Poem@home, Моделирование структуры белка |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Poem@home, Моделирование структуры белка |
nikelong |
Dec 25 2007, 18:59
Пост
#1
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Проект "Poem@home" ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Официальный сайт Статистика по команде "Ukraine" Статистика на фришниках Статистика на фришниках по команде "Ukraine" ТОП-20 участников: ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Дата основания команды - 22.10.2007 Капитан - uNiUs ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Для присоединения к команде Украины: 1. Загрузите BOINC менеджер (Если его у Вас еще нет!) 2. Перейдите в "расширенный вид" 3. Выберите сервис ---> добавить проект 4. Введите адрес проекта http://boinc.fzk.de/poem/ 5. Введите свои регистрационные данные. 6. Найдите нашу команду. Она называется Ukraine и адрес ее статистики вы могли видеть выше. 7. Если есть доступные для загрузки задания Вы их получите и начнете расчеты. ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Полезная информация: Для идентификации пользователя в BOINC могут служить 2 вещи: 1) пара e-mail/пароль 2) межпроектный идентификационный ID (Cross-project ID) - 32значное шестнадцатиричное число. Если Вы пожелаете подключится ещё и к другому BOINC-проекту, то помните: чтобы не плодить новых аккаунтов при подключении к новому проекту или команде, нужно обязательно везде регистрироваться с одним и тем же e-mail/паролем либо CPID. если при регистрации в проекте указать другие e-mail или пароль, BOINC создаст новый аккаунт с тем же именем! ---------------------------------------------------------------------------------------------------------- Описание проекта: Моделирование струтуры белка, используется модифицированный метод молекулярной динамики с помощью стохастической оптимизации. Проект занимается поиском молекул, которые могут заблокировать хемокины (хемотаксические цитокины), что даст возможность блокировать различные процессы в организме на уровне клеточных рецепторов, например, остановить воспалительный процесс. Ведется совместная работа с проектами, посвященными малярии, онкологии, болезни Алцгеймера. В будущем планируется разработать метод моделирования белковых молекул, которые уже могут использовать фармацевты, врачи, ученые, а также детально изучить структуру мебранных белков. Вопрос: "Действительно ли поект POEM@Home отличается от других проектов, изучающих белки?" (Show/Hide) Вопрос: "Сворачивая новую последовательность, как ваш метод будет моделировать действие компаньонок (не нашел другого значения слова chperones) ? Вы участвовали в каком-нибудь недавнем соревновании CASP?" (Show/Hide) Вопрос: Мы хотели бы знать о болезнях, которые Poem@Home мог помочь лечить? (Show/Hide) Вопрос: Что Вы можете сказать на утверждение доктора Бейкера: Розетта использует физически детальную модель всего атома, и была бесспорно лучшим методом до настоящего времени для новых всерток, а также для того, чтобы проектировать новые белки. (Show/Hide) Ссылки по теме:График ППД команды за последние 60 дней: (Show/Hide) http://www.boinc-af.org/content/view/806/219/ http://www.dp.by/wiki/Projects/Poemathome http://wiki.bc-team.org/index.php?title=POEM%40home/en http://www.irelandboinc.com/projects/40-pr...ts/102-poemhome Це повідомлення відредагував x3mEn: May 23 2012, 21:17 |
netphil |
Oct 27 2012, 11:55
Пост
#316
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 110 З нами з: 7-April 12 Користувач №: 2 992 Стать: Чол |
Bel,
