Mapping Cancer Markers Налаштування

[e_alesha]

Mapping Cancer Markers (MCM, Картирование маркеров рака)



Старт проекта: 8 ноября 2013.

Организаторы проекта: Торонтский университет (University of Toronto), факультет компьютерных наук, Лаборатория доктора Игоря Юрисика (Dr. Igor Jurisica), в сотрудничестве с Princess Margaret Cancer Centre. Техническую поддержку оказывает Исследовательский центр наук о жизни IBM (IBM Life Sciences Discovery Centre) на базе объединения World Community Grid.

Официальный сайт проекта: http://www.cs.utoronto.ca/~juris/MCM.htm

Цели и задачи проекта Mapping Cancer Markers

Различные формы рака – одна из главных причин смертности в мире. Современные методы лечения обеспечивают пятилетнюю выживаемость (это считается критерием излечения) лишь менее чем половине пациентов. Некоторые формы рака (например, головного мозга или поджелудочной железы) до сих пор остаются на 100% смертельными – врачи могут только на несколько лет или месяцев продлить мучения больных. Выживаемость больных раком легких лишь в последние годы увеличилась до 16%. Общее количество больных в 31 ведущей стране мира оценивается в 19 млн. человек.

Причины возникновения рака – это не только канцерогены в окружающей среде и общеизвестные вредные привычки, но и нарушения работы генов. Многие из них и тем более процессы их взаимодействия еще не выявлены. Развитие рака является многоступенчатым процессом, который приводит к неконтролируемому росту клеток опухоли, а затем – к их распространению (метастазированию) в другие органы организма. Этот процесс сопровождается усилением активности онкогенов, новыми мутациями, прекращением, подавлением или активизацией кодируемых генами белков.

Злокачественные изменения в клетках могут быть обнаружены с помощью так называемых мАркеров – определенных участков ДНК и связанных с ними специфических белков. Комбинации этих маркеров связаны с характерными типами рака. По наличию тех или иных маркеров в организме человека можно определить его предрасположенность к определенной форме рака, развитие и протекание выявленного заболевания, а также результаты проведенной терапии, что позволяет значительно улучшить качество лечения.

Например, годы исследований рака молочной железы и простаты позволили обнаружить маркеры, которые позволяют диагностировать рак на ранних стадиях, выявлять пациентов с высоким риском заболевания, прогнозировать реакцию организма на лечение. Известны маркеры и для некоторых других видов рака, но еще больше их предстоит открыть, так как рак очень неоднороден.

Авторы проекта Mapping Cancer Markers (MCM) надеются с помощью участников World Community Grid обнаружить и картировать клинически полезные онкомаркеры, связанные с раком молочной железы, яичников, простаты, поджелудочной железы, легких и других органов. Для этого потребуется обработка проб здоровых и пораженных раком образцов тканей тысяч пациентов, а также тестирование астрономического числа комбинаций маркеров. При этом методом простого перебора комбинаций выполнить такую задачу не представляется возможным – на это не хватит никаких вычислительных ресурсов. Вместо этого исследователи применяют специальные эвристические методы уменьшения пространства поиска полезных маркеров, которые позволят произвести всеобъемлющее картирование в разумные сроки с помощью вычислительных мощностей World Community Grid.

Перечень публикаций и патентов организаторов MCM

Связанные с проектом публикации на сайте:
В проекте Mapping Cancer Markers совершенствуют методологию исследования рака

Слово организаторам МСМ:


Требования проекта к ОС и железу: Windows, Linux, Mac; ок. 400 Мб оперативной памяти и 500 Мб свободного места на диске.

Текущая версия расчетного клиента: 7.24

Скриншот графической оболочки клиента Mapping Cancer Markers


Бейджики проекта:

Це повідомлення відредагував Arbalet: Feb 13 2015, 21:04

[omega.zp]

Чего то у меня задания на одном компе зависли, и не уходят. Пишет что на сервере диск аут оф спейс И новые не идут...

Ага, понял. С офф форума:

Temporary pause for the Mapping Cancer Markers project

We launched the Mapping Cancer Markers project this week and accelerated the first batch so that we could check the results sooner for any anomalies. Unfortunately, we found a limitation with the default random number generator being used for the project. The increased volume of results revealed some duplication of computation due to this. That is, the results computed are valid and correct, but in some cases they are duplicated instead of exploring new regions of the search space. For this reason, we are temporarily pausing the project and making some code changes to improve the random number generator usage. We will run a brief beta test for this change and if all looks good, will soon (in a few days) resume the project at full speed. The nature of research is that it often contains unexpected surprises and this is just one of them. Members will receive the normal credits for the work already performed. Thank you for your contributions and support of the project and more importantly thank you for your patience with this.