Допомога - Пошук - Користувачі - Календар
D2ol
Розподілені обчислення в Україні > Завершені проекти > Медико-біологічні (завершені проекти) > Community TSC
1, 2, 3
nikelong


Проект "D2ol"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт - www.d2ol.com
ходите именно по ссылке www.d2ol.com т.к. на d2ol.com находится другой сайт о_0

Официальная статистика по команде "Ukraine"
Cтатистика на фришниках
Расширенная статистика по команде Украины





----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 25.09.2003 Капитан - Death
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

15.04.2009 проект ЗАКРЫВАЕТСЯ!
Точнее перемещается в лабораторию для тестирования результатов работы участников.

Осталось 9 дней для того чтобы улучшить свои финальные результаты.

On April 15, 2009, the D2OL distributed computing project will officially end operations.

Это же сообщение можно прочитать и в самом клиенте.

[hide]
Dear D2OL Community,

On April 15, 2009, the D2OL distributed computing project will officially end operations.

As this chapter in the history of The Rothberg Institute comes to a close, we wanted to take the opportunity to extend a sincere note of thanks to you, our indcredibly dedicated members who have driven every aspect of this project. We also want to take a few moments to reflect on what we have accomplished and to touch on how the project's results, thanks to your committed efforts, will be leveraged by The Rothberg Institute in the future.

As most of you know, this project set out to develop a viable platform for enabling users from around the globe to use their personal computers (whether PCs, Linux or Unix boxes, etc.) to compute the interactions of small molecule drug candidates with target molecules that likely play prominent roles in specific human disease pathways, including those involved in SARS, Avian Flu, and Smallpox. In the more than seven years that the project has been active, our members have returned results for over 150 million drug candidate-disease target tasks, utilizing over 3000 years' worth of CPU time in the process!

With the computational results available to us, we turn our attention toward harvesting the best possible candidates from this data
set and focusing our efforts in the laboratory in order to accomplish our original goal: finding effective real-world treatments for orphan diseases.


As we move forward, we will maintain our list of active and past members who have committed so much time and energy to this project, and we plan to update you periodically on the progress that we're making in the lab. Your efforts have been invaluable in moving us into position to take this next important step, and we truly appreciate the contributions that you have made.

We hope that you have enjoyed participating in this project as much as we have. For all that you have done, thank you!

The Rothberg Institute Staff

Сообщение на форуме
[/hide]

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Для присоединения к команде Украины:

Подробнее описано здесь!

Скачать инсталляху

качаем инсталляцию. Это инсталл без JAVA, Если у Вас не установлена ЖАБА идёте на java.com и качаете себе последний релиз.

Устанавливаем (инсталлер какой-то непривычный но там ничего менять не надо, просто везде жмём кнопку ДАЛЬШЕ) в корневой каталог. В c:\d2ol например. Чтобы не запутаться и чтобы заботало под ВИСТОЙ. Если у вас ХР то можете ставить в програм файлес.

Запускаем. d2ol.exe

Вводим своё мыло. Рабочее!

http://app.d2ol.com/memberServices/myHomepage.jsp

Идём на сайт д2ола ^^^ и регимся с тем же мылом, какое вводили при запуске. Потом логинимся на сайт.

Идём по ссылке "Моя Команда"
http://app.d2ol.com/memberServices/myTeam.jsp

Тут можно выбрать команду к которой вы хотите присоединиться. Да, это команда Ukraine. =)

Теперь идём по этой ссылке:
http://app.d2ol.com/memberServices/myNodes.jsp

тут ваш запущенный агент уже должен был связаться с серваком и рассказать ему о себе, что он работает с вашим мылом в данных.

Внизу есть кнопочка ADD NODE - жмёте на неё и видите список клиентов в которых вы указали своё мыло. Там есть ссылка ADD напротив каждого клиента - жмёте и добавляете его себе.

