Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )

> Биологический проект
Alien
Jan 31 2010, 15:26
Пост #1


Разработчик MolDynGrid
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 569
З нами з: 7-October 07
Користувач №: 594
Стать: Чол
Парк машин:
Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb



Как насчет сделать клиенты для громакса\намда с практическим применением в НИИ академии наук Украины?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post
 
Reply to this topicStart new topic
Відповідей
Alien
Feb 5 2010, 03:54
Пост #2


Разработчик MolDynGrid
*******

Група: Trusted Members
Повідомлень: 569
З нами з: 7-October 07
Користувач №: 594
Стать: Чол
Парк машин:
Q6600 2.4@3.0GHz\Asus p5kc\8Gb\8600GT\2 SATA: Sams 500Gb+ 500Gb + Seagate 400Gb



(Sergyg @ Feb 1 2010, 00:41) *

ПРичем задания из диапазона №№1001-2000 сформированы БЕЗ УЧЁТА результатов выполнения заданий №№0000-1000.
А вот при расчете ВАШИМ методом на кластере (имхо) именно нельзя приступить к серии №№1001-2000 не дождавшись предыдущих. Как раз кластер и выполняет быстренько такой обмен, когда даже при скорости соединения 1Гбит общая производительность в 3 раза падает против коннекта Инфайнибенд.
Имхо это совсем не Боинк...

ну вот я тоже так думаю, наверное в Ф.Х отправляет индивидуальные, целостные, но маленькие задачки (малая система + короткое время). Обмен данных не производится между юзерами.
Пакет отправленный каждому из юзеров должен быть индивидуальным.
Я правильно понял?

Тогда таким критериям отвечают программы с принципом работы как у Modeller и АutoDock. Тут будут десятки тысяч одноядерных независимых пакетов, для одной задачи.
У нас есть питоновский скрипт для моделлера, который может распараллелить в пределах одного узла или пк, если нужно.
Если с чего-то начинать то пока с моделлера, вроде бы он бесплатный.

Run your AutoDock Research project on World Community Grid!
by Sargis Dallakyan — Последнее изменение: 2009-02-10 16:34
Сделали вклад: Bill Bovermann

Does your research run on AutoDock? If so, you may be eligible to benefit from World Community Grid’s free computational power to accelerate your research. AutoDock has already been ”grid-enabled” by World Community Grid’s technical team and is currently being run on World Community Grid with the FightAIDS@Home project from The Scripps Research Institute and the Discover Dengue Drugs - Together project from The University of Texas Medical Branch. Please review World Community Grid’s research project criteria and contact World Community Grid if you have an idea for a project proposal or any questions.

возможно с автодоком не нужно будет создавать 2й велосипед (как предлагал Rilian), даже не знаю пока что делать в данном случае.
Если поставить задачу через WCG, будет ли это считаться украинским проектом?


--------------------
User is offlineProfile CardPM
Go to the top of the page
+Quote Post

Повідомлення у даній Темі
Alien   Биологический проект   Jan 31 2010, 15:26
Rilian   Как насчет сделать клиенты для громакса\намд...   Jan 31 2010, 16:17
Alien   Мы можем обеспечить "серверную" поддерж...   Jan 31 2010, 17:00
Rilian   Мы можем обеспечить "серверную" поддер...   Jan 31 2010, 17:17
Alien   приемлемый дедлайн, ммм наверное это будет действи...   Jan 31 2010, 17:45
Rilian   я не очень понимаю. и докинг (Autodock) (могу пере...   Jan 31 2010, 17:58
Alien   ок, приведу в цифрах. Что касается МД, для нас инт...   Jan 31 2010, 18:25
Rilian   Какие требования по памяти в MD для "интересн...   Jan 31 2010, 18:35
Alien   если поставить весь проект на одно ядро, то не тре...   Jan 31 2010, 18:44
Rilian   на автодоке сейчас считают РВ: docking@home - собс...   Jan 31 2010, 18:55
Alien   чем нам поможет то, что они считают? предоставят г...   Jan 31 2010, 18:58
Rilian   --- с 700МБ памяти на ВЮ на домашних компах думаю ...   Jan 31 2010, 19:00
Alien   такс.. 1- МД это одно, а докинг это другое.. Хотя ...   Jan 31 2010, 19:30
Sergyg   конечно я не знаком даже с основами сегодняшнего п...   Jan 31 2010, 20:40
Rilian   Если мы предоставим сервер и возьмем на себя подде...   Jan 31 2010, 21:00
Alien   Из темы по MolDynGrid Virtual Laboratory, в презе...   Jan 31 2010, 23:12
Sergyg   аааааааа, ты все же предлагаешь (пока что) рассмат...   Jan 31 2010, 23:55
Rilian   Alien, как насчет обычного проекта на BOINC? Строи...   Feb 1 2010, 00:01
Alien   так ребята не спешите комментировать, я обновил по...   Feb 1 2010, 00:11
Rilian   Я прочитал пост, примерно информация соответствует...   Feb 1 2010, 00:18
6 Сторінки V  1 2 3 > » 


Reply to this topicStart new topic
1 Користувачів переглядають дану тему (1 Гостей і 0 Прихованих Користувачів)
0 Користувачів:

 



- Lo-Fi Версія Поточний час: 4th August 2025 - 14:48