News Human projects Налаштування

[Arbalet]

Ученые улучшили алгоритмы сборки РНК благодаря онлайн-игре

Способы сборки молекул РНК, придуманные участниками онлайн-игры EteRNA, позволили разработать алгоритм, намного превосходящий существующие, говорится в статье, опубликованной в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences (Lee et al., RNA design rules from a massive open laboratory, в открытом доступе; пресс-релиз Crowdsourced RNA Designs Outperform Computer Algorithms, Carnegie Mellon and Stanford Researchers Report опубликован на сайте Университета Карнеги-Меллона – ВМ).



«Это было бы невозможно, если бы игроки в EteRNA просто выдавали структуры, используя онлайн-симулятор. Синтезируя наиболее удачные структуры в лаборатории Рхиджу Даса (Rhiju Das) в Стэнфорде, мы даем сообществу обратную связь – что работает, а что нет в реальном мире. В результате любители помогли нам понять принципы сборки РНК и существенно расширили возможности науки», – пояснил Андриан Трейе (Adrien Treiulle) из Университета Карнеги-Меллона в Питтсбурге (США).

Онлайн-игра EteRNA позволила объединить усилия 37 тысяч любителей, решавших двумерные головоломки, связанные со сборкой молекул РНК. При этом они получали от Трейе и его коллег результаты экспериментов, в которых молекулы РНК на самом деле синтезировалась по придуманным ими правилам.

Используя методы машинного обучения, ученые создали на основе наиболее удачных методов сборки РНК алгоритм EteRNAbot. Они сравнили эффективность работы игроков, алгоритма EteRNAbot и двух современных алгоритмов для разработки структур молекул РНК.

На расчет структуры молекулы у компьютера уходит менее минуты, в то время как у человека это занимает 1-2 дня. Плюс проверка в лаборатории занимает месяц, и в целом тестирование заняло год. Результаты показали, что структура, созданная человеком, в 99% случаев превосходит результаты работы обычного алгоритма, в то время как структуры, разработанные EteRNAbot – в 95%. Теперь исследователи планируют включить в игру сборку трехмерных структур.

Искусственные молекулы РНК с заранее заданными свойствами дают возможность исследовать живые системы и управлять их работой. Но пока алгоритмы, которые используются для расчетов необходимой структуры РНК, несовершенны, поэтому при синтезе молекулы часто не обладают нужными свойствами.

[astronom2003]

Астрономы-любители «охотятся» на черные дыры не хуже, чем профессионалы



Обученные волонтеры обнаруживают джеты, идущие от сверхмассивных черных дыр, и сравнивают их с родительскими галактиками не менее эффективно, чем профессиональные астрономы.

Ученые, принимающие участие в работе проекта Radio Galaxy Zoo, разработали онлайн-руководство для обучения добровольцев «охоте» на черные дыры и другие объекты, излучающие большие количества энергии в форме радиоволн.

В рамках этого проекта волонтерам выдаются снимки, сделанные при помощи телескопа в радио- и инфракрасном диапазонах электромагнитного спектра, и от участников проекта требуется сравнить между собой эти изображения, а также сравнить «радиоисточник» с его родительской галактикой.

Результаты, полученные за первый год работы проекта Radio Galaxy Zoo, возглавляемого доктором Джулии Банфилд из Австралийского национального университета и доктором Иви Вонг из Университета Западной Австралии были опубликованы недавно в журнале Monthly Notices of the Royal Astronomical Society.

Перед тем как выдать добровольцам изображения для анализа, ученые провели ряд тестов, которые показали, что обученные по разработанной методике добровольцы справляются с анализом снимков не хуже, чем команда из 10 экспертов – профессиональных астрономов.