Может, это и не новость, буржуи придумали скриптец для анализа .msk-файлов, на предмет, сколько осталось непросчитатанных молекул под текущие очереди.
Добыто на ихнем форуме.
Если кому будет сей вопрос интересен - я выковыряю оттуда топик и переведу инструкцию по запуску скрипта.