Influenza Antiviral Drug Search phase 1 [intermittent], Поиск лекарств от простуды и гриппа |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Influenza Antiviral Drug Search phase 1 [intermittent], Поиск лекарств от простуды и гриппа |
Rilian |
May 5 2009, 18:04
Пост
#1
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Поиск лекарств от простуды и гриппа / Influenza Antiviral Drug Search Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid
Миссия проекта Целью проекта Influenza Antiviral Drug Search является поиск новых лекарственных средств, останавливающих распространение вируса гриппа в организме человека. Объектами исследования стали резистентные (устойчивые к действию лекарств) штаммы, а также разновидности гриппа, не встречавшиеся ранее в природе. Определение химических соединений, эффективно подавляющих размножение гриппа, ускорит появление новых лекарств, необходимых для борьбы с сезонными вспышками, будущими эпидемиями и пандемиями гриппа. Важность проекта Каждый год в мире от гриппа и сопутствующих ему осложнений умирают сотни тысяч людей. Особенно опасный быстро распространяющийся штамм гриппа может убить миллионы жизней. Вирусы гриппа видоизменяется с устрашающей скоростью - ежегодно медики сталкиваемся с новыми их разновидностями. Вакцины от гриппа создаются в расчете на наиболее вероятный в следующем сезоне штамм, но это вовсе не гарантирует появления совершенно неожиданного варианта вируса. Наиболее эффективные в настоящее время антивирусные препараты, такие как осельтамивир (relenza) и занамивир (tamiflu) не могут справиться со всеми разновидностями гриппа. Поэтому производители лекарств постоянно находятся в роли догоняющих, вынужденных заниматься производством вакцин или лекарств, способных противостоять "чертику из табакерки" - штаммам, появление которого стало неожиданностью. Проект Influenza Antiviral Drug Search может восполнить данный пробел путем поиска химических соединений "на перспективу", которые могут стать основой лекарств для лечения самого широкого круга возможных вирусных инфекций. Исследовательский подход Основной идеей проекта Influenza Antiviral Drug Search является идентификация потенциальных кандидатов лекарственных средств, которые блокируют (ингибируют) ключевые компоненты белковой оболочки вируса гриппа — нейраминидазу (N1, N2...), NS1, гемаггютинин и др. цели. Располагая информацией о химических структурах этих целевых молекул проект ставит целью провести масштабное компьютерное моделирование, основанное на методе молекулярного докинга, чтобы определить, какие из миллионов малых молекул могут нарушить работу компонентов клеточной оболочки вируса, тем самым не давая вирусу размножаться в человеческом организме. Расчетное приложение проекта Influenza Antiviral Drug Search написано на основе специализированного программного обеспечения Autodock, предоставленного Исследовательским институтом Скриппса (Scripps Research Institute). Это ПО уже самым лучшим образом зарекомендовало себя в других проектах World Community Grid: FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together и Help Fight Childhood Cancer projects. Информация о найденных с помощью в Influenza Antiviral Drug Search перспективных кандидатах лекарственных средств будет предоставлена в научную медицинскую лабораторию для проведения дополнительных исследований. В результате наша работа приведет к созданию новых вакцин и лекарств, способных противостоять самым неожиданным и опасным вирусам гриппа. Исследователи Проект поддерживается научной командой д-ра Стэна Ватовича (Stan Watowich) из Медицинского отделения Университета Техаса в Галвестоне (The University of Texas Medical Branch), которые сотрудничают с Галвестонской национальной лабораторией (Galveston National Laboratory, UTMB). Именно в UTMB поступает все полезная информация, полученная с нашей помощью в проекте Influenza Antiviral Drug Search, с целью создания новых антивирусных препаратов. Вопросы и ответы по проекту: (Show/Hide) Скриншот графического клиента График производительности проекта: Це повідомлення відредагував Rilian: Mar 7 2010, 01:53 |
nikelong |
May 17 2009, 20:36
Пост
#31
|
Тера ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 11 909 З нами з: 19-March 05 Користувач №: 92 Стать: Чол |
Яеще в ЖЖ читал про паралели между индусской КаКой которую кололи мексиканцам пару лет назад и нынешней теорией с грипом.
