Folding@home: помоги победить коронавирус |
Привіт Гість ( Вхід | Реєстрація )
Folding@home: помоги победить коронавирус |
Arbalet |
Mar 11 2020, 19:03
Пост
#1
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Компания Folding@home объединяет исследователей по всему миру, которые работают над тем, чтобы лучше изучить коронавирус 2019-nCoV и ускорить научные усилия по разработке новых методов спасения людей. Установив предлагаемое программное обеспечение, каждый человек может пожертвовать неиспользованные вычислительные ресурсы своего компьютера консорциуму Folding@home, исследователи которого работают над улучшением понимания структур потенциальных мишеней для лекарств против 2019-nCoV, и помочь в разработке новых методов лечения.
Данные, которые пользователи таким образом помогут генерировать, будут быстро и открыто распространяться в рамках открытого научного сотрудничества нескольких лабораторий по всему миру, предоставляя исследователям новые инструменты для разработки жизненно важных лекарств. 2019-nCoV является близким родственником коронавируса SARS (SARS-CoV) и действует аналогичным образом. Для обоих коронавирусов первый этап заражения происходит в легких, когда белок на поверхности вируса связывается с белком-рецептором на клетке легкого. Этот вирусный белок называется шипом (отмечен красным цветом на изображении ниже), а рецептор – ангиотензинпревращающий фермент 2 (ACE2). Иллюстрация, созданная Центрами по контролю и профилактике заболеваний США (CDC), показывает ультраструктурную морфологию коронавируса. Обратите внимание на шипы, расположенные на внешней поверхности вируса, которые придают ей вид короны, окружающей вирион. Терапевтическое антитело представляет собой белок, который может блокировать связывание вирусного белка с рецептором и предотвратить заражение вирусом клетки легкого. Терапевтическое антитело уже было разработано для SARS-CoV, но для создания терапевтических антител или малых молекул против 2019-nCoV ученые должны лучше понять структуру белка вирусного шипа и механизм его связывания с рецептором ACE2, необходимым для проникновения вируса в клетки человека. Белки все время движутся – они раскачиваются, складываются и разворачиваются, принимая различные формы. Поэтому необходимо изучить не одну форму вирусного шипа, а все возможные варианты с учетом колебания белка и складывания в альтернативные формы. Это позволит лучше понять, как шип взаимодействует с рецептором ACE2, и подобрать терапевтическое антитело. Уже существуют структуры вирусного шипа SARS-CoV, но они с низким разрешением, а формы шипа различаются у SARS-CoV и 2019-nCoV. У нас есть возможность оказать помощь в моделировании структуры белка-шипа 2019-nCoV и идентифицировать участки, на которые может быть нацелено терапевтическое антитело. Для этого нужно построить математические модели, но они требуют достаточной вычислительной мощности. Каждый желающий может поучаствовать в работе, установив программу Folding@home и выбрав вкладку «Any Disease» (любое заболевание) – разработчики пока не сделали опцию для направления ресурсов конкретно на коронавирус, но обещают оповестить, когда реализуют эту функцию. Один белок 2019-nCoV, протеаза, кодируемая вирусной РНК, уже кристаллизован. И хотя интересующий белок-шип 2019-nCoV еще не расшифрован, можно использовать гомологичную структуру шипа SARS-CoV для идентификации мишеней терапевтических антител. Аминат Аджиева, портал «Вечная молодость» <a href="http://vechnayamolodost.ru" target="_blank">http://vechnayamolodost.ru</a> по материалам FOLDING@HOME: FOLDING@HOME Takes Up The