Help Fight Childhood Cancer, проект по подбору лекарств от нейробластомы (рак) Налаштування

[Rilian]

Помоги в борьбе с детским раком / Help Fight Childhood Cancer

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

• Help Fight Childhood Cancer - статья у нас на сайте
• Статистика по команде "Ukraine"
• Топ-50 участников команды
• Общая статистика проекта
• обзор проекта на английском
• Официальный сайт Университета Чиба (новости на сайте)
• Видео, составленное командой NMG-NETWORK

World Community Grid рада объявить о запуске проекта Help Fight Childhood Cancer под руководством Института по Исследованию Рака в Чибо (Япония), а также Университета Чиба (префектура Чиба, Япония). Миссия проекта - найти лекарства которые смогут заблокировать три вида белков обычно связываемых с развитием Нейробластомы (вид рака) - одного из видов плотных опухолей которые чаще всего развиваются у детей. Нахождение лекарств, блокирующих эти белки, позволит более эффективно лечить этот вид опухоли с помощью химиотерапии. Нейробластома проявляется чаще всего в раннем детстве и обычно ведет к смерти. Если проект будет удачным, он может привести к прорыву в исследованиях этой болезни, которая до сих пор не поддавалась ученым, и это позволит намного увеличить шансы на лечение нейробластомы.

В новой фазе проекта, запущеной в Августе 2010, исследуется 3 дополнительных цели
После этого ввиду успешност экспериментов добавлено еще 3 цели. Итого на апрель 2012 года рассчитано 8 целей, и еще 1 на очереди

Help Fight Childhood Cancer это двенадцатый проект в рамках World Community Grid и один из 7 (на момент запуска) которые сейчас активны. Для более детальной информации по остальным проектам, заходите на форум World Community Grid.

Часто задаваемые вопросы по проекту:

Что такое нейробластома?
Нейробластома - один из видов злокачественных опухолей и встречается обычно у младенцев и детей и очень редко у детей старше 10 лет. Клетки этой опухоли напоминают нервные клетки на ранних этапах их развития у плода. Одна треть нейробластом развивается в надпочечниках, другая треть - в брюшной полости по ходу нервных стволов вдоль позвоночника и остальные - в грудной полости и на шее. Некоторые нейробластомы возникают из спинного мозга. Иногда в связи с широким распространением опухоли на момент диагностики трудно установить точно место, откуда возникла опухоль. Не все опухоли нервной системы относятся к злокачественным. Нейробластома составляет 6-10% из всех детских раковых заболеваний и 15% от всех летальных исходов вызванных раком.

Что вызывает нейробластому?
Вероятность возникновения нейробластомы по всему миру почти одинаковая. Это дает возможность предположить, что факторы окружающей среды, например, ее загрязнение, не являются причиной развития этой опухоли. Многие исследователи полагают, что нейробластома возникает в том случае, когда нормальные эмбриональные нейробласты не созревают в нервные клетки или клетки коры надпочечников. Вместо этого, они продолжают расти и делиться. Большинство нейробластом не являются следствием наследуемых мутаций ДНК. Они вызваны мутациями, приобретенными в ранний период жизни ребенка. Эти мутации присутствуют в опухолевых клетках родителя ребенка и не передаются детям. Причины, вызывающие изменения ДНК, приводящие к возникновению нейробластом, не известны.

Какие потенциальные преимущества проекта Help Fight Childhood Cancer?
Институт по Исследованию Рака в Чибо, а также Университет Чиба (Япония) используют компьютерные ресурсы WCG для определения новых лекарственных кандидатов которые имеют нужную форму и химические характеристики для блокирования трех протеинов: TrkB, ALK и SCxx, которые часто встречаются, или ненормально мутируют, в агрессивно развивающихся нейробластомах. Блокирование этих протеинов, как считают ученые, позволит значительно повысить шансы на излечение с помощью химиотерапии.

Что именно считают рассчетные ядра проекта Help Fight Childhood Cancer?
Исследователи приготовили базу из 3 миллионов соединений - или потенциальных кандидатов для лекарства - и используют мощности добровольцев в WCG для симуляции лабораторных экспериментов, чтобы протестировать какие из этих соединений блокируют протеины TrkB, ALK и SCxx. Лучшие из моелкул будут выбраны и протестированы в лаборатории для подавления нейробластомы.

Какие преимущества получает проект от использования World Community Grid?
На своих мощностях исследователям для этого проекта понадобилось бы 8000 лет компьютерных рассчетов. С помощью мощностей участников WCG рассчеты могут быть проведены примерно за 2 года!

