Superlink@technion, Анализ Генов Налаштування

[nikelong]

Проект "Superlink@technion"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

• Официальный сайт
• Официальная статистика по команде "Ukraine"
• Статистика на фришниках
• Статистика на фришниках по команде "Ukraine"
• Статус серверов проекта

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников:

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 10.08.2007 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://cbl-boinc-server2.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------


О проекте:
Поиск и исследование генов, вызывающих такие болезни, как гипертония (повышенное кровяное давление), некоторые формы диабета, рак, шизофрения и многие другие.
Superlink@Technion помогает генетикам выполнять генетический анализ соединения, который является статистическим методом, используемым, чтобы связать функциональность генов с их местоположением на хромосомах.
Super Link является проектом по биологии и компьютерных наук факультета израильского технологического института (Technion).

Ссылки по теме:

• Superlink@EGEE queue
• Superlink@clusters

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

Projrank Team Score
102 Ukraine 27,878

http://www.boinc-af.org/content/view/638/219/
http://www.dp.by/wiki/Projects/Superlinkattechnion

http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Superlink%40Technion/en

http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...perlinktechnion
http://distributed.ru/wiki/pro:superlink

Це повідомлення відредагував nikelong: Dec 26 2010, 23:45

[(_KoDAk_)]

04.07.2008 10:24:10|superlinkattechnion|Sending scheduler request: Requested by user
04.07.2008 10:24:10|superlinkattechnion|(not requesting new work or reporting completed tasks)
04.07.2008 10:24:15|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 10:25:36|superlinkattechnion|Computation for task superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_91419_0 finished
04.07.2008 10:25:38|superlinkattechnion|[file_xfer] Started upload of file superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_91419_0_0
04.07.2008 10:25:40|superlinkattechnion|Sending scheduler request: To fetch work
04.07.2008 10:25:40|superlinkattechnion|Requesting 547678 seconds of new work
04.07.2008 10:25:45|superlinkattechnion|[file_xfer] Finished upload of file superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_91419_0_0
04.07.2008 10:25:45|superlinkattechnion|[file_xfer] Throughput 19231 bytes/sec
04.07.2008 10:25:45|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 10:25:47|superlinkattechnion|Starting superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95929_0
04.07.2008 10:25:47|superlinkattechnion|Starting task superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95929_0 using loadd version 117
04.07.2008 10:25:51|superlinkattechnion|Sending scheduler request: To report completed tasks
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 93.5% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 9.1% of that
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Deferring communication for 1 min 0 sec
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Reason: no work from project
04.07.2008 12:48:06|superlinkattechnion|Computation for task superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95249_0 finished
04.07.2008 12:48:08|superlinkattechnion|[file_xfer] Started upload of file superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95249_0_0
04.07.2008 12:48:08|superlinkattechnion|Sending scheduler request: To fetch work
04.07.2008 12:48:08|superlinkattechnion|Requesting 557402 seconds of new work
04.07.2008 12:48:14|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 12:48:15|superlinkattechnion|[file_xfer] Finished upload of file superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95249_0_0
04.07.2008 12:48:15|superlinkattechnion|[file_xfer] Throughput 20828 bytes/sec
04.07.2008 12:48:16|superlinkattechnion|Starting superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_99119_0
04.07.2008 12:48:16|superlinkattechnion|Starting task superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_99119_0 using loadd version 117
04.07.2008 12:48:19|superlinkattechnion|Sending scheduler request: To report completed tasks
04.07.2008 12:48:24|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 12:48:24|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
04.07.2008 12:48:24|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 93.5% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 9.1% of that
04.07.2008 12:48:24|superlinkattechnion|Deferring communication for 1 min 0 sec
04.07.2008 12:48:24|superlinkattechnion|Reason: no work from project
04.07.2008 13:33:32|superlinkattechnion|Computation for task superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95929_0 finished
04.07.2008 13:33:35|superlinkattechnion|[file_xfer] Started upload of file superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95929_0_0
04.07.2008 13:33:35|superlinkattechnion|Sending scheduler request: To fetch work
04.07.2008 13:33:35|superlinkattechnion|Requesting 548666 seconds of new work
04.07.2008 13:33:39|superlinkattechnion|[file_xfer] Finished upload of file superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_95929_0_0
04.07.2008 13:33:39|superlinkattechnion|[file_xfer] Throughput 22332 bytes/sec
04.07.2008 13:33:40|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 13:33:42|superlinkattechnion|Starting superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_99779_0
04.07.2008 13:33:42|superlinkattechnion|Starting task superlink_wu_26_06_2008_05_30_24_99779_0 using loadd version 117
04.07.2008 13:33:46|superlinkattechnion|Sending scheduler request: To report completed tasks
04.07.2008 13:33:51|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
04.07.2008 13:33:51|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
04.07.2008 13:33:51|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 93.6% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 9.1% of that
04.07.2008 13:33:51|superlinkattechnion|Deferring communication for 1 min 0 sec
04.07.2008 13:33:51|superlinkattechnion|Reason: no work from project


