Rosetta@home, проектирование новых белков Налаштування

[Dimych]

Проект "Rosetta@home"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт

Официальная статистика по команде "Ukraine"

ТОП-20 участников:

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 12.04.2006 Капитан - uNiUs
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Для присоединения к команде Украины:
1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!)
2. Перейдите в "расширенный вид"
3. Выберите сервис ---> добавить проект
4. Введите адрес проекта http://boinc.bakerlab.org/rosetta
5. Введите свои регистрационные данные.
6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше.
7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты.
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
BOINC 6 Versions Change Log
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Полезная информация:
Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи:
1) пара e-mail/пароль
2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число.

Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем!
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Если у вас есть желание помочь команде, посчитать на командный аккаунт, можно использовать так называемый "слабый ключ аккаунта" (weak account key) который позволяет коннектиться к проекту не вводя пароли. Все очки будут присваиваться командному юзеру distributed.org.ua

Чтобы подключиться:
0) установите BOINC
1) создайте файл account_boinc.bakerlab.org_rosetta.xml в папке \data\
2) в файл поместите текст

CODE

<account>
    <master_url>http://boinc.bakerlab.org/rosetta/</master_url>
    <authenticator>46ed7286c5974c66fe43ee6b4828413a</authenticator>
    <project_name>rosetta@home</project_name>
</account>

3) перезагрузите BOINC
----------------------------------------------------------------------------------------------------------

Описание проекта:
Цель проекта - решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии - вычисление 3-х мерной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершенному проекту "Геном человека" известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, не существующих белков. В случае успешного решения данных проблем мы сможем бороться с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями.[/quote]
взято отсюда

PROMO VIDEO new!

Для большей научной пользы выставьте время рассчета ВЮ - 1 день.
Для этого:
1. зайдите в Ваши настройки на сайте, http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs.php?subset=project
2. выберите Target CPU run time = 1 day
3. нажмите Update
4. откройте БОИНК менеджер
5. если у вас сокращенный вид, нажмите Advanced View
6. выберите первую вкладку
7. выберите проект Розетта и нажмите кнопку "Обновить" сверху слева
8. Готово! Теперь каждая молекула будет "предсказываться" 1 день вместо 3 часов (по умолчанию)

Статья в журнале LiveScience.com
Мини FAQ
Исследование болезней
Что мы хотим знать о проекте Rosetta@Home ?
Rosetta@Home FAQ
Описание структур и методов моделирования белков
Сравнение биомедицинских проектов распределенных вычислений

Реферат по Росетте

Инструкция по подключению на FreeBSD, боинк брать на оф сайте

График ППД команды за последние 60 дней:

(Show/Hide)

Марка по теме проекта:



----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Статус сервера выдачи заданий:



Це повідомлення відредагував Rilian: May 10 2011, 13:12

[Arbalet]

Затея, на самом деле, очень хорошая и правильная!

Это настоящий бич боинк-проектов, что там тьма не очень сильных украинских команд. В результате ни о каких серьезных продвижениях в мировом рейтинге там можно и не мечтать. Другое дело, если бы большую часть удалось объединить в рамках проектов в одну команду...

И если кому-то удастся найти способ писать в личку участников боинк-проектов, тому можно купить ящик мороженого

[Panda]

Хмм... Чи то я старий, чи "новое поколение выбирает...", але в наші часи кранчерів агітували на пиві...

[Rilian]

Если что мы напишем админам статистики или регистрации письмо с просьбой выслать список мыл капитанов команд или учаснегов для дальнейшего их присоединения. Думаю ничего страшного в этом нет.

Скажите куда и кому написать письмо, я напишу (на англ)

[nikelong]

Если что мы напишем админам статистики или регистрации письмо с просьбой выслать список мыл капитанов команд или учаснегов для дальнейшего их присоединения.

Я думаю тебе такого не дадут

[Rilian]

как админу команды могут и прислать.

[Rilian]

Подключился к проекту. Посчитаю несколько дней

[uNiUs]

Да, распылятся, пожалуй, не стоит. Если есть желание представлять какую-то фирму или банк - незачем создавать отдельную команду, можно просто создать одну учетную запись и под ней считать всем из них, кто пожелает. Так у нас, например, сделал Profi-P(Profi-press) - это вроде как полиграфическая фирма. Только как связаться с капитанами остальных команд - ума не приложу...

[Rilian]

так как ты капитан команды, довольно большой, я считаю что у тебя есть право связаться с админами проекта и попросить емейлы капитанов других украинских команд..

[uNiUs]

так как ты капитан команды, довольно большой, я считаю что у тебя есть право связаться с админами проекта и попросить емейлы капитанов других украинских команд..

Думаю, не все так просто... И твое мнение и мнение админов проекта может не совпадать Это ведь, по-сути, конфиденциальная инфа, интересная многим спамерам, так что вполне могут и отказать. Да и просто лень им может быть что-то кому-то давать. Разве был хоть один положительный прецендент? Так что, скорее всего, придется искать другие пути... Например, если эти люди отпишутся на этом форуме. Но, если хочешь - можешь попробовать, у тебя с английским получше, чем черт не шутит...

[Vladus]

Зачем мы распыляемся?
На данный момент самые большие показатели в этом проекте у команды UKRAINE.
Может все вместе обсудим и решим в какую одну команду объедениться?
А участникам других команд выслать приглашение.
Что вы думаете по этому поводу?

Полностью поддерживаю эту идею!
Призываю всех желающих считать в Розетте присоединиться к команде UKRAINE.

[nikelong]

А через БОИНК-профиля некоторых людей можно-ж выловить?
У меня так с парой человек получилось....даже в асе общался (!)

[YuRi]

И через них выйти на капитанов их команд

[uNiUs]

А через БОИНК-профиля некоторых людей можно-ж выловить?
У меня так с парой человек получилось....даже в асе общался (!)

Если есть хоть какие-то контакты в профиле типа мыла или аськи - то да, можно. Но к несчастью у большинства кранчеров нет даже самих профилей...
А еще было бы неплохо не только объединить украинские команды, но и попросить присоединиться тех, кто еще ни в одной команде не состоит. Таких тоже много - http://www.boincsynergy.com/stats/country....ine&project=rah
Только вопрос, где взять контактную информацию, по-прежнему остается открытым...

[ReMMeR]

погуглить по нику попытатся можно.