News Human projects Налаштування

[Arbalet]

Ученые улучшили алгоритмы сборки РНК благодаря онлайн-игре

Способы сборки молекул РНК, придуманные участниками онлайн-игры EteRNA, позволили разработать алгоритм, намного превосходящий существующие, говорится в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences (Lee et al., RNA design rules from a massive open laboratory, в открытом доступе; пресс-релиз Crowdsourced RNA Designs Outperform Computer Algorithms, Carnegie Mellon and Stanford Researchers Report опубликован на сайте Университета Карнеги-Меллона – ВМ).



«Это было бы невозможно, если бы игроки в EteRNA просто выдавали структуры, используя онлайн-симулятор. Синтезируя наиболее удачные структуры в лаборатории Рхиджу Даса (Rhiju Das) в Стэнфорде, мы даем сообществу обратную связь – что работает, а что нет в реальном мире. В результате любители помогли нам понять принципы сборки РНК и существенно расширили возможности науки», – пояснил Андриан Трейе (Adrien Treiulle) из Университета Карнеги-Меллона в Питтсбурге (США).

Онлайн-игра EteRNA позволила объединить усилия 37 тысяч любителей, решавших двумерные головоломки, связанные со сборкой молекул РНК. При этом они получали от Трейе и его коллег результаты экспериментов, в которых молекулы РНК на самом деле синтезировалась по придуманным ими правилам.

Используя методы машинного обучения, ученые создали на основе наиболее удачных методов сборки РНК алгоритм EteRNAbot. Они сравнили эффективность работы игроков, алгоритма EteRNAbot и двух современных алгоритмов для разработки структур молекул РНК.

На расчет структуры молекулы у компьютера уходит менее минуты, в то время как у человека это занимает 1-2 дня. Плюс проверка в лаборатории занимает месяц, и в целом тестирование заняло год. Результаты показали, что структура, созданная человеком, в 99% случаев превосходит результаты работы обычного алгоритма, в то время как структуры, разработанные EteRNAbot – в 95%. Теперь исследователи планируют включить в игру сборку трехмерных структур.

Искусственные молекулы РНК с заранее заданными свойствами дают возможность исследовать живые системы и управлять их работой. Но пока алгоритмы, которые используются для расчетов необходимой структуры РНК, несовершенны, поэтому при синтезе молекулы часто не обладают нужными свойствами.

[Arbalet]

К поиску неизвестных предков человека подключили интернет-пользователей


Изображение: fossilfinder.org

На Фестивале науки в Великобритании представлена система Fossilfinder: с ее помощью пользователей интернета приглашают поучаствовать в поиске редких и неоткрытых окаменелостей на миллионах фотографий бассейна Туркана (Кения), где ранее был найден Турканский мальчик, черепа человека умелого и древнейшие орудия в мире. О системе сообщает BBC News.

Сотни тысяч снимков были сделаны археологами с помощью воздушных змеев, беспилотников и других устройств. Один человек и даже группа ученых не смогут просмотреть их, а компьютерная система ищет недостаточно качественно, отметил руководитель проекта Эндрю Уилсон (Andrew Wilson).

Больше всего ученых интересует участок, содержащий окаменелости возрастом 1,4-1,8 миллиона лет — именно тогда сформировались первые три вида рода Homo. Каждый год в регионе выпадают мощные осадки, вымывающие из почвы новые окаменелости.

В систему уже загружен ряд снимков с разрешением три миллиметра на пиксель, покрывающие несколько квадратных километров в различных участках бассейна. Посетителей научат различать типы рельефа, а также попросят определить объекты, которые они встретят на картинках: древние орудия, раковины, кости млекопитающих и даже останки древних гоминидов. Для получения достоверных результатов каждый снимок должны будут оценить как минимум десять человек.

Помимо морального удовлетворения участникам проекта обещают некоторые призы. «Если кто-то найдет останки неизвестных предков человека, он получит право войти в состав комитета, который даст ему имя. Также можно заказать отпечатанную на 3D-принтере копию особенно полюбившейся окаменелости», — пояснил один из авторов проекта Адриан Эванс (Adrian Evans).