Folding на Mac Os, обсуждение Налаштування

[nikelong]

В этой теме предлагаю обсуждать работу фолдинга на компьютерах Макинтош.

Ну и для начала - Folding@Home Monitor Widget

Может, кому пригодится

Статья у нас на сайте.

Це повідомлення відредагував nikelong: Dec 27 2010, 00:06

[tasiziso]

У нас на форуме есть хотя-бы один человек, который работает за макинтошем, а не видел его на витрине?

Я к чему - хотя-бы поставить на мак клиент, рассказать как оно работает. Шоб хоть статейку наваять какую-то...

есть. работаю и девелоплю на нем. фолдин уже больше месяца консольный пашет. спрашивайте. отвечу
iMac 17", C2D 2Ghz, 2GB ram

[nikelong]

tasiziso,
Ну сорри, я попрошу вас напрячся

Вобщем, от Вас нужна статья, пообширнее

Вопросы стандартны: шо качать, как устанавливать, как настраивать, какие-то особенности работы осветлить.
А то тот обрэзок что у нас есть:
https://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=131
ну никак не катит до уровня статьи хотя-бы этой:
https://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=115

[Rilian]

14:02:01] Completed 107500 out of 250000 steps (43%)
[14:16:02] - Autosending finished units... [August 21 14:16:02 UTC]
[14:16:02] Trying to send all finished work units
[14:16:02] + No unsent completed units remaining.
[14:16:02] - Autosend completed
[14:19:49] Completed 110000 out of 250000 steps (44%)
[14:37:33] Completed 112500 out of 250000 steps (45%)
[cli_1]: aborting job:
Fatal error in MPI_Sendrecv: Error message texts are not available
[cli_2]: [cli_3]: aborting job:
Fatal error in MPI_Sendrecv: Error message texts are not available
aborting job:
Fatal error in MPI_Sendrecv: Error message texts are not available
[cli_0]: aborting job:
Fatal error in MPI_Sendrecv: Error message texts are not available
[14:44:51] CoreStatus = 1 (1)
[14:44:51] Sending work to server
[14:44:51] Project: 2677 (Run 12, Clone 78, Gen 37)
[14:44:51] - Error: Could not get length of results file work/wuresults_03.dat
[14:44:51] - Error: Could not read unit 03 file. Removing from queue.
[14:44:51] Trying to send all finished work units
[14:44:51] + No unsent completed units remaining.

так и не понял в чем проблема...

[Death]

fsck?

[Rilian]

посмотрим, если со второй ВЮ ничего не случится - будет считаться на ноуте

[whynot]

memtest86 (или что нужно для этой платформы). Похожие траблы -- кто-то дохнет, то-ли MB, то-ли RAM. Такое ощущение что лечится -- простоем (дать остыть?).

[Rilian]

досчитал еще одну ВЮ, не понятно она отправилась вообще или нет

[09:31:47] Completed 235000 out of 250000 steps (94%)
[09:51:10] Completed 237500 out of 250000 steps (95%)
[10:17:47] Completed 240000 out of 250000 steps (96%)
[10:38:15] Completed 242500 out of 250000 steps (97%)
[10:59:41] Completed 245000 out of 250000 steps (98%)
[11:28:13] Completed 247500 out of 250000 steps (99%)
[11:56:34] Completed 250000 out of 250000 steps (100%)

Writing final coordinates.

Average load imbalance: 3.0 %
Part of the total run time spent waiting due to load imbalance: 2.2 %
Steps where the load balancing was limited by -rdd, -rcon and/or -dds: Z 0 %


Parallel run - timing based on wallclock.