Что изображено на скринсейвере?
Программа симулирует лабораторное исследование, и проверяет, может ли данный лекарственный кандидат потенциально блокировать протеин, связанный с образованием рака. Форма в центре круга детей представляет собой белковую молекулу, которая является целью эксперимента в данном рабочем юните - белок TrkB, ALK, или SCxx. Когда рассчитывается возможная позиция (докинг двух молекул) лекарственного кандидата и одного из 3 белков, это место обозначается цветным шариком.

Скриншот графического клиента

Откуда взялись рисунки на сайте Help Fight Childhood Cancer project и в графическом клиенте?
Они были пожертвованы Ассоциацией Детского Рака Японии (Children's Cancer Association of Japan) - это единственная благотворительная организация в Японии которая поддерживает детей больных раком и их семьи. Организация была основана в 1968 году родителями которые потеряли своих детей, больных раком. Рисунки нарисованы детьми:

* "Лев"

* "Розовые семена"

* "Упражнения по радио"


График производительности проекта:


Це повідомлення відредагував Rilian: Apr 16 2012, 21:20

[Rilian]

Пришла рассылка от WCG

rilian - You Can Help End Childhood Cancer

Alert to all members of World Community Grid - your donated computer cycle time may now help find a cure for childhood cancers! There is a group of cancers that are particularly loathsome because they normally only strike young children. Neuroblastoma is one of these cancers, arising in children under the age of two and resulting in a less than 40% survival rate.

While scientists have uncovered the three proteins that enable this cancer to grow, they now need to search the three million drug candidates for a treatment. And your computer can help us complete this search in the next year.

If you are currently contributing and want to check to see if you are contributing to this project, click here. If you are no longer contributing but would like to contribute to this project, please click here.

The cause of neuroblastoma is unknown, but most physicians believe that it is an accidental cell growth that occurs during normal development of the sympathetic ganglia and adrenal glands. It occurs most often during the first two years of a child's life, and has a high risk for disease relapse with survival rates of less than 40 percent.

The rapid advancement of genetic research at Chiba Cancer Center Research Institute holds great promise for treating neuroblastoma. The new Help Fight Childhood Cancer project will use the idle computational power from your computer to identify which of the three million potential drug candidates can inhibit growth of three particular proteins believed to prevent successful treatment via conventional approaches, such as chemotherapy.

"Our promising research will be further advanced by the free computing power we will use from World Community Grid," said Dr. Akira Nakagawara, the principal investigator at the Chiba Cancer Center Research Institute. "It would take us about 100 years using our own computing resources to make progress, but with access to one of the world's largest virtual supercomputers, we estimate to complete this project in two years, and begin laboratory trials."

Dr. Nakagawara recently earned the Princess Takamatsu Cancer Research Fund Prize 2008 for his neuroblastoma research. In his work, he discovered that one protein, TrkB, is expressed at high levels in aggressive neuroblastomas and enhances the tumor cell's growth. World Community Grid will conduct complex chemistry simulations to determine which drug candidates bond to TrkB, as well as the proteins ALK and SCxx, so that those can be tested further in the laboratory. All results will be made available to the general scientific community to advance the field of cancer biology and drug discovery.

For more information about the Help Fight Childhood Cancer Project and other projects running on World Community Grid, please click here.

We sincerely appreciate your wonderful support!

Вот основная информация (выделена в тексте курсивом):

Быстрое развитие генетических исследований в Институте Исследования Рака в Чиба дает многообещающие надежды на лечение нейробластомы. Новый проект "Помоги Бороться с Детским Раком" будет использовать лишние компьютерные ресурсы чтобы определить какие из трех миллионов лекарственных кандидатов смогут блокировать три определенных белка, которые, уверены ученые, затрудняют успешное лечение традиционными способами, такими как химиотерапия.

Доктор Акира Накагавара, главный исследователь из Института Рака в Чиба, заявляет, что на доступных его лаборатории вычислительных мощностях им бы понадобилось около 100 лет чтобы добиться хоть какого-то прогресса, но используя мощности одного из самых крупных виртуальных суперкомпьютеров, каким является World Community Grid, они оценили время на рассчеты примерно в 2 года, чтобы начать лабораторные исследования на полученных результатах рассчетов.

Доктор Накагавара недавно получил "приз принцессы Такамацу за исследования рака" (Princess Takamatsu Cancer Research Fund Prize 2008) за его исследования нейробластомы. В его работе, было обнаружено что в быстро развивающихся нейробластомах повышено содержание белка TrkB и оно вызывает рост клеток опухоли. Используя программный комплекс Autodock и компьютерную сеть World Community Grid, будут проведены комплексные химические симуляции чтобы определить какие молекулы способны блокировать белок TrkB, а также белки ALK и SCxx, чтобы позже протестировать эти молекулы в лаборатории. Все полученные результаты будут открыты для общего доступа для дальнейших исследований в биологии рака и открытий лекарств против рака.