Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> FiND@Home, поиск лекарств от «забытых» тропических болезней
Arbalet
Dec 23 2014, 02:55
Пост #1


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



FiND@Home (FightNeglectedDiseases@Home) - «Боремся с забытыми болезнями дома»

Приєднане зображення

Организаторы проекта:

Лаборатория комплексных и адаптивных систем из Университетского колледжа Дублина, Ирландия

Официальный сайт проекта
- http://findah.ucd.ie/index.php

Описание целей и задач проекта FightNeglectedDiseases@Home

Текущей целью проекта FiND@Home является поиск целевых белков для новых противомалярийных препаратов в рамках подпроекта FightMalaria@Home.

Переоценить актуальность борьбы с малярией сложно. Страшная статистика такова: малярия убивает одного ребенка каждые 45 секунд. Заболевание наиболее распространено в бедных странах Африки, где ежегодно поражает до 216 млн. человек и убивает 650 тысяч из них, в основном - детей в возрасте до 5 лет (данные Всемирной организации здравоохранения – ВОЗ). Проблема усугубляется тем, что возбудитель заболевания - малярийный плазмодий Plasmodium falciparum, который передается с укусами малярийных комаров, стремительно приспосабливается к имеющимся лекарственным препаратам. Поэтому очень важно не прекращать поиск новых лекарственных средств, ориентированных на «выключение» новых белков в клетках организма паразита.

Геном малярийного плазмодия успешно секвенирован, его протеом (набор белков) известен. Доступны модели кристаллических структур многих целевых белков Plasmodium falciparum, а оставшиеся без таковых - могут быть смоделированы с использованием имеющихся структурных шаблонов. Крупные научно-исследовательские организации (GSK, Novartis) уже опробовали миллионы соединений и отсеяли из них 19 тысяч «хитов» - потенциально эффективных лекарственных молекул, которые показывают многообещающую активность в отношении малярийного плазмодия (MMV). Но они еще не знают, какие целевые белки плазмодия ингибируется этими соединениями. Разработка новых лекарственных средств будет значительно ускорена, если будет известен целевой белок для каждого из обнаруженных «хитов».

Исследователи в рамках проекта FiND@Home планируют провести молекулярное моделирование докинга (стыковки) каждого из обнаруженных 18924 хитов-соединений с каждым из 5363 белков, содержащихся в малярийном плазмодии. Требуемая для выполнения этой задачи вычислительная мощь поистине колоссальна и организаторам проекта крайне необходимы компьютерные ресурсы участников распределенных вычислений со всего мира, использующих BOINC-платформу для помощи научным исследованиям.

Результаты проекта FightMalaria@Home: полная база полученных результатов доступна на данном сайте - http://chemware.ucd.ie/FiNDaH/Malaria.php

Добавить проект в BOINC-менеджере можно по ссылке - http://findah.ucd.ie/

Ссылка на команду Ukraine в статистике проекта FiND@Home - http://findah.ucd.ie/team_display.php?teamid=21


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
2 Сторінки V  1 2 >  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(1 - 14)
Arbalet
Dec 23 2014, 03:02
Пост #2


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Задания коротенькие - считаются по две минуты, заданий на сервере море. koc.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Dec 25 2014, 02:23
Пост #3


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 428
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



все разобрали и пишут проджект андер майнтенанс


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Jan 12 2015, 01:22
Пост #4


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Проект ожил, чтобы сообщить об окончании исследований. Грустно, но оптимистично. smile.gif

Расчетные данные подпроекта FightMalaria@Home теперь будут доступны в Интернете

Вот по этой ссылке - http://chemware.ucd.ie/FiNDaH/Malaria.php

Реализован очень удобный поиск по лигандам и рецепторам, с выдачей всех полученных результатов, чтобы заинтересованные исследователи со всего мира уже более целенаправленно искали новые противомалярийные препараты.

