Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[x3mEn]

Так уже ж було: https://distributed.org.ua/forum/index.php?...ndpost&p=100614

[london2004]

KING100N,
Задание выполняеться допустим за 3 минуты, из них видяха загружена на 50% окло 30-40 секунд. Видео - АМД
Вот поэтому люди и пишут свои конфиги

Эти файлы у меня работают, только c ними, с WCG я уже не могу связаться
Подожду пока они чего-то допилят

[x3mEn]

Задание выполняеться допустим за 3 минуты, из них видяха загружена на 50% окло 30-40 секунд. Видео - АМД
Вот поэтому люди и пишут свои конфиги

Ага, тепер зрозуміло.
В мене відяха навантажена на ~92-98% десь від 0:20 до 4:30, потім 1:00 хвилину простой.
Тобто теоретично десь на 30% більше можна видавати, якщо хоча б 2 завдання в паралелі рахувати...

[Khvastov Maxim]

А мне нифига не дают Карточку BOINC видит и понимает, в профиле всё настроено, а тасков нет...
нд, 14-жов-2012 17:08:23 +0300 | | ATI GPU 0: Redwood (CAL version 1.4.1741, 1024MB, 888MB available, 1040 GFLOPS peak)
нд, 14-жов-2012 17:08:23 +0300 | | OpenCL: ATI GPU 0: Redwood (driver version CAL 1.4.1741, device version OpenCL 1.2 AMD-APP (938.2), 1024MB, 888MB available)

[Khvastov Maxim]

Качнул на всяк случай 28-ю версию, для процессора тянет задания, для видео - нет
пн, 15-жов-2012 22:20:34 +0300 | World Community Grid | Requesting new tasks for ATI
пн, 15-жов-2012 22:20:39 +0300 | World Community Grid | Scheduler request completed: got 0 new tasks
пн, 15-жов-2012 22:20:39 +0300 | World Community Grid | No tasks are available for Help Conquer Cancer

[Death]

последняя же 7.0.36 вроде

[Bel]

66,68%(572 days left)
Прирост + 0,31% за день!

[Rilian]

Server Updates - New GPU's on not send list + new message
We have added the following graphics cards to the do not send list for Help Conquer Cancer:

ATI
Radeon HD 5x00 series (Cedar)

NVIDIA
GeForce 315
GeForce 315M
GeForce 8600M GT
GeForce 8600 GTS
GeForce 9200
GeForce 9300M GS
GeForce 9500 GS
GeForce 9600M GT
GeForce GT 220M
GeForce GT 230
GeForce GT 325M
GeForce GT 610
NVS 300
Quadro FX 1700


We have also modified the server so that if your graphics card cannot run the Help Conquer Cancer project on your GPU, then you will get a message in your message log stating one of:

The Help Conquer Cancer ATI GPU application cannot run on your graphics card

or

The Help Conquer Cancer NVIDIA GPU application cannot run on your graphics card

[Rilian]

Производительность карточек в проекте

Here is the list of top GPU cards that have had returned results returned by at least 3 different users. They are ordered in increasing order by the average elapsed time.

CODE

Elapsed Time    Graphics Card
---------------------------------------------------------
110 secs    AMD Radeon HD 7900 series (Tahiti)
120 secs    AMD Radeon HD 79x0 series (Tahiti)
160 secs    AMD Radeon HD (unknown)
192 secs    AMD Radeon HD 7700 series (Cape Verde)
194 secs    GeForce GTX 580
206 secs    GeForce GTX 480
210 secs    AMD Radeon HD 6900 series (Cayman)
220 secs    GeForce GTX 470
221 secs    GeForce GTX 570
238 secs    GeForce GTX 680
243 secs    ATI Radeon HD5800 series (Cypress)
258 secs    ATI unknown
258 secs    ATI Radeon HD 5800 series (Cypress)
262 secs    GeForce GTX 670
277 secs    AMD Radeon HD 6800 series (Barts)
277 secs    GeForce GTX 590
288 secs    GeForce GTX 560 Ti
290 secs    GeForce GTX 465
307 secs    GeForce GTX 660 Ti
311 secs    ATI Radeon HD5700 series (Juniper)
320 secs    GeForce GTX 560
331 secs    ATI Radeon HD 5700 series (Juniper)
357 secs    GeForce GTX 660
373 secs    GeForce GTX 460
401 secs    GeForce GTX 285
405 secs    Quadro 4000
423 secs    GeForce GTX 670M
423 secs    GeForce GTX 275
443 secs    AMD Radeon HD 6x00 series (Turks)
449 secs    GeForce GTX 280
473 secs    GeForce GTX 295
479 secs    GeForce GTX 550 Ti
483 secs    GeForce GTX 460 SE
513 secs    GeForce GTX 260
518 secs    ATI Radeon HD5x00 series (Redwood)
526 secs    ATI Radeon HD 5x00 series (Redwood)
528 secs    GeForce GTS 450
540 secs    Quadro FX 3800
585 secs    GeForce GTX 560M
589 secs    Quadro 2000M
607 secs    Quadro 2000
653 secs    AMD SUPERSUMO
663 secs    GeForce GTX 460M
678 secs    AMD Radeon HD 6x00 series (Sumo)
731 secs    GeForce GT 555M
827 secs    GeForce GT 640
884 secs    GeForce GT 420M
886 secs    GeForce GT 240
886 secs    GeForce GTS 360M
897 secs    GeForce GT 530
919 secs    GeForce GT 550M
948 secs    GeForce GT 440
959 secs    Quadro 1000M
984 secs    GeForce GT 650M
1031 secs    GeForce GT 430
1038 secs    GeForce GT 525M
1082 secs    GeForce GT 540M
1090 secs    Quadro 600
1167 secs    GeForce GT 630M
1232 secs    GeForce GT 425M
1257 secs    GeForce GT 220
1282 secs    AMD Radeon HD 6300 series (Caicos)
1354 secs    ATI Radeon HD 5x00 series (Cedar)
1409 secs    ATI Radeon HD5x00 series (Cedar)
2283 secs    AMD Radeon HD 6200/6300/7300 series (Wrestler)

[TyphooNick]

Други,
думаю мой Core™i7 2600K и MSI R7950 @1150 лишними не будут.
Присоединяюсь.

[Bel]

TyphooNick, great news!
ЗЫ: 502 days left! Жесть.

[Death]

Вчера было 66,05%(720 days left). Сегодня 66,36%(688 days left) выполнено.

[TyphooNick]

Парни, подскажите, чего бы сделать, что б задания получить на сутки работы, а то идут по 20-40 штук, а потом парочка часов простой.

[Rilian]

Парни, подскажите, чего бы сделать, что б задания получить на сутки работы, а то идут по 20-40 штук, а потом парочка часов простой.

привет

выставь побольше кэш

проблема в том что там щяс чето фиксят и ограничили выдачу заданий до 10 на ядро. Плюс из-за наплыва юзеров периодически перестает хватать ВЮ для ГПУ. На оф форуме обещали это исправить на днях

https://secure.worldcommunitygrid.org/forum...ad_thread,34065

плюс сегодня на 3 часа должны вообще вырубить выдачу заданий. но обещают что после этого будет лучше

[TyphooNick]

Rilian,
понял, спасибо. Кстати, от величения буфера в этом проекте пользы ровно никакой. Поема, Колац - отзываются, а НСС нет. Сыроват еще...