Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Rosetta@home, проектирование новых белков
Dimych
May 29 2007, 12:12
Пост #1


Так, я створив профіль!


Група: New Members
Повідомлень: 2
З нами з: 29-May 07
Користувач №: 522
Стать: Чол



IPB Image

Проект "Rosetta@home"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт

Официальная статистика по команде "Ukraine"

ТОП-20 участников:
IPB Image
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 12.04.2006 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://boinc.bakerlab.org/rosetta
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
BOINC 6 Versions Change Log
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Если у вас есть желание помочь команде, посчитать на командный аккаунт, можно использовать так называемый "слабый ключ аккаунта" (weak account key) который позволяет коннектиться к проекту не вводя пароли. Все очки будут присваиваться командному юзеру distributed.org.ua

Чтобы подключиться:
0) установите BOINC
1) создайте файл account_boinc.bakerlab.org_rosetta.xml в папке \data\
2) в файл поместите текст
CODE
<account>
    <master_url>http://boinc.bakerlab.org/rosetta/</master_url>
    <authenticator>46ed7286c5974c66fe43ee6b4828413a</authenticator>
    <project_name>rosetta@home</project_name>
</account>

3) перезагрузите BOINC
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Описание проекта:
Цель проекта - решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии - вычисление 3-х мерной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершенному проекту "Геном человека" известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, не существующих белков. В случае успешного решения данных проблем мы сможем бороться с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями.[/quote]
взято отсюда

PROMO VIDEO new!

Для большей научной пользы выставьте время рассчета ВЮ - 1 день.
Для этого:
1. зайдите в Ваши настройки на сайте, http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project
2. выберите Target CPU run time = 1 day
3. нажмите Update
4. откройте БОИНК менеджер
5. если у вас сокращенный вид, нажмите Advanced View
6. выберите первую вкладку
7. выберите проект Розетта и нажмите кнопку "Обновить" сверху слева
8. Готово! Теперь каждая молекула будет "предсказываться" 1 день вместо 3 часов (по умолчанию)

Статья в журнале LiveScience.com
Мини FAQ
Исследование болезней
Что мы хотим знать о проекте Rosetta@Home ?
Rosetta@Home FAQ
Описание структур и методов моделирования белков
Сравнение биомедицинских проектов распределенных вычислений

Реферат по Росетте

Инструкция по подключению на FreeBSD, боинк брать на оф сайте

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

IPB Image



Марка по теме проекта:

IPB Image

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:

IPB Image

Це повідомлення відредагував Rilian: May 10 2011, 13:12
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
18 Сторінки V « < 6 7 8 9 10 > »   
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(105 - 119)
Death
Nov 11 2008, 22:13
Пост #106


<script ///>
**********

Група: Moderators
Повідомлень: 6 371
З нами з: 5-November 03
З: Kyiv
Користувач №: 26
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
гидропарк
jabber:deadjdona@gmail.com



реальные результаты. тваюмать как долго я этого ждал

Posted 7 Nov 2008 7:27:53 UTC

Please see Sarel's post today on protein-protein interface design about to start up on rosetta@home. Sarel is designing proteins to block the action of pathogens like cholera, and we are excited that with your help we can make inhibitors for many proteins causing disease. We are also starting large scale tests of brand new structure prediction methods, including some that I have been developing myself. This is a very exciting time at rosetta@home!


--------------------
wbr, Me. Dead J. Dona OGR-27
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Nov 15 2008, 21:03
Пост #107


BOINC-guru
*********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 3 662
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



November 14, 2008
Outage Notice: the project will be down for maintenance starting at 2:00 PST today.

On an unrelated note: WE ARE PLANNING TO INCREASE THE DEFAULT RUN TIME TO 6 HOURS AND THE MINIMUM TO 3 TO REDUCE THE LOAD ON OUR SERVERS. When and how this will occur has not yet been decided. If you have any concerns or would like to add to the discussion please post to this thread.


November 14, 2008
Our fileserver crashed last night. We are planning to upgrade the system very soon. Sorry for any inconvenience.


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Zedus
Nov 25 2008, 22:16
Пост #108


Трохи обжився
**

Група: Trusted Members
Повідомлень: 19
З нами з: 24-November 08
З: Kiev
Користувач №: 870
Стать: Чол
Парк машин:
AuthenticAMD AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core Processor 4200+ [x86 Family 15 Model 75 Stepping 2]



интересный прожект... И сюда внесу свою лепту wink.gif
Плохо только, что задания такие "тяжелые" (
когда интернет по траффику, с этим приходится считаться...


