Версія даної теми для друку

Натисніть сюди для перегляду даної теми у оригінальному форматі

Розподілені обчислення в Україні _ Хімія (завершені проекти) _ mopac@home

Автор: nikelong Jan 1 2010, 21:45



Проект "mopac@home"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
ТОП-20 участников:
[img_]картинка[/img_]
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 03.01.2010 Капитан - ReMMeR
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите http://boinc.berkeley.edu/download.php (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://mopac.cadaster.eu/
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее http://mopac.cadaster.eu/team_display.php?teamid=16 вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Новичкам: http://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=170, как поставить и настроить BOINC-менеджер
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же Именем и EMAIL. если при регистрации в проекте указать другой e-mail , BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! В этом случае рекомендуется зайти во все ваши аккаунты и во все проекты и где надо поменять емейл на нужный. Через некоторое время ваши аккаунты сольются в один с одним cross-project-id.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------


О проекте:

The http://cadaster.eu/ project is an FP7-funded project by the EU that aims to provide a Decision Support System (DSS) to asses the hazard and risk for chemicals belonging to four compound classes. Therefore http://en.wikipedia.org/wiki/Quantitative_structure-activity_relationship models will be developed and validated, as the basic philosophy behind this project is minimizing animal testing, costs, and time. These models need a solid base, which is primarily founded by the knowledge of reliable structures for chemical compounds. The semiempirical quantum chemistry program http://openmopac.net/ can, aside from several other important chemical qualities, provide such structures.

Чем полезен проект?

Environment protection
The basic task of the CADASTER project is to protect the environment. Every single computed molecule can decisively contribute to improve the quality of models that asses the risk of a chemical compound to your ecosystem. With your participation you can contribute to a decrease of pollution.

Animal protection
The usual technique for assesment of hazard and risk, is animal experiments. Contrary to that, our scientific work aims to avoid these experiments. The data collected by mopac@home should enable QSAR-models that estimate toxicity without making living creatures suffer. By joining this project you can lessen the distress on animals.

Scientific progress
The data contributed to mopac@home is not just relevant for the CADASTER project, but can fill a gap in chemical knowledge. Although there are a lot of chemical databases, they either do not focus on optimized chemical structures or only offer few structures. mopac@home is developed to provide not just one chemical conformation per molecule, but to optimize a whole set of initial conformations.

Open project
All data gained by mopac@home is freely accessible by web. Unlike many other projects we do not just ask for computational help, without sharing the information gained by this project. Every computed result is available here to anybody who has an internet connected computer. Our database also enebles you to submit your molecules or molecule-conformations to be optimized by MOPAC.

Ссылки по теме:

http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D0%BE%D0%B8%D1%81%D0%BA_%D0%BA%D0%BE%D0%BB%D0%B8%D1%87%D0%B5%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8B%D1%85_%D1%81%D0%BE%D0%BE%D1%82%D0%BD%D0%BE%D1%88%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B9_%D1%81%D1%82%D1%80%D1%83%D0%BA%D1%82%D1%83%D1%80%D0%B0-%D1%81%D0%B2%D0%BE%D0%B9%D1%81%D1%82%D0%B2%D0%BE

График ППД команды "Ukraine"

Автор: ReMMeR Jan 3 2010, 23:38

http://mopac.cadaster.eu/team_display.php?teamid=16
Создал команду, подправил шапку.

Автор: Rilian Jan 29 2010, 01:29

я Юзер Дня.

Вю были вчера, а никто и не сообщил

Щяс ВЮ нету

Автор: Death Feb 1 2010, 19:37

01.02.2010 19:36:50 Fetching configuration file from http://mopac.cadaster.eu/get_project_config.php
01.02.2010 19:37:09 mopac7 Master file download succeeded
01.02.2010 19:37:14 mopac7 Sending scheduler request: Project initialization.
01.02.2010 19:37:14 mopac7 Requesting new tasks
01.02.2010 19:37:19 mopac7 Scheduler request completed: got 0 new tasks
01.02.2010 19:37:19 mopac7 Message from server: (Project has no jobs available)

