Версія даної теми для друку

Автор: re_SET Feb 22 2012, 23:33

Welcome to the Say No to Schistosoma project!
Dear World Community Grid Members,
Welcome to the Say No to Schistosoma (SN2S) project!

Schistosomiasis is a tropical disease caused by parasitic worms that are transmitted by freshwater snails. The disease kills 20,000 people each year and affects over 207 million people. Schistosomiasis is second only to malaria in its socioeconomic devastation.

We, the researchers at Infуrium University in Belo Horizonte and FIOCRUZ-Minas, Brazil, are using World Community Grid to search for chemical compounds which may lead to new drugs for treating the disease.

We are really looking forward to reviewing the results of this project, and sharing the insights we get from the results with you. As the project moves forward, we will be certain to keep you updated about our findings and publications in this forum.

We are extremely grateful for your willingness to donate your idle computer resources to this ambitious project and to World Community Grid, in general. If you have any questions or comments, please contact us by posting to this Forum.

Thank you from the research team and the Infуrium University and FIOCRUZ-Minas Labs:

Rosвngela Silqueira Hickson Rios: member name: "RHICKSON"
Paulo Linhares: member name: "Paulo.Linhares"

Миссия
Миссия проекта Скажи нет Шистосомозу состоит в выявлении потенциальных кандидатов препарата, который может помочь в лечении шистосомоза. Обширная вычислительная мощь системы World Community Grid будет использоваться для выполнения компьютерного моделирования взаимодействий миллионов химических соединений и некоторых белков цели между собой. Это поможет найти наиболее перспективные соединения, которые могут привести к созданию лекарств, способствующих эффективному лечению этого заболевания.

Значение
Шистосомоз – это хроническая паразитарная болезнь, вызываемая кровяными сосальщиками (трематодами) рода Schistosoma. Ежегодно лечение шистосомоза требуется, по меньшей мере, для 230 миллионов человек. Передача шистосомоза документально зарегистрирована в 77 странах, однако наибольший риск инфицирования существует в 52 странах.
Передача инфекции.
Инфицирование людей происходит во время их контакта с зараженной паразитами водой при проникновении через кожу личинок паразита, выделяемых пресноводными брюхоногими моллюсками.
В организме личинки развиваются во взрослых шистосом. Взрослые черви живут в кровеносных сосудах, где самки откладывают яйца. Некоторые яйца выводятся из организма с фекалиями или мочой для продолжения жизненного цикла паразита. Другие остаются в тканях организма, вызывая иммунную реакцию и прогрессивные поражения органов.

Подход
Программа VINA из исследовательского института Скриппса в Ла-Хойя, Калифорния, будет использоваться для выполнения виртуальных экспериментов химии. Эти виртуальные эксперименты предназначены для поиска лекарственных соединений, которые могли бы отключить части белков, необходимых для выживания паразита. Скрининг на лучший потенциал соединений препарата - первый шаг в процессе разработки эффективных методов лечения этого заболевания. С достаточной вычислительной мощностью, это обследование можно сделать гораздо быстрее, чем при использовании обычных лабораторных экспериментов. При использовании компьютерных мощностей, доступных исследователям, потребуется около 30 лет, для выполнения проверки. Тем не менее, предполагается, что мощность системы World Community Grid позволяет уменьшить это время. Информация о лучших соединениях кандидатов будет опубликована учеными, и будет доступна в открытом доступе для других ученых, чтобы опираться на свои исследования. Дальнейшие лабораторные работы с использованием лучших кандидатов, выявленных в рамках этого проекта могут привести к разработке более эффективных препаратов для борьбы с шистосомозом.

Количество заданий
По рассчетам ученых проект займет примерно 1 год (то есть 1 фаза проекта завершится в феврале 2013)

Связанные с проектом публикации на сайте:
https://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=6504

Автор: re_SET Feb 22 2012, 23:39

Вітаю зі стартом нового проекту! Наразі курю форум

Автор: Alexis Kravtchenko Feb 22 2012, 23:47

Да, уже считается пяток заданий... на Р4 2.0ГГц прогноз 90 часов!!

Автор: re_SET Feb 22 2012, 23:57

Да, я тоже сначала его в рассчетах увидел, вот что в бетах крутилось )))
Описалово делал первый раз, так что если что не так, сильно не бейте. Пока на скорую руку закинул что нарыл. большая часть текста переведена с ангельского, и потом отредактирована мной, так что просьба перечитать.

Автор: MAGADAN Feb 23 2012, 11:19

Однако много времени требуеться на расчеты
У меня по 5 часов
Интересно а кворум какой у ВЮ

Автор: Rilian Feb 23 2012, 13:11

Арр, снова червяки какието

Автор: MAGADAN Feb 23 2012, 14:26

Да все мы червяки какие-то только одни большие а другие маленькие и более сложные
А побеждаю более агресиивные

Автор: Solo196 Feb 25 2012, 19:38

(MAGADAN @ Feb 23 2012, 11:19)

Однако много времени требуеться на расчеты
У меня по 5 часов
Интересно а кворум какой у ВЮ

Автор: Rilian Feb 25 2012, 22:34

QUOTE(MAGADAN @ Feb 23 2012, 11:19)

Однако много времени требуеться на расчеты
У меня по 5 часов
Интересно а кворум какой у ВЮ

Автор: Rilian Feb 25 2012, 23:38

у меня уже

Автор: Brodyaga Feb 25 2012, 23:41

Как обстоят дела с чекпоинтами? Насколько часто?