пашет тока он один
в настройках кеш 3дня

[YuRi]

Меня другое удивляет: в логе я не увидел ни одной загрузки задачи, тогда как по статистике твоих результатов они все-таки загружались. Может, здесь - как в Эйнштейне: загружается большой объем исходных данных, из которых уже "нарезаются" задачи? Но тогда все равно должно быть сообщение, что клиент получил для расчета такую-то задачу. А у тебя я этого не вижу.
По ходу: у тебя какая-то старая версия БОИНКа? Потому что моя ругается совсем по-другому:

04.07.2008 12:21:55 | Milkyway@home . . . | Sending scheduler request: To report completed tasks. Requesting 0 seconds of work, reporting 1 completed tasks
04.07.2008 12:22:10 | Milkyway@home . . . | Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
04.07.2008 12:32:45 | SETI@home . . . . . . | Computation for task 29fe08ab.9741.14387.12.8.147_1 finished
04.07.2008 12:32:45 | SETI@home . . . . . . | Starting 02mr08ac.1998.12919.9.8.9_0
04.07.2008 12:32:45 | SETI@home . . . . . . | Starting task 02mr08ac.1998.12919.9.8.9_0 using setiathome_enhanced version 528
04.07.2008 12:32:47 | SZTAKI Desktop Grid | Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 105842 seconds of work, reporting 0 completed tasks
04.07.2008 12:32:48 | SETI@home . . . . . . | Started upload of 29fe08ab.9741.14387.12.8.147_1_0
04.07.2008 12:32:51 | SETI@home . . . . . . | Finished upload of 29fe08ab.9741.14387.12.8.147_1_0
04.07.2008 12:32:53 | SZTAKI Desktop Grid | Scheduler request succeeded: got 0 new tasks
04.07.2008 12:32:58 | Milkyway@home . . . | Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 42277 seconds of work, reporting 0 completed tasks
04.07.2008 12:33:22 | . . . . . . . . . . . . . . .|Project communication failed: attempting access to reference site
04.07.2008 12:33:23 | Milkyway@home . . . | Scheduler request failed: Couldn't connect to server
04.07.2008 12:33:25 | . . . . . . . . . . . . . . .|Access to reference site succeeded - project servers may be temporarily down.
04.07.2008 12:33:28 | SETI@home . . . . . . | Sending scheduler request: To fetch work. Requesting 96524 seconds of work, reporting 13 completed tasks
04.07.2008 12:33:39 | SETI@home . . . . . . | Scheduler request succeeded: got 20 new tasks
04.07.2008 12:33:41 | SETI@home . . . . . . | Started download of 27my08af.12155.22567.10.8.208
04.07.2008 12:33:41 | SETI@home . . . . . . | Started download of 27my08af.12155.22567.10.8.225
04.07.2008 12:33:57 | SETI@home . . . . . . | Finished download of 27my08af.12155.22567.10.8.208
04.07.2008 12:33:57 | SETI@home . . . . . . | Started download of 27my08af.12155.22567.10.8.214
04.07.2008 12:33:58 | SETI@home . . . . . . | Finished download of 27my08af.12155.22567.10.8.225
04.07.2008 12:33:58 | SETI@home . . . . . . | Started download of 27my08af.12155.22567.10.8.165