Автор: Rilian Feb 1 2010, 19:48

задания есть, надо просто ждать. поставь больше кэш

Автор: Rilian Feb 6 2010, 17:54

есть ВЮ

Автор: Death Feb 6 2010, 21:59

06.02.2010 21:54:39 mopac7 Starting task 21874_9970_bo_0 using mopac version 607
06.02.2010 21:54:41 mopac7 Started upload of 21820_4297_bo3_0_0
06.02.2010 21:54:46 mopac7 Computation for task 21874_9970_bo_0 finished
06.02.2010 21:54:48 mopac7 Finished upload of 21820_4297_bo3_0_0
06.02.2010 21:54:48 mopac7 Started upload of 21874_9970_bo_0_0
06.02.2010 21:54:57 mopac7 Finished upload of 21874_9970_bo_0_0
06.02.2010 21:55:02 Project communication failed: attempting access to reference site
06.02.2010 21:55:05 Internet access OK - project servers may be temporarily down.
06.02.2010 21:56:09 mopac7 Sending scheduler request: To fetch work.
06.02.2010 21:56:09 mopac7 Reporting 4 completed tasks, requesting new tasks
06.02.2010 21:56:14 mopac7 Scheduler request completed: got 0 new tasks
06.02.2010 21:56:14 mopac7 Message from server: (Project has no jobs available)

Автор: nikelong Feb 7 2010, 21:09

С какой страны проект? (для БТП нужно?)

Автор: Rilian Feb 7 2010, 21:27

based in Munich, Germany

Автор: Rilian Mar 14 2010, 17:42

Есть ВЮ

но не понятно что они считают. Также нет официального форума и контактов где можно спросить о проекте ... help.gif

Автор: Death Mar 14 2010, 20:48

What is the use of mopac@home?

The http://cadaster.eu/ project is an FP7-funded project by the EU that aims to provide a Decision Support System (DSS) to asses the hazard and risk for chemicals belonging to four compound classes. Therefore http://en.wikipedia.org/wiki/Quantitative_structure-activity_relationship models will be developed and validated, as the basic philosophy behind this project is minimizing animal testing, costs, and time. These models need a solid base, which is primarily founded by the knowledge of reliable structures for chemical compounds. The semiempirical quantum chemistry program http://openmopac.net/ can, aside from several other important chemical qualities, provide such structures.

Why should you join mopac@home ???

Environment protection
The basic task of the CADASTER project is to protect the environment. Every single computed molecule can decisively contribute to improve the quality of models that asses the risk of a chemical compound to your ecosystem.

Animal protection
The usual technique for assesment of hazard and risk, is animal experiments. Contrary to that, our scientific work aims to avoid these experiments. The data collected by mopac@home should enable QSAR-models that estimate toxicity without making living creatures suffer. By joining this project you can lessen the distress on animals.

Scientific progress
The data contributed to mopac@home is not just relevant for the CADASTER project, but can fill a gap in chemical knowledge. Although there are a lot of chemical databases, they either do not focus on optimized chemical structures or only offer few structures. mopac@home is developed to provide not just one chemical conformation per molecule, but to optimize a whole set of initial conformations.

Open project
All data gained by mopac@home is freely accessible by web. In our project every computed result is available here to anybody who has an internet connected computer. Our http://cadaster.eu/mopac/ also enables you to submit your molecules or molecule-conformations to be optimized by MOPAC.

Автор: Rilian Mar 14 2010, 20:59

Death, это я читал

мне не понятно, сейчас тестовые данные, или реальные обрабатываются

Автор: Death Mar 15 2010, 11:59

написал на мыло. мож ответят.

Автор: Rilian Mar 15 2010, 12:07

QUOTE(Death @ Mar 15 2010, 11:59) *

написал на мыло. мож ответят.

куда? huh1.gif

Автор: Death Mar 15 2010, 21:05

одмину вестимо. )) на кадавере, тьфу на кадастере есть контакті.

http://www.cadaster.eu/node/38

и заодно попросил врубить форум на проекте.

пока ответа нет ((((

Автор: Rilian Mar 21 2010, 23:16

ВАРНИНГ

в текущем приложении EP@home 6.07 есть утечки памяти. Все ВЮ, которые делают вид что чето считают больше пары минут, на самом деле уходят в еррор через полчаса по таймауту

пример:
http://mopac.cadaster.eu/result.php?resultid=222381
http://mopac.cadaster.eu/result.php?resultid=222478


QUOTE(Death @ Mar 15 2010, 21:05) *

одмину вестимо. )) на кадавере, тьфу на кадастере есть контакті.
http://www.cadaster.eu/node/38
и заодно попросил врубить форум на проекте.

тоже написал ему мыло чтобы открыли message board rtfm.gif ph34r2.gif

Автор: ReMMeR Aug 22 2010, 23:22


Автор: Rilian Aug 22 2010, 23:38

не считаю проект пока что так как там были ВЮ с ошибками.

