Версія даної теми для друку

Автор: Rilian Oct 15 2014, 12:17

Uncovering Genome Mysteries (UGM) - Раскрытие тайн генома



Старт проекта: 15 октября 2014

Организаторы проекта:


http://www.unsw.edu.au/ (University of New South Wales, UNSW)
http://www.cmb.unsw.edu.au/ (Centre of Marine Bio-Innovation, CMB)
http://sims.org.au/ (Sydney Institute of Marine Sciences, SIMS)
http://www.worldcommunitygrid.org/research/ugm1/researchers.do

Официальный сайт проекта: http://www.worldcommunitygrid.org/research/ugm1/overview.do

Цели и задачи проекта Uncovering Genome Mysteries

Мы прошли долгий путь – от открытия антибиотика, выделяемого из плесневого гриба пенициллиума (лат. Penicillium), который убивает патогенные микробы в нашем организме, до использования бактерий-разрушителей нефти, попадающей в окружающую среду. Теперь мы гораздо лучше понимаем то, какие преимущества дают исследования природы для сферы здравоохранения, сельского хозяйства и промышленности. Миллионы видов организмов за миллиард лет существования жизни на Земле сталкивались с необходимостью выживания во всевозможных условиях, которые только можно представить. Понимание того, как им удалось приспособиться и выработать те или иные полезные качества, может быть использовано во благо человечества. Мы уже знаем организмы, обладающие свойствами, которые могут помочь решить такие актуальные проблемы, как противостояние развитию лекарственно-устойчивых патогенных микроорганизмов, загрязнение окружающей среды и нехватка энергии. Но большинство открытий в этой области только предстоит совершить, так как множество организмов, населяющие биосферу Земли, еще не только не исследованы на генетическом уровне, но даже не определены.

Первым шагом в понимании потенциала неизвестного организма является декодирование последовательности его ДНК, в которой отдельные участки отвечают за работу тех или иных генов – «программ-алгоритмов» строительства необходимых клетке полипептидов (белков). Выявление полезных генов и соответствующих им участков ДНК – основа для любых потенциальных медицинских и промышленных применений перспективных организмов.

Достижения последних лет в области технологий секвенирования генома позволяют декодировать ДНК организмов очень быстро, идентифицируя участки с отдельными генами. Но важнейшей и очень трудоемкой задачей в этой области исследований остается понимание функций выявляемых генов и кодируемых ими белков, а также их сложнейших взаимозависимостей.

Проект «Раскрытие тайн генома» планирует помочь в решении этой задачи. Необходимо провести сравнительный анализ ок. 200 млн. генов, выявленных при секвенировании геномов ряда микроорганизмов, найденных в самых отдаленных уголках земного шара. Сравнение новых последовательностей ДНК должно помочь выявить их сходство с уже известными участками геномов, кодирующих белки с полезными свойствами.

Вычислительный масштаб поставленной проектом задачи просто ошеломляет. Это возможно только благодаря огромной суммарной вычислительной мощности участников World Community Grid, к помощи которых проект и обращается.

Организаторы проекта «Раскрытие тайны генома» обещают создать и опубликовать в открытом доступе базу данных со всей полученной информацией. Эти результаты должны помочь ученым в решении следующих задач:
1. Открытие новых функций белков и расширение знаний о биохимических процессах в целом
2. Определение особенностей взаимодействия организмов друг с другом и окружающей средой
3. Документирование исходного состояния микробного разнообразия для лучшего понимания процессов изменения микроорганизмов под действием экологических рисков
4. Понимание и моделирования сложных микробных систем
5. Более глубокое понимание микроорганизмов, их белков и ферментов, будет полезно в разработке новых лекарственных средств, новых источников возобновляемой энергии, улучшении питания, очистке окружающей среды, создании «зеленых» промышленных процессов и многом другом

Подробнее о проекте: https://secure.worldcommunitygrid.org/research/ugm1/details.do

Новости проекта: https://secure.worldcommunitygrid.org/research/ugm1/news.do

Требования проекта к ОС и железу: Windows, Linux, Mac; ок. 100 Мб оперативной памяти и 500 Мб свободного места на диске.

Скриншот графической оболочки клиента Uncovering Genome Mysteries


Бейджики проекта:

Автор: Arbalet Oct 15 2014, 16:41

Ура! Новый проект от WCG! Новые бейджи для истинных ценителей

Автор: Rilian Oct 15 2014, 17:25

я вже почав кранчити. пропоную позмагатися хто швидше отримає Sapphire

Автор: MAGADAN Oct 15 2014, 19:40

Я понимаю что аншлийский первый язык
А на родном языке что нельзя сразу шапку проекта делать , хот в общих чертах.

Автор: Arbalet Oct 16 2014, 01:36

MAGADAN, завтра шапку запилю в лучших традициях

Автор: Sergyg Oct 16 2014, 21:51

а как сделать, чтобы ТАКИЕ задания приходили? Пока вот не видно. (вообще, я так понимаю, они все приходят скопом, как сервер выбросит )

Автор: CrazyBigCat Oct 16 2014, 22:28

В своём профиле на сайте WCG в разделе My Projects можешь указать только этот проект или вместе с другими...

Автор: Sergyg Oct 17 2014, 00:10

лазил-лазил, но в упор не видел.

теперь почти сходу попал, куда надо, наверное, в подобной уверенности (в успехе) и состоит єффект плацебо))

Спасибо, CrazyBigCat !

Автор: tiss Nov 5 2014, 14:32

А можно где-то увидеть статистику по команде в данном ПОДпроекте?

Автор: Rilian Nov 5 2014, 18:48

https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/team/viewMyTeam.do

Автор: tiss Nov 5 2014, 19:29

Ну батенька я наверное какой-то не такой - дай мне скриншот того, что я прошу

Автор: LSA Nov 5 2014, 19:59

Я також не знайшов. Був у них сайт з фокусами, а зараз ледь ноги не поламав...

Автор: Rilian Nov 7 2014, 16:35

общая статистака команди есть

по юзерам - нет

НО била на одном из сайтов генерации сигнатур проекта. Попробую найти

Автор: Rilian Nov 12 2014, 15:05

накранчил на

Автор: gladiator_maximus Nov 12 2014, 15:52

а шапка где ж? месяц поди прошел.

Автор: Arbalet Nov 13 2014, 23:44

Зато уже золотой бейджик

Автор: re_SET Nov 14 2014, 11:58

Батенька, да вы задрот!!

Автор: Arbalet Nov 14 2014, 15:30

Значит я попал в правильное место!

Автор: Arbalet Dec 8 2014, 21:32

Запилил шапку - ЙО!

Автор: Rilian Dec 9 2014, 09:12

Arbalet, спасибо за отличную работу!

Автор: Arbalet Dec 9 2014, 12:03

Rilian
Мне этот проект немного Simap напоминает, так сказать подхватит выпавшее знамя

Автор: Rilian Jan 25 2015, 12:40

Автор: tiss Feb 13 2015, 08:00

Total Run Time 10:027:22:28:22