я прехожу в ВЦГ только после переустановки БОИНК - нифига не работает ВЦГ 27.10.2012 12:52:59 Starting BOINC client version 6.10.58 for windows_x86_64 27.10.2012 12:52:59 log flags: file_xfer, sched_ops, task 27.10.2012 12:52:59 Libraries: libcurl/7.19.7 OpenSSL/0.9.8l zlib/1.2.3 27.10.2012 12:52:59 Data directory: C:\Program Files (x86)\BOINC\DATA 27.10.2012 12:52:59 Running under account netphil 27.10.2012 12:52:59 Processor: 8 GenuineIntel Intel® Core i7-2600K CPU @ 3.40GHz [Family 6 Model 42 Stepping 7] 27.10.2012 12:52:59 Processor: 256.00 KB cache 27.10.2012 12:52:59 Processor features: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss htt tm pni ssse3 cx16 sse4_1 sse4_2 nx lm vmx tm2 popcnt aes pbe 27.10.2012 12:52:59 OS: Microsoft Windows 7: Enterprise x64 Edition, Service Pack 1, (06.01.7601.00) 27.10.2012 12:52:59 Memory: 7.96 GB physical, 15.93 GB virtual 27.10.2012 12:52:59 Disk: 488.18 GB total, 415.28 GB free 27.10.2012 12:52:59 Local time is UTC +3 hours 27.10.2012 12:52:59 ATI GPU 0: ATI unknown (CAL version 1.4.1741, 3072MB, 5151 GFLOPS peak) 27.10.2012 12:52:59 World Community Grid URL http://www.worldcommunitygrid.org/; Computer ID 2198696; resource share 100 27.10.2012 12:52:59 World Community Grid General prefs: from World Community Grid (last modified 13-Oct-2012 10:40:35) 27.10.2012 12:52:59 World Community Grid Host location: none 27.10.2012 12:52:59 World Community Grid General prefs: using your defaults 27.10.2012 12:52:59 Reading preferences override file 27.10.2012 12:52:59 Preferences: 27.10.2012 12:52:59 max memory usage when active: 4077.29MB 27.10.2012 12:52:59 max memory usage when idle: 7339.12MB 27.10.2012 12:53:00 max disk usage: 10.00GB 27.10.2012 12:53:00 don't use GPU while active 27.10.2012 12:53:00 suspend work if non-BOINC CPU load exceeds 25 % 27.10.2012 12:53:00 (to change preferences, visit the web site of an attached project, or select Preferences in the Manager) 27.10.2012 12:53:00 Not using a proxy 27.10.2012 12:53:00 Suspending computation - initial delay 27.10.2012 12:59:13 World Community Grid update requested by user 27.10.2012 12:59:15 World Community Grid Sending scheduler request: Requested by user. 27.10.2012 12:59:15 World Community Grid Not reporting or requesting tasks 27.10.2012 12:59:19 World Community Grid Scheduler request completed 27.10.2012 12:59:26 World Community Grid update requested by user 27.10.2012 12:59:26 World Community Grid update requested by user 27.10.2012 12:59:26 World Community Grid update requested by user 27.10.2012 12:59:29 World Community Grid Sending scheduler request: Requested by user. 27.10.2012 12:59:29 World Community Grid Not reporting or requesting tasks 27.10.2012 12:59:31 World Community Grid Scheduler request completed |
Sonechko |
Oct 27 2012, 21:34
Пост
#317
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 311 З нами з: 27-June 08 З: Київ Користувач №: 768 Стать: НеСкажу Парк машин: Ryzen 1700X 3.6GHz, 32G RAM, MSI Gaming 2xRX480 4G |
10/27/12 17:53:27 | | Starting BOINC client version 6.12.34 for windows_x86_64
10/27/12 17:53:27 | | ATI GPU 0: ATI Radeon HD 5700 series (Juniper) (CAL version 1.4.1741, 512MB, 1360 GFLOPS peak) Може тому і працює? Там взагалі радять апгрейднутись на 7-у версію, але у мене не пахало, відуху не бачило. Але ребут допоміг) -------------------- ______
|
Sonechko |
Oct 28 2012, 19:37
Пост
#318
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 311 З нами з: 27-June 08 З: Київ Користувач №: 768 Стать: НеСкажу Парк машин: Ryzen 1700X 3.6GHz, 32G RAM, MSI Gaming 2xRX480 4G |
10/27/12 17:53:27 | | Starting BOINC client version 6.12.34 for windows_x86_64 10/27/12 17:53:27 | | ATI GPU 0: ATI Radeon HD 5700 series (Juniper) (CAL version 1.4.1741, 512MB, 1360 GFLOPS peak) Може тому і працює? Там взагалі радять апгрейднутись на 7-у версію, але у мене не пахало, відуху не бачило. Але ребут допоміг) 10/28/12 19:02:51 | | Starting BOINC client version 7.0.28 for windows_x86_64 10/28/12 19:02:51 | | ATI GPU 0: Juniper (CAL version 1.4.1741, 512MB, 479MB available, 2720 GFLOPS peak) От звідки кукурудзяні Гфлопси беруться=) Стидоба кароч -------------------- ______
|
mysterix |
Nov 29 2012, 13:40
Пост
#319
|
кранчер-новачок Група: Trusted Members Повідомлень: 52 З нами з: 12-July 07 З: Кривой Рог Користувач №: 555 Стать: Чол Парк машин: PIV 3ГГц (630), 3ГБ ОЗУ DDR2, ATI HD5450 512МБ DDR2 |
что-то перестали приходить таски - всё время отписывает, что ваш файл апп_инфо не имеет годной версии поем++. Написал на официальном форуме, пока не ответили. Уже пол дня простоя.