--------------------


 

 
I'm HAPPY )))
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Nov 26 2008, 01:16
Пост #109


BOINC-guru
*********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 3 662
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



QUOTE(Zedus @ Nov 25 2008, 22:16) *

интересный прожект... И сюда внесу свою лепту wink.gif
Плохо только, что задания такие "тяжелые" (
когда интернет по траффику, с этим приходится считаться...

высвляешь растектное время задания 24 часа и трафик становится меньше))


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Dec 27 2008, 00:34
Пост #110


BOINC-guru
*********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 3 662
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



такое событие пропустили

Jul 14, 2008
Predictor of the day: Congratulations to Admin (Team Ukraine) for predicting the lowest energy structure for workunit FR_298_relax_3292_0 !


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
tribal
Jan 7 2009, 20:16
Пост #111


Kранчер из глубинки
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 906
З нами з: 16-October 08
З: Горловка
Користувач №: 845
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
AMD Athlon II X4 635@3.3GHz/ GF250GTS



прикольненько - считается розета 6 с копейками часов, остается 20 минут и 3% соответсвено, потом бах - посчитано 4 с копейками часа и всего лишь 73%... и заново считаем smile.gif))


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 7 2009, 20:17
Пост #112


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 162
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



какая версия проги? чето пишет БОИНК, что пишет розетта?


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
tribal
Jan 7 2009, 23:17
Пост #113


Kранчер из глубинки
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 906
З нами з: 16-October 08
З: Горловка
Користувач №: 845
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
AMD Athlon II X4 635@3.3GHz/ GF250GTS



07.01.2009 17:53:01|rosetta@home|Restarting task cc2_1_8_mammoth_mix_cen_cst_hb_t322__IGNORE_THE_REST_2CY9A_3_5882_55_0 using minirosetta version 147

боинк 6.4.2.... а никто и не ругалси.. просто он его остановил и перезапустил почему-то с меньших процентов... вопщем боинк у мя живет своей жизнью smile.gif


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 7 2009, 23:45
Пост #114


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 162
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



ненене должен быть подробный лог в БОИНКЕ. скопируй все что есть


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
tribal
Jan 8 2009, 11:50
Пост #115


Kранчер из глубинки
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 906
З нами з: 16-October 08
З: Горловка
Користувач №: 845
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
AMD Athlon II X4 635@3.3GHz/ GF250GTS



Rilian,
да фиг с ним, вчера просмотрел весь лог ниче кроме paused и restart про розету не было... досчитался и хорошо, главно что очки начислили smile.gif


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 8 2009, 12:47
Пост #116


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 162
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



tribal, ну ок

пока вцг в отключке, считаю Rosett-у


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
tribal
Jan 8 2009, 17:44
Пост #117


Kранчер из глубинки
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 906
З нами з: 16-October 08
З: Горловка
Користувач №: 845
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
AMD Athlon II X4 635@3.3GHz/ GF250GTS



Rilian,
пока вцг в отключке, считаю Rosett-у

shuffle.gif ну ненаю... я домой пришел а wcg мене 2 задания подтянул, с подозрительными названиями в теле ....rosetta.... гм, я так понимаю два проекта пересеклись?


--------------------

User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jan 8 2009, 21:08
Пост #118


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 162
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



если ты подключен к проекту Human Proteonome Folding то да, там на алгоритма розетты фолдятся белки


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Jan 8 2009, 22:52
Пост #119


BOINC-guru
*********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 3 662
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



скачет процентов бывает если ты менял время расчета заданий
но они обычно пролоджает считать....


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
(_KoDAk_)
Jan 11 2009, 15:39
Пост #120


BOINC-guru
*********

Група: Trusted Members
Повідомлень: 3 662
З нами з: 11-August 07
З: Kharkov
Користувач №: 569
Стать: Чол
Парк машин:
E3-1245V2@3400-Mhz 16GB 1х GTX760DCMOC2GD5 Q8200@2300-Mhz 4GB + то там то сям



так перебои с заданиями закончились

и вот что бывает если ошибится в одну букву

http://www.youtube.com/watch?v=W3aN6-xGjMw


--------------------
- "ты говоришь так, будто тебя чай ваше не вставляет "

(Show/Hide)











Спаcибо автору алфавита за любезно предоставленные буквы.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

18 Сторінки V « < 6 7 8 9 10 > » 
Reply to this topicStart new topic
5 Користувачів переглядають дану тему (5 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 4th August 2025 - 05:45