NODE (s) Real (s) (%)
Time: 20308.000 20308.000 100.0
5h38:28
(Mnbf/s) (GFlops) (ns/day) (hour/ns)
Performance: 96.057 4.034 0.319 75.231

gcq#63080: Thanx for Using GROMACS - Have a Nice Day

[11:56:39] DynamicWrapper: Finished Work Unit: sleep=10000
[11:56:49]
[11:56:49] Finished Work Unit:
[11:56:49] - Reading up to 21200688 from "work/wudata_04.trr": Read 21200688
[11:56:49] trr file hash check passed.
[11:56:49] - Reading up to 27162548 from "work/wudata_04.xtc": Read 27162548
[11:56:51] xtc file hash check passed.
[11:56:51] edr file hash check passed.
[11:56:51] logfile size: 200416
[11:56:52] Leaving Run
[11:56:56] - Writing 48708404 bytes of core data to disk...
[11:56:59] ... Done.
[11:57:30] - Shutting down core
[11:57:30]
[11:57:30] Folding@home Core Shutdown: FINISHED_UNIT
Error encountered before initializing MPICH

тут оно висело пару минут , нажал Ctrl+C

(Show/Hide)

[11:59:15] ***** Got an Activate signal (2)
[11:59:15] Killing all core threads

Folding@Home Client Shutdown.
macbookr:Folding@home.app rilian$ ./fah6 -verbosity 9

Note: Please read the license agreement (fah6 -license). Further
use of this software requires that you have read and accepted this agreement.

2 cores detected


--- Opening Log file [August 23 11:59:18 UTC]


# Mac OS X SMP Console Edition ################################################
###############################################################################

Folding@Home Client Version 6.24R1

http://folding.stanford.edu

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /Users/rilian/Library/Folding@home
Executable: ./fah6
Arguments: -verbosity 9

[11:59:18] - Ask before connecting: No
[11:59:18] - User name: Dmitriy_Sukhomlynov_aka_Rilian (Team 2164)
[11:59:18] - User ID: 6B769C2A3A870D8F
[11:59:18] - Machine ID: 1
[11:59:18]
[11:59:18] Loaded queue successfully.
[11:59:18] - Autosending finished units... [August 23 11:59:18 UTC]
[11:59:18] Trying to send all finished work units
[11:59:18] + No unsent completed units remaining.
[11:59:18] - Autosend completed
[11:59:18]
[11:59:18] + Processing work unit
[11:59:18] At least 4 processors must be requested; read 1.
[11:59:18] Core required: FahCore_a2.exe
[11:59:18] Core found.
[11:59:18] - Using generic /Applications/Folding@home.app/mpiexec
[11:59:18] Working on queue slot 04 [August 23 11:59:18 UTC]
[11:59:18] + Working ...
[11:59:18] - Calling '/Applications/Folding@home.app/mpiexec -np 4 -host 127.0.0.1 ./FahCore_a2.exe -dir work/ -suffix 04 -checkpoint 5 -verbose -lifeline 11014 -version 624'

[11:59:18]
[11:59:18] *------------------------------*
[11:59:18] Folding@Home Gromacs SMP Core
[11:59:18] Version 2.07 (Sun Apr 19 14:29:51 PDT 2009)
[11:59:18]
[11:59:18] Preparing to commence simulation
[11:59:18] - Ensuring status. Please wait.
[11:59:18] Project: 0 (Run 0, Clone 0, Gen 0)
[11:59:18]
[11:59:18] - Writing "": (overwrite)Could not open "" for writing!
[11:59:18] Error: Could not write local file. Exiting.
[11:59:23] - Shutting down core
^C[11:59:26] ***** Got an Activate signal (2)
[11:59:26] Killing all core threads

Folding@Home Client Shutdown.
macbookr:Folding@home.app rilian$ ./fah6 -verbosity 9 -send all

Note: Please read the license agreement (fah6 -license). Further
use of this software requires that you have read and accepted this agreement.

