Uncovering Genome Mysteries, раскрытие тайн генома Налаштування

[Rilian]

Uncovering Genome Mysteries (UGM) - Раскрытие тайн генома



Старт проекта: 15 октября 2014

Организаторы проекта:


Университет Нового Южного Уэльса (University of New South Wales, UNSW)
Центр морских биоинноваций (Centre of Marine Bio-Innovation, CMB)
Институт морских наук Сиднея (Sydney Institute of Marine Sciences, SIMS)
Исследовательская команда проекта

Официальный сайт проекта: ugm1/overview

Цели и задачи проекта Uncovering Genome Mysteries

Мы прошли долгий путь – от открытия антибиотика, выделяемого из плесневого гриба пенициллиума (лат. Penicillium), который убивает патогенные микробы в нашем организме, до использования бактерий-разрушителей нефти, попадающей в окружающую среду. Теперь мы гораздо лучше понимаем то, какие преимущества дают исследования природы для сферы здравоохранения, сельского хозяйства и промышленности. Миллионы видов организмов за миллиард лет существования жизни на Земле сталкивались с необходимостью выживания во всевозможных условиях, которые только можно представить. Понимание того, как им удалось приспособиться и выработать те или иные полезные качества, может быть использовано во благо человечества. Мы уже знаем организмы, обладающие свойствами, которые могут помочь решить такие актуальные проблемы, как противостояние развитию лекарственно-устойчивых патогенных микроорганизмов, загрязнение окружающей среды и нехватка энергии. Но большинство открытий в этой области только предстоит совершить, так как множество организмов, населяющие биосферу Земли, еще не только не исследованы на генетическом уровне, но даже не определены.

Первым шагом в понимании потенциала неизвестного организма является декодирование последовательности его ДНК, в которой отдельные участки отвечают за работу тех или иных генов – «программ-алгоритмов» строительства необходимых клетке полипептидов (белков). Выявление полезных генов и соответствующих им участков ДНК – основа для любых потенциальных медицинских и промышленных применений перспективных организмов.

Достижения последних лет в области технологий секвенирования генома позволяют декодировать ДНК организмов очень быстро, идентифицируя участки с отдельными генами. Но важнейшей и очень трудоемкой задачей в этой области исследований остается понимание функций выявляемых генов и кодируемых ими белков, а также их сложнейших взаимозависимостей.

Проект «Раскрытие тайн генома» планирует помочь в решении этой задачи. Необходимо провести сравнительный анализ ок. 200 млн. генов, выявленных при секвенировании геномов ряда микроорганизмов, найденных в самых отдаленных уголках земного шара. Сравнение новых последовательностей ДНК должно помочь выявить их сходство с уже известными участками геномов, кодирующих белки с полезными свойствами.

Вычислительный масштаб поставленной проектом задачи просто ошеломляет. Это возможно только благодаря огромной суммарной вычислительной мощности участников World Community Grid, к помощи которых проект и обращается.

Организаторы проекта «Раскрытие тайны генома» обещают создать и опубликовать в открытом доступе базу данных со всей полученной информацией. Эти результаты должны помочь ученым в решении следующих задач:
1. Открытие новых функций белков и расширение знаний о биохимических процессах в целом
2. Определение особенностей взаимодействия организмов друг с другом и окружающей средой
3. Документирование исходного состояния микробного разнообразия для лучшего понимания процессов изменения микроорганизмов под действием экологических рисков
4. Понимание и моделирования сложных микробных систем
5. Более глубокое понимание микроорганизмов, их белков и ферментов, будет полезно в разработке новых лекарственных средств, новых источников возобновляемой энергии, улучшении питания, очистке окружающей среды, создании «зеленых» промышленных процессов и многом другом

Подробнее о проекте: https://secure.worldcommunitygrid.org/resea...ugm1/details.do

Новости проекта: https://secure.worldcommunitygrid.org/research/ugm1/news.do

Требования проекта к ОС и железу: Windows, Linux, Mac; ок. 100 Мб оперативной памяти и 500 Мб свободного места на диске.

Скриншот графической оболочки клиента Uncovering Genome Mysteries


Бейджики проекта:

Це повідомлення відредагував Arbalet: Dec 11 2014, 14:03