----- P.S. Ага, кажется, прояснилось. Как мне указали, на странице состояния проекта пишет, что нет тасков для ГПУ. http://boinc.fzk.de/poem/server_status.php |
eugeny |
Feb 17 2013, 17:57
Пост
#320
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 431 З нами з: 2-May 09 З: Запорожье Користувач №: 1 016 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i7-8700K@4300 32GB@3200 GTX1080Ti@1900 |
Небольшое исследование на i7-2600K@4500 16GB@1866 GTX470@1512:
курсивом выделены задания, которые считались вместе с llr avx жирным - считались только poem opencl задания на 1,3,5,7 ядрах Что-то мне подсказывает, что оптимальный вариант - по 2 задания, на крайняк по 3. -------------------- |
mysterix |
Mar 24 2013, 18:00
Пост
#321
|
кранчер-новачок Група: Trusted Members Повідомлень: 52 З нами з: 12-July 07 З: Кривой Рог Користувач №: 555 Стать: Чол Парк машин: PIV 3ГГц (630), 3ГБ ОЗУ DDR2, ATI HD5450 512МБ DDR2 |
Что-то я не пойму. Перестали отправляться и приходить задания. Вылазит какая-то новая ошибка.
это только у меня так? P.S. Сервер лёг, что ли. ------------------ А вот сейчас только-что задания отправились, но новые не пришли. Уже без ошибки - просто не пришли. И сайт poem не открывается. Хотя на boinc.ru пишет наличие заданий. ------------------------- Ага, сервер заработал, задания потихоньку стали приходить. |
DAlex |
Apr 4 2013, 14:44
Пост
#322
|
Трохи обжився Група: Trusted Members Повідомлень: 16 З нами з: 30-March 06 Користувач №: 199 Стать: Чол Парк машин: Intel(R) Core(TM) i7 CPU Q 740 @ 1.73GHz [Family 6 Model 30 Stepping 5] (8 processors) AuthenticAMD AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core Processor 5200+ [Family 15 Model 107 Stepping 2] (2 processors) GenuineIntel Intel(R) Core(TM)2 CPU 6300 @ 1.86GHz [Family 6 Model 15 Stepping 2] (2 processors) |
Перестали отправляться и приходить задания.
Сервер лёг, что ли? |
Rilian |
Apr 4 2013, 15:35
Пост
#323
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Перестали отправляться и приходить задания. Сервер лёг, что ли? Да, сайт лежит! Для таких случаев я всем рекомендую на всех компах иметь "запасной проект". Например для POEM это Rosetta@home в запасном проекте установите в своем профиле на сайте Resource Share = 0 в этом случае проект будет получать задания только при невозможности получения заданий с активного проекта -------------------- |
Rilian |
Jun 22 2013, 09:38
Пост
#324
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
-------------------- |
eugeny |
Jul 28 2013, 18:33
Пост
#325
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 431 З нами з: 2-May 09 З: Запорожье Користувач №: 1 016 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: i7-8700K@4300 32GB@3200 GTX1080Ti@1900 |
Загрузка cpu в 4 потока :
-------------------- |
Rilian |
Jul 28 2013, 20:46
Пост
#326
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
У меня грузит видяху + 1 CPU ядро на 2-ядерной машине
-------------------- |
Rilian |
Sep 12 2013, 17:58
Пост
#327
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
-------------------- |
Arbalet |
Sep 22 2013, 23:11
Пост
#328
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Следите за потоками, иногда один может сглючить и зависнуть, пока его вручную не перезапустишь, вот как у меня - 54 часа холостого хода...
-------------------- (Show/Hide) |
DonDrakon |
Dec 31 2013, 11:26
Пост
#329
|
Соромлюсь щось писати Група: New Members Повідомлень: 14 З нами з: 7-August 13 Користувач №: 3 279 Стать: Чол Free-DC_CPID |
Чекаємо нових цікавих завдать для відеокарт після нового року:
The POEM++ OpenCL project 'gpucrystal' is going to be finalized soon. In other words no more work units will be created, and as soon as the circulating jobs are finished, the queue will run dry. We are currently working on a follow-up project, which will start in January 2014, accompanied by a new POEM release. Thank you all for contributing your GPU power to this project. Please use this POEM OpenCL rest period to support other great projects in the BOINC network. I'm looking forward to see your GPU back at POEM next year. |
egorio |
Mar 23 2014, 22:14
Пост
#330
|
I am with Stupid Група: Trusted Members Повідомлень: 648 З нами з: 2-June 08 З: Киева Користувач №: 751 Стать: Чол Free-DC_CPID |
Появились задания для GPU
|
Lo-Fi Версія | Поточний час: 27th September 2024 - 03:14 |