Софт не обновлялся с декабря 2009

Автор: x3mEn Jun 10 2011, 08:35

Є ВЮ

Автор: x3mEn Jun 10 2011, 10:38

Деякі завдання тривають досить довго, у мене - близько години, і закінчуються зі статусом Compute error.
Хоча в дійсності просто

<message>
Maximum elapsed time exceeded
</message>

Автор: Rilian Sep 30 2011, 23:27

есть вю!

правда вылетают с ошибкой

Автор: Death Sep 30 2011, 23:59

пишут на форуме что те что меньше чем полчаса - нормально щитаются

Автор: Death Oct 1 2011, 00:29

cloudee eu


01.10.2011 1:28:29 | mopac7 | Started download of 1632230_1331_bo
01.10.2011 1:28:30 | mopac7 | Finished download of 1632230_1331_bo
01.10.2011 1:28:30 | mopac7 | Starting task 1632230_1331_bo_0 using mopac version 13
01.10.2011 1:28:32 | mopac7 | Computation for task 1632230_1331_bo_0 finished
01.10.2011 1:28:34 | mopac7 | Started upload of 1632230_1331_bo_0_0
01.10.2011 1:28:36 | mopac7 | [error] Error reported by file upload server: invalid signature
01.10.2011 1:28:36 | mopac7 | Giving up on upload of 1632230_1331_bo_0_0: permanent upload error
01.10.2011 1:28:37 | mopac7 | Sending scheduler request: To report completed tasks.
01.10.2011 1:28:37 | mopac7 | Reporting 1 completed tasks, requesting new tasks for CPU
01.10.2011 1:28:38 | mopac7 | Scheduler request completed: got 1 new tasks
01.10.2011 1:28:40 | mopac7 | Started download of 1632285_9487_bo
01.10.2011 1:28:41 | mopac7 | Finished download of 1632285_9487_bo
01.10.2011 1:28:41 | mopac7 | Starting task 1632285_9487_bo_0 using mopac version 13
01.10.2011 1:28:43 | mopac7 | Computation for task 1632285_9487_bo_0 finished
01.10.2011 1:28:45 | mopac7 | Started upload of 1632285_9487_bo_0_0
01.10.2011 1:28:47 | mopac7 | [error] Error reported by file upload server: invalid signature
01.10.2011 1:28:47 | mopac7 | Giving up on upload of 1632285_9487_bo_0_0: permanent upload error
01.10.2011 1:28:48 | mopac7 | Sending scheduler request: To report completed tasks.
01.10.2011 1:28:48 | mopac7 | Reporting 1 completed tasks, requesting new tasks for CPU
01.10.2011 1:28:50 | mopac7 | Scheduler request completed: got 1 new tasks
01.10.2011 1:28:52 | mopac7 | Started download of 1632233_7201_bo
01.10.2011 1:28:53 | mopac7 | Finished download of 1632233_7201_bo
01.10.2011 1:28:53 | mopac7 | Starting task 1632233_7201_bo_0 using mopac version 13
01.10.2011 1:28:55 | mopac7 | Computation for task 1632233_7201_bo_0 finished

Автор: Rilian Oct 1 2011, 09:31

у меня на win32 вилетают все

Автор: Death Oct 1 2011, 11:45

это с клавдии - лин64
ГДЕ ЖЕ ОНО РАБОТАЕТ??

Автор: Rilian Oct 1 2011, 19:45

QUOTE(Death @ Oct 1 2011, 12:45) *

это с клавдии - лин64
ГДЕ ЖЕ ОНО РАБОТАЕТ??

надо на вюпропе посмотреть....

Автор: Death Oct 1 2011, 20:55

а в шапку топ10 юзеров как вставить?

Автор: Rilian Jan 1 2012, 13:37

Внезапно выдают ВЮ на winXP x64

Автор: nikelong Mar 19 2012, 00:45

(ReMMeR @ Aug 22 2010, 23:22) *



Сегодня снова такое. Рильян, прикрути баннер к профилю, пусть нашару сайт Команду рекламирует )))

Автор: Death Mar 19 2012, 10:51

какой то он сцуко полудохлый.

2 миллиона ву висит в пендинге из за отключенного ассимилятора.

и стат не экспортится.

Автор: Death Mar 19 2012, 11:14

http://mopac.cadaster.eu/forum_thread.php?id=37

задал вопрос

Invision Power Board
© Invision Power Services