Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Fold It, Онлайн-игра по свертыванию белков
(_KoDAk_)
May 10 2008, 09:35
Пост #1


BOINC-guru
*********

Група: Moderators
Повідомлень: 3 714
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям





Проект "FOLD It"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт

Статистика по команде "Ukraine"

wiki по стратегии
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 10.05.2008 Капитан - KoDAk


О проекте:
Теперь в фолдинг белков можно играть

Инструкция по установке под Linux (fold.it linux setup) находится ниже

14.05.2008 [06:08], Арсений Герасименко
На страницах новостной ленты 3DNews мы не раз освещали достижения участников Folding@Home, проекта распределенных вычислений, объединяющего мощности сотен тысяч персональных ПК по всему миру. Сегодня же хочется рассказать об очень интересной разработке ученых Вашингтонского университета, которые превратили невероятно сложный процесс сворачивания белков в увлекательную игру.

Итак, программный продукт Fold.it позволяет практически любому пользователю в трёхмерном режиме создать наиболее рациональную модель сворачивания белка. Нужно сказать, что сам процесс сворачивания (фолдинга) по своей сути очень сложный, для для его расчета требуется много времени и ресурсов ПК. Как известно, многие пользователи во всем мире тратят огромное количество времени на практически бессмысленные электронные забавы. В свою очередь, Fold.it позволяет провести десятки человеко-часов с пользой для медицины и фармацевтики. Согласно имеющимся данным, в ближайшем будущем эта программа сможет получать данные о требующих изучения протеинах. Подобно Folding@Home, результаты можно будет отправить с помощью интернета в центр обработки.

Теперь в фолдинг белков можно играть

Напомним, что накопление знаний о свойствах белков может поспособствовать поиску лекарств от таких недугов как рак, болезнь Альцгеймера и даже СПИД. Согласитесь, спасти мир играючи – неплохая перспектива. Поиграть в фолдинг белков смогут как пользователи платформы Windows, так и Mac. Для этого нужно лишь зарегистрироваться и скачать файл объемом 53 Мб.

FOLD.IT Linux - запускаем под линуксом

1. для начала надо установить WINE
sudo apt-get install wine

2. качаем инсталяху Fold.It к себе в директорию
cd ~/some/dir; wget http://fold.it/portal/files/app/Fold%20It!.exe

3. запускаем установщик с помощью wine
wine "Fold It!.exe"

4. подтверждаем что хотим установить в C:\Program Files\foldit smile.gif
5. next -> next -> finish
6. в конце установки будет галочка "launch fold.it" - нажимаем ее и ОК
7. готово!

(Show/Hide)



http://www.boinc-af.org/content/view/942/219/

http://elementy.ru/news?newsid=431388

Це повідомлення відредагував nikelong: Sep 3 2010, 10:03
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
4 Сторінки V < 1 2 3 4 >  
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(30 - 44)
Sergyg
Jul 29 2009, 22:28
Пост #31


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



http://fold.it/portal/buddylist
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Aug 4 2009, 13:58
Пост #32


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



EKONOMIST , а че - Сохраненные для группы (мной) решения не загружаются?
Чего то сам не пойму: сегодня сохранял новые, а в списке в окне слева - не появляются...
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
EKONOMIST
Aug 4 2009, 14:26
Пост #33


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 87
З нами з: 12-January 09
Користувач №: 902
Стать: Чол
Парк машин:
Дабл-дуб e5200 8800GTS (g80) Два дуба e4600 9600GSO (g92) Atom n450



Наверное с серваком что-то. Я тоже седня с утрячка посохранял на новых пазлах, а расшарить группе не смог - показывает "аплоад" и все idontno.gif


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Aug 5 2009, 01:29
Пост #34


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



пока не сохраняет...
и ещё глюк /думаю, через время оно одумается smile.gif / в забеге 176 до 15 и до150 заслуги EKONOMISTа пока не учтены - 0 очков за высокие места в итоге. Такое бывало и раньше, временно тупит их счетная система ...
--------------
в этом есть и "+" у тебя уже более 150 очков, но пока оно не сочитало - можно было бы успеть поучаствовать в забеге для до_150 (у мну такое было), жаль щас нет кажись нужного задания...
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
EKONOMIST
Aug 5 2009, 06:55
Пост #35


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 87
З нами з: 12-January 09
Користувач №: 902
Стать: Чол
Парк машин:
Дабл-дуб e5200 8800GTS (g80) Два дуба e4600 9600GSO (g92) Atom n450



Т.е. как это не учтены? Я вроде как по всем текущим в верхах нахожусь. У меня все отображается - кол-во очков за молекулу (как мне, так и команде, где я ее выводил) в списках, когда играешь.

