Создание промо видеоматериалов по РВ, обсуждаем Налаштування

[gladiator_maximus]

С Первым Днем Осени!
И в качестве сюрприза- этот ролик сделанный мной:
http://www.youtube.com/watch?v=YvaBu30pVmc

[Alien]

ну скорее из видео F@H, ну или так как у вас где-то был ролик на 2 минуты, фолдинг белка http://www.youtube.com/watch?v=meNEUTn9Atg&NR=1
Шарики используются для того, чтоб снизить нагрузку на визуализацию (меньше полигонов в рендере), это простой метод который отображает каждый атом в грубой форме (не показывает связь, не относительный размер). Есть еще вандерваальсовские шарики, это более реально, но и они не используются почти. Неинформативно получается.
В биологии принято рассматривать белок в 4 типах структур.
Чтоб все понимали... Первичная это просто схематическое обозначение аминокислотной последовательности, вторичная это отображение спиралей (телефонный шнур) и бета-складчатых элементов (чаще как стрелочки). Третичная это когда с вторичной показываются еще петли (просто лапша) которые связывают между собой вторичные элементы. Четвертичная, когда третичная состоит из нескольких доменов (нескольких кусков). Для биологов и биофизиков ценность в видео заключается в том, чтоб наблюдать как изменяются вторичные элементы, образуются ли новые (с петель) а может изменяются старые (удлиняются или укорачиваются). Иногда комбинируют, накладывают 2 типа визуализации, к примеру по вторичной структуре + стиксы разные, ну чтоб показать бензольные кольца а.о. и т.д. Потому что при построении вторичной используются только С-альфа атомы... ну типа иногда бывает недостаточно, когда хочется показать геометрию альфа-спирали и т.д.
Альфа-спираль встречается как правило на внешней поверхности белка ибо водорастворимая часть (контактирует с водой), бета-элементы внутри (гидрофобны).. Но в целом от белка зависит. =)
Вот почему важно знать где и что находится, определить на глаз тип белка и как он изменяется.