Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Help Fight Childhood Cancer, проект по подбору лекарств от нейробластомы (рак)
Rilian
Mar 8 2009, 00:08
Пост #1


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



IPB Image
IPB Image

Помоги в борьбе с детским раком / Help Fight Childhood Cancer

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid thumbsup.gifWorld Community Grid рада объявить о запуске проекта Help Fight Childhood Cancer под руководством Института по Исследованию Рака в Чибо (Япония), а также Университета Чиба (префектура Чиба, Япония). Миссия проекта - найти лекарства которые смогут заблокировать три вида белков обычно связываемых с развитием Нейробластомы (вид рака) - одного из видов плотных опухолей которые чаще всего развиваются у детей. Нахождение лекарств, блокирующих эти белки, позволит более эффективно лечить этот вид опухоли с помощью химиотерапии. Нейробластома проявляется чаще всего в раннем детстве и обычно ведет к смерти. Если проект будет удачным, он может привести к прорыву в исследованиях этой болезни, которая до сих пор не поддавалась ученым, и это позволит намного увеличить шансы на лечение нейробластомы.

В новой фазе проекта, запущеной в Августе 2010, исследуется 3 дополнительных цели
После этого ввиду успешност экспериментов добавлено еще 3 цели. Итого на апрель 2012 года рассчитано 8 целей, и еще 1 на очереди

Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках World Community Grid и один из 7 (на момент запуска) которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум World Community Grid.

Часто задаваемые вопросы по проекту:

Что такое нейробластома?
Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком.

Что вызывает нейробластому?
Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны.

Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer?
Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии.

Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer?
Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы.

Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid?
На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года!

Что изображено на скринсейвере?
Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.

IPB Image
Скриншот графического клиента


Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте?
Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми:

* "Лев"
IPB Image
* "Розовые семена"
IPB Image
* "Упражнения по радио"
IPB Image

График производительности проекта:
IPB Image

Це повідомлення відредагував Rilian: Apr 16 2012, 21:20
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
20 Сторінки V < 1 2 3 4 > »   
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(15 - 29)
Rilian
Mar 18 2009, 01:32
Пост #16


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Поздравляем Freesom с ацким ППД 20000 очков, а также с бронзовой медалью в этом проекте

http://www.worldcommunitygrid.org/stat/vie...serName=Freesom


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 18 2009, 02:06
Пост #17


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



В проекте посчитано 80000ВЮ, что составляет 80000/9000000=0.88% и каждый день сейчас считается 25000ВЮ = 0.25% проекта!

Такими темпами проект будет завершен через 400 дней. Можно начинать педалить smile.gif


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Tamagoch
Mar 18 2009, 07:57
Пост #18


Мультікранчер
********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 744
З нами з: 27-September 03
З: Бровари
Користувач №: 18
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Xeon 2690v2 (6x quiet mode), AMD Ryzen 5 3600 (6x no-HT), Intel i5 3rd gen (4x), а також все інше під рукою



Rilian,
ты считаешь 3 миллиона соединений на три белка, которые проверяются по очереди (сейчас к примеру педалим TrkB), но вот бардак с кворумом вообще сбивает с толку, то 1 то 2, наверное если это учитывать, будет еще больше фактических расчетных заданий.... только не понятно как учитывать smile.gif


--------------------
(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Red-O
Mar 18 2009, 08:29
Пост #19


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 105
З нами з: 12-November 07
З: Бровари
Користувач №: 645
Стать: Чол
Парк машин:
Щось вдома, щось на роботі... 50/50



(Tamagoch @ Mar 18 2009, 07:57) *
но вот бардак с кворумом вообще сбивает с толку, то 1 то 2
Так а як воно у них взагалі з нарахуванням очків?
Ну написано "Statistics are unavailable until within 24 hours after returning your first result to the server."
Так вже вчора ввечері воно само показувало "Last Result Returned ... 24+ hour(s) ago"
на перший результат, зараз вже "12+ hour(s) ago" на другий, тобто вже ну точно быльше 24 годин. А досі нічого не показує, в магнетизмі хоч "pending" висять.
Як вкинуло перше завдання, то хоч почало показувати "Device installation 1", до того 0 було.
Тобто щось воно там собі рахує, а коли мені покаже? wink2.gif
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
lividum
Mar 18 2009, 08:39
Пост #20


кранчер-новачок
***

Група: Trusted Members
Повідомлень: 39
З нами з: 27-May 08
Користувач №: 749
Стать: Чол
Парк машин:
Core 2 Quad 6600 (3400) Asus P5K PRO RAM 4GB Geforce GTX470 Hitachi 500 GB WD 1000 GB



люди, а проект вообще работает? а то постави галочку на этом проекте, но мне почему то по прежнему идут только ВЮ от Хелп конквир Кансер...может еще что-то сделать надо?
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Tamagoch
Mar 18 2009, 09:17
Пост #21


Мультікранчер
********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 744
З нами з: 27-September 03
З: Бровари
Користувач №: 18
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Xeon 2690v2 (6x quiet mode), AMD Ryzen 5 3600 (6x no-HT), Intel i5 3rd gen (4x), а також все інше під рукою