Пока на представленном сайте доступны первые 400 соединений (перспективных лекарственных молекул) из пакета MMV400 (MalariaBox), которые по базе можно посмотреть на эффективность связывания с белками малярийного плазмодия. Завершаются последние расчеты для оставшихся 19 тыс. соединений из MMV19K, которые позже будут добавлены на сайт.

По результатам проведенных расчетов готовится статья, на которую понадобится чуть больше времени, чем ожидалось. Как закончат - сообщат отдельно.

Выражают большую признательность всем участникам проекта. Надеются, что результаты будут полезны и приведут к появлению новых эффективных лекарств, а также - к открытию новых перспективных целевых белков малярийного плазмодия, которые можно использовать для создания таковых.

koc.gif

ЗЫ: На мой взгляд, образцово показательный проект, хотя мы почти и не успели поучаствовать - припозднились... Зато все результаты максимально открыты и доступны - пользуйся на здоровье. thumbsup.gif

Надеюсь, будет продолжение в виде новых исследований. Поэтому пока в завершенные переносить не буду.


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Jan 14 2015, 00:36
Пост #5


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



ves001.gif worthy.gif yahoo.gif
Запустили 3 192 552 новых WU! swoon.gif

Надо бы поднять команду в статистике, пока не прикрыли лавочку! Мы пока на 28 месте koc.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Death
Jan 14 2015, 02:29
Пост #6


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 428
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



14-Jan-15 02:26:31 | FiND@Home | Scheduler request completed: got 80 new tasks



Computing status

Work #
Tasks ready to send 755
Tasks in progress 104,894


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Jan 21 2015, 13:49
Пост #7


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Фсьо - задания просчитаны, подняли с камрадами Ukraine до 24-го места, с чем команду и поздравляю! drinks2.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 21 2015, 13:50
Пост #8


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 333
З нами з: 22-February 06
З: Ванкувер
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



странно, у меня есть 10к в єтом проекте. может страничка проекта тут єто дубликат старой теми?


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Jan 21 2015, 14:30
Пост #9


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



(Rilian @ Jan 21 2015, 13:50) *

странно, у меня есть 10к в єтом проекте. может страничка проекта тут єто дубликат старой теми?

Перед созданием темы, я пытался найти похожую по ключевым словам, но не преуспел.


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Jan 27 2015, 23:27
Пост #10


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Еще подкинули заданьев - захомячился, считаю koc.gif
Надо команду пропампить, пока есть такая возможность!


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Feb 3 2015, 23:37
Пост #11


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Новая огромная партия заданий - 8,310,176 WUs! swoon.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 11 2015, 22:45
Пост #12


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



хе-хе, один компик 2010года (односокетный) даёт 30k в сутки wink2.gif
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Feb 17 2015, 09:15
Пост #13


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



похоже, разные задания ОЧЕНЬ разного времени счёта



-------------

любопытно, 0,36% от этих 8,310,176 WUs уже капнуло мне (при том, что задействованы откровенно скромные мощности). Думается, в этом проекте на данный момент нет мастодонтов, подключенных к гектару ветряков ))
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Feb 20 2015, 21:43
Пост #14


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



Останавливают сервер до следующей недели. В понедельник пойдет раздача оставшихся 3 млн. заданий.


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Arbalet
Feb 23 2015, 20:40
Пост #15


Штандартенкранчер
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 2 656
З нами з: 16-August 05
Користувач №: 119
Стать: Чол
Парк машин:
Расово верная продукция AMD & ATI: FX-8320 + Phenom II X6 1090T + HD5870 + HD5770



У них там оказывается случилась авария базы данных, но уже пофиксили - идет обещанная раздача 3 млн. тасков! ves001.gif


--------------------
(Show/Hide)


My asteroids: 1150 Achaia, 1643 Brown, 3286 Anatoliya

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

2 Сторінки V  1 2 >
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 26th July 2017 - 00:36

Rambler's Top100 Рейтинг@Mail.ru
Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.