Fight Againist COVID-19/2019-NCOV. Немножечко полезного FAQ от Cullorblind, чтобы повысить отдачу от железа: Вижу в теме GTX 1070 на скринах , но с очень низким PPD как для GTX 1070, у которого PPD должен быть от 600к до 800к в зависимости от частоты чипа и задания. Как будто не введён passkey, а если не введён - тогда не начисляется Quick Return Bonus, с которым PPD в зависимости от мощности железа и задания в 2-10 раз выше чем без passkey. Поэтому, чтобы не профукивать PPD - и свой и команды - просьба в standalone-клиенте жамкнуть Configure, потом на вкладке Identity - на соответствующую ссылку для получения passkey на мыло, а потом из почты нужно скопипастить passkey в клиент в поля passkey и reenter. Для новичков считающих с 0 заданий - после получения passkey и 10 посчитанных заданий PPD существенно вырастет, см. скрины. Как установить небраузерный standalone-клиент: https://forums.overclockers.ru/viewtopic.php?f=21&t=395883 https://foldingathome.org/support/faq/insta...guides/windows/ Последние дней 10 - сильная напряжёнка с генерацией новых заданий в связи с огромным наплывом и новых участников и переключением нескольких кластеров из майнинга, железо может простаивать до часа в попытках дождаться у серваков своей очереди на скачивание заданий. Современные GPU имеют больше терафлопс и всегда приносят больший PPD на ватт по сравнению с CPU, условно 100 ватт на ничзкочастотном AMD 8 ядернике это 100к PPD, 100 ватт на GTX 1060 - это 500к PPD c passkey. Поэтому оптимальные по энергоэффективности конфиги - срендне-малоядерный процессор от 3 ГГц и GPU на какой есть деньги, желательно Nvidia; AMD 5700 XТ считает только последнее 22 ядро, на Vega10 считает и 21 и 22 ядро, но на них чаще бывают ошибки с последними COVID-19 related проектами -------------------- (Show/Hide) |
rpisarev |
Mar 22 2020, 21:37
Пост
#16
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 371 З нами з: 10-December 11 Користувач №: 2 868 Стать: bot |
|
gladiator_maximus |
Mar 23 2020, 08:57
Пост
#17
|
Все буде Україна! Група: Moderators Повідомлень: 1 010 З нами з: 29-January 10 З: 47°52'N,35°03'E Користувач №: 1 284 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb |
Не было бы счастья, да несчастье помогло.
Форум оживился, появился интерес к фолдингу. И первыми майнерами были как раз кранчеры, которые по фану и начинали майнить биткоин. Сейчас, когда майнинг на гпу приносит копейки, как раз в свете событий с коронавирусом вырос интерес к фолдингу, когда можно задейстовавать свои видеокарты для борьбы с болезнью. -------------------- |
Dromage |
Mar 23 2020, 12:36
Пост
#18
|
Мега ранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 1 095 З нами з: 6-March 12 З: Кривий Ріг Користувач №: 2 942 Стать: Чол Парк машин: домашня конячка: i5-4690K, домашній ішачок: pentium B970 |
Согласен.
Эпидемия - зло... Но я очень рад видеть снова старые знакомые ники на форуме (новые, если что, - тоже рад)! Не пропадайте и в годы благополучия. -------------------- |
re_SET |
Mar 23 2020, 19:41
Пост
#19
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 454 З нами з: 26-January 09 З: Волинська обл., смт. Любешів Користувач №: 911 Стать: Чол Парк машин: 1х Athlon X2 BE2300 (2.2 Ghz) 1x C2D E8200 1x C2D E2180 (2.34 Ghz) 1x C2D E2160 1x C2D E5200 (2.9 Ghz) 9x C2D E6500 (Up 3.24 Ghz) 1x C2Q Q8300 (Up 3 Ghz) |
Согласен. Эпидемия - зло... Но я очень рад видеть снова старые знакомые ники на форуме (новые, если что, - тоже рад)! Не пропадайте и в годы благополучия. -------------------- Нельзя попасть в Рай одной религии, не попав при этом в Ад всех остальных...
