Help Conquer Cancer, исследование структуры белков в раковых клетках Налаштування

[Rilian]

Читайте статьи о проекте на нашем сайте:
* Официальная статистика
* FAQ по проекту help conquer cancer
* Help Conquer Cancer
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, январь 2008
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, май 2008 (в переводе) :onpc:
* Help Conquer Cancer - результаты проекта, октябрь 2008 (в переводе) :onpc:
* Сайт Института Рака в Онтарио

Как присоединиться читайте в главном топике World Community Grid

WCG запускает новый проект "Помоги Победить Рак", занимающийся улучшением результатов исследований белков методом рентгеновской кристаллографии. Это поможет не только записать части протеономы человека, но и улучшает понимание возникновения, развития и методы борьбы с раком. Проект спонсирует Институт Рака в Онтарио, Канада. Перейти на официальную страницу



Если Вы желаете помочь ученым в понимании такой сложной, многогранной и беспощадной болезни как Рак — присоединяйтесь к проекту распределенных вычислений "Help Conquer Cancer" (Помоги Победить Рак) основанный учеными из "Ontario Cancer Institute (OCI)" (Институт Рака в Онтарио), "Princess Margaret Hospital" (Госпиталь Принцессы Маргарет» и "University Health Network" (Университетская Сеть Здоровья).
Смысл помощи в том, чтобы предоставить ученым неиспользованное процессорное время вашего ПК для анализа фотографий белков сделанных методом "X-ray Crystallography" (Рентген кристаллография) с целью определения структуры этих белков и в дальнейшем понимания их роли в инициировании, течении и лечении Рака.

Миссия
Миссия проекта ПОМОГИ ПОБЕДИТЬ РАК состоит в том, чтобы улучшить результаты рентгеновской кристаллографии, которая помогает исследователям не только описать неизвестные структуры протеономы человека, но и большим образом понять как образуется рак, как он развивается, и как на него можно повлиять.

Важность проекта
Для того чтобы существенным образом повлиять на понимание рака и на его лечение, нужно не только открыть новые терапевтические подходы нацеленные на исследование метастаз (процесс распространения рака на другие органы тела), но и найти некие маркеры или структурные метки, с помощью которых можно было бы провести раннюю диагностику

Во время изучения многих форм рака, исследователи смогли сделать некоторые открытия даже имея ограниченное представление об участвующих в образовании рака белках. Однако, чтобы глубже понять и найти более эффективные способы лечения, необходимо исследовать все вовлеченные в процесс белки, их структуру и функции, чем и занимается данный проект. В основном это белки, характерные для раковых клеток, а также белки которые в них подавляются. Также исследуются белки которые были модифицированы и изменили свою структуру под воздействием рака.

С помощью рентгеновской кристаллографии исследователи смогут получить более точные данные о структуре этих белков. Это должно привести к более глубокому пониманию функций ракообразующих белков, и позволит найти потенциальные лекарства от смертельной болезни.

С начала проекта обрабатывалось 85 млн изображений.
По данным на 30 июня 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 115 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 230 млн заданий.
По уточненным данным на 20 октября 2010, в данной фазе проекта обрабатывается более 105 млн изображений, каждое из них - на 2 разных компьютерах. Итого в проекте - 210 млн заданий.

Более 560 (на 1 января 2011) человек из украинской команды распределенных вычислений отдают свободные мощности своих компьютеров на эти исследования.

(Show/Hide)

Help Conquer Cancer project announcement:

World Community Grid takes great pleasure in announcing its newest research project: Help Conquer Cancer, sponsored by the Ontario Cancer Institute in Canada. The mission of Help Conquer Cancer is to improve the results of protein X-ray crystallography, which helps researchers not only annotate parts of the human proteome, but importantly improves their understanding of cancer initiation, progression, and treatment. For more information about this research project, click here. For additional announcement information about this project, please click here.

Help Conquer Cancer runs only on the BOINC client. For more information about BOINC see the last article in this newsletter.