Автор: Rilian Feb 25 2012, 23:43

QUOTE(Brodyaga @ Feb 25 2012, 23:41)

Автор: Dromage Mar 7 2012, 08:41

А мне этих Шистосом чего-то не даёт обсчитывать... Может потому что у меня от 9-ти проектов разрешено ВЮшки закачивать? ))

Кто посоветует почти новичку как распределять силы лучше? Все сразу или один проект, потом второй... и т.д. по очереди.

Автор: MAGADAN Mar 7 2012, 08:59

Вот мне тоже интересно как лучше только один бить или все потихоньку
Есть комндная цель так сказать на неделю месяц квартал год
КРОМЕ ОБЩЕЙ БЫТЬ ПЕРВЫМИ

Автор: Bel Mar 7 2012, 22:00

Лично я досчитываю проекты, которые скоро могут завершится Считаю 1-3 проекта, в зависимости от времени расчета.

Автор: Dromage Mar 13 2012, 08:38

Rilian, однако... Уже до рубина досчитал? )

Автор: Rilian Mar 26 2012, 14:37

набрал Изумруд

Автор: Rilian Apr 16 2012, 20:25

Накранчил на сапфир

перехожу обратно в HFCC+HCC

Автор: Rilian Apr 16 2012, 21:07

По рассчетам ученых проект займет примерно 1 год (то есть 1 фаза проекта завершится в феврале 2013)

Автор: Rilian Jun 6 2012, 14:49

С этого момента в проекте кворум = 1

Автор: Rilian Jun 15 2012, 10:25

Seeking New Treatments for an Ancient Disease

картинки из статьи







http://citizenibm.com/2012/06/seeking-new-treatments-for-an-ancient-disease.html

Автор: Bel Aug 25 2012, 09:52

Среднее время выполнения всех заданий увеличилось на 40%!

Автор: Rilian Nov 18 2012, 13:11

Say No to Schistosomiasis project update Oct 22, 2012

* 10 белков протестированы "вживую", и есть еще 16 многообещающих белка на очереди
* в университете Inforium University создана кафедра по изучению био-информатики "Professional Masters on Information Technology applied to Computational Biology".
* ученые проекта участвовали в 13 международном симпозиуме по изучениею шистосомиаза. Тезисы http://pide.cpqrr.fiocruz.br/iss2012/

Автор: Sonechko Dec 5 2012, 23:41

єсть +1 равлик

Автор: Rilian Jan 19 2013, 15:26

Выдача заданий будет приостановлена всвязи с проблемами с серверами на стороне ученых проекта

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,34587

Автор: Rilian Mar 27 2013, 20:10

Project Update Feb, 2013

So far, we have 18 new compounds being tested in vitro and in vivo. Test results will be made available as soon as they are completed.

We have another 23 potential targets being evaluated for testing.

Thank you for your participation.

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread_thread,34757

Автор: Dromage Jun 19 2013, 07:36

Что творится с WCG вообще - в этой конкретной теме спрашивать не буду (хотя всего 2 активных проекта +1 полукастрированный TCEP2... это ужасающе).
Скажите мне хотя бы конкретно по Шистосоме. Что тут случилось?! Только собрался поработать на бейджик. И на тебе. Без заданий.

Автор: MAGADAN Jun 19 2013, 09:02

Поддерживаю данный вопрос

Автор: Rilian Jun 19 2013, 09:33

Dromage, на оф форуме писали что проект ставится в замедленный режим. Задания должны получать только те у кого включен только этот проект

Автор: LSA Jul 23 2013, 11:36

Зловив бетку
Project Name: Beta - Say No to Schistosoma
Created: 07/22/2013 22:31:27
Name: BETA_SN2S_4EL6_0000002_2013
Minimum Quorum: 2
Replication: 2

Автор: tiss Jul 23 2013, 14:31

QUOTE(LSA @ Jul 23 2013, 12:36)

Автор: Rilian Jul 27 2013, 10:21

я всего одну бету поймал. Поздно обнаружил что всвязи с подключением к новому проекту QCNA он мне сбросил дефолтные настройки везде и ВЦГ не получало ВЮ

Автор: niggativ86 Aug 2 2013, 22:04

Появились задания))))

Автор: Rilian Aug 17 2013, 10:07

Project update 2013 08 15

This is a brief update about the Say No To Schistosoma Project on World Community Grid.
The researchers have constructed a new web site look which can be seen here: http://www.schistosomaonline.com.br.
They have added 19 new protein targets to the project and these are listed here: http://www.mestradoti.com.br/schistosoma/targets .
Over 4 million additional candidate compounds are being added to the project and we should start running the screenings for these on the grid soon after the data is prepared.

The researchers have one paper submitted to a journal for review and have written another paper which should be submitted soon.

We will post news items about these papers when they are published.

The researchers have done some preliminary laboratory testing of the best candidate compounds.

Before human testing of the best candidate compounds can proceed, the Brazilian Research Ethics Committee must approve this testing request. The approval process is expected to take 6 to 8 months.

The researchers thank all of the generous volunteers who make this project possible.

Автор: Rilian Oct 15 2014, 12:18

переношу в завершенние!

Автор: Arbalet Apr 28 2015, 23:52

Организаторы проекта The Say No to Schistosoma отчитались о ходе исследований: https://distributed.org.ua/forum/index.php?showtopic=6504