Нах добавлять себе свою же ноду я не знаю, но это надо сделать, а то будете потом спрашивать где моя тачка, чувак и мои результаты )))
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

О проекте:
D2OL — Drug Design Optimization Lab --Распределенный поиск новых лекарств от малярии, лихорадки Эбола и некоторых форм склероза.
romko
Проект не виглядає живим... Останнє оновлення головної сторінки - за 2004 рік.

А от в статистиці нашої команди лінк на rc5.org.ua непогано було б і замінити на https://distributed.org.ua/ Може прислужиться підвищенню PageRank smile.gif
Oleg82
об'ясните нафига регать команду если ты собираешся в ней участвовать два дня?
Death
нафига нафига
шоб было дофига ))

Members
Rank Member Nodes Cands Confs
1 berkut7 0 0 0
2 Death 1 0 0

офигенная статистика )) зато команда есть....
кстати я там считал пару недель, непонятно почему нули.

щас накатаю служебку.
но сначала попробую пароль вспомнить )))
nikelong
[b]Death,[/]

Вспомнил пароль?

Да и вообще, в 2-х словах - че за проект? о_0
(_KoDAk_)
D2OL — Drug Design Optimization Lab --Распределенный поиск новых лекарств от малярии, лихорадки Эбола и некоторых форм склероза.
(_KoDAk_)
D2OL v3.0 available for Windows, Download Now 04/16/08
http://www.d2ol.com/dOL/download_instructions.html
Client Changes:
-The ability to control task expiration from the client
-Automatic task monitoring to ensure that D2OL won't affect your computer's interactive performance
-Multiprocessor support
-Automatic detection of the number of processors on your computer
-The ability to run multiple agents automatically with the same node number and only one installation
-The ability to make configuration changes to each agent or have changes propagate across all running agents
-Separate task queues for each agent


http://app.d2ol.com/stats/topTeams.jsp?d=All&t=allTime
ReMMeR
Бугага!
Это мой первый проект smile.gif
А клиент и не поменялся практически smile.gif
Если вообще поменялся.
От непердвиденной перезагрузки мог нафиг слетететь весь кеш.
(_KoDAk_)
((( не стабильный он его на долго оставлять нельза он вот седня ошибку совершил и пока я не нажал ОК он не продолжилл(((
полдня потерял (((((
(_KoDAk_)
(Death @ May 13 2008, 12:58 PM) *

Кстати появился третий клиент

What's New in Version 3.0 of CommunityTSC (D2OL)™ 4/17/2008
ужеж выше писал об этом

и на нем же я и считаю
(Death @ May 13 2008, 12:58 PM) *


Вот ещё такая есть

Team Name Ukraine
Owner talex
Members 54
Created 12/30/02
Team Page
Description
Members
Rank Member Nodes Cands Confs
1 vasya 5 2,472 49,440
2 denbora 2 0 0
3 REM_FE 5 0 0
4 talex 4 0 0
5 Master_FE 3 0 0
6 VeL 1 0 0
7 VeLlingtoN 1 0 0
8 Davis 3 0 0
9 STSurgeon 1 0 0

-давай ссылку на это дело где ты ее нашел ???
-по чему их две ?
-и почему вы уважаемый числитесь с "о" ?????

и я ж это могу только в ушерб стату в росетте (
Death
у них на сайте )

только у них всё так через жжжж всё сделано, что не поймёшь.

две разные статистики.

я помню что я где-то месяц считал. почему теперь ноль непонятно...
Death
кстати, запустил у себя два клиента д2ол

быстро молотят.

только я не могу понять как к команде присоединиться? там при запуске агента оно спрашивает только мыло и всё. блин.

просто есть d2ol.com а есть tsc.com это типа одно и то же но не совсем.