Может, до речи, эт такая особенность текущих заданий? Типа сделай сам?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Aug 5 2009, 10:51
Пост #36


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



Ы, ну вот верх статистики команды:
181: Mini-CASP 1c - 10,033 - 08:45
180: Mini-CASP 1b - 9,942 - 08:45
179: Mini-CASP 1a - 9,949 - 08:45
176: Quest to the Native 9 13 10,104 2 Yesterday
178: Core and Tail Design 11 9,928 2 08/03
177: Freestyle Design 80 12 9,432 1 07/31
176 (<15): Quest to the Native 9 1 10,072 0 07/30
175: More Interface Design 15 10,045 1 07/29
176 (<150): Quest to the Native 9 7 10,048 0 07/29
174: More Core Design 13 10,491 2 07/29

я понимаю, шо оно тут плохо размещается,
для 176 (<150) и 176 (<15) у команды 0 баллов (Points ). Ну за 1-е место (в 176 (<15)) - должны были баллов 5 дать. Можешь апрель-май команды посм. А у тебя лично - да, все там правильно, я просто думал, что места были заняты повыше smile.gif

и цифра заработанных очков в таблице команд и на странице внутрикомандной статистики - всегда немного различаются smile.gif /вторая отстает/

ЗЫ: EKONOMIST - чемпиён! winner.gif
/может ті ишо и мануал читал? а то мне в чате пиплі советовали, но пока я не../
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
EKONOMIST
Aug 5 2009, 11:35
Пост #37


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 87
З нами з: 12-January 09
Користувач №: 902
Стать: Чол
Парк машин:
Дабл-дуб e5200 8800GTS (g80) Два дуба e4600 9600GSO (g92) Atom n450



Да ну ее нах ихнюю статистику. Легче китайский выучить, чем в ней разбираться. Я подумал просто, что все сбросилось, когда GPU фолдинг систему повесил как раз на моменте сохранения, а проверять не стал уже - спать ушел.

В разговорном англицком я силен немного, но их терминология иногда даже промт в ступор приводит (я даже обучалку не до конца прошел из-за этого), так что я тоже пас.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
EKONOMIST
Aug 10 2009, 20:09
Пост #38


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 87
З нами з: 12-January 09
Користувач №: 902
Стать: Чол
Парк машин:
Дабл-дуб e5200 8800GTS (g80) Два дуба e4600 9600GSO (g92) Atom n450



Вот уже несколько раз наблюдаю 6e047365df22.gif странный момент - кто-то поднимает страну по очкам, но в списке при этом нет ни одного плаера с таким достижением, играющего за юкрэйн (понятно huh1.gif, что кроме Sergyg'a некому, его кстати в такие моменты тоже в списках не бывает sarcastic.gif ). В партизаны записались, товарисч? ph34r2.gif
З.ы. В последнем пазле жжете, прям атака sidechain-клонов undertable.gif


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Aug 11 2009, 18:02
Пост #39


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



Гі, єта йа и есть biggrin.gif
просто не знал, шо ты не знаешь,
што если я загружаю твой результат (сохраненный), то он загружается, но я должен на 1 очко его улучшить и тогда результат мне присваивается. smile.gif
Но не совсем присваивается: в рейтингах soloist у меня сохраняются только мои достижения, а после улучшение твоего - єтот балл записівается мне в рейтинг evolver (раньше я вообще не знал, откуда єти євольверы берутся).
Главный момент здесь в том, что балл команды растет.
Неужели ты не загружал мой результат (если он выше твоего), то пока ты на балл не улучшишь его, он зачеркнут, а далее - растет, но ты автоматически их солистов переходишь в эвольверы. А в исходном списке участников - отображены солисты.
ЗЫ: обычно максимальный результат эвольверов выше, чем солистов.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Dec 3 2009, 17:29
Пост #40


