Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[Arbalet]

А видалить проект і заново підключити пробував?

Аднака работает, вай шайтан!

[LSA]

А таке питання, яка HD краща для даного роекту - 7770 чи 6930?

[TyphooNick]

LSA,
Кращою буде Radeon HD 6930 - все ж таки 1280 потокових процесорів на частоті 750 MHz проти 640 у Radeon HD 7770 на частоті 1000 MHz. Розгінний потенціал HD 7770 не високий (приблизно 12 - 16%) і не компенсує відставання від HD 6930 на номінальній частоті. Якщо більш сухою мовою цифр, то відставання в обчисленнях HD 7770 від HD 6930 буде приблизно 25 - 30%.

P.S. Якби Boinc міг задіяти теселяцію, то HD 7770 обігнав би HD 6930 приблизно у 5 - 6 разів Це особливість нової архітектури AMD Graphics Core Next.

УСІМ у кого відеоплати AMD!!!
Сміливо можете встановлювати жовтневий AMD Catalyst 12.10, який пройшов WHQL-сертифікацію. Сам працюю з ним другу добу - ні однієї помилки, тривалість виконання завдань зменшилася на декілька секунд (точно на скільки не вкажу, лише помітив, що до 2-х хвилин завдань відправлятися стало більше, а більше 2-х хвилин - менше. Тільки зверніть увагу, що підтримуються не усі ОС і лише Radeon HD 5***, 6*** і 7*** серій. Правда, на моєму другому комп"ютері з HD 4890 програма автооновлення драйвера запропонувала нову (12.10) версію! Диваки ці інженери з AMD...

[x3mEn]

FP32 HD6930 = 1920 GFLOPs
FP32 HD7770 = 1280 GFLOPs

FP64 HD6930 = 480 GFLOPs
FP64 HD7770 = 80 GFLOPs

TDP HD6930 = 225 W
TDP HD7770 = 80 W

[LSA]

Дякую. Сьогодні приїде 6930.
Вибрав по FP64 HD6930 = 480 GFLOPs

[TyphooNick]

LSA,
TDP HD 6930 в 3D режимі 200 W, в 2D - 20 W. Більше того, це максимальне мпоживання електроенергії (пікове). В Умовах реальної роботи воно буде однозначно меншим. Правда, якщо розігнати до 920 MHz, то споживання енергії виросте, але продуктивність підніметься з 480 GFLOPs до приблизно 589 GFLOPs

[Rilian]

Сегодня, 25 октября, в возрасте 69 лет ушел из жизни Эмануэль Стюард

Об этом на своей странице в Твиттере сообщил воспитанник и друг легендарного тренера Джонатон Бэнкс, который готовит Владимира Кличко к бою против польского боксера Мариуша Ваха.

"Он ушел, но никогда не будет забыт. Ты провел хороший бой, и закончил свой путь. Со слезами на глазах я говорю: Покойся с миром, Эмануэль Стюард", - написал Бэнкс.

Напомним, ранее у Эмануэля Стюарда диагностирован рак. Из-за внезапно выявленного заболевания готовить Кличко к бою с Вахом начал его воспитанник Джонатон Бэнкс.

[LSA]

Прискорбно. Земля йому пухом.
А для проекту
тут
http://www.techpowerup.com/forums/showthread.php?t=174138
є апп_інфо для HCC
ATI/AMD GPU ONLY (No CPU work)
ATI/AMD GPU and GFAM
NVIDIA GPU Only
NVIDIA GPU and CPU HCC

[TyphooNick]

А все же прискорбно, что такое благое дело, как борьба с онкозаболеваниями, лишено поддержки такого распостраненного семейства как Radeon 4*** серии. А ведь у многих еще стоят эти рабочие лошадки, которые в свое время "и Nvidia на скаку останавливали, и в горячие новинки комфортно позволяли войти". Вот и моя "запаска" Sapphire HD 4890 New Edition для общего блага поработала бы.
Кстати, смотря на все это, складывается ощущение, что видеокарты сегодня все больше приобретают очертания процессоров (в классическом, конечно же, понимании). Это неплохо с точки зрения развития и прогресса, но грозит в определенных масштабах, особенно во временных, несовместимостью как аппаратной, так и програмной. Остается надеяться, что такая жертва не будет слишком значительной для технологического прыжка. Будем посмотреть...

[LSA]

Маркетинг у всьому виною. Карти попередніх поколінь могли-б ще послужити, але нові розробки потрібно окупати, а за старі дєнюшка вже отримана...
Для цього і вводяться нові функції і набір команд, підкупаються корпорації для підтримки потрібного софту чи заліза. Це стосується всієї комп. індустрії, та мабуть і взагалі...

[x3mEn]

Кранчери і майнери, мабуть, найвимогливіші користувачі відях і на якісь сумнівні "покращення" не ведуться.
Як показала практика, не дивлячись на маркетингові потуги, 6ххх серія вцілому була дуже прохолодно сприйнята володарями 5ххх серії.

а вже 7ххх серія має низку переваг над 6ххх:
- перехід з 40нм на 28нм техпроцес - менше енергоспоживання
- підтримка подвійної точності для карт середньої ланки (від 7750 і вище)

4ххх серія дійсно була досить цікавою свого часу, але це 55 нм техпроцес, за показником FP64 GFLOPs/TDP 4890 поступається 7970 утричі.

[TyphooNick]

x3mEn,
Згоден повністю.
А якщо до уваги взяти просунутий теселятор і розгін більше як 35% у 7*** серії, додати значне (порівняно) покращення роботи з новими драйверами, - а з цим у AMD були в свій час проблеми,- отримуємо якраз те, що потрібно і одним і іншим. Але ж хочеться, щоб саме ТИМ воно залишалося всюди й довше)

[x3mEn]

TyphooNick, яка користь кранчеру чи майнеру від теселяції?

[TyphooNick]

TyphooNick, яка користь кранчеру чи майнеру від теселяції?

Здавалось би ніякої, але...
1. Є велика ймовірність, що відповідне програмне забезпечення почне її або його (теселяцію програмну або апаратний теселятор) використовувати.
2. Більше шансів не викинути адаптер через якийсь період, а продати його як ще актуальний продукт геймеру.
3. Кранчер теж, мабуть, людина, якій хочеться побігати в якісь сучасні ігри, які все частіше використовують теселяцію.
4. Та й взагалі, просто тішитися, що воно є)

[tiss]

TyphooNick, яка користь кранчеру чи майнеру від теселяції?

Сотрудник стоя у меня за спиной прочитал твой пост и спрашивает "Это разговор об онанизме или петтинге?"