Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках
Rilian
Nov 27 2007, 22:55
Пост #1


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 161
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



IPB Image

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid thumbsup.gif

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу

IPB Image

Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий. koc.gif

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

QUOTE
Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.


------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта
IPB Image

видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
41 Сторінки V « < 13 14 15 16 17 > »   
Reply to this topicStart new topic
Відповідей(210 - 224)
gladiator_maximus
Jul 2 2010, 16:37
Пост #211


Все буде Україна!
*******

Група: Moderators
Повідомлень: 1 011
З нами з: 29-January 10
З: 47°52'N,35°03'E
Користувач №: 1 284
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb



Подскажите, если ли смысл ставить виртуалку, на нее линукс 64 бит?
Будет ли выигрыш от производительности?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 2 2010, 16:53
Пост #212


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 161
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(gladiator_maximus @ Jul 2 2010, 17:37) *

Подскажите, если ли смысл ставить виртуалку, на нее линукс 64 бит?
Будет ли выигрыш от производительности?

имхо, будет. на линуксе и маке при всех прочих считается быстрее


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
ReMMeR
Jul 2 2010, 21:40
Пост #213


----===[ oO ]===----
*********

Група: Team member
Повідомлень: 2 910
З нами з: 20-October 05
З: Quake arena
Користувач №: 135
Стать: Чол
Free-DC_CPID



имхо, будет. на линуксе и маке при всех прочих считается быстрее

Соглашусь. Тем более, что сейчас виртуализация скоее упирается в кол-во памяти, а не в ЦПУ. Это по моим личным ощущениям.


--------------------
(Show/Hide)

# Open Door, So I Walk Inside ...


echo 'tuk tuk' > /dev/buben




RC5-72:


OGR-25:


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 3 2010, 12:04
Пост #214


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 161
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



Посчитано 37.72% - 87,686,825 заданий из 115000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 142,345,337 заданий rtfm.gif

Вчерашняя скорость 249000 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 571 день cool2.gif koc.gif thumbsup.gif help.gif

koc.gif koc.gif koc.gif ph34r2.gif

На core2duo 2.1ghz 64-bit за день считается 20 заданий. Грубо говоря нам надо 1500000 компов на 1 день smile.gif


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 6 2010, 11:20
Пост #215


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 161
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



на Ubuntu 64bit на 2.6Ghz 1 WU считается за 55 минут fear.gif koc.gif


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
Jul 6 2010, 11:35
Пост #216


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



Не глюк точно fear.gif Может попробовать эту убунту blink.gif


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 6 2010, 11:45
Пост #217


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 161
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(corsar83 @ Jul 6 2010, 12:35) *

Не глюк точно fear.gif Может попробовать эту убунту blink.gif

IPB Image


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Brodyaga
Jul 6 2010, 12:54
Пост #218


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 401
З нами з: 16-March 10
З: Севастополь
Користувач №: 1 348
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
1: Intel Core 2 Duo CPU E4600 @ 2.40GHz, Ubuntu 10.04 x64. 2: Intel Pentium 4 CPU 2.40GHz, Ubuntu 10.04 x86. 3: Пара вспомогательных компьютеров, Ubuntu 10.04 x86.



QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 12:20) *

на Ubuntu 64bit на 2.6Ghz 1 WU считается за 55 минут fear.gif koc.gif

Какое ключевое слово из вышенаписаного? 64bit или Ubuntu?
На Intel Core 2 Duo CPU E4600 @ 2.40GHz, Windows XP Professional SP3 х86 1 ВЮ считается примерно 2,5 часа.


--------------------
Делай что должен и будь что будет.

(Show/Hide)




User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
ReMMeR
Jul 6 2010, 12:59
Пост #219


----===[ oO ]===----
*********

Група: Team member
Повідомлень: 2 910
З нами з: 20-October 05
З: Quake arena
Користувач №: 135
Стать: Чол
Free-DC_CPID



QUOTE
Какое ключевое слово из вышенаписаного? 64bit или Ubuntu?

Наверное ключевые слова здесь : Linux 64 bit, Core i7


--------------------
(Show/Hide)

# Open Door, So I Walk Inside ...


echo 'tuk tuk' > /dev/buben




RC5-72:


OGR-25:


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
Jul 6 2010, 13:21
Пост #220


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



У меня на 64 бит Win7 считает не намного быстрее чем на XP 32 бит. И уж никак не за час. А где-то 2-2,5. Знач всё же линух.