Other Research Projects:

The Help Conquer Cancer project is the fifth research project that is currently active on World Community Grid. The other four projects include: Human Proteome Folding - Phase II, FightAIDS@Home, Discovering Dengue Drugs - Together, and AfricanClimate@Home. We hope that you are participating in one or more of these projects. For more information about all five projects, please click here.

Time to Go BOINC!

In the October 2007 newsletter, World Community Grid announced that it was migrating entirely to BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), a software platform for volunteer computing and desktop grid computing. The move is being made to provide a better experience for all our members.

This is a reminder to all users of the United Devices client that you must migrate to the BOINC client before it sunsets in 2008 by visiting the website and downloading and installing the BOINC client. The BOINC installer will detect if a computer is running the UD client and if it is found, will help you uninstall it. Details on downloading and installing the BOINC agent for Windows may be found here.

To determine whether you are currently on the BOINC or UD client, double click on the World Community Grid icon in your system tray. If you are running the BOINC client, you will see "BOINC Client" at the top of the information panel. If you are running the United Devices client it will say United Devices in the lower right hand corner.

More details about the migration are available in the member news forum.

Are you active?

As we start this new project, the World Community Grid team wants to make sure that everyone who has signed up is actively contributing. To check out if you are actively contributing, sign in on the website and go to My Grid. In the middle of that page you will see a field for "Last Results Returned". If the last time you returned a result was more than 30 days ago, you are probably not active. The easiest way to become active again is to check that the software is installed and running properly.

To see if the software is installed, check for the World Community Grid logo in your system tray. Here is an example of what the logo looks like in the system tray:

Double-clicking on the logo will bring up the client. If the client does not appear to be running correctly (i.e., the numbers for Task Run Time or Elapsed Time are not increasing, examples below), please use the Contact Us feature on the bottom of most pages of the World Community Grid website, and a World Community Grid team member will help you to figure out how to become active again.

If the World Community Grid logo is not in your system tray, you will need to install the software. For instructions, click here. If you have any questions about this, please ask in the forums or send an email via Contact Us.

------------------------------

Для большей скорости (прирост 40%) используйте 64-битную ОС!

график проекта


видео о проекте


Це повідомлення відредагував Rilian: Jan 6 2011, 09:26

[cosmo_vk]

Sekerob обмовился что на самом деле добавили не 30 лямов новых заданий, а только 20. В итоге сейчас проект завершен на 55%
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ffset,50#299461

[Yurr]

Очень плохо что ВЮ в Help Conquer Cancer идут через https Ибо у меня выход в инет для компов с Боинком организован через прокси и по логин-паролю, но как оказалось, через secure-соединение не идет трафик, если клиент аутентифицируется по логину-паролю, если по IP - тогда работает отлично.

[Rilian]

Очень плохо что ВЮ в Help Conquer Cancer идут через https Ибо у меня выход в инет для компов с Боинком организован через прокси и по логин-паролю, но как оказалось, через secure-соединение не идет трафик, если клиент аутентифицируется по логину-паролю, если по IP - тогда работает отлично.

ccproxy тебе в помощь (ищи по форуму)

[Yurr]

ccproxy тебе в помощь (ищи по форуму)

спс, поищу и попробую ccproxy

[Rilian]

ccproxy тебе в помощь (ищи по форуму)

спс, поищу и попробую ccproxy

ну как, получилось?

https://distributed.org.ua/forum/index.php?...=404&hl=ccproxy

https://distributed.org.ua/forum/index.php?...roxy#entry35506

[Rilian]

Посчитано 54.9% - 110339666 заданий из 105000000 ВЮ (с кворумом в 2 задания на ВЮ), и осталось досчитать 99 660 334 заданий

Средняя недельная скорость 235000 заданий в день, с такой скоростью проект завершится через 424 дня

[Rilian]

corsar83, подпишись на этот топик: http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,30185

[corsar83]

corsar83, подпишись на этот топик: http://www.worldcommunitygrid.org/forums/w...ad_thread,30185

Seems CUDA was dropped and all cards are on OpenCL

вот чо ответили в твоей новой теме . Короче как я и говорил фиг поймешь. Можно пролететь прийдеться наверно ждать нового года, когда внедрят уже этот опенсл и будет все понятно

[SlavaAltus]

В последних дровишках для АТИ Catalyst 10.10 - OpenCL уже официально включён!