(Show/Hide) |
dimus8210 |
Mar 25 2020, 14:58
Пост
#20
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 699 З нами з: 24-November 13 З: Київ Користувач №: 3 348 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Ryzen 5900X, 32Gb озу, RTX3060, Ubuntu 20.04; E5-2680x2, 32Gb озу, GT1030, Ubuntu 20.04 |
https://itc.ua/news/belyj-dom-ibm-nasa-i-dr...perkompyuterov/
Белый дом, IBM, NASA и другие компании объединились для борьбы с коронавирусом с помощью суперкомпьютеров -------------------- Science knows no country, because knowledge belongs to humanity, and is the torch which illuminates the world. Science is the highest personification of the nation because that nation will remain the first which carries the furthest the works of thought and intelligence. Louis Pasteur
|
Cullorblind |
Mar 25 2020, 19:21
Пост
#21
|
Так, я створив профіль! Група: New Members Повідомлень: 1 З нами з: 25-March 20 Користувач №: 3 755 Стать: Чол |
Всем добрый вечер!
Вижу в теме GTX 1070 на скринах , но с очень низким PPD как для GTX 1070, у которого PPD должен быть от 600к до 800к в зависимости от частоты чипа и задания. Как будто не введён passkey, а если не введён - тогда не начисляется Quick Return Bonus, с которым PPD в зависимости от мощности железа и задания в 2-10 раз выше чем без passkey. Поэтому, чтобы не профукивать PPD - и свой и команды - просьба в standalone-клиенте жамкнуть Configure, потом на вкладке Identity - на соответствующую ссылку для получения passkey на мыло, а потом из почты нужно скопипастить passkey в клиент в поля passkey и reenter. Для новичков считающих с 0 заданий - после получения passkey и 10 посчитанных заданий PPD существенно вырастет, см. скрины. (чтобы сразу было видно новичкам - лучше скопипастить эту тему c passkey в верхний OП-пост, если есть F@H группа на Facebook - нужно закинуть и туда, меня в FB или прикрыли или ломанули) Как установить небраузерный standalone-клиент: https://forums.overclockers.ru/viewtopic.php?f=21&t=395883 https://foldingathome.org/support/faq/insta...guides/windows/ Последние дней 10 - сильная напряжёнка с генерацией новых заданий в связи с огромным наплывом и новых участников и переключением нескольких кластеров из майнинга, железо может простаивать до часа в попытках дождаться у серваков своей очереди на скачивание заданий. Современные GPU имеют больше терафлопс и всегда приносят больший PPD на ватт по сравнению с CPU, условно 100 ватт на ничзкочастотном AMD 8 ядернике это 100к PPD, 100 ватт на GTX 1060 - это 500к PPD c passkey. Поэтому оптимальные по энергоэффективности конфиги - срендне-малоядерный процессор от 3 ГГц и GPU на какой есть деньги, желательно Nvidia; AMD 5700 XТ считает только последнее 22 ядро, на Vega10 считает и 21 и 22 ядро, но на них чаще бывают ошибки с последними COVID-19 related проектами Це повідомлення відредагував Cullorblind: Mar 25 2020, 19:25 Приєднані зображення |
Arbalet |
Mar 25 2020, 22:18
Пост
#22
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Cullorblind, вот спасибо тебе, добрый человек! Уже получил по почте и ввел passkey, а полезную инструкцию добавил в шапку
-------------------- (Show/Hide) |
gladiator_maximus |
Mar 26 2020, 07:42
Пост
#23
|
Все буде Україна! Група: Moderators Повідомлень: 1 010 З нами з: 29-January 10 З: 47°52'N,35°03'E Користувач №: 1 284 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb |
Тоже решил пофолдить. Скромный вклад. Вот только инфа о проекте не грузится, видно на скрине, через разные браузеры пробовал. И очень долго можно ожидать заданий, тут же нет буфера. -------------------- |
Arbalet |
Mar 26 2020, 08:13
Пост
#24
|
Штандартенкранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 2 647 З нами з: 16-August 05 Користувач №: 119 Стать: Чол Парк машин: FX-8320 + 1070Ti |
Хм, после ввода passkey у меня сбросилась статистика и я начал считать с 0 очков, хотя ни ник, ни номер команды не поменялись...
-------------------- (Show/Hide) |
cadet-ua |
Mar 26 2020, 16:49
Пост
#25
|
kранчер Група: Trusted Members Повідомлень: 74 З нами з: 23-September 07 З: Павлоград Користувач №: 582 Стать: Чол Парк машин: AMD FX 3820, AMD FX 8150, AMD X6, AMD X4, Intel 3770, Intel 4770 .... |
Сейчас их сервера перегружены желающими.