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
drorion
Jul 6 2010, 13:26
Пост #221


мрію про ферму...
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 152
З нами з: 4-July 04
Користувач №: 59
Стать: Чол
Парк машин:
i7-2600 Phenom X6 1055 C2D P8400 2.26



QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 12:20) *

на Ubuntu 64bit на 2.6Ghz 1 WU считается за 55 минут fear.gif koc.gif


Та ну...
У меня убунту 10.4 64-bit на Phenom X6 2.8Ghz на одном ядре HCC считается за 1 час 30мин - 1.40 мин.

Это что ж получается, одно ядро Core i7 2.6Ghz быстрее в 2 раза чем Phenom 2.8 Ghz????
Похоже я лоханулся с покупкой st.gif

2 Rilian: А сколько у тебя в боинк бенче пишет мипсов и фипсов?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
corsar83
Jul 6 2010, 13:57
Пост #222


кранчер зі стажем
******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 426
З нами з: 28-January 10
Користувач №: 1 282
Стать: Чол
Free-DC_CPID
Парк машин:
Pentium E6500 2,93Ghz, Phenom X6 1055T 2.8Ghz Gigabyte 5870OC(875/4800), Radeon 5750



Ну 1.30 это еще нормально. У меня на том же проце на XP 32 бит считает где-то за 3 часа, а иногда и больше. НСС с этим процом чото не дружит. А вот например Docking i Fight Aids, довольно быстро. Не медленней чем интел это уж точно.

П.С. Попробую и я убунту


--------------------


User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Rilian
Jul 6 2010, 14:06
Пост #223


interstellar
**********

Група: Team member
Повідомлень: 17 161
З нами з: 22-February 06
З: Торонто
Користувач №: 184
Стать: НеСкажу
Free-DC_CPID
Парк машин:
ноут и кусок сервера



QUOTE(drorion @ Jul 6 2010, 14:26) *

Это что ж получается, одно ядро Core i7 2.6Ghz быстрее в 2 раза чем Phenom 2.8 Ghz????
Похоже я лоханулся с покупкой st.gif

я думаю, в HCC, все дело в битности (64 нада) и объеме кэша ядер

на сервере с бубунтой 64бит кэш 4МБ. Я сам был шоке когда увидел скорость

QUOTE(drorion @ Jul 6 2010, 14:26) *

А сколько у тебя в боинк бенче пишет мипсов и фипсов?

CODE
Tue Jul  6 15:04:17 2010           Number of CPUs: 2
Tue Jul  6 15:04:17 2010           2431 floating point MIPS (Whetstone) per CPU
Tue Jul  6 15:04:17 2010           5076 integer MIPS (Dhrystone) per CPU

это с макбука, core2duo T8100 2.1ghz, 3MB cache


--------------------
(Show/Hide)


IPB Image

IPB Image

IPB Image
IPB Image

загальна статистика: BOINCstats * FreeDC команда: BOINC команда Ukraine

IPB Image

IPB Image
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
drorion
Jul 6 2010, 14:16
Пост #224


мрію про ферму...
*****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 152
З нами з: 4-July 04
Користувач №: 59
Стать: Чол
Парк машин:
i7-2600 Phenom X6 1055 C2D P8400 2.26



QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 15:06) *

я думаю, в HCC, все дело в битности (64 нада) и объеме кэша ядер
на сервере с бубунтой 64бит кэш 4МБ. Я сам был шоке когда увидел скорость

У меня 64 бит Убунту!
Кеш 4МБ это какой кеш? У меня L1-128KB, L2-512KB, L3-6MB

QUOTE(Rilian @ Jul 6 2010, 15:06) *

это с макбука, core2duo T8100 2.1ghz, 3MB cache


Хм, я про Коре i7 спрашивал, который в 2 раза дрючит мой феном Х6.


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
Peret
Jul 6 2010, 16:12
Пост #225


kранчер
****

Група: Trusted Members
Повідомлень: 88
З нами з: 6-April 07
Користувач №: 496
Стать: Чол



Может дело еще и в компиляторе, вон в ейнштейне AMD тоже Intelу сливает, так там дело именно в оптимизированном под интел компилляторе.
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

41 Сторінки V « < 13 14 15 16 17 > » 
Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 6th July 2025 - 14:41