2 cores detected


--- Opening Log file [August 23 11:59:29 UTC]


# Mac OS X SMP Console Edition ################################################
###############################################################################

Folding@Home Client Version 6.24R1

http://folding.stanford.edu

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: /Users/rilian/Library/Folding@home
Executable: ./fah6
Arguments: -verbosity 9 -send all

[11:59:29] - Ask before connecting: No
[11:59:29] - User name: Dmitriy_Sukhomlynov_aka_Rilian (Team 2164)
[11:59:29] - User ID: 6B769C2A3A870D8F
[11:59:29] - Machine ID: 1
[11:59:29]
[11:59:29] Loaded queue successfully.
[11:59:29] Attempting to return result(s) to server...
[11:59:29] Trying to send all finished work units
[11:59:29] + No unsent completed units remaining.
[11:59:29] ***** Got a SIGTERM signal (15)
[11:59:29] Killing all core threads

Folding@Home Client Shutdown.
macbookr:Folding@home.app rilian$ [0]1:Return code = 0, signaled with Quit

macbookr:Folding@home.app rilian$

твайумать, у нас есть кнопочка "спойлер" шоб такие длинные простыни ныкать подкат!

Це повідомлення відредагував nikelong: Aug 23 2009, 23:21

[whynot]

Судя по этому -- нет. Сам SMP не юзаю, однако, если я правильно понимаю шум из этой области, то ругань на этот MPICH это нормально (могу очень сильно ошибаться). Может оно не висело? В паралельном мире OSX какая-нибудь пародия на tcpdump(8) есть?

[Rilian]

Я хз, потом через пару дней в списке процессов еще обнаружил FahCore_*

3 дня проц времени зря потратил

[Gred]

Столкнулся с такой проблемой, имеется программа для просмотра видео Plex, которой очень хочется пользоваться. Но она не тянет 1080р фильмы елси параллельно с ней работает фолдинг. На маке остановка фолдинга немного глючная, и частенько слетают WU, поэтому останавливать рассчеты каждый раз когда хочется посмотреть кино совсем не хочется. Может кто подскажет способ задать фолдингу на UNIX низкий приоритет, а Plex высокий? Пробовал через renice +20 на Plex - не помогло.

[Rilian]

Gred,

sudo renice -n20 folding_app_PID

я когда-то видел скрипт который получает PID по имени, и весь ренайс добавлял в крон, чтобы ренайс подцеплял новые ВЮшки самостоятельно

[Gred]

Gred,

sudo renice -n20 folding_app_PID

я когда-то видел скрипт который получает PID по имени, и весь ренайс добавлял в крон, чтобы ренайс подцеплял новые ВЮшки самостоятельно

Не, -20 на фолдинг тоже не помогает. Сделал даже -20 на фолдинг и +20 на Plex - все равно страшно тормозит, фолдинг грузит процессор на 330%, Plex - на 65-70. Стоит выключить фолдинг и плекс берет 100-120 и играет без тормозов. Так главное VLC играет те же фильмы при загрузке процессора 30% и не тормозит абсолютно, но зараза не хочет звук по цифре выводить, а в стерео смотреть не кайф. Обидно .

[Rilian]

-n это параметр

"20" - минимальный приоритет

"-20" - максимальный

сорри за оффтопик, но, ты участвуешь в QCN ?

[Gred]

-n это параметр

"20" - минимальный приоритет

"-20" - максимальный

сорри за оффтопик, но, ты участвуешь в QCN ?

Вот что я ввожу в терминале
Gred:~ evgeniy$ sudo renice -n -20 99477
Password:
Gred:~ evgeniy$ sudo renice -n +20 99567
(99477 - FahCore_a3.exe, 99567 - Plex)
При этом не замечаю абсолютно никаких изменений в скорости проигрывания, ни капли.

Не, в QCN не участвую, у меня хакинтош, акселерометра нету. Я вообще из РВ считаю только фолдинг и с недавних пор PrimeGrid когда challenge .

[Rilian]

sudo renice -n 20 99477

sudo renice -n -20 99567

+20 - это минимальный приоритет. для Фолдинга
-20 - максимальный приоритет. Для проигрывателя