QMC@home, развиваем метод Монте-Карло в квантовой химии Налаштування

[nikelong]

Проект "Qmc@home"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

• Официальный сайт
• Статистика по команде "Ukraine"
• Статистика на фришниках
• Статистика по команде "Ukraine" на фришниках

ТОП-20 участников:

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 05.03.2006 Капитан - Wit Serdakovskij
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://qah.uni-muenster.de/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Если у вас есть желание помочь команде, посчитать на командный аккаунт, можно использовать так называемый "слабый ключ аккаунта" (weak account key) который позволяет коннектиться к проекту не вводя пароли. Все очки будут присваиваться командному юзеру distributed.org.ua

Чтобы подключиться:
0) установите BOINC
1) создайте файл account_qah.uni-muenster.de.xml в папке \data\
2) в файл поместите текст

CODE

<account>
    <master_url>http://qah.uni-muenster.de/</master_url>
    <authenticator>8046f2dde0707b4994e12cf0ba4bb096</authenticator>
    <project_name>QMC@HOME</project_name>
</account>

3) перезагрузите BOINC
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Наша статья с описанием проекта.

Ссылки по теме:

• Метод Монте-Карло - Википедия

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

Марка по теме проекта:



Так выглядит скринсэйвер:

(Show/Hide)

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:



http://www.boinc-af.org/content/view/880/291/

http://www.boinc-af.org/content/view/393/291/

http://www.boinc-af.org/content/view/102/216/

http://www.dp.by/wiki/Projects/Qmcathome

CODE

http://wiki.bc-team.org/index.php?title=QMC%40home/en

http://www.irelandboinc.com/projects/40-projects/107-qmchome

Тут перевод описалова проекта с оффсайта:
http://www.boinc.ru/forum/default.aspx?g=posts&t=163

Це повідомлення відредагував Rilian: May 10 2011, 13:16

[Rilian]

Кто-то кто участвует, отправьте сообщение капитану команды Украины в этом проекте с просьбой изменить ссылку на сайт команды на distributed.org.ua

вот его профиль, http://qah.uni-muenster.de/show_user.php?userid=721

[(_KoDAk_)]

написал. )

[(_KoDAk_)]

изменил

[Rilian]

Супер!

[nikelong]

Добавил статью с основными моментами по проекту:

http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=139

[Arbalet]

Организаторы проекта выпустили отчет для Американского Химического Общества (American Chemical Society) о результатах текущих исследований: http://pubs.acs.org/cgi-bin/abstract.cgi/j.../jp077592t.html

Web Release Date: January 18, 2008
Copyright © 2008 American Chemical Society

Toward the Exact Solution of the Electronic Schrödinger Equation for Noncovalent Molecular Interactions: Worldwide Distributed Quantum Monte Carlo Calculations

Martin Korth, Arne Lüchow, and Stefan Grimme*

Organisch-Chemisches Institut, Universität Münster, Corrensstrasse 40, D-48149 Münster, Germany and Institut für Physikalische Chemie, RWTH Aachen University, D-52056 Aachen, Germany

Received: September 20, 2007
In Final Form: December 10, 2007

Abstract:
Quantum Monte Carlo (QMC) calculations on the stacked (st) and Watson/Crick (wc) bound adenine/thymine (A/T) and cytosine/guanine (C/G) DNA base pair complexes were made possible with the first large scale distributed computing project in ab initio quantum chemistry, Quantum Monte Carlo at Home (QMC@HOME). The results for the interaction energies (wc-A/T = 15.7 kcal/mol, wc-C/G = 30.2 kcal/mol, st-A/T = 13.1 kcal/mol, st-C/G = 19.6 kcal/mol) are in very good agreement with the best known coupled-cluster based estimates. The accuracy of these values is further supported by calculations on the S22 benchmark set of noncovalently bound systems, for which we obtain a small mean absolute deviation of 0.68 kcal/mol. Our results support previous claims that the stacking energies are of comparable magnitude to the interactions of the commonly discussed hydrogen-bonded motif. Furthermore, we show that QMC can serve as an advantageous alternative to conventional wave function methods for large noncovalently bound systems. We also investigated in detail all technical parameters of the QMC simulations and recommend a careful optimization procedure of the Jastrow correlation factors in order to obtain numerically stable and reliable results.

Основной вывод таков: проекту удалось добиться с помощью технологии РВ высокой степени точности вычисления при решении задач в нековалентно-свзязанных системах с использованием методов квантовой химии.

[uNiUs]

Добавил временно пару тазиков на этот проект, т.к Розетту они пока по техническим причинам считать не могут. Мож, какую-нить пользу принесут. А посоревноваться можно и ЗДЕСЬ

[(_KoDAk_)]

мдаа что-то зачастили Client error хотя предпосылок нету (

[Arbalet]

мдаа что-то зачастили Client error хотя предпосылок нету (

Тоже замечал, но не очень часто - 2-3% от всех заданий, не более. Да и вообще, удивляется не стоит - проект в бета-стадии

[(_KoDAk_)]

ну вот и пока подождем пока он оттуда выйдет, тогда посморим и поробуем, а пока возвращаюсь в разетту.

[Arbalet]

ну вот и пока подождем пока он оттуда выйдет, тогда посморим и поробуем, а пока возвращаюсь в разетту.

Ну это относительная "бета", они и на данном этапе уже начали решать научные задачи (см. отчет выше), попутно занимаясь оптимизацией расчетов. Мне такой подход напоминает F@H, в котором изрядную долю заданий составляют тестовые блоки.

У этого проекта пока не замечал ни падения серверов, ни задержек с начислением очков. Графика достойная. Информационно поддерживают проект хорошо. Организатор проекта - фундаментальный ученый, проф. Стефан Гримм из Мюнстерского университета, видный специалист в квантовой химии. Так что проект очень представительный и перспективный.

[(_KoDAk_)]

щас есть небольшая косность в начислени очков
время 21000 =134 очка
время 21500 =134 очка
время 20500 =134 очка
а
из плюсов еще то что процесс жрет 80-120 Мб (что в полне скромно)
а также мылый трафик.

[Arbalet]

uNiUs меня уже догнал по среднесуточному сливу.
Вот что значит современный парк компьютеров! Его три машинки не напрягаясь сделали мои 12 в течение нескольких дней Но да ладно, зато проекту хорошо и команде.

[Arbalet]

Поздравляем нашего (_KoDAk_) с попаданием на главную страницу проекта QMC