Биологический проект Налаштування

[Alien]

Как насчет сделать клиенты для громакса\намда с практическим применением в НИИ академии наук Украины?

[Algon]

можно скомпилировать с mpi для параллелизации. хз как оно на винде..

А вот здесь можно подробнее? Я вроде как в общих чертах разобрался с этим Cygwin и нарыл кучу материала по нему. Теоретически он позволяет компилить под Windows любые исходники для Linux (кроме разве что уж совсем специфических). Но имеет и свои недостатки, например жесткую привязку к машине и учетке пользователя. Нужно разбираться дальше, скорее всего этого можно избежать.

Ждемс туториала по установке для виндовс.

Ок, до понедельника сделаю.

пол года..ммм .. У меня тогда стояло 1000 нс, можно сократить, если хочешь, до 1 нс (нужно мне будет переделать проект).

Если получится скомпилировать с MPI, есть идея как пихнуть все это на наш кластер. Там такая задача посчиталась бы примерно за 20-30 часов.

теперь вопрос, можно ли эту одну задачу распараллелить между кранчерами? Или только в предалах одного ПК\сервера?

Пока ответить затрудняюсь, нужно попробовать с MPI на отдельной машине, на кластере и гриде. Сейчас у меня маловато данных для выводов.

Встречный вопрос: можно ли по этой задаче как-то проверить промежуточные результаты, чтобы убедиться, что все работает как нужно? Или действительно лучше будет просчитать короткую задачу?
В настоящий момент Step 247600