чёрти-что...

http://d2ol.childhooddiseases.org/stats/topTeams.jhfp раз

Team Profile
Name: Ukraine
Registered: 12/30/02 10:17 AM
# of Members: 54
# of Nodes: 101
Age: 1961 days
Total Docking Time: 23 days, 07 hr, 02 min, 04 sec
System-wide Contribution: 0.00668%
Best Candidate Found: spe_AF399_41704351.pdbq
Candidates Conformers
Processed: 2,472 Processed: 49,440
Avg Dock Time: 13 min, 34 sec Avg Dock Time: 40.706 sec
Avg Per Day: 1.261 Avg Per Day: 25.212
Past Week: 0 Past Week: 0
Today: 0 Today: 0

Copyright © 2000-2003 The Rothberg Institute. All Rights Reserved


и два http://app.d2ol.com/memberServices/teamProfile.jsp?id=6041

Team Name Ukraine
Owner Death
Members 3
Created 9/25/03
Team Page https://distributed.org.ua

Description All Ukrainians come here. Nevseremos! Всi сюди. Команда друзів Ukraine RC5.

Members
Rank Member Nodes Cands Confs
1 KoDAk 1 639 12,780
2 berkut7 0 0 0
3 Death 1 0 0


Визначення stampede в Інтернеті мовою:англійська:

cause to run in panic; "Thunderbolts can stampede animals"
cause a group or mass of people to act on an impulse or hurriedly and impulsively; "The tavern owners stampeded us into overeating"
a headlong rush of people on a common impulse; "when he shouted `fire' there was a stampede to the exits"
act, usually en masse, hurriedly or on an impulse; "Companies will now stampede to release their latest software"
run away in a stampede
a wild headlong rush of frightened animals (horses or cattle)
wordnet.princeton.edu/perl/webwn

A stampede is an act of mass impulse among herd animals or a crowd of people in which the herd (or crowd) collectively begins running with no clear direction or purpose. Stampedes are believed to originate from biological responses in the brains and endocrine systems of herd animals. ...
en.wikipedia.org/wiki/Stampede
(_KoDAk_)
Death, ну я вижу смог присоединится к http://app.d2ol.com/memberServices/teamPro....jsp?id=6041&go
поздравляю
nikelong
Death,
Ну сорри, из двух команд выбирай ту шо в шапке smile.gif

Вопервых там есть ссылка на наш сайт, а во вторых по ней считается статистика на дц-ваулте
nikelong
Напишите пошагово как подключится к проекту, а потом - как подключится к команде.

И напишите ППД своих процессоров.
Death
ппд тут нету

можно просто прикинуть сколько за сутки считает.

как подключиться - позже.
mad
(Death @ May 14 2008, 01:02 PM) *

ппд тут нету

можно просто прикинуть сколько за сутки считает.

как подключиться - позже.

Скорее FAQ - скорее результаты smile.gif
А по трафику как оно (в сутки, примерно)?
(_KoDAk_)
трафик жукто маленький, я его не замечаю (на фоне Demis) вовсе
ReMMeR
Dimes !!

П.с.
Скільки якер воно хрумає ?
Всі ? одне ?
(_KoDAk_)
в 3.0 клиенте есть определитель кол. ядер и он запускает столько клиентов сколько ядер
В настройка можно указать кол. ядер вылеляемых на растерзание клиента

мини руководство
-устанавл клиент
-указ свое мыло -- клиент конектится качает задания
в правом верхнем углу окошка клиента указал ваш "Node ID" в данном проекте
-и дем на http://app.d2ol.com/memberServices/createMember.jsp
регистрироумся
-и уж тока тепер присоединяемся к Статистика по команде "Ukraine"
Death
http://www.d2ol.com/installers_new/Windows...installD2OL.exe

качаем. инсталлим (инсталлер какой-то непривычный), запускаем.