[corsar83]

В последних дровишках для АТИ Catalyst 10.10 - OpenCL уже официально включён!

Да в этих дровишках довольно много чо новенького, в том числе и опенсл. Осталось только чтоб проекты распред. вычислениий к себе его прилепили нормально, а то на радеонах считать почти нечего. Быстрей бы уже

[Yurr]

ну как, получилось?

https://distributed.org.ua/forum/index.php?...=404&hl=ccproxy

https://distributed.org.ua/forum/index.php?...roxy#entry35506

пока решил вопрос с помощью UserGate 2.8

[Rilian]

Статья о результатах проекта за октябрь 2010!

Dear World Community Grid members,
We have a new progress report on the HCC project web site. We have lately enhanced our automatic image classifier by simultaneously considering multiple images from the same crystallization trial:



These images were taken one week apart during a single crystallization trial. The state of the trial changes from precipitate at week 0 (left), through mixed precipitate and crystal at week 1, to crystal at weeks 2, 3, and 4. By evaluating multiple images in the same time course, a more consistent classification is obtained. We are also studying the effect of expanding the context of the image in other dimensions.

Thank you for your continued donations of CPU time and enthusiasm to this project and others on the World Community Grid. Your contributions make this research possible.

Christian A. Cumbaa
Research Associate
Ontario Cancer Institute

Если очень кратко: теперь анализатор изображении кристаллографии может работать с изображениями одного и того же кристалла но за разные периоды времени, и на основании изменений делать какие-то выводы

Скачать пресс-релиз (на английском): http://www.cs.toronto.edu/~juris/WCG/UPDATE-OCT2010.pdf

[Rilian]

Умер Виктор Черномырдин. По этому поводу грянул хор ответственных и не очень лиц: "Какой был замечательный человек! Какого масштаба! Да, как жаль!" Впереди роскошные похороны в прямом эфире. Дань уважения, о которой человек и не мечтал при жизни. Хотя, конечно, это уважение и забота, когда человек жив, ему гораздо полезней. Люди придают излишне большое значение похоронам, украшая смерть: торжественно, цветы, замечательный гроб, вереница людей, красивые и добрые слова в адрес усопшего. Вместо того, чтобы хоть часть этих усилий направить на то, чтобы человек жил! Черномырдин умер от рака. Вот лучше бы все задумались, что рак - это плохо и с ним нужно бороться. Что у нас в стране из рук вон плохо обстоят дела с профилактикой, лечением и научными изысканиями в онкологии. Тем не менее в мире существуют исследования, эксперименты, идеи которые могут существенно снизить смертность от онкологических заболеваний, продлить жизнь человеку. Что необходимо внедрять в клинику новые методы биоинформатического поиска, моделирования заболеваний, драг-дизайна, секвенирования ракового генома. Что нужно финансировать борьбу с раком! Необходимо изучать фундаментальные механизмы старения, как основной причины раковых заболеваний.
На похоронах люди сожалеют о смерти человека, но это уже поздно. Надо действовать, когда человек жив, когда вы сами ещё живы.

http://m-batin.livejournal.com/88182.html

пс: рекомендую подписаться на его ЖЖ

[nikelong]

Письмо с того света...

Приветствую вас, Живые!

Моё имя вам ничего не скажет, так что и называться не буду. Мне, по большому счёту, и дела до вас никогда не было. Но теперь, когда я могу посмотреть из того мира, в котором я сейчас нахожусь, в тот, в котором вы живёте, всё моё существо сжимается от боли и сострадания к вам. Ведь и я когда-то был точно таким же, как вы. Я совершал те же ошибки, которые из поколения в поколение с каким-то маниакальным упорством совершаете и вы. В вашей жизни появилось много всяких красивых и полезных штук: вы зовёте их мобильниками, компьютерами, автомобилями, Интернетом… да всего и не перечесть. Но ваши ошибки практически не отличаются от тех, которые совершали ваши прапрадеды… И я!

