существуют две основные причины этой ошибки, которые мы видели:

1) Если вы были следить за ходом вашей работы подразделений на графиках, можно увидеть, что энергия системы меняется с каждым шагом. Иногда положение атомов в конце перспективе причин энергии системы для изменения более чем "разумный" для моделирования и работы подразделения из ошибок.

2) деятельность подразделений, что ошибка в быстрее обусловлены случайными размещения молекул вызывая много атомов, чтобы быть рядом с "краем" в симуляции, которая вызывает ошибку, когда энергия системы оценки.

А теперь хорошая новость: оба эти ошибки являются более распространенными в некоторых видах моделирования мы работает, поэтому мы удалили их из очереди. Мы также изучение результатов мы уже получили обратно. На следующий пакетный работы подразделений мы отправляем примет все мы поняли, до сих пор во внимание.

CEP команда очень благодарны всем, кто был вне хруст. Это самый большой набор симуляций мы когда-либо имел возможность запускать и мы очень рады, о будущем этого проекта! biggrin

CEP команда

Автор: Rilian Feb 4 2009, 22:35

Наконец-то накранчил на золотую медаль

Автор: KING100N Feb 4 2009, 23:10

Congratulations!!!

Автор: Rilian Feb 6 2009, 01:29

Добавлены рассчетные ядра для Linux и MacOS/Intel

Автор: nikelong Feb 13 2009, 17:01

http://www.boinc-af.org/content/view/725/217/

Автор: Rilian Feb 23 2009, 22:46

https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=24633

Привет всем,

Итак, как вы все знаете, мы временно без работы подразделений. CEP команда прилагает все усилия для получения новой качественной WU порожденной тем, что каждый человек может продолжать работать в направлении CEP медалей и материалов для новых солнечных батарей!

Вот где мы находимся:

ВЮ типа А: Мы делаем науку. Это означает, что некоторые вещи не работают, как мы считали бы они ... но это означает, что у нас есть шанс извлечь уроки из ошибок, которые были возвращены. Мы получения более вида деятельности единицы, но мы стараемся свести к минимуму вероятность того, что мы увидим, ошибки, которые повлекли за собой проблемы в прошлом. Чтобы сделать это, мы повысили нашу "в доме" скрининг попытаться лучше смысл которого заданий будет проходить гладко и мы обрабатываем до работы блока данных весьма минуту. Опять же, это лишь пауза - у нас есть десятки тысяч молекул для тестирования!

BЮ типа Б: Эти рабочие юниты являются продолжением успешного вида деятельности единиц. Нам нужно больше статистических данных для анализа каждой вычислительной работы, с тем, что это роль B тип заданий. Мы сосредоточены на работе подразделений, которые были завершены, поэтому рабочие места, что вызвало серьезные проблемы, не будут включены в этот раунд. Чтобы убедиться, что вещи работают должным образом, они будут разосланы в ближайшее время бета-версии, так держать глаза открытыми!

Мы также работаем по времени алгоритм, чтобы WCG технологий можно более точно определить время для завершения работы.

Мы очень напряженно работают над получением всех недочетов устранены из этого огромного проекта - благодаря тому что Вы остаетесь с нами!

Автор: Rilian Mar 24 2009, 00:59

В данное время в проекте закончились задания. ВЦГ считает быстрее чем задания выдаются исследователями

Чтобы ваши компьютеры не простаивали, рекомендую включить галочку "If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project." (получать задания из других проектов)

https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewMyProjects.do

Автор: cosmo_vk Mar 25 2009, 05:57

да маловато они выпустили заданий, у меня моя ферма пару поймала и все. Никак до золотой медальки не доберусь в проекте.

Автор: Rilian Mar 25 2009, 11:55

Вчера вечером уже задания были

Автор: Rilian Mar 30 2009, 22:21

http://www.youtube.com/watch?v=WwSgy1WANn8

Видео. Главный ученый Alan Aspuru-Guzik рассказывает о том что именно считается в проекте

Автор: Tamagoch Mar 31 2009, 09:01

круто, аж захотелось переключиться....
надо где-то на лето выбрать его проектом месяца

Автор: KING100N Mar 31 2009, 13:42

Надо бы, но по-моему, задания как-то вяло выдают. Из двух подпроектов - HFCC и СЕР у меня 90% времени считаются HFCC

Автор: Zudwa Apr 6 2009, 21:02

Приглашаю всех заинтересованых посетить мой блог -
http://zudvva.livejournal.com/
Этот блог был задуман как фиксация апдейтов статуса проекта, однако вместе с этим также есть статьи из прессы и другие новости об экологии и политике.
Все переводы на русском языке. Удачного просмотра!
Кстати перевод reseach page - страницы об исследовании - также доступен в моем переводе в FAQ'е по ссылке https://secure.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/printpost?post=222851

Автор: Rilian Apr 6 2009, 21:47

у нас как бе ресеарч уже переведен (спасибо Алгону)

Автор: Zudwa Apr 7 2009, 11:45

Не было времени разобраться - а в шапке наверху только английская версия. Если у вас есть перевод на украинский - пишите пользователю Sekerob на форуме WCG. Он добавит ваш перевод в FAQ.