Типа ахтунг - это звенья одной цепи ... -------------------- |
Arbalet |
May 17 2009, 21:03
Пост
#32
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Значит 99% переболело, выздоровело, и получило иммунитет от этой волны гриппа. И в дальнейшем их дети получат иммунитет, и так далее. Значит чем меньше лечить этот грипп, тем здоровее популяци людей. Правильно ? Грипп слишком быстро видоизменяется. Поэтому хотя эти 99% и получили иммунитет, но только от данной разновидности гриппа. И к тому же их наверняка хорошо лечили, поэтому не все из выживших перенесли бы вирус без медицинского обслуживания. Что случится, если через пару лет появится какой-нибудь вирус-жнец, убивающий четверть или даже половину всех заболевших? Неужели позволим вирусу определять, кто из живущих заслуживает смерти, а кто - нет? Если оставим все на откуп природе, то просто исчезнем как биологический вид. Нам дан разум - уникальное преимущество, и просто глупо не воспользоваться им для поиска вакцин от гриппа или таблеток от головной боли. Человек перестал быть игрушкой в руках природы и сам творит свою эволюцию. А хорошо это или плохо - вопрос философский. -------------------- (Show/Hide) |
Rilian |
May 17 2009, 21:29
Пост
#33
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Грипп слишком быстро видоизменяется. вот именно, ко всем штаммам не успеешь подобрать лекарство. в природе слабые не выдерживают конкуренции, а у нас получается что делаем лекарства от всего подряд, вследствие чего организм сам ни от чего не защищается -------------------- |
Sergyg |
May 17 2009, 21:52
Пост
#34
|
Гидробиолог Група: Trusted Members Повідомлень: 947 З нами з: 1-April 09 З: Dnipropetrovsk Користувач №: 980 Стать: Чол Парк машин: мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU |
вследствие чего организм сам ни от чего не защищается Єто не совсем правильный вывод. Если бы не современные фарм.средства и другие техники (напр., восточные, я о них ничего не знаю ) просто умирало бы гораздо больше людей, средняя продолжительность жизни была бы меньшей. Наверное, дети (и вообще потомки) в целом были бы здоровее, чем сейчас, если до репродуктивного возраста не доживали бы люди с более слабым иммунитетом. Игра с природой была бы более честной и более жестокой (для нас) С другой стороны - раньше человечество (и наш иммунитет) никогда не сталкивался с такой высокой плотностью населения, огромными скоростями и дальностью транспортных сообщений. Также повысился уровень всяческого загрязнения в планетарных масштабах. Поэтому неблагоприятные факторы для иммунитета сегодня гораздо более жёсткие, чем когда-либо. Похоже, мы создаем себе условия, в которых, если не помогать своему здоровью, вероятность выжить значительно уменьшается. Так что иммунитет у нас, имхо, довольно хороший, в конце-концов, его долго создавала эволюция и мы его имеем. Медицина - способ "не попасть в печальный, но всегда имевшийся, процент, не прошедших ест.отбор". |
Death |
May 18 2009, 11:02
Пост
#35
|
<script ///> Група: Moderators Повідомлень: 6 371 З нами з: 5-November 03 З: Kyiv Користувач №: 26 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: гидропарк jabber:deadjdona@gmail.com |
Значит чем меньше лечить этот грипп, тем здоровее популяци людей. Значит чем меньше лечить этот грипп, тем меньше и здоровее популяция людей. ))))) Если оставим все на откуп природе, то просто исчезнем как биологический вид. странно, за 100000 лет не исчезли, а тут вдруг исчезнем. -------------------- |
Rilian |
May 18 2009, 11:05
Пост
#36
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
у вас есть аргументы против того что меньшая но здоровая популяция лучше большей но больной?