вводим мыло.

http://app.d2ol.com/memberServices/myHomepage.jsp

регимся с тем же мылом. логинимся на сайт.

http://app.d2ol.com/memberServices/myTeam.jsp

моя команда. я не знаю как присоединиться к команде. )))))

http://app.d2ol.com/memberServices/myNodes.jsp

тут походу ваш запущенный агент уже должен был связаться с серваком и рассказать ему о себе

внизу есть кнопочка ADD NODE - жмёте на неё и добавляете её себе.

нах добавлять себе же свою ноду я не знаю. но так надо сделать, а то будете потом спрашивать где моя тачка и мои результаты )))
(_KoDAk_)
(ReMMeR @ May 14 2008, 02:59 PM) *

Скільки якер воно хрумає ?

31 задание принятое+отправленое =1.5 Мб
в день мой Е2200@3300 двумя я драми дерает где-то 500 таких даний в день
(_KoDAk_)

что вот эти внизе в маленьких окошках ??
Death
это текущие задания. когда нажимаешь вручную отправить результаты по мере скачивания эти окошки заполняются.

хочу предупредить всех об возможной подставе!!

я поставил максимальное количество результатов 6 штук вместо дефолтных 30, думал оно посчитает их и будет чаще сливать и получать новые результаты, ну чтобы не раз в сутки сливалось. утром прихожу - эту сцука досчитала 6 штук и висит, ждёт пинка под попку. нажал кнопку слить - оно скачало новые и считает дальше.

НЕ ПРОКОЛИТЕСЬ КАК Я!

сделайте штук 50 заданий в очереди. у них экспайр ВЮ 30 дней. на любой современной тачке 1 ВЮ считается не больше часа. Так что 50-100 заданий самый раз. На выходные можно вообще 200-300 делать.
mad
Поставил, клиент v3 висит уже очень долго, показывает:
Initializing... (this may take several minutes)
- всё.
Комп: Виста, стоит jre1.6.0_05.
TCPView показывает established connection к childhooddiseases.org.
Windows Firewall что включен, что выключен - ничего.
проксей нет.
И сколько это длиться будет? Кто советом помочь может?

Update: статус тот же, зато теперь появилась ошибка: Error retrieving management data. Error Detail: Only 4 of 5 management data files were refreshed.
Death
прокси есть?
mad
(Death @ May 15 2008, 02:15 PM) *

прокси есть?

(mad @ May 15 2008, 12:06 PM) *

проксей нет.

За два часа клиент скачал 9 заданий - было: Retrieving data for task. 50 left to load, стало - Retrieving data for task. 41 left to load.
Но статус тот же - Initializing...
Регить в инете не даёт, пишет нет такой ноды.
Оставлю на ночь, посмотрю, чем закончится.
Death
кстати, ставить надо не в програм филез!

ставь в c:\d2ol например
mad
(Death @ May 15 2008, 03:48 PM) *

кстати, ставить надо не в програм филез!

ставь в c:\d2ol например

Ставил в D:\Utils\CommunityTSC.
Но в конце концов оно мне надоело - надо было перегрузиться - начало тянучку с самого начала, и я его грохнул.

Подскажите плиз другой медицинский проект, который юзает мульпроцессорность, не жрёт трафик, считает одно задание быстрее 8 часов, дедлайны у заданий хотя бы 4 дня, и чтобы на выходных сам справлялся без "Нажмите эту кнопку, чтобы продолжить работу". Фолдинг не предлагать, мощности уже не те, а мелкий проект могу вытянуть.
Некто
официальный сайт указан неверно smile.gif надо к d2ol.com еще www добавить smile.gif
Death
mad, попробуй всё-таки ещё раз запустить.
в висте есть режим совместимости с xp sp2
попробуй под ним. и инсталлить с отключенным UAC!

и обнови жабу. ))

мы просто планируем устроить педаль в д2ол - цель 20-е место. будет общее соревнование.

Некто, без www. попадаешь на сайт ТСЦ - это походу два разных проекта.
Некто
(Death @ May 16 2008, 10:21 AM) *

Некто, без www. попадаешь на сайт ТСЦ - это походу два разных проекта.

