А зачем мы считали? Налаштування

[tyoma]

После 2007 года - я не вижу ни привета ни отчета по этому проэкту. Сайт в полудауне. В общем логичный вопрос - нас кинули? И второй вопрос - а где написано, что нас опять не кидают/будут кидать в подобных проэктах? В ФАДе как бы говорилось про открытость результатов, так где они? Ну или раскажите про тяжелую судьбу создателей ФАДа, хоть какую то, кто то знает?

[Sergyg]

я вот не хочу говорить ничего плохого, и признаю, что недостаточно компетентен, но, когда я пытался слегка разобраться, что считает FAH и особенно разглядывая их публикации, приведенные на сайте и ДИНАМИКУ и хронологию этих публикаций с учетом динамики вычислительных мощностей - то радужные мысли не приходят.
Имхо топчатся на месте и... не вижу ихнего вклада в мировую науку, осознавая, какие мощные выч.ресурсы им бесплатно предоставили.
Раньше на калькуляторах большего добивались, имхо.

Надеюсь, истина хотя бы посередине, и наоборот, я сильно хотел бы ошибаться.

Попробую ещё посмотреть, что там новенького (ФАХ)...

[Alien]

я вот не хочу говорить ничего плохого, и признаю, что недостаточно компетентен, но, когда я пытался слегка разобраться, что считает FAH и особенно разглядывая их публикации, приведенные на сайте и ДИНАМИКУ и хронологию этих публикаций с учетом динамики вычислительных мощностей - то радужные мысли не приходят.
Имхо топчатся на месте и... не вижу ихнего вклада в мировую науку, осознавая, какие мощные выч.ресурсы им бесплатно предоставили.
Раньше на калькуляторах большего добивались, имхо.

Надеюсь, истина хотя бы посередине, и наоборот, я сильно хотел бы ошибаться.

Попробую ещё посмотреть, что там новенького (ФАХ)...

ты верно подметил, все правильно.
Сегодня кластерные системы позволяют почти линейно масштабировать задачу, что дает незаменимый прирост в продолжительности динамики.
МД методом расчета BOINC - вымирает. Его перспективы лишь как тестовые задачи и наладка новых алгоритмов. Тестирование, как тестирование, дорогое удовольствие на кластерах, где выполняются реальные задачи. Я думаю ближайшее время будут меньше полезных биологических публикаций в МД таким методом распределения, но не меньше пользы от новых разработок методов. К примеру ГПУ модуль для громакса как раз был разработан от команды ФАХ. Только пока жаль, что нельзя использовать более 1 видяхи для задачи. С технической точки зрения не переплюнули кластерные ЦПУ (если речь о громаксе). Но это сегодня и я думаю все реально.

Докинг продолжает жить и вижу перспективы большие, как и моделирование по гомологии. Так же думаю хорошие перспективы в квантовой химии. У них время расчета на задачу как раз до 6 часов в среднем. Хотя в с качественными базисами в квантах 6 часов с расчета на 8 ядер. В 6 часов на 1 ядре наверное можно успеть что-то типа пару молекул воды.