Fold It, Онлайн-игра по свертыванию белков Налаштування

[(_KoDAk_)]

Проект "FOLD It"

----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Официальный сайт

Статистика по команде "Ukraine"

wiki по стратегии
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
Дата основания команды - 10.05.2008 Капитан - KoDAk


О проекте:
Теперь в фолдинг белков можно играть

Инструкция по установке под Linux (fold.it linux setup) находится ниже

14.05.2008 [06:08], Арсений Герасименко
На страницах новостной ленты 3DNews мы не раз освещали достижения участников Folding@Home, проекта распределенных вычислений, объединяющего мощности сотен тысяч персональных ПК по всему миру. Сегодня же хочется рассказать об очень интересной разработке ученых Вашингтонского университета, которые превратили невероятно сложный процесс сворачивания белков в увлекательную игру.

Итак, программный продукт Fold.it позволяет практически любому пользователю в трёхмерном режиме создать наиболее рациональную модель сворачивания белка. Нужно сказать, что сам процесс сворачивания (фолдинга) по своей сути очень сложный, для для его расчета требуется много времени и ресурсов ПК. Как известно, многие пользователи во всем мире тратят огромное количество времени на практически бессмысленные электронные забавы. В свою очередь, Fold.it позволяет провести десятки человеко-часов с пользой для медицины и фармацевтики. Согласно имеющимся данным, в ближайшем будущем эта программа сможет получать данные о требующих изучения протеинах. Подобно Folding@Home, результаты можно будет отправить с помощью интернета в центр обработки.

Теперь в фолдинг белков можно играть

Напомним, что накопление знаний о свойствах белков может поспособствовать поиску лекарств от таких недугов как рак, болезнь Альцгеймера и даже СПИД. Согласитесь, спасти мир играючи – неплохая перспектива. Поиграть в фолдинг белков смогут как пользователи платформы Windows, так и Mac. Для этого нужно лишь зарегистрироваться и скачать файл объемом 53 Мб.

FOLD.IT Linux - запускаем под линуксом

1. для начала надо установить WINE

sudo apt-get install wine

2. качаем инсталяху Fold.It к себе в директорию

cd ~/some/dir; wget http://fold.it/portal/files/app/Fold%20It!.exe

3. запускаем установщик с помощью wine

wine "Fold It!.exe"

4. подтверждаем что хотим установить в C:\Program Files\foldit
5. next -> next -> finish
6. в конце установки будет галочка "launch fold.it" - нажимаем ее и ОК
7. готово!

(Show/Hide)

http://www.boinc-af.org/content/view/942/219/

http://elementy.ru/news?newsid=431388

Це повідомлення відредагував nikelong: Sep 3 2010, 10:03

[Sergyg]

Проект интересный! :-) я побаивался, что мене быстро 150 баллов насчитают, и перестанут пускать в задания до_150, а они совсем и не торопяцца баллы складывать. Насчитали очки по каждому из заданий (ч/з 1,5 дня после завершения) а общую сумму не складывают :-) более того - открылся следующий тур, можно параллельно 136 и 137 играть.
Что меня удивило: % загрузки 1 из ядер все же зависит от сложности молекулі: в 136 туре - простая молекула - 21% (сместо 25% раньше) а в 137 ОЧЕНЬ навороченная молекула, грузиццо уже 2 ядра, так что 4-ядерник в итоге загружен на 41-48% Это МОЩЩЩЬ!
ЗЫ: у нас харошие командные очки начисляются, вот только не ясно, добавтся ли когда-нибудь к рейтинговым 6 баллам хоть что-то /61-место/ или оно там заморожено.

ЗЫ2: 01.04 вышло обновление ядра программы, имхо, появились новые опции, дающие ещё больше возможностей, правда и более сложное, когда уже молекула особо не улучшается, оно только портит (есть опции - сохранение положения, и возврат к самому высокому баллу (конформации). Почитать бы туториал.

кроме того, в Extras , когда у вас есть бонусные (?) очки / не заметил, откуда ни взялись, когда обнаружил, их было у мну 5/ можно воспользоваться 2 видами помощи: 1 балл сттОит то, чтобы программа подсветила (выделила цветом) самые неудачные участки молекулы, только они не предупредили, что длится это всего 90 секунд (причем захват экрана его не берёт! (в другое время берёт ) ТОлько фоткать ! И ещё помощь - 2 балла стоит - подровнять свою молекулу под топовое решение учаснегоф (я так поднялсо в командном рейтинге в 135туре (>150) с 3-го на 2-е место (в самом конце состязания). Теперь у мене всего 1 бонусное очко, новых почему-то не дают, оно и понятно - они ж не пересчитывали рейтиги участников давненько).
ЗЫ3: шо-то вы стесняетесь, граждане, никаво нивидно