Задания могут не приходить несколько часов. -------------------- |
ArsenEverlast |
Mar 26 2020, 19:57
Пост
#26
|
мрію про ферму... Група: Trusted Members Повідомлень: 157 З нами з: 8-February 14 З: Lviv Користувач №: 3 385 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Dell Inspiron 7720 (i7-3632QM, Radeon HD 7730M), ARTLINE Gaming X93 (i7-6700K, AMD Radeon RX 6700 XT), Dell G3 (i7-10750H, GeForce GTX 1650 Ti), HP Victus (i5-13500H, GeForce RTX 4050) |
-------------------- |
fram |
Mar 27 2020, 09:51
Пост
#27
|
кранчер зі стажем Група: Trusted Members Повідомлень: 328 З нами з: 17-March 10 З: Харьков Користувач №: 1 349 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: fx8370, RX588x2 |
никогда не любил фолдинг с их клиентом. Все через жопу.
Г Где мой старый аккаунт? -------------------- Жить, конечно, хорошо....а хорошо жить - еще лучше
|
gladiator_maximus |
Mar 29 2020, 12:26
Пост
#28
|
Все буде Україна! Група: Moderators Повідомлень: 1 010 З нами з: 29-January 10 З: 47°52'N,35°03'E Користувач №: 1 284 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: ЦП-AMD FX 8300 3.6 GHz, ГП-Radeon RX 480 4 Gb; ОЗУ- DDR3 24 GB (1600MHz); SSD Iridium 256 Gb; HDD- Toshiba 2Tb+4Tb; / Intel® Xeon® CPU E5-2640 2.80GHz/16Gb DDR3 1333/RX 480 8 Gb/SSD 120 Gb |
Посчитал несколько заданий. Последнее пару суток назад.
Посмотрел статистику, количество вьюшек всего на пару штук увеличилось, хотя их больше посчитано, очки не увеличились. Это реджекты? Тут нет нормальной статы как в боинке, чтобы увидеть какие задания валидны, какие нет? -------------------- |
ArsenEverlast |
Mar 29 2020, 19:14
Пост
#29
|
мрію про ферму... Група: Trusted Members Повідомлень: 157 З нами з: 8-February 14 З: Lviv Користувач №: 3 385 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Dell Inspiron 7720 (i7-3632QM, Radeon HD 7730M), ARTLINE Gaming X93 (i7-6700K, AMD Radeon RX 6700 XT), Dell G3 (i7-10750H, GeForce GTX 1650 Ti), HP Victus (i5-13500H, GeForce RTX 4050) |
переключайтеся із цього галімого проекту на GPUGRID, якраз зараз дофіга завдань є
-------------------- |
dimus8210 |
Mar 29 2020, 19:51
Пост
#30
|
кранчер з фермою Група: Trusted Members Повідомлень: 699 З нами з: 24-November 13 З: Київ Користувач №: 3 348 Стать: Чол Free-DC_CPID Парк машин: Ryzen 5900X, 32Gb озу, RTX3060, Ubuntu 20.04; E5-2680x2, 32Gb озу, GT1030, Ubuntu 20.04 |
переключайтеся із цього галімого проекту на GPUGRID, якраз зараз дофіга завдань є проект не галімий, просто дохреніші народу набігло після закриття SETI, ще й фішка Folding що запустили вивчення коронавірусу на хвилі інформаційного поносу, от і скінчились завдання, в GPUGRID також зараз нові кранчери прибувають досить стрімко. В Rosetta до речі теж за останні дні багатенько кранчерів приєдналось. -------------------- Science knows no country, because knowledge belongs to humanity, and is the torch which illuminates the world. Science is the highest personification of the nation because that nation will remain the first which carries the furthest the works of thought and intelligence. Louis Pasteur
|
Lo-Fi Версія | Поточний час: 24th September 2024 - 16:11 |