-------------------- |
Sergyg |
May 18 2009, 14:57
Пост
#37
|
Гидробиолог Група: Trusted Members Повідомлень: 947 З нами з: 1-April 09 З: Dnipropetrovsk Користувач №: 980 Стать: Чол Парк машин: мозок - понад GPU, CPU та GPU+CPU |
у вас есть аргументы против того что меньшая но здоровая популяция лучше большей но больной? Рассуждая о популяции кроликов - вряд ли у кого будут такие аргументы, мы им (кроликам) искренне пожелаем (для ихнего же светлого будущего ) жёсткий отбор для здровой нации Но применительно к людям, учитывая то, что мы ими и являемся, уже не можем (ну, думаю, большинство из нас) оставаться такими же непреклонными в правоте суждений. Напротив, каждый сделает все возможное, чтобы найти возможность и помочь организму пережить очередной, опасный для жизни момент (в плане болезни). |
mzhelo |
May 18 2009, 19:36
Пост
#38
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 284 З нами з: 15-April 09 З: Днепропетровск Користувач №: 997 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Intel(R) Celeron(R) CPU 2.66GHz; Intel(R) Core2 Duo 6320 CPU 1.86GH; Intel(R) Core(TM) i7 CPU 930 @ 2.80GHz + GTX275; Intel(R) Core(TM) i5 CPU U 520 @ 1.07GHz |
у вас есть аргументы против того что меньшая но здоровая популяция лучше большей но больной? Рассуждая о популяции кроликов - вряд ли у кого будут такие аргументы, мы им (кроликам) искренне пожелаем (для ихнего же светлого будущего ) жёсткий отбор для здровой нации Но применительно к людям, учитывая то, что мы ими и являемся, уже не можем (ну, думаю, большинство из нас) оставаться такими же непреклонными в правоте суждений. Напротив, каждый сделает все возможное, чтобы найти возможность и помочь организму пережить очередной, опасный для жизни момент (в плане болезни). Тем более, своему организму или организму кого-то из своих близких. -------------------- (Show/Hide) |
Tamagoch |
May 26 2009, 22:15
Пост
#39
|
Мультікранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 731 З нами з: 27-September 03 З: Бровари Користувач №: 18 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Xeon 2690v2 (6x quiet mode), AMD Ryzen 5 3600 (6x no-HT), Intel i5 3rd gen (4x), а також все інше під рукою |
закончились задания, а точнее место на диске сервера проекта - кранчеры захавали все, что плохо лежало
Work units for the Influenza Antiviral Drug Search project will temporarily run out until the researchers are able to generate some more. They are running out of disk space running two projects at once. However more disk space should be available soon. Thank you for your patience. вот недавно решили проблему с этим самым местом на диске... The disk problem has been resolved and we are starting to prepare new work units for the project. Thanks for waiting and contributing! а все равно сыпется все подряд, кроме простуды -------------------- (Show/Hide) |
Rilian |
May 26 2009, 22:18
Пост
#40
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
у меня нормально выдавалось посл неделю. щяс включил IADS + HFCC
-------------------- |
Tamagoch |
May 27 2009, 05:19
Пост
#41
|
Мультікранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 731 З нами з: 27-September 03 З: Бровари Користувач №: 18 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Xeon 2690v2 (6x quiet mode), AMD Ryzen 5 3600 (6x no-HT), Intel i5 3rd gen (4x), а також все інше під рукою |
сегодня ночью начали поступать новые задания, все в норме
-------------------- (Show/Hide) |
Rilian |
Aug 26 2009, 17:05
Пост
#42
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
За 2 процессорных года вычислений заработал Сапфировую Медаль
-------------------- |
Rilian |
Oct 25 2009, 11:18
Пост
#43
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Очевидно, что сегодня в мире идет гонка между вирусом гриппа H1N1 и изобретателями вакцины против него. Изготовить вакцину настолько быстро, чтобы обогнать эпидемию, очень сложно, но в текущем месяце начинаются клинические испытания двух кандидатов на победу в этой гонке. Это вакцины, содержащие «вирусоподобные частицы» (virus-like particle - VLP). Возможно, эти препараты оправдают возложенные на них ожидания.