Я умер от рака лёгких в одной далёкой деревеньке, каких полным полно на просторах нашей необъятной страны. Всю свою жизнь я курил. Точно так же, как сейчас это делаете и вы. Сигареты тогда были ещё в диковинку, проще было купить упаковку мелко нарезанного табака и курить трубку. Я курил, не обращая внимания ни на что. Ни на то, что в тридцать лет почти остался без зубов и задыхался по утрам от чудовищного кашля. Ни на то, что в сорок лет стал выглядеть на все шестьдесят. Это вы, по какой-то необъяснимой глупости, считаете, что ваши курящие сверстники выглядят ровно на столько, сколько им есть на самом деле.

Ха! Да вам просто уже не с кем сравнить свои изуродованные тела. Ведь среди вас здоровых людей почти не осталось. Ваши матери рожали вас с сигаретой в зубах, а ваши невесты и жёны курят, как матросы китобойного судна. Да и сами вы курите так, будто ничего важнее в вашей жизни нет. Ваши дети, ещё каким-то чудом не вступившие в армию любителей табачно-бумажной соски, уже сейчас травятся табачным дымом, коим вы их окутали со всех сторон. Мне больно и страшно смотреть, как вы, гуляя со своими крохотными детишками в парке или на природе, курите не просто в их присутствии, а прямо рядом, находясь от них на расстоянии вытянутой руки. Вы до того одурманили себя этим проклятым зельем, что некурящих людей уже считаете если не ненормальными, то странными – точно!

Не думайте, что я не знаю, о чём говорю. Ведь я не просто побывал в вашей шкуре. Я не просто был таким же курильщиком, как и вы. Я умер от этого. Я прошёл весь этот мучительный, тупиковый путь от начала и до конца. От первой папиросы, стащенной у отца, до смерти от раковой опухоли, которая превратила мои лёгкие в кучу протухшего окровавленного мяса, разрушила лимфатическую систему и, в конечном счёте, уничтожила мой мозг. Но если в наше время не было никого, кто бы открыто заявил, что эта безобидная на вид травка – самый настоящий убийца, то вам об этом буквально кричат на каждом углу. А вы, как дураки, считающие себя умнее планеты всей, не просто продолжаете курить, но и пополняете свои ряды, затаскивая туда уже детей.

Бросайте это дело. Сейчас, когда вы ещё молоды и сильны, вам тяжело поверить в то, что вы обречены. Вам всё ещё кажется, что вы «контролируете ситуацию» и сможете бросить курить, «когда придёт время». Но это время не придёт никогда. И каждая выкуренная вами сигарета делает пропасть между вашей свободой и вашей смертью всё шире и шире. И чем дольше вы тянете резину, тем меньше шансов у вас освободиться от курения.

Знаю, что вам тяжело поверить в то, что чаша сия вас не минует. Вы, в силу своей молодости или неистребимой тупости, не можете поверить в то, что эта дымящаяся штучка в ваших руках – орудие самоубийства, которым вы себя изничтожаете каждый день. Но когда вы окажетесь на смертном одре, вы будете готовы продать душу дьяволу лишь бы избавиться от чудовищных мук и будете обливаться совершенно бесполезными слезами покаяния от того, что когда-то давно решили стать старше и круче и взяли в рот свою первую сигарету.

Вы будете грызть локти из-за того, что по собственной дурости расплачивались собственным здоровьем за имидж, когда в душной сауне выкуривали с компаньонами и партнёрами по бизнесу толстые, как сарделька, сигары, или раскуривали трубку перед объективами видеокамер. Перед смертью вы все пожалеете о том, что курите. Но я не хочу, чтобы вы и ваши дети умерли от табака. Я знаю, каково это. Я умер от этого. Освободитесь и сделайте ваших потомков свободными!

Искренне ваш, Мёртвый…

[vitalidze1]

Папіроси - признак поганого виховання батьками.