FiND@Home, поиск лекарств от «забытых» тропических болезней |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
FiND@Home, поиск лекарств от «забытых» тропических болезней |
Arbalet |
Dec 23 2014, 02:55
Пост
#1
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
FiND@Home (FightNeglectedDiseases@Home) - «Боремся с забытыми болезнями дома»
Организаторы проекта: Лаборатория комплексных и адаптивных систем из Университетского колледжа Дублина, Ирландия Официальный сайт проекта - http://findah.ucd.ie/index.php Описание целей и задач проекта FightNeglectedDiseases@Home Текущей целью проекта FiND@Home является поиск целевых белков для новых противомалярийных препаратов в рамках подпроекта FightMalaria@Home. Переоценить актуальность борьбы с малярией сложно. Страшная статистика такова: малярия убивает одного ребенка каждые 45 секунд. Заболевание наиболее распространено в бедных странах Африки, где ежегодно поражает до 216 млн. человек и убивает 650 тысяч из них, в основном - детей в возрасте до 5 лет (данные Всемирной организации здравоохранения – ВОЗ). Проблема усугубляется тем, что возбудитель заболевания - малярийный плазмодий Plasmodium falciparum, который передается с укусами малярийных комаров, стремительно приспосабливается к имеющимся лекарственным препаратам. Поэтому очень важно не прекращать поиск новых лекарственных средств, ориентированных на «выключение» новых белков в клетках организма паразита. Геном малярийного плазмодия успешно секвенирован, его протеом (набор белков) известен. Доступны модели кристаллических структур многих целевых белков Plasmodium falciparum, а оставшиеся без таковых - могут быть смоделированы с использованием имеющихся структурных шаблонов. Крупные научно-исследовательские организации (GSK, Novartis) уже опробовали миллионы соединений и отсеяли из них 19 тысяч «хитов» - потенциально эффективных лекарственных молекул, которые показывают многообещающую активность в отношении малярийного плазмодия (MMV). Но они еще не знают, какие целевые белки плазмодия ингибируется этими соединениями. Разработка новых лекарственных средств будет значительно ускорена, если будет известен целевой белок для каждого из обнаруженных «хитов». Исследователи в рамках проекта FiND@Home планируют провести молекулярное моделирование докинга (стыковки) каждого из обнаруженных 18924 хитов-соединений с каждым из 5363 белков, содержащихся в малярийном плазмодии. Требуемая для выполнения этой задачи вычислительная мощь поистине колоссальна и организаторам проекта крайне необходимы компьютерные ресурсы участников распределенных вычислений со всего мира, использующих BOINC-платформу для помощи научным исследованиям. Результаты проекта FightMalaria@Home: полная база полученных результатов доступна на данном сайте - http://chemware.ucd.ie/FiNDaH/Malaria.php Добавить проект в BOINC-менеджере можно по ссылке - http://findah.ucd.ie/ Ссылка на команду Ukraine в статистике проекта FiND@Home - http://findah.ucd.ie/team_display.php?teamid=21 -------------------- (Show/Hide) |
Sergyg |
Feb 23 2015, 23:29
Пост
#16
|
Гидробиолог Група: Trusted Members Повідомлень: 947 З нами з: 1-April 09 З: Dnipropetrovsk Користувач №: 980 Стать: Чол Парк машин: мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU |
долевое участие
|
Arbalet |
Feb 24 2015, 00:06
Пост
#17
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
-------------------- (Show/Hide) |
Arbalet |
Feb 26 2015, 17:56
Пост
#18
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Координатор проекта сообщил, что вскоре нас ожидает мега-пачка новых заданий - на 60 млн. штук!
Он как раз подчищает базу данных для ее загрузки. Говорит, что ему нравится, чем мы тут занимаемся. Честно признается, что результаты проекта являются частью защиты его научной степени PhD (это докторская степень в западной высшей школе). Сейчас же он готовится сосредоточиться на поиске лекарств (в лабораторных условиях) от Rhodococcus equi - внутриклеточной бактерии-паразита, вызывающей туберкулез у жеребят. Но проект закрывать не планирует. -------------------- (Show/Hide) |
Arbalet |
Mar 24 2015, 11:53
Пост
#19
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Перед обещанными 60 млн. WU, попросили просчитать 5,610,195 заданий.
-------------------- (Show/Hide) |
mr11 |
Dec 4 2016, 01:49
Пост
#20
|
Трохи обжився Група: Trusted Members Повідомлень: 28 З нами з: 15-January 10 Користувач №: 1 271 Стать: bot Парк машин: Phenom || X4 955, 4гб РАМ. |
Завдання то 6, то 16, то 26, то 36 хвилин рахуються. Причому, прогрес-бар абсолютно неадекватний. І ще й завдань накачало як із переляку, а дедлайн 1 день.
|
Lo-Fi Версія | Поточний час: 26th September 2024 - 15:35 |