Наша Рассылка, http://subscribe.ru/catalog/science.health.fadmedic Налаштування

[tyoma]

Урра! Возобновилась рассылка новостей с subscribe.ru! . Арбалету и Реммеру респект

http://subscribe.ru/catalog/science.health.fadmedic

[Rilian]

[16:04:39] Arbalet: ок, спасибо..
[16:04:55] rilian: это еще не все
[16:05:01] rilian: ща когда будет текст
[16:05:07] rilian: его можно подправлять
[16:05:56] rilian: Мы сообщаем относительно существования переходного процесса белковых спиралей и их комбинаций в развернутом ансамбле, и на заказе формирования helices, который, кажется, в значительной степени соглашается с предыдущими экспериментальными результатами. Переходная местная структура соблюдена даже в отсутствии полной родной структуры. Мы также вычисляем наборы пар остатка остатка, которые являются статистически прогнозирующими из формирования данных местных структур в наших моделированиях.
[16:06:11] rilian: мне перефразировать самому?
[16:06:24] Arbalet: не надо

Формирование местной структуры при моделировании двух маленьких белков.
Guha Jayachandran, V. Vishal, Angel E. Garc?a and V. S. Pande. Journal of Structural Biology, (2006)

Рассматриваются белки villin headpiece и винтообразном фрагменте B белка A. Для изучения формы и состояния локальной структуры этих маленьких альфа-спиральных белков использовалась ресурсоемкие модели молекулярной динамики, включая моделирование массивной атомарной структуры.
Мы можем сообщить о существовании белковых спиралей в переходном процессе и их комбинайций в unfolded ensemble, а также существовании порядка формирования спиралей, что почти полностью подтверждается предыдущими экспериментальными результатами. Локальная структура молекул при переходном процессе была рассмотрена даже при отсутствии общей природной структуры. Мы также рассчитываем наборы пар residue-residue, которые могут быть предсказаны статистическими методами на основании формирования данных местных структур в наших симуляциях фолдинга.