Биологический проект Налаштування

[Alien]

Как насчет сделать клиенты для громакса\намда с практическим применением в НИИ академии наук Украины?

[Sergyg]

я пока что не понял разницы между тем, что предлагал Rilian и BOINC.

Ы, так Rilian именно Боинк и предлагает. (ну или хотя бы принцип Боинка, /многократно сорри/ но это не принципиально)

А вот мне пока кажется (через необiзнанiсть), что кластер ну слишком отличается от Боинка т.е. традиционных РВ именно из-за этого:

Т.е. грубо говоря вычисления в кластере линейны во времени: чтобы начался расчет кластера на 100-м часу его работы, нужно выполнить 99 часов предыдущих вычислений. И вся эта махина - считает много суток.

получается так, расечты самого процесса МД, ведутся по фреймам (кадрам). В каждый фрейм заложены скоростя атомов, которые используются для последущего.. Принцип цепочки. Но для расчета одного фрейма, идет распределение вычислений по узлам и ядрам. Вот почему можно хорошо распараллелить, но при этом критично к задержкам.

А Боинк (поправьте, если это не так) - как раз рассылает множество заранее заготовленных, достаточно несвязных между собой, маленьких заданий. Т.е. автор проекта имеет небольшие вычислительные мощности (+ свой мозг) - только, чтобы сформировать задания. Их делают очччень много, заготавливают впрок, рассылаются с дублированием (повторностью для лостоверности). ПРичем задания из диапазона №№1001-2000 сформированы БЕЗ УЧЁТА результатов выполнения заданий №№0000-1000.
А вот при расчете ВАШИМ методом на кластере (имхо) именно нельзя приступить к серии №№1001-2000 не дождавшись предыдущих. Как раз кластер и выполняет быстренько такой обмен, когда даже при скорости соединения 1Гбит общая производительность в 3 раза падает против коннекта Инфайнибенд.
Имхо это совсем не Боинк...

_______________________
забавно выглядят наши лаги в реагировании на посты, нужно включать "сообщ. отредактировано" для ясности

Це повідомлення відредагував Sergyg: Feb 1 2010, 00:44