вот вот smile.gif я зашел по ссылке с шапки (без ввв) вчера и заметил, что что-то не то... статистика другая smile.gif
mad
(Death @ May 16 2008, 10:13 AM) *

mad, попробуй всё-таки ещё раз запустить.
в висте есть режим совместимости с xp sp2
попробуй под ним. и инсталлить с отключенным UAC!

и обнови жабу. ))
...

UAC выключен был

(mad @ May 15 2008, 12:06 PM) *

Комп: Виста, стоит jre1.6.0_05.

Куда её обновлять?

Я с этим больше играться не буду - попробую пока малярию посчитать.
nikelong
(Некто @ May 16 2008, 10:13 AM) *

официальный сайт указан неверно smile.gif надо к d2ol.com еще www добавить smile.gif


fixed

(mad @ May 16 2008, 10:30 AM) *

Я с этим больше играться не буду - попробую пока малярию посчитать.


Я тоже на малярию обратил внимание. Так что хороший выбор. Но пока считаю ЕОН, там у нас положение еще хуже smile.gif
Death
скорее всего эта тварь хочет жабу 1.5

но с их поддержкой и общим уровнем следующий клиент будт в декабре прочём какого года непонятно :-EE
Некто
(nikelong @ May 16 2008, 10:33 AM) *

(Некто @ May 16 2008, 10:13 AM) *

официальный сайт указан неверно smile.gif надо к d2ol.com еще www добавить smile.gif

fixed

плохо фиксд как-то О.о кидает на CommunityTSC
nikelong
(Некто @ May 16 2008, 02:39 PM) *

(nikelong @ May 16 2008, 10:33 AM) *

(Некто @ May 16 2008, 10:13 AM) *

официальный сайт указан неверно smile.gif надо к d2ol.com еще www добавить smile.gif

fixed

плохо фиксд как-то О.о кидает на CommunityTSC


А так?
Некто
(nikelong @ May 16 2008, 02:51 PM) *

(Некто @ May 16 2008, 02:39 PM) *

(nikelong @ May 16 2008, 10:33 AM) *

(Некто @ May 16 2008, 10:13 AM) *

официальный сайт указан неверно smile.gif надо к d2ol.com еще www добавить smile.gif

fixed

плохо фиксд как-то О.о кидает на CommunityTSC


А так?

травишь? smile.gif все равно ж оно без ввв открывает
nikelong
Короче.
Ссылки нормальной небудет.
Ходите на сайт копипастом.
Death
на д2ол ком находится сайт ТСЦ!
клиенты похожи очень, но цели обсчёта разные. в смысле target proteins
(_KoDAk_)
на Этих вЫходных буду от жигать )
Некто
Death, ты куда пропал? smile.gif
(_KoDAk_)
адд мини фак
добавление 2й и болие компав
-ставим клиент
-регистрируем на тот же маил
-потом идем на http://app.d2ol.com/memberServices/myHomepage.jsp логинимся (вот тока тут у меня бока вылазят постоянно)
и дем в My Node
жмем ADD
-появл список ID компов зарегиных на это мыло
выбираем нужные и join
Death
поставил папе на ноут )) пусть не стоит зря...

сегодня мы обгоним Эстонию! )))
Некто
эстонцы позади smile.gif следующая цель Poland smile.gif
nikelong
http://d2ol.childhooddiseases.org/memberSe...file.jsp?id=616

о_0

Это шо за статистика?
(_KoDAk_)
Это якась паралельна статистика з паралельною украиною
Некто
(nikelong @ May 20 2008, 12:37 AM) *

http://d2ol.childhooddiseases.org/memberSe...file.jsp?id=616

о_0

Это шо за статистика?

это communityTSC
nikelong
Ладно, вопрос другой:

объясните мне плиз между ними разницу smile.gif)
.
Invision Power Board © 2001-2024 Invision Power Services, Inc.