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



што та мало активности... вот скатились с 17 на 19-е место /так и есть - больше всего очков могут приносить учёные-химики (а также физики, ибо процесс физизико-химический smile.gif ) , у которых мало очков, до 150. Чтобы участовать в забегах, где нет монстров фолдинга biggrin.gif
думаю, мировой мозг гуманоидов пока превосходит вычислительные способности даже 48 ядерного процессора. Хотя бенчмарков и не встречал. Только опосредованные предположения
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
uNiUs
Dec 12 2009, 02:26
Пост #41


Rosetta@Home капитан
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 173
З нами з: 17-June 07
З: Zp.ua
Користувач №: 529
Стать: Чол
Free-DC_CPID



Решил тут немного поднять рейтинг команды - в номинациях <15 и <150 несложно первые места занимать. Так эти редиски мне сразу 300 очков припаяли. blink.gif За что они меня так? Вроде ж ничего плохого не делал... Всего пару дней поиграл... ph34r2.gif
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Dec 12 2009, 19:58
Пост #42


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



Вітаємо ветеранів! drinks2.gif /а где тут картинко, как мы в 4-м классе ходили ветеранов поздравлять, только нашли или нет -не помню telephone.gif /

А што ж ты так неосторожно? вроде, все по-честному - занял высокие места, за что и очков припаяли. Более того, из-за дискретности начисления тебе удалось сразу участвовать в нескольких забега (для начинающих shuffle.gif ), по завершении которых начислили много очков.
Похоже, теперь команде вообще не начисляют в "молодежных состязаниях". (уже ЭКОНОМИСТу - не давали командных)

Но во "взрослом" забеге ты заработал 6 очков команде winner.gif
___________________
с течением времени (ч/з пару мес.) кол-во очков у тебя уменьшится
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
uNiUs
Dec 15 2009, 15:15
Пост #43


Rosetta@Home капитан
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 173
З нами з: 17-June 07
З: Zp.ua
Користувач №: 529
Стать: Чол
Free-DC_CPID



Да какой из меня ветеран? Так, немного поигрался на старте проекта shuffle.gif

Ну, раз в "молодежных состязаниях" стране баллов не начисляют - невелика потеря. Мне уже 512 баллов насчитали. Эх, их бы команде...
Знач попробуем в общем зачете. Только вот конкуренция там ппц. Если в 30-ку в личном зачете вошел - уже хорошо. О первых местах только мечтать...
Интересно, долго ли народ там парится, чтобы выйти на первое место? Или там методики какие-то отличные от универсального метода научного тыка?

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Sergyg
Dec 17 2009, 01:36
Пост #44


Гидробиолог
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 966
З нами з: 1-April 09
З: Dnipropetrovsk
Користувач №: 980
Стать: Чол
Парк машин:
мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU



да, народ там продвинутый,
причем, если я все ваще делаю на планшете (мыж уж очень неудобна), то я спрашивал товарисчей в чате - говорят - пальцем в тачпад тычут и молекулы вертят (ахренеть)

в силу всяческих обстоятельств я так и не смотрел ихние хелпы, народ в чате - оч советовал. Наверное, стоит все же как-нибудь.
Могу с уверенностью сказать, что времени монстры тратят много, но в то же время меня обходят в осн. оч быстро. Оставалось только удивляться. Была мысль, что оне чужие пресеты используют, так нет же - в том случае в общей таблице (Солистов) они бы не продвигались, а лишь в списке Эвольверов.
Похоже, мудростью обладают.
Имею только одну мысль, что пользу выцарапывают совмещая знания о влиянии разных типов связей между пептидами (элементы белковой молекулы) на итоговую энергию молекулы (стемимся к минимуму). Т.е. при включении отображения этих самых связей в окне просмотра.
Русские - молодцы, отжигает тов. vakobo и Grom. Хотя недавно я думал, что второй - это способ прибавить очков команде в молодежный забегах со стороны первого (хорошо сказал smile.gif ).
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Aug 6 2010, 23:31
Пост #45


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 344
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Публикация о проекте koc.gif
http://www.nature.com/news/2010/100804/full/466685a.html



--------------------
(Show/Hide)

Миссия проекта Help Fight Childhood Cancer (Помоги Победить Детский Рак) - подобрать белки, блокирующие некоторые виды рака. Подключайтесь!
IPB Image
IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

общая статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

4 Сторінки V < 1 2 3 4 >
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 28th March 2024 - 21:48

Invision Power Board v1.3.3 © 1996 IPS, Inc.