Основное биомедицинское новшество VLP-вакцин кроется в антигене - компоненте, провоцирующем ответ иммунной системы вакцинированного человека. В отличие от обычных вакцин, VLP-вакцины не содержат мертвых или ослабленных вирусов в качестве антигена, вместо этого в них содержатся белковые оболочки, выращенные в клетках растений или насекомых. С точки зрения иммунной системы эти «пустышки» ничем не отличаются от настоящих вирусов, но на самом деле они не содержат вредоносного генетического материала. «Частицы точно воспроизводят вирус, но, так как они не содержат вирусных нуклеиновых кислот, они совершенно безопасны», - говорит Полли Рой, преподаватель лондонского Института гигиены и тропических болезней. Отсутствие генетического материала также минимизирует потребность в формалине и детергентах - обычно они используются для ослабления вируса, но они же могут сделать вирус непригодным для создания вакцины. Но важнее всего то, что вакцины с вирусоподобными частицами могут быть сделаны быстро. «С момента, как ты обнаруживаешь вспышку заболевания и публикуешь генетическую последовательность возбудителя до получения пригодной к употреблению вакцины может пройти от одного до трех месяцев», - говорит Тед Росс, микробиолог и генетик, исследующий VLP в Центре изучения вакцин при университете города Питтсбурга. Это создает огромное преимущество перед существующим подходом, при котором ученые могли только надеяться создать вакцину против вируса H1N1 за семь месяцев. Новая технология достаточно мобильна, чтобы не дать вирусу перейти из одного полушария в другое, как это случилось с вирусом свиного гриппа, когда он последовал за зимой из северного полушария в южное. -------------------- |
Rilian |
Oct 30 2009, 14:42
Пост
#44
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
Sep 9, 2009
QUOTE Greetings all, We are now within 1 month left of new work for the IADS project. By my estimates, we now have between 25-30 days of new work remaining to be sent out for this project. We are waiting for the final batches to be able to give a better estimate. We will attempt to keep members up to date on estimates as we know them better. If you have any questions feel free to post them in here and we will try to answer them. Note: This project will continue at steady pace and will not have a speed up to finish it. Thanks, -Uplinger The researchers have identified 9 targets they wish to initially investigate. We are currently working on target 6 and 7 with most of 6 being completed. There has been talk of additional targets, but for now these are the most interesting. We did not know how many initial targets there would be. Вобщем 1 фаза проекта завершилась 12 октября 2009. Исследовано 9 "целей", про вторую фазу на оф форуме официально ничего не написано -------------------- |
Rilian |
Nov 5 2009, 20:20
Пост
#45
|
interstellar Група: Team member Повідомлень: 17 049 З нами з: 22-February 06 З: Торонто Користувач №: 184 Стать: НеСкажу Free-DC_CPID Парк машин: ноут и кусок сервера |
https://secure.worldcommunitygrid.org/forum...ad?thread=27840
официальный пост про завершение первой фазы проекта It's official - “Influenza Antiviral Drug Search - Phase 1” is done! Similar to our related “Discovering Dengue Drugs-Together” project, all Phase 1 results that you have generated to help find new influenza antivirals are on our disk servers. They are being processed and double-checked. Thank you for your efforts and help! Phase 1 is only the first step on our path to discovering new influenza drugs. Phase 1 has systematically tested ~3 million small "drug-like" molecules against 9 influenza neuraminidase strains (including Tamiflu-resistant and Relenza-resistant strains). These 27 million individual docking experiments were completed in ~5 months. Our 30-node high-performance cluster would have needed to run nonstop for 100 years to finish these calculations. Phase 1 identified numerous that could potentially interact with each neuraminadase