Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Rosetta@home, проектирование новых белков
Dimych
May 29 2007, 12:12
Пост #1


Так, я створив профіль!


Група: New Members
Повідомлень: 2
З нами з: 29-May 07
Користувач №: 522
Стать: Чол



IPB Image

Проект "Rosetta@home"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт

Официальная статистика по команде "Ukraine"

ТОП-20 участников:
IPB Image
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 12.04.2006 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://boinc.bakerlab.org/rosetta
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
BOINC 6 Versions Change Log
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Если у вас есть желание помочь команде, посчитать на командный аккаунт, можно использовать так называемый "слабый ключ аккаунта" (weak account key) который позволяет коннектиться к проекту не вводя пароли. Все очки будут присваиваться командному юзеру distributed.org.ua

Чтобы подключиться:
0) установите BOINC
1) создайте файл account_boinc.bakerlab.org_rosetta.xml в папке \data\
2) в файл поместите текст
CODE
<account>
    <master_url>http://boinc.bakerlab.org/rosetta/</master_url>
    <authenticator>46ed7286c5974c66fe43ee6b4828413a</authenticator>
    <project_name>rosetta@home</project_name>
</account>

3) перезагрузите BOINC
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Описание проекта:
Цель проекта - решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии - вычисление 3-х мерной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершенному проекту "Геном человека" известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, не существующих белков. В случае успешного решения данных проблем мы сможем бороться с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями.[/quote]
взято отсюда

PROMO VIDEO new!

Для большей научной пользы выставьте время рассчета ВЮ - 1 день.
Для этого:
1. зайдите в Ваши настройки на сайте, http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project
2. выберите Target CPU run time = 1 day
3. нажмите Update
4. откройте БОИНК менеджер
5. если у вас сокращенный вид, нажмите Advanced View
6. выберите первую вкладку
7. выберите проект Розетта и нажмите кнопку "Обновить" сверху слева
8. Готово! Теперь каждая молекула будет "предсказываться" 1 день вместо 3 часов (по умолчанию)

Статья в журнале LiveScience.com
Мини FAQ
Исследование болезней
Что мы хотим знать о проекте Rosetta@Home ?
Rosetta@Home FAQ
Описание структур и методов моделирования белков
Сравнение биомедицинских проектов распределенных вычислений

Реферат по Росетте

Инструкция по подключению на FreeBSD, боинк брать на оф сайте

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

IPB Image



Марка по теме проекта:

IPB Image

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:

IPB Image

Це повідомлення відредагував Rilian: May 10 2011, 13:12
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
18 Сторінки V « < 9 10 11 12 13 > »   
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(150 - 164)
gladiator_maximus
May 27 2010, 06:30
Пост #151


Все буде Україна!
*******

Група: Moderators
Повідомлень: 1 011
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb



Rilian,
В Диспетчере задач имя пользователя проектов от БОИНКА те же, что и папка в которой они находятся.
Как можно проверить права на запись?
А что значит "не качать новый софт"?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
uNiUs
May 28 2010, 07:42
Пост #152


Rosetta@Home капитан
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 168
З нами з: 17-June 07
З: Zp.ua
Користувач №: 529
Стать: Чол
Free-DC_CPID



gladiator_maximus,
можно поступить проще - просто запусти boincmgr.exe под админом и посмотри, повторится ли проблема.
А антивирь случайно не ESET NOD32 Smart Security?
ЗЫ: Если ось - ХР проблема может быть в лимите на 10 коннектов, особенно учитывая кучу запущенного софта + торренты.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
xapaktep
May 28 2010, 11:20
Пост #153


Так, я створив профіль!


Група: New Members
Повідомлень: 2
З нами з: 11-February 10
Користувач №: 1 307
Стать: Чол
Парк машин:
GenuineIntel Pentium(R) Dual-Core CPU E6500 @ 2.93GHz [x86 Family 6 Model 23 Stepping 10] AuthenticAMD AMD Athlon(tm) Neo X2 Dual Core Processor L335 [x86 Family 15 Model 107 Stepping 2] GenuineIntel Intel(R) Celeron(R) M CPU 430 @ 1.73GHz [x86 Family 6 Model 14 Stepping 8] GenuineIntel Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU P8600 @ 2.40GHz [x86 Family 6 Model 23 Stepping 6]



У мене теж нещодавно почалися якісь трабли. Раніше на завдання йшло до 6 годин - а тепер від 30 до 70 годин. Жодних змін в залізі не відбувалось. При цьому іноді час йде, а процент завдання не змінюється. Хелп!