может убери галочку с HCC вообще
проект-то работает, начисление очков по всем проектам тут


--------------------
(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Red-O
Mar 18 2009, 09:47
Пост #22


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 105
З нами з: 12-November 07
З: Бровари
Користувач №: 645
Стать: Чол
Парк машин:
Щось вдома, щось на роботі... 50/50



(Tamagoch @ Mar 18 2009, 09:17) *
начисление очков по всем проектам тут
Тю, наче вранці там ще порожньо було. Зараз нормально - ті завдання чекають підтвердження.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
lividum
Mar 18 2009, 09:54
Пост #23


кранчер-новачок
***

Група: Trusted Members
Повідомлень: 39
З нами з: 27-May 08
Користувач №: 749
Стать: Чол
Парк машин:
Core 2 Quad 6600 (3400) Asus P5K PRO RAM 4GB Geforce GTX470 Hitachi 500 GB WD 1000 GB



о...только что посмотрел в список жаб, есть одно задание из нового проекта...знач все ок
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 18 2009, 11:03
Пост #24


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(Tamagoch @ Mar 18 2009, 07:57) *

Rilian,
ты считаешь 3 миллиона соединений на три белка, которые проверяются по очереди (сейчас к примеру педалим TrkB), но вот бардак с кворумом вообще сбивает с толку, то 1 то 2, наверное если это учитывать, будет еще больше фактических расчетных заданий.... только не понятно как учитывать smile.gif

С кворумом все ок, каждый комп периодически проверяется так:

комп рандомно выбирается из списка непроверенных и копия ВЮ, которую он посчитал, высылается на заведомо проверенный комп. Если ВЮ валидируется, то все ок. Если у компа последние 15 ВЮ валидны, он заносится в список правильных компов и его кворум становится всегда 1 (до первой ошибки, конечно)


QUOTE(lividum @ Mar 18 2009, 09:54) *

о...только что посмотрел в список жаб, есть одно задание из нового проекта...знач все ок

в первый день очень мало человек на официальном форуме жаловались что им не приходят задания ХФЦЦ. Сейчас таких жалоб нет. У меня стоит галочка на ХФЦЦ, а также "получать ВЮ других проектах если в выделенных нет заданий" и пока все ВЮ что приходят - ХФЦЦшные rilian.gif

У меня уже серебрянная медалька за 45 процессорных дней (иду со скоростью 12 в день!) IPB Image


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
lividum
Mar 18 2009, 17:56
Пост #25


кранчер-новачок
***

Група: Trusted Members
Повідомлень: 39
З нами з: 27-May 08
Користувач №: 749
Стать: Чол
Парк машин:
Core 2 Quad 6600 (3400) Asus P5K PRO RAM 4GB Geforce GTX470 Hitachi 500 GB WD 1000 GB



Rilian,

а мне вот только 1 пришла, комп ее посчитал и больше нету.

а если сделать как у тебя то будут какой-нибудь рис присылать, а если даже и нет, то Конквир Кансер тоже ж считать нужно...что придется чередовать их что ли...какая то система не гибкая...нет чтоб отслеживалась загрузка донора и прсылались апример напополам задания в выбраных проектах, например 4 ядра работают, так по 2 задания на них с двух проектов.

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 18 2009, 18:07
Пост #26


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Увеличь кэш и убери галку "получать другие задания" (и проверь что у тебя галка поставлена только на HFCC)

У меня стабильно приходят ВЮ HFCC, еще ни одной левой не было smile.gif Вообще, дефицита нет, проверяй настройки


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 19 2009, 10:24
Пост #27


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Таки-да, за ночь поймал 2 ВЮ из других проектов. В процентном соотношении это примерно 0.5% других ВЮ

Еще на оф форуме я прочитал что если у вас явно выбран один проект, то его приоритет для вашего компа повышается и соответственно понижается для тех у кого выбрано несколько проектов. Поэтому ВЮ в первую очередь идут тем кто выбрал проект, а остальным - как останется. Таким образом контроллируется общее распределение ВЮ по всем компам


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Tamagoch
Mar 19 2009, 22:07
Пост #28


Мультікранчер
********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 1 744
З нами з: 27-September 03
З: Бровари
Користувач №: 18
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Xeon 2690v2 (6x quiet mode), AMD Ryzen 5 3600 (6x no-HT), Intel i5 3rd gen (4x), а також все інше під рукою



пять минут назад смотрел - 8.5% задания было выполнено, только что включил - 7.9%
т.е., процесс иногда откатывается при неудачной попытке просчета части задания? раньше не замечал...


--------------------
(Show/Hide)

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 19 2009, 22:18
Пост #29


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Я тоже не замечал. Посмотри потом лог, когда ВЮ зальется на сайт. Если будет чето интересное, пиши


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Mar 19 2009, 23:19
Пост #30


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Поздравляем Vitalidze1 с бронзовой медалькой за 2 недели рассчетов: IPB Image


--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

20 Сторінки V < 1 2 3 4 > » 
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 19:31

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.