target. Typically, ~90-95% of Phase 1 “hits” turn out to be false positives when tested in the laboratory. Thus, Phase 1 hits are very inefficient to pursue with laboratory testing. “Influenza Antiviral Drug Search - Phase 2” is designed to reduce the number of Phase 1 false positives. In Phase 2, we will complete ~2000 computationally demanding free energy calculations for each protein target (each calculation uses a promising Phase 1 hit)s. These calculations will eliminate many of the Phase 1 false positives and produce refined hit lists that are expected to contain ~80% true positives. Testing Phase 2 hits in the laboratory will be much more productive, efficient, and rewarding than testing Phase 1 hits. Beta testing is underway for “Discovering Dengue Drugs – Phase 2”. The programs and workflow required for ”Influenza Antiviral Drug Search - Phase 2” are similar to the dengue project. Thus, “Influenza Drug Search - Phase 2” should launch soon after “Discovering Dengue Drugs - Phase 2” starts. We look forward to your continued help and generosity as we work together to find new cures for influenza infections. All my best, and many thanks! Stan P.S. Although completed, IADS-1 will remain officially active on the grid. From time to time, we will need to test additional drug targets to help refine our evolving drug predictions, so do not be surprised if new IADS-1 workunits occasionally show up in your cache. QUOTE Это официально - "Поиск препарата против гриппа - Фаза 1" завершена! Как и наши связаны "Открывая Денге-лекарства вместе", проект, все фазы 1 результатов, что вы вызвали, чтобы помочь найти новые антивирусные гриппа на наших серверах диска. Они обрабатываются и двойной проверкой. Благодарим вас за ваши усилия и помочь! Фазы 1 является лишь первым шагом на нашем пути к открытию новых лекарственных препаратов гриппа. Фаза 1 систематически тестирования ~ 3 млн малых "наркотиков типа" молекул против гриппа 9 нейраминидазы штаммов (в том числе Тамифлю устойчивостью и Реленза-резистентные штаммы). Эти 27 миллионов отдельных экспериментов стыковке была завершена в ~ 5 месяцев. Наш 30-узел суперкомпьютерного кластера пришлось бы работать без перерыва в течение 100 лет, чтобы закончить эти расчеты. Фаза 1 выявила многочисленные элементы, которые потенциально могут взаимодействовать друг с neuraminadase цели. Как правило, ~ 90-95% Фазы 1 "хиты" оказываются ложных срабатываний при проведении испытаний в лабораторных условиях. Таким образом, этап 1 показов очень неэффективно проводить лабораторные испытания. "Грипп противовирусный препарат поиска - Фаза 2" предназначен для сокращения числа Фазы 1 ложных срабатываний. В фазе 2, мы завершим ~ 2000 требовательных бесплатный расчет энергии для каждого белка-мишени (каждого расчета используется многообещающий этап 1 записей) С. Эти расчеты позволят устранить многие из фазы 1 ложных срабатываний, а также производит изысканные списках хит, должны содержать ~ 80% истинного срабатываний. Тестирование Фазы 2 показов в лабораторных условиях будет гораздо более продуктивным, эффективным и полезным, чем стадии тестирования 1 хиты. Бета-тестирование идет на "Открывая Денге Наркотики - Фаза 2". Программы и документооборота, необходимого для "Грипп противовирусный препарат поиска - Фаза 2" похожи на денге проекта. Таким образом, "Грипп наркотиками Поиск - Фаза 2" следует начать сразу после "Открывая Денге Наркотики - Фаза 2" начинается. Мы рассчитываем на вашу неизменную помощь и щедрость, когда мы работаем вместе, чтобы найти новые методы лечения гриппозной инфекции. Все мои лучшие, и большое спасибо! Stan P.S. Хотя завершена, IADS-1 будет оставаться активным Официально на сетке. Время от времени нам понадобится для проверки дополнительных лекарственных препаратов, чтобы улучшить наш развивающийся прогнозов наркотиков, так что не удивляйтесь, если новый IADS-1 workunits иногда появляются в кэш. пс: Переводчик жжот -------------------- |
Lo-Fi Версія | Поточний час: 27th September 2024 - 07:57 |