[(_KoDAk_)]

03.07.2008 23:28:29||BOINC 6.1.0.32 v5 - 32 bit Windows Edition by Crunch3r
03.07.2008 23:28:29||Platform: windows_intelx86
03.07.2008 23:28:29||enabled features:
03.07.2008 23:28:29||-cpu_affinity
03.07.2008 23:28:29||-delayed return_results_immediately (1 min)
03.07.2008 23:28:30||log flags: task, file_xfer, sched_ops
03.07.2008 23:28:30||Libraries: libcurl/7.16.4 OpenSSL/0.9.8e zlib/1.2.3

реально ано чуш гонир провремя работы ( 14 мин а не часов) все еше ЁЁ фактическое время выаолнеия задание 2-3 часа но CPU Time не больше 14-16 мин и опять с 0
или вариант меня мегв плбщит

[(_KoDAk_)]

и вот вам результат мы уже 120)
и что уще удивительно папка спроектом весит 640 кб и таки при старте нового задания закачни таки нет

[(_KoDAk_)]

CPU time (sec) claimed credit granted credit
58,320.00 460.92 72.00
что ваше ужас

[Rilian]

ппц 460.92 -> 72.00

[(_KoDAk_)]

так щас там 76е место
а дальше если он в dc-vault попадет) или настроение ....

[nikelong]

Superlink@EGEE queue
http://cbl-boinc-server2.cs.technion.ac.il/cplan/

Superlink@clusters
http://cbl-boinc-server1.cs.technion.ac.il...linkatclusters/

Це повідомлення відредагував nikelong: Oct 9 2008, 16:22

[Death]

Account creation disabled

Participants total 7
Computers total 12497

[Death]

в ноябре ВУ кончились.

[Death]

We are happy to announce the completion of another batch. As before, there are two different issues on which we want to conclude. The first is the throughput. Thanks to our crunchers we broke all our previous records with the landmark 3.5 mlns jobs in 3 weeks. It is a real success and we are grateful to each and everyone of you who took part in this computation.

The second issue is the genentics. Here the news is not so good. Unfortunately, the results didn't show any significant signal of mutation. This data was collected to study a kidney disease, and we changed it to find whether there is any chance to detect the single provided that we gather more data from the population. The answer is no. Another point is that it shows that in this case the application of another quite popular alternative algorithm wouldn't help, prompting that Superlink employs the right algorithm for computations.

The problem that really troubles us is that we failed to catch incorrect results. Namely, after the analysis it is clear that our system didn't catch 10 (out of 3.5 mlns) jobs that returned incorrect result ( it is clear that the result is infeasible from the numerical point of view) We will work to find the problem and eliminate it before the next batch is submitted.

Yet another issue that will be handled BEFORE the next batch is the one of further improvement of the scheduling backend to increase its scalability to the future uses.

Thanks again to all the participants!!

Mark and Artyom

Вобщем и цедом они снчала хотят снизить нагрузку на сервер (3.5М ву за 3 недели).
И плохая новость - программа не показала каких-либо генетических изменений, которіе они хотели найти. Поєтому они будут менять программу, прежде чем пустят новіе ВУ.

[Death]

пошли новые вушки ))
30минут - 1час.

[Rilian]

Присоединился

заданий пока нет (хотя на сайте неск тысяч ждут)

[Rilian]

Есть задания!

[Death]

Opportunities
Rank Team Score Average Daily Gain Days to Overtake
101 SKGiven 29,441 0 4 444.24
100 Geocaching 29,699 0 4 480.90

4 очка в сутки и будем ползти до сотни 444 дня.
4000 очков в сутки и мы будем в топ100 уже сегодня.

1 квад на неделю нас бы спас )))))