--------------------
<a href="http://stats.free-dc.org/cpidtagb.php?cpid=9e6fbc3b95d5802433ef17ecb8813696&theme=14&cols=1" target="_blank"></a>
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
May 28 2010, 12:05
Пост #154


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



6 часов это потому, что в профиле стоко стоит. Максимум можно 24 часа поставить. Но у меня на версии 2.14 тоже такая же фигня. Время идет, а процент не увеличивается. Задание просто какбы перестаёт считатся. Помогает пауза и снова запуск. Но постоянно тыкать это слишком no.gif


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
May 28 2010, 16:24
Пост #155


Все буде Україна!
*******

Група: Moderators
Повідомлень: 1 011
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb



uNiUs,
Антивир Нод32 не Smart Security, обычный , фаер Комодо 4.0, минирозетту тоже добавил в список разрешенных приложений.
Лимит у меня на 100 коннектов.
Вот уже 15 часов считается еще одно задание-посмотрим,отпишусь.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
May 30 2010, 05:28
Пост #156


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 157
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(gladiator_maximus @ May 28 2010, 17:24) *

uNiUs,
Антивир Нод32 не Smart Security, обычный , фаер Комодо 4.0, минирозетту тоже добавил в список разрешенных приложений.
Лимит у меня на 100 коннектов.
Вот уже 15 часов считается еще одно задание-посмотрим,отпишусь.

минирозетту добавил только сейчас?

с виду, задание досчиталось успешно http://boinc.bakerlab.org/rosetta/results.php?hostid=1276956


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
May 30 2010, 08:43
Пост #157


Все буде Україна!
*******

Група: Moderators
Повідомлень: 1 011
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb



Rilian,
В список разрешенных приложений Комодо минирозетту и базы добавил как раз перед просчетом этой успешной вюхи.
Может случайность, а может и нет.
Щас космологию считаю, завтра к вечеру досчитаю, перейду на розетту-посмотрим.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
Jun 1 2010, 19:04
Пост #158


Все буде Україна!
*******

Група: Moderators
Повідомлень: 1 011
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb



Еще два задания успешно засчитались.
Видимо все таки фаервол порол задания.
А может и нет. Посмотрим.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jun 2 2010, 09:11
Пост #159


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 157
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(gladiator_maximus @ Jun 1 2010, 20:04) *

Еще два задания успешно засчитались.
Видимо все таки фаервол порол задания.
А может и нет. Посмотрим.

а все начиналось с того что "проект кривой" wink.gif


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
gladiator_maximus
Jun 2 2010, 15:34
Пост #160


Все буде Україна!
*******

Група: Moderators
Повідомлень: 1 011
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb



Rilian,
Да ладно, с кем не бывает.
Главное найти корень проблемы и решить ее.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
G.R.Max
Jun 19 2010, 11:55
Пост #161


Соромлюсь щось писати
*

Група: New Members
Повідомлень: 12
З нами з: 29-May 10
Користувач №: 1 403
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Всего 3



Странная ситуация.
Я Розету не считал уже год, тут решил опять её попробовать.
Раньше был в другой команде. Перевёл розету в вашу команду, и просчитал задание одно на сутки.
Странное дело, но на сайте http://stat.polarseti.ru/index.php?t=11&p=0 не появилась моя статистика.
Хотя Розета засчитала 183 поинта. По другим проэктам проблем не было, они высвечиваются, а розеты нету(((
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jun 19 2010, 19:11
Пост #162


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 157
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



G.R.Max, смотри статистику по BoincStats. Поларсети глючит, особенно в новых аккаунтах и при переходах из команд


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
Aug 9 2010, 15:15
Пост #163


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



Aug 8, 2010
Rosetta@home related advances have been featured in the national media twice in the last month. The first advance was the design of a protein catalyst that joins two molecules in a way not found in Nature; this was reported in Science magazine in July. The second advance is the finding that FoldIt players can solve hard structure prediction problems; this was reported in Nature magazine this week. These advances were covered in the New York Times, the LA times, and likely in your local newspaper. Thanks to all of you for your contributions to Rosetta@home!


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
Sep 22 2010, 10:05
Пост #164


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



Sep 21, 2010
The minirosetta application has been updated to version 2.15.

Проснулись после отпуска icon_trollface.png

upd: add new protocols for symmetrical oligomers and membrane proteins.


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Brodyaga
Oct 15 2010, 13:18
Пост #165


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 401
З нами з: 16-March 10
З: Севастополь
Користувач №: 1 348
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
1: Intel Core 2 Duo CPU E4600 @ 2.40GHz, Ubuntu 10.04 x64. 2: Intel Pentium 4 CPU 2.40GHz, Ubuntu 10.04 x86. 3: Пара вспомогательных компьютеров, Ubuntu 10.04 x86.



Как командное ППД за вчера вверх стрельнуло. WCG отвалился, так все, кто заданиями не запасся, сюда перешли wink.gif


--------------------
Делай что должен и будь что будет.

(Show/Hide)




User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

18 Сторінки V « < 9 10 11 12 13 > » 
Reply to this topicStart new topic
5 Користувачів переглядають дану тему (5 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 20th June 2025 - 06:28