Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[Rilian]

в проекте приблизительно 6% тасков - с ошибками или отправленные на валидацию

поэтому, по уточненным данным, посчитано 135 323 199 тасков, из них реальные 135 323 199 * 0.94 = 127 203 807

осталось досчитать 210 000 000 - 127 203 807 = 82 796 193 * 1.06 = 87 763 964

при средней недельной скорости 218 000 это 87 763 964 / 218 000 = 402 дня

[Rilian]

в проекте приблизительно 6% тасков - с ошибками или отправленные на валидацию

поэтому, по уточненным данным, посчитано 137,044,748 тасков, из них реальные 137,044,748 * 0.94 = 128 822 063

осталось досчитать 210 000 000 - 128 822 063 = 81 177 937 * 1.06 = 86 048 613

при средней недельной скорости 215 600 это 86 048 613 / 215 600 = 399 дней

[Rilian]

в проекте приблизительно 6% тасков - с ошибками или отправленные на валидацию

поэтому, по уточненным данным, посчитано 139,985,389 тасков, из них реальные 139,985,389 * 0.94 = 131586266

осталось досчитать 210 000 000 - 131586266 = 78413734 * 1.06 = 83118558 заданий

при средней недельной скорости 210 000 это 83118558 / 210 000 = 395 дней

[Rilian]

обновление статуса, и также кратко о HCC2

Grid members,

The March 2011 update for the Help Conquer Cancer project has been posted. In this update, we announce an increase in the number of HCC work units, discuss the continuing work on modeling protein crystallization changes over time, compare our automatic scoring system to human experts in a real-world test, and share some other news from our lab.

Thank you to all World Community Grid members for your enthusiasm and your donations of compute time. This research would not be possible without you.

Christian A. Cumbaa
Research Associate, Ontario Cancer Institute
University Health Network

http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/UPDATE-MAR2011.pdf

[Rilian]

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,31041

бета тест (только windows). по идее новый клиент на Виндовс будет также ускорен как и под линукс/мак

[Rilian]

http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,31096

В связи с некоторыми изменениями при выпуске новой версии клиента 6.42 БУДУТ перебои в выдаче ВЮ

поэтому во избежание простоев ваших компьютеров, убедитесь что в вашем аккаунте в нужных профилях стоит галка "If there is no work available for my computer for the projects I have selected above, please send me work from another project."

[corsar83]

Чото долго нету новой версии и заданий, уже пора бы

[akostyrin]

Началась раздача новых ВЮ с версией 6.42!

[corsar83]

Началась раздача новых ВЮ с версией 6.42!

Да пошли уже. Стало быстрей где-то на 30%. На линухе все же шустрее.

[Rilian]

Ура! Кранчим дальше!

[cosmo_vk]

судя по возросшей скорости обсчета, проект закончиться через 200 с небольшим дней.

[Rilian]

Расчехляю лучеметы для пентатлона

[Rilian]

Неплохо пентатлон подтолкнул ежедневные сливы..7



таким темпом проект закончится через 144 дня

[Rilian]

через 2 дня, 19 мая 2011, Алекс, админ проекта Majestic-12, подарит нам 1 день вычислений HCC на своем 1-терафлоповом сервере!

http://www.majestic12.co.uk/forum/viewtopi...p?p=54736#54736

Предлагаю присоединиться к этому знаменательному событию и поставить новый командный рекорд по дневным сливам

В топик приглашаются наши веселые фермеры

[Bel]

А это только нам такие привилегии? Конечно приятно, но если нам одним, то за что тогда?