Superlink@technion, Анализ Генов Налаштування

[nikelong]

Проект "Superlink@technion"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

• Официальный сайт
• Официальная статистика по команде "Ukraine"
• Статистика на фришниках
• Статистика на фришниках по команде "Ukraine"
• Статус серверов проекта

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников:

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 10.08.2007 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://cbl-boinc-server2.cs.technion.ac.il/superlinkattechnion/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------


О проекте:
Superlink@Technion помогает генетикам выполнять генетический анализ соединения, который является статистическим методом, используемым, чтобы связать функциональность генов с их местоположением на хромосомах. Это обычно служит для того, чтобы обнаружить видоизмененные вызывающие болезнь гены.

Super Link является проектом по биологии и компьютерных наук факультета
израильского технологического института (Technion).

варнинг, жрет много памяти! 450-500MB


Ссылки по теме:

• Superlink@EGEE queue
• Superlink@clusters

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

Projrank Team Score
102 Ukraine 27,878

http://www.boinc-af.org/content/view/638/219/

http://www.dp.by/wiki/Projects/Superlinkattechnion

http://wiki.bc-team.org/index.php?title=Superlink%40Technion/en

http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...perlinktechnion

http://distributed.ru/wiki/pro:superlink

Це повідомлення відредагував Rilian: Mar 15 2009, 01:24

[(_KoDAk_)]

ситуацию исправил ))
для справки
- задания мелкие CPU time (sec) 269
- каждое задание сжирает 350-400Мб ОЗУ

[(_KoDAk_)]

Superlink@Technion помогает генетикам выполнять генетический анализ соединения, который является статистическим методом, используемым, чтобы связать функциональность генов с их местоположением на хромосомах. Это обычно служит для того, чтобы обнаружить видоизмененные вызывающие болезнь гены.

[Death]

странное задание - статус ОБРАБОТАТЬ В ПЕРВУЮ ОЧЕРЕДЬ. не видел такого раньше )

[Rilian]

Death, по идее боинк клиент сам такие статусы присваивает когда остается мало времени до дедлайна

в англ версии пишется Running, High Priority

[(_KoDAk_)]

не он кай-то странный (прибацаное понятие о дедлайне заданий)
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 92.3% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 8.3% of that
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Deferring communication for 1 min 0 sec
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Reason: no work from project

[YuRi]

не он кай-то странный (прибацаное понятие о дедлайне заданий)
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Scheduler RPC succeeded [server version 511]
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 92.3% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 8.3% of that
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Deferring communication for 1 min 0 sec
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Reason: no work from project

Почему "прибацанное"?
Все правильно. Он посчитал, что машина у тебя работает 22,5 часа в сутки. Из них час пятьдесят отводится на расчет superlinkattechnion. Потом он взял ориентировочное время расчета одного задания в проекте и прикинул, что при данных условиях ты до дедлайна это задание не посчитаешь.
Так что все правильно.
Другое дело, что он не всегда может правильно оценить вычислительную емкость заданий проекта. Но тут виноват ты сам. BOINC тренируется в правильной оценке путем многократных упражнений при расчете заданий проекта, а ты со своей политикой прыжков из одного проекта в другой не даешь ему такой возможности.
У меня на "старых" клиентах время расчета "стандартного" для проекта задания определяется с достаточно высокой точностью. А вот на новых клиентах в зависимости от проекта ошибка в оценке времени расчета может достигать порядка (!). Особенно этим "славится" SZTAKI DG. Но и Эйнштейн и СЕТИ поначалу могут ошибаться в два (!) раза.

[(_KoDAk_)]

он не всегда может правильно оценить вычислительную емкость заданий проект
так то воно так але
время выполнения задания = "0"
а также Almeregrid Testgrid умудренный 6 мин выполнения а выполняется мин 30

[YuRi]

Совершенно верно. Задание на задание не приходится. Тяжело предсказать, когда та или другая итерация уткнется в какой-нибудь "банан Розенброка", когда даже небольшая ошибка в направлении движения намного замедляет сходимость алгоритма.
Именно поэтому БОИНКу и требуется достаточно большая выборка, чтобы более-менее точно оценить вычислительную емкость той или иной задачи. Хотя, как я уже сказал, и тут могут быть свои отклонения от усредненного значения.

[(_KoDAk_)]

но суть проблему в том что: упорно накачивается по одному заданию на ядро и все никакого 3х дневного запаса кеша нет
а это чревато простоями....

[YuRi]

Даже не знаю.
На одной твоей машине задача завершилась с ошибкой, на другой - ты сам ее абортировал. По одному расчету завершено. Для твоих машин дневная квота - 39 заданий на процессор. Но задания не выдаются.
Судя по этому

02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
02.07.2008 13:47:49|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 92.3% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 8.3% of that

у тебя по другим проектам много заданий. Посмотри - может там их и больше, чем на 3 дня лежит. ))

[(_KoDAk_)]

запущен был тока он сам, другие приостановлены
щас плюнул и оставил его на ночь
увидим что он там натворит
вот от куда он 92.3% и 8.3% достает также осталось неизвестно

[(_KoDAk_)]

щас
вот
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Message from server: No work sent
04.07.2008 10:25:56|superlinkattechnion|Message from server: (won't finish in time) Computer on 93.5% of time, BOINC on 100.0% of that, this project gets 9.1% of that
но он упорно держит по одному заданнию на ядро и зака чледтолько после завершению предыдушего(

[YuRi]

Скорей всего это сервер выдает нереальные оценочные данные времени расчета. Т.е. твоя машина запрашивает у него заданий на, допустим 100'000 секунд расчетного времени. А сервер считает, что минимальное задание у него в несколько раз больше и поэтому ничего не выдает.
Причем это не обязательно ошибка сервера. Это может быть специальная политика хозяев проекта. Так, в Милкивэй стоит ограничение в 20 задач/сутки.

[Death]

поставь в настройках получать задаий на три дня работы. или на неделю. я правда не пробовал но попробовать дело одной минуты )))