Автор: Rilian Apr 7 2009, 12:05

Я знаю, я читаю оф форум

Как будет перевод, добавим

Автор: Tamagoch Apr 7 2009, 20:31

по теме: проект и ВЮ уже стабильны? хочу предложить на педаль в мае - солнечный проект ведь

Автор: Rilian Apr 7 2009, 20:41

да

Автор: Rilian Apr 25 2009, 09:54

В программе CEP были сделаны различные исправления, позволяющие лучше отслеживать ошибки, а также исправляющие некоторые ошибки приводящие к статусу Error не по вине юзера. Новая версия рассчетного ядра CEP имеет немного больший размер и будет закачана автоматически со следующей ВЮ

Автор: Sirchyk May 1 2009, 19:44

Знову якість проблеми. В мене чомусь не рахуються завдання - час ЦП рахується, але не зменшується час який залишився, і не відображається прогрес - 0%... Вже третє завдання за сьогодні - перші 2 видалив. Вже навіть пробував перезапускати проект - не допомогло. Думав може щось з компютером але CPDN beta працює нормально, порахувало десь 10 % за пів дня... Хто щось може сказати на це???

Автор: Rilian May 1 2009, 20:04

Попробуй временно переключиться на другие подпроекты.

Автор: Tamagoch May 1 2009, 20:05

попробую посчитать этот проект после симапа, отпишусь о процессе

Автор: Sirchyk May 2 2009, 18:25

Перевів потужність на HFCC.

Автор: Sirchyk May 31 2009, 11:56

Може хтось підкаже як перевірити наявність завдань????

Автор: Rilian May 31 2009, 12:00

выбери только этот проект в My Projects (и галочку get work from other projects)

а вообще, судя по графику в шапке темы, сейчас задания закончились

к тому же, сейчас идет бета-тестирование заданий типа "C" для этого проекта. После тестирования, они будут доступны (думаю в течение недели)

Автор: kornq Sep 1 2009, 19:27

Скоро закончится первая фаза проэкта, просчитано - 90,42%. Предположительно ловить задания можно будет до октября.

Автор: Rilian Sep 1 2009, 20:32

кто собирает медали - вперед!

у меня золотая уже есть

Автор: vitalidze1 Sep 1 2009, 20:37

Класний проект, але завань дуже мало роздають, 1 до 40 в порівннянні з HFCC HFC

Автор: Arbalet Sep 2 2009, 23:31

Едва-едва на серебряную медаль насчитал - мало очень вюшек падает. Одно время даже на пару дней все машины исключительно на этот проект переводил, но это не помогло. Будем надеяться, что вторая фаза будет поинтереснее, в том числе и в плане графики - пусть вернут взад энергетические графики, а то зеленые шишки ни разу не информативные.

Автор: Rilian Sep 7 2009, 14:20

ВЮ будут примерно до 15 сентября 2009

Автор: kornq Oct 10 2009, 20:48

Да когда уже они досчитают, 99,99% процентов уже пару дней подряд . Просто интересно.

Автор: Rilian Oct 10 2009, 21:15

Вчера было посчитано 5 ВЮх, сколько еще осталось знают одни тока админы WCG

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/viewProject.do?projectShortName=cep1

Автор: kornq Oct 14 2009, 20:46

А проэкт та, давно уже закончился. 12 Oct 2009 - End of The Clean Energy Phase 1 Project

Автор: Rilian Oct 14 2009, 20:54

Гуд. Значит в следующей фазе будут рассчитывать КПД лучших кандидатов, которые были найдены в фазе 1. Будем ждать (ц)

Автор: Rilian Oct 15 2009, 11:25

World Community Grid is pleased to announce that as a result of the generous contribution of computing power from our members, Phase 1 of The Clean Energy Project finished on October 13, 2009.

The project launched on December 5, 2008 and ran for less than a year. During that time over 57,000 members processed almost 2 million results which required over 2,000 years of computing power from over 121,000 computers.

With the completion of this project, our members have significantly contributed to the research of discovering new materials that efficiently harvest solar radiation for the next generation of solar cells. This research information has helped determine which materials are most promising for developing affordable solar energy technology. This same research would have taken 22 years to complete on a regular scientific cluster.

Phase 1 was designed to perform molecular mechanics calculations: Some of the computers contributing to the Clean Energy Project are carrying out molecular mechanics calculations of molecular crystals, thin films and molecular and polymer blends to study the packing arrangements and for predicting charge and excitation energy transport properties of the candidate materials. These calculations will be carried out using the CHARMM molecular mechanics package developed by the Karplus group at Harvard University.

Phase 2 of the project will perform electronic structure calculations: To obtain the relevant optical and electronic transport properties, some of the computers connected to the Clean Energy Project will be computing calculations using wave function methods (such as Hartree-Fock or second-order perturbation theory) and density functional theory. These calculations will help researchers build a database of molecular properties that together with the results of the molecular mechanics calculations will help us identify potential candidate materials. The electronic structure calculations will be performed with the Q-Chem quantum chemistry code, developed by Q-Chem, Inc.

At this time, the researchers are busy performing post-processing on the results from Phase 1 and are preparing for Phase 2. You may read about these plans and get the latest update from The Clean Energy Project Scientists in this forum thread .

On behalf of The Clean Energy Project research staff at Harvard University, USA, we wish to express our sincere gratitude to you for contributing your computer power to this project. With your contribution, this phase of the project was completed in a fraction of the time it would otherwise have taken.

пора открывать вторую ветку

Автор: Rilian Apr 20 2010, 00:04

1 фаза официально завершена

анонсирована http://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=4487